MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 100

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	AAATA	2	10	1296	1305	80 %	20 %	0 %	0 %	203288274
2	NC_011246	ATTTA	2	10	3723	3732	40 %	60 %	0 %	0 %	203288276
3	NC_011246	CTTTA	2	10	3765	3774	20 %	60 %	0 %	20 %	203288276
4	NC_011246	AATTA	2	10	4343	4352	60 %	40 %	0 %	0 %	203288277
5	NC_011246	AAATT	2	10	5684	5693	60 %	40 %	0 %	0 %	203288278
6	NC_011246	ATGTA	2	10	10041	10050	40 %	40 %	20 %	0 %	203288281
7	NC_011246	TCTCT	2	10	11515	11524	0 %	60 %	0 %	40 %	203288282
8	NC_011246	CATAT	2	10	11624	11633	40 %	40 %	0 %	20 %	203288282
9	NC_011246	AAATC	2	10	11881	11890	60 %	20 %	0 %	20 %	203288282
10	NC_011246	AATTT	2	10	15882	15891	40 %	60 %	0 %	0 %	203288284
11	NC_011246	AACAT	2	10	16417	16426	60 %	20 %	0 %	20 %	203288284
12	NC_011246	AAATG	2	10	19032	19041	60 %	20 %	20 %	0 %	203288285
13	NC_011246	CAATA	2	10	23481	23490	60 %	20 %	0 %	20 %	203288288
14	NC_011246	CATAT	2	10	26585	26594	40 %	40 %	0 %	20 %	203288290
15	NC_011246	TAAAA	2	10	27782	27791	80 %	20 %	0 %	0 %	203288291
16	NC_011246	AAACT	2	10	28634	28643	60 %	20 %	0 %	20 %	203288293
17	NC_011246	TAAAC	2	10	28685	28694	60 %	20 %	0 %	20 %	203288293
18	NC_011246	TAACA	2	10	28874	28883	60 %	20 %	0 %	20 %	203288293
19	NC_011246	TTTAA	2	10	31471	31480	40 %	60 %	0 %	0 %	203288294
20	NC_011246	CAAAA	2	10	32333	32342	80 %	0 %	0 %	20 %	203288294
21	NC_011246	AATGA	2	10	32944	32953	60 %	20 %	20 %	0 %	203288295
22	NC_011246	TAGCA	2	10	33596	33605	40 %	20 %	20 %	20 %	203288296
23	NC_011246	AAATA	2	10	34605	34614	80 %	20 %	0 %	0 %	203288296
24	NC_011246	AAAAT	2	10	35458	35467	80 %	20 %	0 %	0 %	203288297
25	NC_011246	TTTAA	2	10	35536	35545	40 %	60 %	0 %	0 %	203288297
26	NC_011246	AAGAT	2	10	35720	35729	60 %	20 %	20 %	0 %	203288297
27	NC_011246	AAATA	2	10	36900	36909	80 %	20 %	0 %	0 %	203288298
28	NC_011246	TGAAT	2	10	37162	37171	40 %	40 %	20 %	0 %	203288298
29	NC_011246	ATATC	2	10	37285	37294	40 %	40 %	0 %	20 %	203288298
30	NC_011246	TTTCA	2	10	37461	37470	20 %	60 %	0 %	20 %	203288298
31	NC_011246	TGAAT	2	10	37924	37933	40 %	40 %	20 %	0 %	203288299
32	NC_011246	ACCTA	2	10	38025	38034	40 %	20 %	0 %	40 %	203288299
33	NC_011246	TCTTT	2	10	39766	39775	0 %	80 %	0 %	20 %	203288302
34	NC_011246	ATTTA	2	10	43681	43690	40 %	60 %	0 %	0 %	203288305
35	NC_011246	ATTAA	2	10	47526	47535	60 %	40 %	0 %	0 %	203288309
36	NC_011246	AATAA	2	10	47599	47608	80 %	20 %	0 %	0 %	203288309
37	NC_011246	ACTTC	2	10	48620	48629	20 %	40 %	0 %	40 %	203288310
38	NC_011246	ATTTT	2	10	48815	48824	20 %	80 %	0 %	0 %	203288310
39	NC_011246	ATCTG	2	10	49523	49532	20 %	40 %	20 %	20 %	203288310
40	NC_011246	ATTAA	2	10	50301	50310	60 %	40 %	0 %	0 %	203288311
41	NC_011246	ATCAT	2	10	50967	50976	40 %	40 %	0 %	20 %	203288312
42	NC_011246	AGACA	2	10	52569	52578	60 %	0 %	20 %	20 %	203288313
43	NC_011246	TCTTG	2	10	56677	56686	0 %	60 %	20 %	20 %	203288317
44	NC_011246	AAAAT	2	10	57386	57395	80 %	20 %	0 %	0 %	203288317
45	NC_011246	TCTTT	2	10	58570	58579	0 %	80 %	0 %	20 %	203288319
46	NC_011246	AATTA	2	10	59144	59153	60 %	40 %	0 %	0 %	203288319
47	NC_011246	CTTGA	2	10	60101	60110	20 %	40 %	20 %	20 %	203288321
48	NC_011246	TAAAT	2	10	60453	60462	60 %	40 %	0 %	0 %	203288322
49	NC_011246	AACAC	2	10	60684	60693	60 %	0 %	0 %	40 %	203288323
50	NC_011246	GTAAT	2	10	61111	61120	40 %	40 %	20 %	0 %	203288323
