MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	AAAC	2	8	96	103	75 %	0 %	0 %	25 %	203288273
2	NC_011246	ACAG	2	8	570	577	50 %	0 %	25 %	25 %	203288273
3	NC_011246	TGAA	2	8	779	786	50 %	25 %	25 %	0 %	203288274
4	NC_011246	ATTA	2	8	1621	1628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011246	ATTA	2	8	1677	1684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011246	ATTA	2	8	1708	1715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011246	TAAT	2	8	1784	1791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011246	TAAT	2	8	1794	1801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011246	AAAG	2	8	2049	2056	75 %	0 %	25 %	0 %	203288275
10	NC_011246	ATGA	2	8	2283	2290	50 %	25 %	25 %	0 %	203288275
11	NC_011246	TAAT	2	8	2419	2426	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
12	NC_011246	TGAA	2	8	2656	2663	50 %	25 %	25 %	0 %	203288275
13	NC_011246	CAAA	2	8	3533	3540	75 %	0 %	0 %	25 %	203288276
14	NC_011246	AAAT	2	8	3783	3790	75 %	25 %	0 %	0 %	203288276
15	NC_011246	TCTA	2	8	4196	4203	25 %	50 %	0 %	25 %	203288277
16	NC_011246	ATCT	2	8	5006	5013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011246	ATTT	2	8	5083	5090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011246	AATT	2	8	5982	5989	50 %	50 %	0 %	0 %	203288278
19	NC_011246	TTAA	2	8	6238	6245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011246	ATTA	2	8	6251	6258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011246	GCCT	2	8	6289	6296	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011246	TAAT	2	8	6308	6315	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011246	AAAT	2	8	6468	6475	75 %	25 %	0 %	0 %	203288279
24	NC_011246	ATTT	2	8	7525	7532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011246	TTAT	2	8	7691	7698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011246	ACAA	2	8	7708	7715	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011246	ACTC	2	8	7959	7966	25 %	25 %	0 %	50 %	203288280
28	NC_011246	ATTT	2	8	8907	8914	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011246	ATTA	2	8	8969	8976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011246	TCAT	2	8	9465	9472	25 %	50 %	0 %	25 %	203288281
31	NC_011246	ACAT	2	8	10107	10114	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_011246	TAAT	2	8	10169	10176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011246	TTCA	2	8	10497	10504	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011246	ATCA	2	8	10623	10630	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_011246	TATT	2	8	11116	11123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011246	ATTT	2	8	12162	12169	25 %	75 %	0 %	0 %	203288282
37	NC_011246	CTTT	2	8	12173	12180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_011246	AATC	2	8	12334	12341	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_011246	TAAT	2	8	12342	12349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011246	ATTT	2	8	12402	12409	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011246	TAAT	2	8	12753	12760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011246	AAGA	2	8	12956	12963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011246	AGTA	2	8	13431	13438	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011246	GATA	2	8	13789	13796	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011246	CAAG	2	8	13805	13812	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011246	ATTA	3	12	14181	14192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011246	TTCA	2	8	14224	14231	25 %	50 %	0 %	25 %	203288283
48	NC_011246	ATTC	2	8	14269	14276	25 %	50 %	0 %	25 %	203288283
49	NC_011246	AAGC	2	8	14435	14442	50 %	0 %	25 %	25 %	203288283
50	NC_011246	TGAA	2	8	15496	15503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011246	TAAA	2	8	15533	15540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011246	TCTT	3	12	16324	16335	0 %	75 %	0 %	25 %	203288284
53	NC_011246	ATTA	2	8	16594	16601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011246	ATTA	2	8	16645	16652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011246	CAAA	2	8	16984	16991	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_011246	CAAA	2	8	17319	17326	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011246	ATTA	2	8	17777	17784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011246	ATCA	2	8	17877	17884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011246	AAAT	2	8	18056	18063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011246	ATTT	2	8	18099	18106	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011246	GAAA	2	8	18414	18421	75 %	0 %	25 %	0 %	203288285
62	NC_011246	AAAT	2	8	18785	18792	75 %	25 %	0 %	0 %	203288285
63	NC_011246	AAGA	2	8	18922	18929	75 %	0 %	25 %	0 %	203288285
64	NC_011246	TTGA	2	8	19081	19088	25 %	50 %	25 %	0 %	203288285
65	NC_011246	CAAT	2	8	19173	19180	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011246	TAAT	2	8	19272	19279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011246	TAAA	2	8	19307	19314	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011246	TTTA	2	8	19318	19325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011246	TTAT	2	8	19326	19333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011246	ATTA	2	8	19445	19452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011246	AAAT	2	8	19717	19724	75 %	25 %	0 %	0 %	203288286
72	NC_011246	TTTA	2	8	19765	19772	25 %	75 %	0 %	0 %	203288286
73	NC_011246	CTAA	2	8	20509	20516	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011246	ATAA	2	8	20589	20596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011246	ATTT	2	8	20706	20713	25 %	75 %	0 %	0 %	203288287
76	NC_011246	GTAA	2	8	20743	20750	50 %	25 %	25 %	0 %	203288287
77	NC_011246	TCAA	2	8	20794	20801	50 %	25 %	0 %	25 %	203288287
78	NC_011246	TAAA	2	8	20813	20820	75 %	25 %	0 %	0 %	203288287
79	NC_011246	TTAC	2	8	20966	20973	25 %	50 %	0 %	25 %	203288287
