MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	TTCTGC	2	12	3448	3459	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288508
2	NC_011247	TTTCTT	2	12	5038	5049	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288510
3	NC_011247	AGGAGC	2	12	5210	5221	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288510
4	NC_011247	TTTCTT	2	12	6451	6462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288511
5	NC_011247	CAATTT	2	12	8419	8430	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288513
6	NC_011247	TACTCC	2	12	8839	8850	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203288513
7	NC_011247	CAGGAG	2	12	8995	9006	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288513
8	NC_011247	GGAGCA	2	12	9111	9122	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288513
9	NC_011247	CAGGAG	2	12	9148	9159	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203288513
10	NC_011247	ATAAAT	2	12	10420	10431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288514
11	NC_011247	TCCAGT	2	12	13930	13941	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	203288517
12	NC_011247	CTCCAG	2	12	16384	16395	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	203288519
13	NC_011247	TAGTTC	2	12	17552	17563	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203288520
14	NC_011247	TTCCTC	2	12	17591	17602	0 %	50 %	0 %	50 %	203288520
15	NC_011247	ATTAAC	2	12	19759	19770	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288523
16	NC_011247	ATATAA	2	12	20581	20592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288523
17	NC_011247	ATTAAC	2	12	20736	20747	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288524
18	NC_011247	ATATAA	2	12	21609	21620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288525
19	NC_011247	GTCTTT	2	12	22502	22513	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	203288526
20	NC_011247	ACTTAT	2	12	22791	22802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288527
21	NC_011247	CATCAG	2	12	23249	23260	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	203288527
22	NC_011247	TAAAAC	2	12	24435	24446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288528
23	NC_011247	TTGCCT	2	12	26301	26312	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288530
24	NC_011247	AAACCT	2	12	27541	27552	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203288531
25	NC_011247	AAAGAA	2	12	30551	30562	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288532
26	NC_011247	AAAGAA	2	12	32545	32556	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288533
27	NC_011247	AAAGAA	2	12	34537	34548	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288534
28	NC_011247	AAAATA	2	12	36980	36991	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288535
29	NC_011247	ATTTAT	2	12	37699	37710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288536
30	NC_011247	CTCATA	2	12	45458	45469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288541
31	NC_011247	TTTGTT	2	12	48215	48226	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	203288543
32	NC_011247	CAAGCC	2	12	48970	48981	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288544
33	NC_011247	ATAGTA	2	12	54775	54786	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288548
34	NC_011247	TCTTCA	2	12	57254	57265	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288550
35	NC_011247	TAACAT	2	12	57451	57462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288550
36	NC_011247	GCCTTG	2	12	65559	65570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288556
37	NC_011247	CTCTTA	2	12	65626	65637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288556
38	NC_011247	TATCAT	2	12	66102	66113	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288557
39	NC_011247	ATTATA	2	12	68293	68304	50 %	50 %	0 %	0 %	203288559
40	NC_011247	TATCTC	2	12	77146	77157	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288567
41	NC_011247	AAATTA	2	12	78359	78370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288569
42	NC_011247	CTTTAT	2	12	83776	83787	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288574
43	NC_011247	CAGCAC	2	12	87685	87696	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288576
44	NC_011247	TTAAAT	2	12	88149	88160	50 %	50 %	0 %	0 %	203288576
45	NC_011247	TATTCA	2	12	90426	90437	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288579
46	NC_011247	TTCTTT	2	12	92246	92257	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288581
47	NC_011247	ATTAAC	2	12	96148	96159	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288585
48	NC_011247	AAAATC	2	12	97255	97266	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288586
49	NC_011247	CATTTA	2	12	97302	97313	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288586
50	NC_011247	AAATTT	2	12	97541	97552	50 %	50 %	0 %	0 %	203288586
51	NC_011247	TTGGAA	2	12	98818	98829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288589
52	NC_011247	ATATTA	2	12	102020	102031	50 %	50 %	0 %	0 %	203288594
53	NC_011247	ATTTAA	2	12	103313	103324	50 %	50 %	0 %	0 %	203288596
54	NC_011247	AAACAG	2	12	105819	105830	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	203288598
55	NC_011247	ATCTTT	2	12	106135	106146	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288598
56	NC_011247	TATGCA	2	12	113659	113670	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288600
57	NC_011247	ACTTAA	2	12	118456	118467	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288602
58	NC_011247	TTAAAA	2	12	120164	120175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288603
59	NC_011247	ACCTTA	2	12	121449	121460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288604
60	NC_011247	AAATAA	2	12	122922	122933	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288606
61	NC_011247	AAATAA	2	12	123986	123997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288607
62	NC_011247	GAAAAT	2	12	125093	125104	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	203288608
63	NC_011247	CTCATA	2	12	132346	132357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288615
64	NC_011247	TCAAAA	2	12	133352	133363	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288616
65	NC_011247	ATGTCT	2	12	137356	137367	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203288622
66	NC_011247	TGATAT	2	12	139202	139213	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288623
67	NC_011247	TGATAT	2	12	139217	139228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288623
68	NC_011247	TAGTGA	2	12	140573	140584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288624
69	NC_011247	AATTTT	2	12	143214	143225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288626
70	NC_011247	TTGAAA	2	12	143578	143589	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288626
71	NC_011247	TAAAGA	2	12	144645	144656	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	203288627
72	NC_011247	TTTTAA	2	12	144837	144848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288627
73	NC_011247	TAATGA	2	12	146437	146448	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288628
74	NC_011247	TCTAAT	3	18	146903	146920	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288628
75	NC_011247	ATTTAG	2	12	149449	149460	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288630
76	NC_011247	ATGGGT	2	12	150874	150885	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288631
77	NC_011247	TTCCTG	2	12	155065	155076	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288634
78	NC_011247	AGATGA	2	12	156371	156382	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	203288635
79	NC_011247	GATAAG	2	12	158065	158076	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	203288637
80	NC_011247	GATGTT	2	12	160704	160715	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	203288639

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.