MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl165

Total Repeats: 312

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011247	AT	3	6	1501	1506	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
2	NC_011247	AT	3	6	1539	1544	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
3	NC_011247	AT	3	6	1660	1665	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
4	NC_011247	AT	3	6	1726	1731	50 %	50 %	0 %	0 %	203288507
5	NC_011247	TC	3	6	2407	2412	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
6	NC_011247	CT	3	6	2437	2442	0 %	50 %	0 %	50 %	203288507
7	NC_011247	AT	3	6	2699	2704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
8	NC_011247	TA	3	6	3209	3214	50 %	50 %	0 %	0 %	203288508
9	NC_011247	CT	3	6	3931	3936	0 %	50 %	0 %	50 %	203288509
10	NC_011247	TA	3	6	4622	4627	50 %	50 %	0 %	0 %	203288510
11	NC_011247	AG	3	6	6260	6265	50 %	0 %	50 %	0 %	203288511
12	NC_011247	TA	3	6	7286	7291	50 %	50 %	0 %	0 %	203288512
13	NC_011247	TA	3	6	7296	7301	50 %	50 %	0 %	0 %	203288512
14	NC_011247	AG	4	8	7527	7534	50 %	0 %	50 %	0 %	203288512
15	NC_011247	AG	3	6	7768	7773	50 %	0 %	50 %	0 %	203288512
16	NC_011247	TA	3	6	8509	8514	50 %	50 %	0 %	0 %	203288513
17	NC_011247	TA	3	6	8519	8524	50 %	50 %	0 %	0 %	203288513
18	NC_011247	TA	3	6	8779	8784	50 %	50 %	0 %	0 %	203288513
19	NC_011247	TC	3	6	8923	8928	0 %	50 %	0 %	50 %	203288513
20	NC_011247	TA	3	6	9879	9884	50 %	50 %	0 %	0 %	203288514
21	NC_011247	TA	3	6	11029	11034	50 %	50 %	0 %	0 %	203288515
22	NC_011247	AT	4	8	11132	11139	50 %	50 %	0 %	0 %	203288515
23	NC_011247	TG	3	6	11387	11392	0 %	50 %	50 %	0 %	203288515
24	NC_011247	AC	3	6	12034	12039	50 %	0 %	0 %	50 %	203288516
25	NC_011247	GT	4	8	12098	12105	0 %	50 %	50 %	0 %	203288516
26	NC_011247	TA	3	6	12337	12342	50 %	50 %	0 %	0 %	203288516
27	NC_011247	TA	3	6	12553	12558	50 %	50 %	0 %	0 %	203288516
28	NC_011247	GT	3	6	13287	13292	0 %	50 %	50 %	0 %	203288517
29	NC_011247	TA	3	6	13743	13748	50 %	50 %	0 %	0 %	203288517
30	NC_011247	AC	3	6	14425	14430	50 %	0 %	0 %	50 %	203288518
31	NC_011247	GT	4	8	14489	14496	0 %	50 %	50 %	0 %	203288518
32	NC_011247	TA	3	6	14728	14733	50 %	50 %	0 %	0 %	203288518
33	NC_011247	TA	3	6	14944	14949	50 %	50 %	0 %	0 %	203288518
34	NC_011247	GT	3	6	15688	15693	0 %	50 %	50 %	0 %	203288519
35	NC_011247	TA	3	6	16141	16146	50 %	50 %	0 %	0 %	203288519
36	NC_011247	TA	3	6	18193	18198	50 %	50 %	0 %	0 %	203288521
37	NC_011247	AG	3	6	19077	19082	50 %	0 %	50 %	0 %	203288522
38	NC_011247	TA	3	6	19128	19133	50 %	50 %	0 %	0 %	203288522
39	NC_011247	AG	3	6	20048	20053	50 %	0 %	50 %	0 %	203288523
40	NC_011247	TC	3	6	20121	20126	0 %	50 %	0 %	50 %	203288523
41	NC_011247	AG	3	6	21025	21030	50 %	0 %	50 %	0 %	203288524
42	NC_011247	TA	3	6	22089	22094	50 %	50 %	0 %	0 %	203288526
43	NC_011247	TA	3	6	22301	22306	50 %	50 %	0 %	0 %	203288526
44	NC_011247	AT	3	6	22453	22458	50 %	50 %	0 %	0 %	203288526
45	NC_011247	CT	3	6	23103	23108	0 %	50 %	0 %	50 %	203288527
46	NC_011247	AT	3	6	24324	24329	50 %	50 %	0 %	0 %	203288528
47	NC_011247	TA	3	6	25246	25251	50 %	50 %	0 %	0 %	203288529
48	NC_011247	TA	3	6	25930	25935	50 %	50 %	0 %	0 %	203288530
49	NC_011247	AT	3	6	25972	25977	50 %	50 %	0 %	0 %	203288530
50	NC_011247	CT	3	6	26447	26452	0 %	50 %	0 %	50 %	203288530
51	NC_011247	TA	3	6	27632	27637	50 %	50 %	0 %	0 %	203288531
52	NC_011247	AT	3	6	27647	27652	50 %	50 %	0 %	0 %	203288531
53	NC_011247	AT	3	6	28558	28563	50 %	50 %	0 %	0 %	203288531
54	NC_011247	AT	3	6	29983	29988	50 %	50 %	0 %	0 %	203288532
55	NC_011247	TA	3	6	30407	30412	50 %	50 %	0 %	0 %	203288532
