MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 1284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	GAA	2	6	27	32	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
2	NC_011246	CAA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
3	NC_011246	AAG	2	6	173	178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
4	NC_011246	AAG	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
5	NC_011246	CAA	2	6	211	216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
6	NC_011246	AAG	2	6	251	256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
7	NC_011246	AAG	2	6	293	298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
8	NC_011246	AAG	2	6	353	358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
9	NC_011246	AAG	2	6	380	385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
10	NC_011246	AAT	2	6	441	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
11	NC_011246	AGA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
12	NC_011246	AGA	2	6	465	470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
13	NC_011246	ATT	2	6	483	488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
14	NC_011246	AAG	4	12	497	508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
15	NC_011246	AGA	2	6	516	521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
16	NC_011246	ATA	2	6	527	532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288273
17	NC_011246	AGA	2	6	549	554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
18	NC_011246	AGA	2	6	558	563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
19	NC_011246	GAA	3	9	583	591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
20	NC_011246	ACA	2	6	597	602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
21	NC_011246	CAA	2	6	607	612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288273
22	NC_011246	GAA	3	9	613	621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288273
23	NC_011246	ATT	2	6	627	632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288273
24	NC_011246	GAG	2	6	640	645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	203288273
25	NC_011246	ATT	2	6	720	725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
26	NC_011246	TAG	2	6	810	815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
27	NC_011246	ATA	2	6	818	823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
28	NC_011246	ACA	2	6	830	835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
29	NC_011246	CCT	2	6	872	877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288274
30	NC_011246	TGC	2	6	972	977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288274
31	NC_011246	ATA	2	6	989	994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
32	NC_011246	ATT	2	6	1014	1019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
33	NC_011246	TAT	2	6	1069	1074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
34	NC_011246	GAT	2	6	1186	1191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
35	NC_011246	CAA	2	6	1226	1231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
36	NC_011246	AGA	2	6	1233	1238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
37	NC_011246	AGA	2	6	1359	1364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288274
38	NC_011246	ATG	3	9	1391	1399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288274
39	NC_011246	CAA	2	6	1405	1410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288274
40	NC_011246	ATT	2	6	1430	1435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288274
41	NC_011246	AAT	2	6	1464	1469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288274
42	NC_011246	ATG	2	6	1929	1934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
43	NC_011246	TAT	2	6	1951	1956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
44	NC_011246	GAA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
45	NC_011246	ATA	3	9	2080	2088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
46	NC_011246	GAA	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
47	NC_011246	TTG	2	6	2106	2111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288275
48	NC_011246	CAA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
49	NC_011246	TAG	2	6	2170	2175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
50	NC_011246	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
51	NC_011246	TAA	2	6	2204	2209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
52	NC_011246	AAG	2	6	2296	2301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288275
53	NC_011246	ATT	2	6	2348	2353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
54	NC_011246	GAT	2	6	2376	2381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
55	NC_011246	AAT	2	6	2390	2395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
56	NC_011246	TAG	2	6	2408	2413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
57	NC_011246	ATA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
58	NC_011246	AAT	2	6	2636	2641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
59	NC_011246	ATA	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
60	NC_011246	TAA	2	6	2783	2788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288275
61	NC_011246	GTA	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288275
62	NC_011246	CTG	2	6	2895	2900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288275
63	NC_011246	AAC	2	6	2916	2921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288275
64	NC_011246	ATT	2	6	2922	2927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288275
65	NC_011246	CTT	2	6	2929	2934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288275
66	NC_011246	TTC	2	6	3240	3245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
67	NC_011246	AAT	2	6	3252	3257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
68	NC_011246	TAT	2	6	3272	3277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288276
69	NC_011246	TGG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288276
70	NC_011246	TAG	2	6	3584	3589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288276
71	NC_011246	CTT	2	6	3689	3694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288276
72	NC_011246	AAT	2	6	3813	3818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288276
73	NC_011246	ATT	2	6	4106	4111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
74	NC_011246	TAC	2	6	4132	4137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
75	NC_011246	TGC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203288277
76	NC_011246	TAT	2	6	4235	4240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
77	NC_011246	TAA	2	6	4309	4314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
78	NC_011246	ACT	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
79	NC_011246	TAC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
80	NC_011246	AAC	2	6	4436	4441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288277
81	NC_011246	TAG	2	6	4558	4563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203288277
82	NC_011246	TCA	2	6	4596	4601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288277
83	NC_011246	TAA	2	6	4730	4735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288277
84	NC_011246	ATT	3	9	4742	4750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
85	NC_011246	TAT	2	6	4751	4756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288277
86	NC_011246	TTG	2	6	5251	5256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288278
87	NC_011246	ATA	2	6	5501	5506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
88	NC_011246	TTC	2	6	5566	5571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288278
89	NC_011246	ATT	2	6	5656	5661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288278
90	NC_011246	TAA	2	6	5741	5746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
91	NC_011246	CAT	2	6	5784	5789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288278
92	NC_011246	ACC	3	9	5884	5892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288278
93	NC_011246	CCT	2	6	5921	5926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288278
94	NC_011246	CCA	2	6	5946	5951	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203288278
95	NC_011246	ATC	2	6	5956	5961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288278
96	NC_011246	TAT	2	6	6033	6038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288278
97	NC_011246	TCC	2	6	6046	6051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288278
98	NC_011246	ACA	2	6	6061	6066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288278
99	NC_011246	TAA	2	6	6073	6078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288278
100	NC_011246	CTC	2	6	6360	6365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203288279
101	NC_011246	TAA	2	6	6476	6481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
102	NC_011246	TAA	2	6	6497	6502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
103	NC_011246	TAA	2	6	6548	6553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
104	NC_011246	CTA	2	6	6557	6562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288279
105	NC_011246	TAA	2	6	6824	6829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
106	NC_011246	ATT	2	6	6840	6845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
107	NC_011246	ATT	2	6	6888	6893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288279
108	NC_011246	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288279
109	NC_011246	AAT	2	6	6926	6931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288279
110	NC_011246	TTC	2	6	6979	6984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288279
111	NC_011246	TCT	3	9	6997	7005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288279
112	NC_011246	CTT	3	9	7019	7027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288279
113	NC_011246	TGT	2	6	7131	7136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203288279
114	NC_011246	ATC	2	6	7215	7220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288279
115	NC_011246	GAC	2	6	7255	7260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203288279
116	NC_011246	ACA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288279
117	NC_011246	AGA	2	6	7792	7797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203288280
118	NC_011246	CTT	2	6	7839	7844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288280
119	NC_011246	CAA	2	6	7872	7877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288280
120	NC_011246	CAA	2	6	7929	7934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288280
121	NC_011246	TTC	2	6	8030	8035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288280
122	NC_011246	TCA	2	6	8051	8056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288280
123	NC_011246	ATT	2	6	8233	8238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288280
124	NC_011246	CTA	2	6	8249	8254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288280
125	NC_011246	TAA	2	6	8318	8323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203288280
126	NC_011246	CAT	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288280
127	NC_011246	TCA	2	6	8420	8425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203288280
128	NC_011246	ACA	2	6	8426	8431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203288280
129	NC_011246	TCT	2	6	8439	8444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288280
130	NC_011246	GGT	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	203288280
131	NC_011246	TTA	2	6	8591	8596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288280
132	NC_011246	TTC	2	6	8629	8634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203288280
133	NC_011246	TAT	2	6	8643	8648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203288280
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