51	NC_011246	TATTT	2	10	61760	61769	20 %	80 %	0 %	0 %	203288324
52	NC_011246	AAAAG	2	10	62041	62050	80 %	0 %	20 %	0 %	203288324
53	NC_011246	ATGCA	2	10	62799	62808	40 %	20 %	20 %	20 %	203288326
54	NC_011246	AATAA	2	10	62907	62916	80 %	20 %	0 %	0 %	203288326
55	NC_011246	AAATT	2	10	63004	63013	60 %	40 %	0 %	0 %	203288326
56	NC_011246	CACCT	2	10	67625	67634	20 %	20 %	0 %	60 %	203288328
57	NC_011246	AAAAC	2	10	68406	68415	80 %	0 %	0 %	20 %	203288329
58	NC_011246	CAACA	2	10	68458	68467	60 %	0 %	0 %	40 %	203288329
59	NC_011246	AAATA	2	10	69089	69098	80 %	20 %	0 %	0 %	203288329
60	NC_011246	TCAAT	2	10	69894	69903	40 %	40 %	0 %	20 %	203288330
61	NC_011246	AAAAT	2	10	72245	72254	80 %	20 %	0 %	0 %	203288331
62	NC_011246	ATAAA	2	10	73031	73040	80 %	20 %	0 %	0 %	203288331
63	NC_011246	AAACA	2	10	73180	73189	80 %	0 %	0 %	20 %	203288331
64	NC_011246	TTATA	2	10	73632	73641	40 %	60 %	0 %	0 %	203288331
65	NC_011246	TAAAT	2	10	75968	75977	60 %	40 %	0 %	0 %	203288332
66	NC_011246	TTCAA	2	10	76380	76389	40 %	40 %	0 %	20 %	203288333
67	NC_011246	TAAAT	2	10	77534	77543	60 %	40 %	0 %	0 %	203288333
68	NC_011246	TGTAC	2	10	81875	81884	20 %	40 %	20 %	20 %	203288335
69	NC_011246	AATTA	2	10	82459	82468	60 %	40 %	0 %	0 %	203288335
70	NC_011246	TAATA	2	10	83290	83299	60 %	40 %	0 %	0 %	203288336
71	NC_011246	ATAAA	2	10	84466	84475	80 %	20 %	0 %	0 %	203288338
72	NC_011246	CTCTT	2	10	84637	84646	0 %	60 %	0 %	40 %	203288338
73	NC_011246	AATAA	2	10	84735	84744	80 %	20 %	0 %	0 %	203288338
74	NC_011246	TAAAA	2	10	85049	85058	80 %	20 %	0 %	0 %	203288338
75	NC_011246	AAAAT	2	10	85797	85806	80 %	20 %	0 %	0 %	203288339
76	NC_011246	TAAAA	2	10	86113	86122	80 %	20 %	0 %	0 %	203288339
77	NC_011246	TAAAA	2	10	87305	87314	80 %	20 %	0 %	0 %	203288340
78	NC_011246	AAGTA	2	10	88713	88722	60 %	20 %	20 %	0 %	203288341
79	NC_011246	TTTAA	2	10	89083	89092	40 %	60 %	0 %	0 %	203288342
80	NC_011246	TTCAT	2	10	89113	89122	20 %	60 %	0 %	20 %	203288342
81	NC_011246	ATCCC	2	10	92776	92785	20 %	20 %	0 %	60 %	203288346
82	NC_011246	TCTTT	2	10	93103	93112	0 %	80 %	0 %	20 %	203288346
83	NC_011246	ATTGT	2	10	95143	95152	20 %	60 %	20 %	0 %	203288349
84	NC_011246	ATATT	2	10	97513	97522	40 %	60 %	0 %	0 %	203288350
85	NC_011246	GTTTT	2	10	100568	100577	0 %	80 %	20 %	0 %	203288353
86	NC_011246	ATTTG	2	10	100726	100735	20 %	60 %	20 %	0 %	203288353
87	NC_011246	GAGAA	2	10	100779	100788	60 %	0 %	40 %	0 %	203288353
88	NC_011246	TGTTT	2	10	101359	101368	0 %	80 %	20 %	0 %	203288353
89	NC_011246	TTTTA	2	10	103141	103150	20 %	80 %	0 %	0 %	203288354
90	NC_011246	ATTTT	2	10	103266	103275	20 %	80 %	0 %	0 %	203288354
91	NC_011246	TATTC	2	10	112254	112263	20 %	60 %	0 %	20 %	203288356
92	NC_011246	TATCT	2	10	112401	112410	20 %	60 %	0 %	20 %	203288356
93	NC_011246	TGTAG	2	10	116268	116277	20 %	40 %	40 %	0 %	203288359
94	NC_011246	GTTTT	2	10	117080	117089	0 %	80 %	20 %	0 %	203288359
95	NC_011246	AAATT	2	10	117266	117275	60 %	40 %	0 %	0 %	203288360
96	NC_011246	ATTTA	2	10	118565	118574	40 %	60 %	0 %	0 %	203288361
97	NC_011246	GAAGA	2	10	118971	118980	60 %	0 %	40 %	0 %	203288361
98	NC_011246	AAGAT	2	10	119314	119323	60 %	20 %	20 %	0 %	203288361
99	NC_011246	GGTAA	2	10	120956	120965	40 %	20 %	40 %	0 %	203288362
100	NC_011246	TGGGA	2	10	121003	121012	20 %	20 %	60 %	0 %	203288362

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.