MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 248

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	TAAA	2	8	946	953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011247	TTGC	2	8	1261	1268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011247	AAAT	2	8	1302	1309	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011247	ACTA	2	8	1359	1366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011247	TATC	2	8	2541	2548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011247	ATTA	2	8	4101	4108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011247	AATA	2	8	4199	4206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011247	TAAT	2	8	4262	4269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011247	TTAT	2	8	5578	5585	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011247	AATA	2	8	5594	5601	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011247	TAAT	2	8	5657	5664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011247	AATA	2	8	6915	6922	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011247	AAGA	2	8	6926	6933	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011247	TTAA	2	8	6970	6977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011247	AATA	2	8	8138	8145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011247	AATT	2	8	8213	8220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011247	ATTA	2	8	9428	9435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011247	ATTT	2	8	10515	10522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011247	TTAA	2	8	10550	10557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011247	TAAT	2	8	10697	10704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011247	ATTT	2	8	11818	11825	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011247	ATAA	2	8	11936	11943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011247	ATAA	2	8	13012	13019	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011247	ATTT	2	8	14209	14216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011247	ATAA	2	8	14327	14334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011247	ATAA	2	8	16746	16753	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011247	ATTT	2	8	16789	16796	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011247	TAAT	2	8	16819	16826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011247	ACTA	2	8	21667	21674	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_011247	TTAA	2	8	23610	23617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011247	TATC	2	8	24517	24524	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011247	TCCT	2	8	25485	25492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011247	TAAT	2	8	26801	26808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011247	AATT	2	8	27291	27298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011247	ATCT	2	8	27401	27408	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_011247	AGAT	2	8	28883	28890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011247	ATTT	2	8	28893	28900	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011247	ATTT	2	8	29077	29084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011247	ATTT	2	8	29178	29185	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011247	ATTT	2	8	29422	29429	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011247	ACAA	2	8	33991	33998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_011247	GTTA	2	8	35924	35931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011247	ACAG	2	8	36382	36389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_011247	CAAT	2	8	37435	37442	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011247	ATTA	2	8	37467	37474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011247	ATTA	2	8	37498	37505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011247	TAAT	2	8	37574	37581	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011247	TAAT	2	8	37584	37591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011247	GTTA	2	8	38446	38453	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011247	AAAC	2	8	38569	38576	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_011247	ACAG	2	8	39043	39050	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011247	TGAA	2	8	39252	39259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011247	ATTA	2	8	40097	40104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011247	ATTA	2	8	40153	40160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011247	ATTA	2	8	40184	40191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011247	TAAT	2	8	40260	40267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011247	TAAT	2	8	40270	40277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011247	ATCT	2	8	43480	43487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011247	ATTT	2	8	43557	43564	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011247	TTAA	2	8	44712	44719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011247	ATTA	2	8	44725	44732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011247	GCCT	2	8	44763	44770	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011247	ATTT	2	8	47358	47365	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011247	TTAT	2	8	47521	47528	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011247	ACAA	2	8	47538	47545	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011247	ATTT	2	8	48736	48743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011247	ATTA	2	8	48798	48805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011247	ATAA	2	8	48843	48850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011247	ACAT	2	8	49935	49942	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_011247	TAAT	2	8	49997	50004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011247	TATT	2	8	50945	50952	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011247	CTTT	2	8	51999	52006	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011247	TAAT	2	8	52156	52163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011247	TAAT	2	8	52169	52176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011247	ATTT	2	8	52229	52236	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011247	TAAT	2	8	52580	52587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011247	ATTA	3	12	54006	54017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011247	TGAA	2	8	55318	55325	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011247	TAAA	2	8	55355	55362	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011247	ATTA	2	8	56414	56421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011247	ATTA	2	8	56464	56471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011247	ATTA	2	8	57595	57602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011247	ATCA	2	8	57695	57702	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_011247	ATTT	2	8	57917	57924	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011247	CAAT	2	8	58991	58998	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011247	TAAT	2	8	59090	59097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011247	AAAT	2	8	59126	59133	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011247	TTTA	2	8	59136	59143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011247	TTAT	2	8	59144	59151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011247	ATTA	2	8	59263	59270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011247	AAAT	2	8	59547	59554	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011247	TTTA	2	8	59595	59602	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011247	CTAA	2	8	60353	60360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011247	ATAA	2	8	60433	60440	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011247	ATTT	2	8	61441	61448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011247	TTAA	2	8	61461	61468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011247	ATAA	2	8	63781	63788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011247	TAAT	2	8	63806	63813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011247	AATA	2	8	64832	64839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011247	CCCT	2	8	66772	66779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_011247	AATT	2	8	69484	69491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011247	ATAA	2	8	69566	69573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011247	TAAA	2	8	69619	69626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011247	GTTA	2	8	69674	69681	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011247	CATA	2	8	69765	69772	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_011247	TAAT	2	8	70035	70042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011247	ATTT	2	8	71509	71516	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011247	TAAT	2	8	72327	72334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011247	AAAC	2	8	73451	73458	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_011247	TCCT	2	8	74564	74571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_011247	TATT	2	8	74648	74655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011247	TACA	2	8	77460	77467	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011247	AATT	2	8	77476	77483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011247	CTAT	2	8	78206	78213	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011247	AAAT	2	8	80242	80249	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011247	CATG	2	8	80277	80284	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011247	ATTT	2	8	80333	80340	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011247	TCTA	2	8	80421	80428	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_011247	AAAT	2	8	80435	80442	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011247	AATT	2	8	80570	80577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011247	ACTA	2	8	80663	80670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_011247	AAAC	2	8	80737	80744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_011247	TCAT	2	8	80839	80846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_011247	ATCA	2	8	80854	80861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_011247	AATT	2	8	80978	80985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011247	ATCT	2	8	81014	81021	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_011247	TCTA	2	8	81295	81302	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011247	TTTA	2	8	82134	82141	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011247	AACC	2	8	82170	82177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011247	CAAA	3	12	83068	83079	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011247	TCAA	2	8	84219	84226	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
132	NC_011247	ATAA	2	8	84620	84627	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011247	CATC	2	8	84639	84646	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011247	CAAA	2	8	85217	85224	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011247	CAAT	2	8	85295	85302	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011247	TTAA	2	8	89650	89657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011247	AAAC	2	8	89705	89712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_011247	CAAA	2	8	90992	90999	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011247	ATTT	2	8	92757	92764	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011247	AATT	3	12	92781	92792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011247	GAAA	2	8	92878	92885	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011247	CTAT	2	8	92914	92921	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011247	CCTA	2	8	93549	93556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011247	TAAT	2	8	94530	94537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011247	AATC	2	8	94611	94618	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_011247	TAAA	2	8	95764	95771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011247	ATAA	2	8	96376	96383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011247	ATTT	2	8	100069	100076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011247	ATTT	2	8	102386	102393	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011247	ATTA	2	8	104865	104872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011247	ATCA	2	8	104913	104920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_011247	ATTT	2	8	104965	104972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011247	TAAA	2	8	104980	104987	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011247	ATAA	2	8	105017	105024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011247	GTAA	2	8	105053	105060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_011247	TAAA	2	8	106674	106681	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.