MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	TATTT	2	10	1444	1453	20 %	80 %	0 %	0 %	203288507
2	NC_011247	CAAAT	2	10	2000	2009	60 %	20 %	0 %	20 %	203288507
3	NC_011247	TTTTG	2	10	2172	2181	0 %	80 %	20 %	0 %	203288507
4	NC_011247	TTCTT	3	15	2194	2208	0 %	80 %	0 %	20 %	203288507
5	NC_011247	TTCTC	2	10	3284	3293	0 %	60 %	0 %	40 %	203288508
6	NC_011247	TAATA	2	10	4027	4036	60 %	40 %	0 %	0 %	203288509
7	NC_011247	CAATT	2	10	5876	5885	40 %	40 %	0 %	20 %	203288511
8	NC_011247	CTATA	2	10	8344	8353	40 %	40 %	0 %	20 %	203288513
9	NC_011247	CAATT	2	10	9780	9789	40 %	40 %	0 %	20 %	203288514
10	NC_011247	TTCTT	2	10	11185	11194	0 %	80 %	0 %	20 %	203288515
11	NC_011247	ATTTT	2	10	11420	11429	20 %	80 %	0 %	0 %	203288515
12	NC_011247	TGCTT	2	10	12512	12521	0 %	60 %	20 %	20 %	203288516
13	NC_011247	TGCTT	2	10	14903	14912	0 %	60 %	20 %	20 %	203288518
14	NC_011247	TGCTT	2	10	16100	16109	0 %	60 %	20 %	20 %	203288519
15	NC_011247	AAATA	2	10	16559	16568	80 %	20 %	0 %	0 %	203288519
16	NC_011247	AACCA	2	10	17180	17189	60 %	0 %	0 %	40 %	203288520
17	NC_011247	TTTCT	2	10	19101	19110	0 %	80 %	0 %	20 %	203288522
18	NC_011247	CTTCT	2	10	19283	19292	0 %	60 %	0 %	40 %	203288522
19	NC_011247	TGCTT	2	10	19296	19305	0 %	60 %	20 %	20 %	203288522
20	NC_011247	CTTCT	2	10	20254	20263	0 %	60 %	0 %	40 %	203288523
21	NC_011247	ACACT	2	10	20356	20365	40 %	20 %	0 %	40 %	203288523
22	NC_011247	CCTCT	2	10	20489	20498	0 %	40 %	0 %	60 %	203288523
23	NC_011247	CTTCT	2	10	23225	23234	0 %	60 %	0 %	40 %	203288527
24	NC_011247	ATTTA	2	10	24189	24198	40 %	60 %	0 %	0 %	203288528
25	NC_011247	TAATA	2	10	24296	24305	60 %	40 %	0 %	0 %	203288528
26	NC_011247	TTAAT	2	10	24677	24686	40 %	60 %	0 %	0 %	203288529
27	NC_011247	ATTTT	2	10	24735	24744	20 %	80 %	0 %	0 %	203288529
28	NC_011247	TAAAT	2	10	24926	24935	60 %	40 %	0 %	0 %	203288529
29	NC_011247	AAATA	2	10	30445	30454	80 %	20 %	0 %	0 %	203288532
30	NC_011247	TAAAA	2	10	30628	30637	80 %	20 %	0 %	0 %	203288532
31	NC_011247	ATAAA	2	10	31901	31910	80 %	20 %	0 %	0 %	203288533
32	NC_011247	AAATA	2	10	32439	32448	80 %	20 %	0 %	0 %	203288533
33	NC_011247	AAATA	2	10	34431	34440	80 %	20 %	0 %	0 %	203288534
34	NC_011247	CATGG	2	10	36653	36662	20 %	20 %	40 %	20 %	203288535
35	NC_011247	AAATA	2	10	37066	37075	80 %	20 %	0 %	0 %	203288535
36	NC_011247	ATTTA	2	10	42196	42205	40 %	60 %	0 %	0 %	203288538
37	NC_011247	CTTTA	2	10	42238	42247	20 %	60 %	0 %	20 %	203288538
38	NC_011247	AATTA	2	10	42817	42826	60 %	40 %	0 %	0 %	203288539
39	NC_011247	AAATT	2	10	44158	44167	60 %	40 %	0 %	0 %	203288540
40	NC_011247	TCTTT	2	10	45275	45284	0 %	80 %	0 %	20 %	203288541
41	NC_011247	ATGTA	2	10	49869	49878	40 %	40 %	20 %	0 %	203288544
42	NC_011247	AAATC	2	10	51710	51719	60 %	20 %	0 %	20 %	203288546
43	NC_011247	TCAAA	2	10	53416	53425	60 %	20 %	0 %	20 %	203288547
44	NC_011247	AATTT	2	10	55704	55713	40 %	60 %	0 %	0 %	203288549
45	NC_011247	AACAT	2	10	56239	56248	60 %	20 %	0 %	20 %	203288549
46	NC_011247	AAATG	2	10	58850	58859	60 %	20 %	20 %	0 %	203288551
