MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	ATTAGA	2	12	150	161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288273
2	NC_011246	AAAAAG	2	12	278	289	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203288273
3	NC_011246	TTAGAG	2	12	409	420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288273
4	NC_011246	TTTGTT	2	12	8385	8396	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	203288280
5	NC_011246	CAAGCC	2	12	9142	9153	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288281
6	NC_011246	ATAGTA	2	12	14950	14961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288283
7	NC_011246	GCCTTG	2	12	25681	25692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288289
8	NC_011246	CTCTTA	2	12	25751	25762	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288289
9	NC_011246	TATCAT	2	12	26227	26238	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288290
10	NC_011246	ATTATA	2	12	28418	28429	50 %	50 %	0 %	0 %	203288292
11	NC_011246	TATCTC	2	12	37217	37228	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203288298
12	NC_011246	AAATTA	2	12	38417	38428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288300
13	NC_011246	CTCATA	2	12	39949	39960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288302
14	NC_011246	TCAAAA	2	12	40955	40966	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288303
15	NC_011246	CTTTAT	2	12	45586	45597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288307
16	NC_011246	CAGCAC	2	12	49497	49508	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	203288310
17	NC_011246	TTAAAT	2	12	49961	49972	50 %	50 %	0 %	0 %	203288310
18	NC_011246	ATATTC	2	12	52230	52241	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288313
19	NC_011246	TTCTTT	2	12	54051	54062	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203288315
20	NC_011246	ATTAAC	2	12	57824	57835	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288318
21	NC_011246	AAAATC	2	12	58931	58942	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203288319
22	NC_011246	CATTTA	2	12	58978	58989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203288319
23	NC_011246	AAATTT	2	12	59217	59228	50 %	50 %	0 %	0 %	203288319
24	NC_011246	TTGGAA	2	12	60494	60505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288322
25	NC_011246	TTAAAT	2	12	61938	61949	50 %	50 %	0 %	0 %	203288324
26	NC_011246	ATATTA	2	12	63696	63707	50 %	50 %	0 %	0 %	203288327
27	NC_011246	AAACAG	2	12	67474	67485	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	203288328
28	NC_011246	ATCTTT	2	12	67790	67801	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203288328
29	NC_011246	TATGCA	2	12	75768	75779	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203288332
30	NC_011246	TAATAT	2	12	79407	79418	50 %	50 %	0 %	0 %	203288334
31	NC_011246	ACTTAA	2	12	80530	80541	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203288334
32	NC_011246	TTAAAA	2	12	82232	82243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288335
33	NC_011246	AAATAA	2	12	84995	85006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288338
34	NC_011246	AAAATA	2	12	85063	85074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288338
35	NC_011246	AAATAA	2	12	86059	86070	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203288339
36	NC_011246	GAAAAT	2	12	87166	87177	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	203288340
37	NC_011246	ATGTCT	2	12	97690	97701	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203288351
38	NC_011246	TGATAT	2	12	99537	99548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203288352
39	NC_011246	TAGTGA	2	12	100894	100905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288353
40	NC_011246	AATTTT	2	12	103535	103546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288354
41	NC_011246	TTGAAA	2	12	103899	103910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203288354
42	NC_011246	ATGGGT	2	12	111285	111296	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	203288356
43	NC_011246	TTCCTG	2	12	115474	115485	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	203288358
44	NC_011246	AGATGA	2	12	116780	116791	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	203288359
45	NC_011246	GATGTT	2	12	120398	120409	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	203288362

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.