MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 381

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	AT	3	6	1003	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
2	NC_011246	AT	3	6	1033	1038	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
3	NC_011246	TA	3	6	1136	1141	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
4	NC_011246	AT	4	8	1190	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
5	NC_011246	AT	3	6	1269	1274	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
6	NC_011246	AT	3	6	1654	1659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011246	AT	3	6	1722	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011246	TA	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
9	NC_011246	AG	3	6	2523	2528	50 %	0 %	50 %	0 %	203288275
10	NC_011246	AT	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
11	NC_011246	AT	4	8	2823	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
12	NC_011246	TA	3	6	3335	3340	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
13	NC_011246	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
14	NC_011246	AT	4	8	3633	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
15	NC_011246	TA	3	6	3653	3658	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
16	NC_011246	AT	3	6	3805	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
17	NC_011246	TA	3	6	3864	3869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011246	AT	3	6	3975	3980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011246	TA	4	8	3992	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011246	CA	3	6	4115	4120	50 %	0 %	0 %	50 %	203288277
21	NC_011246	TA	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	203288277
22	NC_011246	AT	3	6	4897	4902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011246	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288278
24	NC_011246	AT	3	6	6189	6194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011246	AT	3	6	6272	6277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011246	AT	3	6	6777	6782	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
27	NC_011246	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
28	NC_011246	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
29	NC_011246	AC	3	6	7355	7360	50 %	0 %	0 %	50 %	203288279
30	NC_011246	AT	3	6	7457	7462	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011246	CT	3	6	7573	7578	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011246	TA	3	6	8990	8995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011246	CA	3	6	9502	9507	50 %	0 %	0 %	50 %	203288281
34	NC_011246	TC	3	6	9812	9817	0 %	50 %	0 %	50 %	203288281
35	NC_011246	AT	3	6	10227	10232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011246	CA	3	6	10335	10340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011246	AT	3	6	10350	10355	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011246	TA	3	6	10828	10833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011246	CA	3	6	11084	11089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011246	AT	3	6	11360	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	203288282
41	NC_011246	TA	4	8	11755	11762	50 %	50 %	0 %	0 %	203288282
42	NC_011246	AC	3	6	11776	11781	50 %	0 %	0 %	50 %	203288282
43	NC_011246	AT	3	6	12419	12424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011246	AT	3	6	12675	12680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011246	TG	3	6	12793	12798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011246	AT	3	6	12872	12877	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011246	TA	3	6	13216	13221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011246	TA	3	6	14133	14138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011246	AT	3	6	14391	14396	50 %	50 %	0 %	0 %	203288283
50	NC_011246	AT	3	6	14637	14642	50 %	50 %	0 %	0 %	203288283
51	NC_011246	TA	3	6	15195	15200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011246	CA	3	6	15351	15356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011246	AT	3	6	15789	15794	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
54	NC_011246	AT	3	6	16044	16049	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
55	NC_011246	AT	3	6	16150	16155	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
56	NC_011246	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011246	TA	3	6	16540	16545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011246	TC	3	6	16672	16677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011246	AC	3	6	17557	17562	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_011246	CA	3	6	17706	17711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_011246	AT	3	6	17941	17946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011246	AT	3	6	18215	18220	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011246	AT	3	6	18292	18297	50 %	50 %	0 %	0 %	203288285
64	NC_011246	TG	3	6	19476	19481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011246	TA	3	6	19557	19562	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
66	NC_011246	AT	3	6	20110	20115	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
67	NC_011246	AT	3	6	20196	20201	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
68	NC_011246	AT	3	6	20717	20722	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
69	NC_011246	TA	3	6	20900	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