47	NC_011247	TAATA	2	10	62112	62121	60 %	40 %	0 %	0 %	203288553
48	NC_011247	CAATA	2	10	63325	63334	60 %	20 %	0 %	20 %	203288554
49	NC_011247	CTTTT	2	10	64499	64508	0 %	80 %	0 %	20 %	203288555
50	NC_011247	CATAT	2	10	66460	66469	40 %	40 %	0 %	20 %	203288557
51	NC_011247	TAAAA	2	10	67657	67666	80 %	20 %	0 %	0 %	203288558
52	NC_011247	AAACT	2	10	68509	68518	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
53	NC_011247	TAAAC	2	10	68560	68569	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
54	NC_011247	TAACA	2	10	68749	68758	60 %	20 %	0 %	20 %	203288560
55	NC_011247	CAAAA	2	10	72260	72269	80 %	0 %	0 %	20 %	203288562
56	NC_011247	AATGA	2	10	72869	72878	60 %	20 %	20 %	0 %	203288563
57	NC_011247	TAGCA	2	10	73519	73528	40 %	20 %	20 %	20 %	203288564
58	NC_011247	AAATA	2	10	74528	74537	80 %	20 %	0 %	0 %	203288564
59	NC_011247	AAAAT	2	10	75381	75390	80 %	20 %	0 %	0 %	203288565
60	NC_011247	TTTAA	2	10	75459	75468	40 %	60 %	0 %	0 %	203288565
61	NC_011247	AAGAT	2	10	75643	75652	60 %	20 %	20 %	0 %	203288565
62	NC_011247	ATATG	2	10	76128	76137	40 %	40 %	20 %	0 %	203288566
63	NC_011247	TAAAT	2	10	76148	76157	60 %	40 %	0 %	0 %	203288566
64	NC_011247	AAATA	2	10	76829	76838	80 %	20 %	0 %	0 %	203288567
65	NC_011247	TGAAT	2	10	77091	77100	40 %	40 %	20 %	0 %	203288567
66	NC_011247	ATATC	2	10	77214	77223	40 %	40 %	0 %	20 %	203288567
67	NC_011247	TTTCA	2	10	77390	77399	20 %	60 %	0 %	20 %	203288567
68	NC_011247	TGAAT	2	10	77866	77875	40 %	40 %	20 %	0 %	203288568
69	NC_011247	ATTTA	2	10	81871	81880	40 %	60 %	0 %	0 %	203288572
70	NC_011247	ATTAA	2	10	85714	85723	60 %	40 %	0 %	0 %	203288575
71	NC_011247	AATAA	2	10	85787	85796	80 %	20 %	0 %	0 %	203288575
72	NC_011247	ACTTC	2	10	86808	86817	20 %	40 %	0 %	40 %	203288576
73	NC_011247	ATTTT	2	10	87003	87012	20 %	80 %	0 %	0 %	203288576
74	NC_011247	ATCTG	2	10	87711	87720	20 %	40 %	20 %	20 %	203288576
75	NC_011247	ATTAA	2	10	88489	88498	60 %	40 %	0 %	0 %	203288577
76	NC_011247	ATCAT	2	10	89155	89164	40 %	40 %	0 %	20 %	203288578
77	NC_011247	AGACA	2	10	90764	90773	60 %	0 %	20 %	20 %	203288579
78	NC_011247	TTAAA	2	10	91658	91667	60 %	40 %	0 %	0 %	203288580
79	NC_011247	TCTTG	2	10	94866	94875	0 %	60 %	20 %	20 %	203288584
80	NC_011247	AAAAT	2	10	95710	95719	80 %	20 %	0 %	0 %	203288584
81	NC_011247	TCTTT	2	10	96894	96903	0 %	80 %	0 %	20 %	203288586
82	NC_011247	AATTA	2	10	97468	97477	60 %	40 %	0 %	0 %	203288586
83	NC_011247	TAAAT	2	10	98777	98786	60 %	40 %	0 %	0 %	203288589
84	NC_011247	AACAC	2	10	99008	99017	60 %	0 %	0 %	40 %	203288590
85	NC_011247	GTAAT	2	10	99435	99444	40 %	40 %	20 %	0 %	203288590
86	NC_011247	TATTT	2	10	100084	100093	20 %	80 %	0 %	0 %	203288591
87	NC_011247	AAAAG	2	10	100365	100374	80 %	0 %	20 %	0 %	203288591
88	NC_011247	AATAA	2	10	101231	101240	80 %	20 %	0 %	0 %	203288593
89	NC_011247	AAATT	2	10	101328	101337	60 %	40 %	0 %	0 %	203288593
90	NC_011247	TTTTA	2	10	103166	103175	20 %	80 %	0 %	0 %	203288596
91	NC_011247	ATCTT	2	10	103769	103778	20 %	60 %	0 %	20 %	203288597
92	NC_011247	TAAAA	2	10	104288	104297	80 %	20 %	0 %	0 %	203288597