56	NC_011247	TA	3	6	30453	30458	50 %	50 %	0 %	0 %	203288532
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59	NC_011247	AT	3	6	31977	31982	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
60	NC_011247	AT	3	6	32389	32394	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
61	NC_011247	TA	3	6	32401	32406	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
62	NC_011247	TA	3	6	32447	32452	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
63	NC_011247	TA	3	6	32478	32483	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
64	NC_011247	AT	4	8	32903	32910	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
65	NC_011247	AT	5	10	33512	33521	50 %	50 %	0 %	0 %	203288533
66	NC_011247	TA	3	6	34393	34398	50 %	50 %	0 %	0 %	203288534
67	NC_011247	TA	3	6	34439	34444	50 %	50 %	0 %	0 %	203288534
68	NC_011247	TA	3	6	34470	34475	50 %	50 %	0 %	0 %	203288534
69	NC_011247	AT	4	8	34895	34902	50 %	50 %	0 %	0 %	203288534
70	NC_011247	AT	3	6	36800	36805	50 %	50 %	0 %	0 %	203288535
71	NC_011247	TA	3	6	36903	36908	50 %	50 %	0 %	0 %	203288535
72	NC_011247	AT	3	6	37039	37044	50 %	50 %	0 %	0 %	203288535
73	NC_011247	AT	3	6	41019	41024	50 %	50 %	0 %	0 %	203288537
74	NC_011247	AT	4	8	41296	41303	50 %	50 %	0 %	0 %	203288537
75	NC_011247	TA	3	6	41808	41813	50 %	50 %	0 %	0 %	203288538
76	NC_011247	AT	4	8	42106	42113	50 %	50 %	0 %	0 %	203288538
77	NC_011247	TA	3	6	42126	42131	50 %	50 %	0 %	0 %	203288538
78	NC_011247	AT	3	6	42278	42283	50 %	50 %	0 %	0 %	203288538
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80	NC_011247	AT	3	6	43632	43637	50 %	50 %	0 %	0 %	203288540
81	NC_011247	TA	3	6	45664	45669	50 %	50 %	0 %	0 %	203288541
82	NC_011247	AT	3	6	46009	46014	50 %	50 %	0 %	0 %	203288541
83	NC_011247	AT	3	6	46610	46615	50 %	50 %	0 %	0 %	203288542
84	NC_011247	TA	3	6	46681	46686	50 %	50 %	0 %	0 %	203288542
85	NC_011247	AT	3	6	46729	46734	50 %	50 %	0 %	0 %	203288542
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92	NC_011247	AT	3	6	50178	50183	50 %	50 %	0 %	0 %	203288545
93	NC_011247	TA	3	6	50657	50662	50 %	50 %	0 %	0 %	203288545
94	NC_011247	CA	3	6	50913	50918	50 %	0 %	0 %	50 %	203288545
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98	NC_011247	AT	3	6	52699	52704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288547
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104	NC_011247	AT	3	6	55972	55977	50 %	50 %	0 %	0 %	203288549
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107	NC_011247	AT	3	6	60561	60566	50 %	50 %	0 %	0 %	203288552
108	NC_011247	TA	3	6	60744	60749	50 %	50 %	0 %	0 %	203288552
109	NC_011247	AT	3	6	61618	61623	50 %	50 %	0 %	0 %	203288553
110	NC_011247	TA	3	6	61653	61658	50 %	50 %	0 %	0 %	203288553
111	NC_011247	AT	3	6	61877	61882	50 %	50 %	0 %	0 %	203288553
112	NC_011247	AC	3	6	62195	62200	50 %	0 %	0 %	50 %	203288553
113	NC_011247	TA	3	6	62357	62362	50 %	50 %	0 %	0 %	203288553
114	NC_011247	AC	4	8	62948	62955	50 %	0 %	0 %	50 %	203288554
115	NC_011247	AC	3	6	63421	63426	50 %	0 %	0 %	50 %	203288554
116	NC_011247	TA	3	6	63456	63461	50 %	50 %	0 %	0 %	203288554
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119	NC_011247	AT	3	6	64723	64728	50 %	50 %	0 %	0 %	203288555
120	NC_011247	AT	3	6	65067	65072	50 %	50 %	0 %	0 %	203288556
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122	NC_011247	AT	3	6	65192	65197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288556
123	NC_011247	TA	3	6	65247	65252	50 %	50 %	0 %	0 %	203288556
124	NC_011247	AT	3	6	66056	66061	50 %	50 %	0 %	0 %	203288557
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.