MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	ATAAA	2	10	9014	9023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011246	TTACA	2	10	12199	12208	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011246	ATATA	3	15	12316	12330	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011246	TCAAA	2	10	13588	13597	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011246	AATAT	2	10	15118	15127	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011246	AAATA	2	10	15382	15391	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011246	ATTAA	2	10	16460	16469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011246	TAAAA	2	10	16566	16575	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011246	TTAAA	2	10	19240	19249	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011246	TAAAG	2	10	20368	20377	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011246	TAATA	2	10	22268	22277	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011246	CTTTT	2	10	24621	24630	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011246	ATTAA	2	10	25973	25982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011246	TAATT	2	10	25999	26008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011246	ATACC	2	10	29632	29641	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_011246	TATAA	2	10	29978	29987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011246	TATAA	2	10	34712	34721	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011246	ATCAC	2	10	34749	34758	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_011246	ATATG	2	10	36197	36206	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011246	TAAAT	2	10	36217	36226	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011246	CAAAA	2	10	37591	37600	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_011246	AATAT	2	10	38315	38324	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011246	AAAAT	2	10	38378	38387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011246	CTAAA	2	10	42202	42211	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011246	TATTT	2	10	42507	42516	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011246	AAAAC	2	10	42845	42854	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011246	ATTAA	2	10	44074	44083	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011246	TCAAA	2	10	46095	46104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011246	AATTT	2	10	46904	46913	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011246	ATTTA	2	10	51737	51746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011246	TAAAT	2	10	51795	51804	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011246	ATACA	2	10	51844	51853	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011246	AAATT	2	10	54672	54681	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011246	ATTAT	2	10	57452	57461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011246	TTAAC	2	10	64752	64761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011246	TTTTA	2	10	64842	64851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011246	ATTTA	2	10	65225	65234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011246	ATCTT	2	10	65425	65434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011246	TAAAA	2	10	65943	65952	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011246	TAATT	2	10	66368	66377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011246	TAAAT	2	10	66549	66558	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011246	TTAAT	2	10	68296	68305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011246	ATTTA	2	10	69575	69584	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011246	ATAAA	2	10	69680	69689	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011246	TATAT	2	10	70594	70603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011246	TTAAA	2	10	70922	70931	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011246	ATTAT	2	10	70962	70971	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011246	AACAA	2	10	71234	71243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_011246	TTAAA	2	10	72203	72212	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011246	TTATC	2	10	74201	74210	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011246	TAGTA	2	10	74249	74258	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011246	AATAA	2	10	76179	76188	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011246	AAAAC	2	10	78926	78935	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011246	AAAAT	2	10	78986	78995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011246	AAAAT	2	10	82688	82697	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011246	ATTAA	2	10	86276	86285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011246	CTACA	2	10	86304	86313	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_011246	AGATT	2	10	86626	86635	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011246	TTTTA	2	10	87624	87633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011246	TAATT	2	10	89639	89648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011246	TAATA	2	10	89855	89864	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011246	CTTTA	2	10	98078	98087	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011246	CTTTT	2	10	98274	98283	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_011246	TTTTG	2	10	99158	99167	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011246	TTAAT	2	10	100243	100252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011246	ATATA	2	10	101834	101843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011246	ATATT	2	10	102342	102351	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011246	AAAGA	2	10	102614	102623	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011246	TAATT	2	10	105003	105012	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011246	TTCAT	2	10	105396	105405	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011246	TTAAT	2	10	105592	105601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011246	TAAAT	2	10	106170	106179	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011246	TTTTG	2	10	108253	108262	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011246	TTAAT	2	10	108319	108328	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011246	ATAAG	2	10	113988	113997	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011246	ATTTT	2	10	116026	116035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011246	ATTTA	2	10	117549	117558	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011246	AATTT	2	10	121254	121263	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011246	AAAAT	2	10	123871	123880	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.