93	NC_011247	TAATT	2	10	104713	104722	40 %	60 %	0 %	0 %	203288597
94	NC_011247	CACCT	2	10	105970	105979	20 %	20 %	0 %	60 %	203288598
95	NC_011247	AACAA	2	10	109561	109570	80 %	0 %	0 %	20 %	203288599
96	NC_011247	TTCAA	2	10	112711	112720	40 %	40 %	0 %	20 %	203288600
97	NC_011247	TAAAT	2	10	113859	113868	60 %	40 %	0 %	0 %	203288600
98	NC_011247	TTCAA	2	10	114271	114280	40 %	40 %	0 %	20 %	203288601
99	NC_011247	TAAAT	2	10	115425	115434	60 %	40 %	0 %	0 %	203288601
100	NC_011247	TGTAC	2	10	119807	119816	20 %	40 %	20 %	20 %	203288603
101	NC_011247	AATTA	2	10	120391	120400	60 %	40 %	0 %	0 %	203288603
102	NC_011247	TAATA	2	10	121222	121231	60 %	40 %	0 %	0 %	203288604
103	NC_011247	ATAAA	2	10	122390	122399	80 %	20 %	0 %	0 %	203288606
104	NC_011247	TCTCT	2	10	122560	122569	0 %	60 %	0 %	40 %	203288606
105	NC_011247	AATAA	2	10	122662	122671	80 %	20 %	0 %	0 %	203288606
106	NC_011247	TAAAA	2	10	122976	122985	80 %	20 %	0 %	0 %	203288606
107	NC_011247	AAAAT	2	10	123724	123733	80 %	20 %	0 %	0 %	203288607
108	NC_011247	TAAAA	2	10	124040	124049	80 %	20 %	0 %	0 %	203288607
109	NC_011247	TAAAA	2	10	125232	125241	80 %	20 %	0 %	0 %	203288608
110	NC_011247	AAGTA	2	10	126640	126649	60 %	20 %	20 %	0 %	203288609
111	NC_011247	TTTAA	2	10	127009	127018	40 %	60 %	0 %	0 %	203288610
112	NC_011247	TTCAT	2	10	127039	127048	20 %	60 %	0 %	20 %	203288610
113	NC_011247	ATCCC	2	10	130668	130677	20 %	20 %	0 %	60 %	203288614
114	NC_011247	TCTTT	2	10	130995	131004	0 %	80 %	0 %	20 %	203288614
115	NC_011247	TCTTT	2	10	132163	132172	0 %	80 %	0 %	20 %	203288615
116	NC_011247	ATTGT	2	10	134802	134811	20 %	60 %	20 %	0 %	203288619
117	NC_011247	ATATT	2	10	137171	137180	40 %	60 %	0 %	0 %	203288621
118	NC_011247	GTTTT	2	10	140247	140256	0 %	80 %	20 %	0 %	203288624
119	NC_011247	GAGAA	2	10	140458	140467	60 %	0 %	40 %	0 %	203288624
120	NC_011247	TGTTT	2	10	141038	141047	0 %	80 %	20 %	0 %	203288624
121	NC_011247	TCAAA	2	10	142286	142295	60 %	20 %	0 %	20 %	203288625
122	NC_011247	TTTTA	2	10	142820	142829	20 %	80 %	0 %	0 %	203288626
123	NC_011247	ATTTT	2	10	142945	142954	20 %	80 %	0 %	0 %	203288626
124	NC_011247	TAATT	2	10	144672	144681	40 %	60 %	0 %	0 %	203288627
125	NC_011247	TTCAT	2	10	145062	145071	20 %	60 %	0 %	20 %	203288627
126	NC_011247	TATTC	2	10	151843	151852	20 %	60 %	0 %	20 %	203288631
127	NC_011247	TATCT	2	10	151990	151999	20 %	60 %	0 %	20 %	203288631
128	NC_011247	TGTAG	2	10	155859	155868	20 %	40 %	40 %	0 %	203288635
129	NC_011247	GTTTT	2	10	156671	156680	0 %	80 %	20 %	0 %	203288635
130	NC_011247	AAATT	2	10	156857	156866	60 %	40 %	0 %	0 %	203288636
131	NC_011247	ATTTA	2	10	158871	158880	40 %	60 %	0 %	0 %	203288638
132	NC_011247	AGAAA	2	10	159281	159290	80 %	0 %	20 %	0 %	203288638
133	NC_011247	AAGAT	2	10	159620	159629	60 %	20 %	20 %	0 %	203288638
134	NC_011247	GGTAA	2	10	161262	161271	40 %	20 %	40 %	0 %	203288639
135	NC_011247	TGGGA	2	10	161309	161318	20 %	20 %	60 %	0 %	203288639
136	NC_011247	TTTTA	2	10	162389	162398	20 %	80 %	0 %	0 %	203288640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.