80	NC_011246	CTAT	2	8	20996	21003	25 %	50 %	0 %	25 %	203288287
81	NC_011246	AATT	2	8	21104	21111	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
82	NC_011246	TAAT	2	8	21299	21306	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
83	NC_011246	GAAT	2	8	21426	21433	50 %	25 %	25 %	0 %	203288287
84	NC_011246	ATTT	2	8	21597	21604	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011246	TTAA	2	8	21617	21624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011246	AAAT	2	8	22618	22625	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011246	ATTT	2	8	23018	23025	25 %	75 %	0 %	0 %	203288288
88	NC_011246	AAGC	2	8	23126	23133	50 %	0 %	25 %	25 %	203288288
89	NC_011246	ATTA	2	8	23445	23452	50 %	50 %	0 %	0 %	203288288
90	NC_011246	CATT	2	8	23588	23595	25 %	50 %	0 %	25 %	203288288
91	NC_011246	ATAA	2	8	23904	23911	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011246	TAAT	2	8	23929	23936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011246	TCTT	2	8	23958	23965	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011246	AATA	2	8	24001	24008	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011246	CAAA	2	8	24073	24080	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_011246	TAAA	2	8	24195	24202	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011246	ATTT	2	8	24441	24448	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011246	AATA	2	8	24954	24961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011246	TACT	2	8	25227	25234	25 %	50 %	0 %	25 %	203288289
100	NC_011246	TTAA	2	8	26325	26332	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
101	NC_011246	AAAT	2	8	26840	26847	75 %	25 %	0 %	0 %	203288290
102	NC_011246	CCCT	2	8	26897	26904	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
103	NC_011246	ATAA	2	8	27122	27129	75 %	25 %	0 %	0 %	203288291
104	NC_011246	TATT	2	8	27853	27860	25 %	75 %	0 %	0 %	203288292
105	NC_011246	TAAA	2	8	28138	28145	75 %	25 %	0 %	0 %	203288292
106	NC_011246	CATT	2	8	28591	28598	25 %	50 %	0 %	25 %	203288292
107	NC_011246	TTTA	2	8	28664	28671	25 %	75 %	0 %	0 %	203288293
108	NC_011246	CATA	2	8	29396	29403	50 %	25 %	0 %	25 %	203288293
109	NC_011246	TTCA	2	8	29409	29416	25 %	50 %	0 %	25 %	203288293
110	NC_011246	ATAA	2	8	29648	29655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011246	TAAA	2	8	29701	29708	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011246	GTTA	2	8	29756	29763	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011246	CATA	2	8	29847	29854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011246	TAAT	2	8	30111	30118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011246	ATGC	2	8	30265	30272	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011246	GTTT	2	8	30309	30316	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011246	TATT	2	8	30362	30369	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011246	TAAA	2	8	30541	30548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011246	ACTT	2	8	30880	30887	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_011246	TGTT	2	8	31130	31137	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011246	TGAT	2	8	31178	31185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011246	ACCA	2	8	31304	31311	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011246	ATTT	2	8	31584	31591	25 %	75 %	0 %	0 %	203288294
124	NC_011246	AGCA	2	8	31819	31826	50 %	0 %	25 %	25 %	203288294
125	NC_011246	TTTA	2	8	32077	32084	25 %	75 %	0 %	0 %	203288294
126	NC_011246	TAAT	2	8	32400	32407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011246	TAAA	2	8	32557	32564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011246	AACA	2	8	33529	33536	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011246	TAAA	2	8	34070	34077	75 %	25 %	0 %	0 %	203288296
130	NC_011246	TCCT	2	8	34641	34648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011246	TATT	2	8	34725	34732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011246	ATTT	2	8	34969	34976	25 %	75 %	0 %	0 %	203288297
133	NC_011246	TAAT	2	8	35156	35163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
134	NC_011246	AATC	2	8	36542	36549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_011246	TACT	2	8	36596	36603	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011246	CAAC	2	8	36881	36888	50 %	0 %	0 %	50 %	203288298
137	NC_011246	TTTA	2	8	37134	37141	25 %	75 %	0 %	0 %	203288298
138	NC_011246	TACA	2	8	37518	37525	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_011246	AATT	2	8	37534	37541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011246	AACT	2	8	37644	37651	50 %	25 %	0 %	25 %	203288299
141	NC_011246	ATAA	2	8	37836	37843	75 %	25 %	0 %	0 %	203288299
142	NC_011246	TTTG	2	8	37891	37898	0 %	75 %	25 %	0 %	203288299
143	NC_011246	TGAT	2	8	38085	38092	25 %	50 %	25 %	0 %	203288299
144	NC_011246	AATA	2	8	38093	38100	75 %	25 %	0 %	0 %	203288299
145	NC_011246	AAAT	2	8	38150	38157	75 %	25 %	0 %	0 %	203288299
146	NC_011246	CAAT	2	8	38192	38199	50 %	25 %	0 %	25 %	203288299
147	NC_011246	CTAT	2	8	38264	38271	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_011246	TTCA	2	8	38441	38448	25 %	50 %	0 %	25 %	203288300
149	NC_011246	GCTT	2	8	39557	39564	0 %	50 %	25 %	25 %	203288302
150	NC_011246	TCTT	2	8	40408	40415	0 %	75 %	0 %	25 %	203288302
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440	NC_011246	TAAT	2	8	122540	122547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_011246	ATTG	2	8	122905	122912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
442	NC_011246	TTAA	2	8	123021	123028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
443	NC_011246	CTTT	2	8	123572	123579	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
444	NC_011246	TAAA	2	8	123650	123657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
445	NC_011246	ATAA	2	8	123919	123926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.