70	NC_011246	TA	5	10	21522	21531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011246	AT	3	6	21533	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011246	TA	3	6	21659	21664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011246	TA	3	6	21695	21700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011246	AT	3	6	21718	21723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011246	AT	3	6	21775	21780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011246	TA	3	6	21810	21815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011246	AT	3	6	22034	22039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011246	AC	3	6	22351	22356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011246	TA	3	6	22513	22518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011246	AC	4	8	23104	23111	50 %	0 %	0 %	50 %	203288288
81	NC_011246	AC	3	6	23544	23549	50 %	0 %	0 %	50 %	203288288
82	NC_011246	TA	3	6	23579	23584	50 %	50 %	0 %	0 %	203288288
83	NC_011246	TA	5	10	23607	23616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011246	AT	3	6	23618	23623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011246	AT	3	6	23805	23810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011246	AT	3	6	23834	23839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011246	AT	3	6	23895	23900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011246	AT	3	6	24346	24351	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011246	TA	3	6	24669	24674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011246	AT	3	6	24845	24850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011246	TA	4	8	24989	24996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011246	AT	3	6	25189	25194	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
93	NC_011246	TC	3	6	25301	25306	0 %	50 %	0 %	50 %	203288289
94	NC_011246	AT	3	6	25314	25319	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
95	NC_011246	TA	3	6	25369	25374	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
96	NC_011246	AT	3	6	25931	25936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011246	AT	3	6	26181	26186	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
98	NC_011246	AT	3	6	26872	26877	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
99	NC_011246	AT	3	6	26976	26981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011246	TA	3	6	27259	27264	50 %	50 %	0 %	0 %	203288291
101	NC_011246	TC	3	6	27876	27881	0 %	50 %	0 %	50 %	203288292
102	NC_011246	TC	3	6	28495	28500	0 %	50 %	0 %	50 %	203288292
103	NC_011246	AT	3	6	28800	28805	50 %	50 %	0 %	0 %	203288293
104	NC_011246	TC	3	6	28851	28856	0 %	50 %	0 %	50 %	203288293
105	NC_011246	GA	3	6	29161	29166	50 %	0 %	50 %	0 %	203288293
106	NC_011246	AT	3	6	29554	29559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011246	CA	3	6	29901	29906	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011246	TA	3	6	29950	29955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011246	AT	4	8	30065	30072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011246	TA	3	6	30196	30201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011246	TC	3	6	30277	30282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011246	CT	3	6	30961	30966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011246	TA	3	6	31360	31365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011246	CA	3	6	31796	31801	50 %	0 %	0 %	50 %	203288294
115	NC_011246	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	203288295
116	NC_011246	TA	3	6	33368	33373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011246	AT	4	8	33398	33405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011246	TA	4	8	33407	33414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011246	CT	3	6	33608	33613	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
120	NC_011246	CT	3	6	34289	34294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
121	NC_011246	TC	3	6	34553	34558	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
122	NC_011246	AC	3	6	34596	34601	50 %	0 %	0 %	50 %	203288296
123	NC_011246	TC	4	8	34861	34868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011246	TC	3	6	35126	35131	0 %	50 %	0 %	50 %	203288297
125	NC_011246	AT	3	6	35410	35415	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
126	NC_011246	AC	3	6	35655	35660	50 %	0 %	0 %	50 %	203288297
127	NC_011246	AT	3	6	35782	35787	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
128	NC_011246	AT	4	8	35790	35797	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
129	NC_011246	TA	3	6	35869	35874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011246	TC	3	6	36270	36275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_011246	TC	3	6	36326	36331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011246	AC	3	6	36716	36721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011246	TA	5	10	36817	36826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011246	AT	3	6	36828	36833	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011246	AT	3	6	36980	36985	50 %	50 %	0 %	0 %	203288298
136	NC_011246	CT	3	6	37372	37377	0 %	50 %	0 %	50 %	203288298
137	NC_011246	TA	3	6	37473	37478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011246	AG	3	6	37916	37921	50 %	0 %	50 %	0 %	203288299
139	NC_011246	AT	3	6	38239	38244	50 %	50 %	0 %	0 %	203288299
140	NC_011246	CT	3	6	38526	38531	0 %	50 %	0 %	50 %	203288300
141	NC_011246	AT	3	6	38853	38858	50 %	50 %	0 %	0 %	203288301
142	NC_011246	CT	3	6	39180	39185	0 %	50 %	0 %	50 %	203288301
143	NC_011246	AT	3	6	39188	39193	50 %	50 %	0 %	0 %	203288301
144	NC_011246	AT	3	6	39257	39262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011246	TA	3	6	40149	40154	50 %	50 %	0 %	0 %	203288302
146	NC_011246	AT	3	6	40494	40499	50 %	50 %	0 %	0 %	203288302
147	NC_011246	CA	3	6	40573	40578	50 %	0 %	0 %	50 %	203288303
148	NC_011246	AT	3	6	40699	40704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288303
149	NC_011246	AT	3	6	41297	41302	50 %	50 %	0 %	0 %	203288304
150	NC_011246	TA	3	6	41472	41477	50 %	50 %	0 %	0 %	203288304
151	NC_011246	CT	3	6	41725	41730	0 %	50 %	0 %	50 %	203288304
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.