MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1 plasmid pl124

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011246	AT	3	6	1003	1008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
2	NC_011246	AT	3	6	1033	1038	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
3	NC_011246	TA	3	6	1136	1141	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
4	NC_011246	AT	4	8	1190	1197	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
5	NC_011246	AT	3	6	1269	1274	50 %	50 %	0 %	0 %	203288274
6	NC_011246	TA	3	6	2275	2280	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
7	NC_011246	AG	3	6	2523	2528	50 %	0 %	50 %	0 %	203288275
8	NC_011246	AT	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
9	NC_011246	AT	4	8	2823	2830	50 %	50 %	0 %	0 %	203288275
10	NC_011246	TA	3	6	3335	3340	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
11	NC_011246	AT	3	6	3474	3479	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
12	NC_011246	AT	4	8	3633	3640	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
13	NC_011246	TA	3	6	3653	3658	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
14	NC_011246	AT	3	6	3805	3810	50 %	50 %	0 %	0 %	203288276
15	NC_011246	CA	3	6	4115	4120	50 %	0 %	0 %	50 %	203288277
16	NC_011246	TA	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	203288277
17	NC_011246	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	203288278
18	NC_011246	AT	3	6	6777	6782	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
19	NC_011246	TA	3	6	6848	6853	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
20	NC_011246	AT	3	6	6896	6901	50 %	50 %	0 %	0 %	203288279
21	NC_011246	AC	3	6	7355	7360	50 %	0 %	0 %	50 %	203288279
22	NC_011246	CA	3	6	9502	9507	50 %	0 %	0 %	50 %	203288281
23	NC_011246	TC	3	6	9812	9817	0 %	50 %	0 %	50 %	203288281
24	NC_011246	AT	3	6	11360	11365	50 %	50 %	0 %	0 %	203288282
25	NC_011246	TA	4	8	11755	11762	50 %	50 %	0 %	0 %	203288282
26	NC_011246	AC	3	6	11776	11781	50 %	0 %	0 %	50 %	203288282
27	NC_011246	AT	3	6	14391	14396	50 %	50 %	0 %	0 %	203288283
28	NC_011246	AT	3	6	14637	14642	50 %	50 %	0 %	0 %	203288283
29	NC_011246	AT	3	6	15789	15794	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
30	NC_011246	AT	3	6	16044	16049	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
31	NC_011246	AT	3	6	16150	16155	50 %	50 %	0 %	0 %	203288284
32	NC_011246	AT	3	6	18292	18297	50 %	50 %	0 %	0 %	203288285
33	NC_011246	TA	3	6	19557	19562	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
34	NC_011246	AT	3	6	20110	20115	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
35	NC_011246	AT	3	6	20196	20201	50 %	50 %	0 %	0 %	203288286
36	NC_011246	AT	3	6	20717	20722	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
37	NC_011246	TA	3	6	20900	20905	50 %	50 %	0 %	0 %	203288287
38	NC_011246	AC	4	8	23104	23111	50 %	0 %	0 %	50 %	203288288
39	NC_011246	AC	3	6	23544	23549	50 %	0 %	0 %	50 %	203288288
40	NC_011246	TA	3	6	23579	23584	50 %	50 %	0 %	0 %	203288288
41	NC_011246	AT	3	6	25189	25194	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
42	NC_011246	TC	3	6	25301	25306	0 %	50 %	0 %	50 %	203288289
43	NC_011246	AT	3	6	25314	25319	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
44	NC_011246	TA	3	6	25369	25374	50 %	50 %	0 %	0 %	203288289
45	NC_011246	AT	3	6	26181	26186	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
46	NC_011246	AT	3	6	26872	26877	50 %	50 %	0 %	0 %	203288290
47	NC_011246	TA	3	6	27259	27264	50 %	50 %	0 %	0 %	203288291
48	NC_011246	TC	3	6	27876	27881	0 %	50 %	0 %	50 %	203288292
49	NC_011246	TC	3	6	28495	28500	0 %	50 %	0 %	50 %	203288292
50	NC_011246	AT	3	6	28800	28805	50 %	50 %	0 %	0 %	203288293
51	NC_011246	TC	3	6	28851	28856	0 %	50 %	0 %	50 %	203288293
52	NC_011246	GA	3	6	29161	29166	50 %	0 %	50 %	0 %	203288293
53	NC_011246	CA	3	6	31796	31801	50 %	0 %	0 %	50 %	203288294
54	NC_011246	CT	3	6	32701	32706	0 %	50 %	0 %	50 %	203288295
55	NC_011246	CT	3	6	33608	33613	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
56	NC_011246	CT	3	6	34289	34294	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
57	NC_011246	TC	3	6	34553	34558	0 %	50 %	0 %	50 %	203288296
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60	NC_011246	AT	3	6	35410	35415	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
61	NC_011246	AC	3	6	35655	35660	50 %	0 %	0 %	50 %	203288297
62	NC_011246	AT	3	6	35782	35787	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
63	NC_011246	AT	4	8	35790	35797	50 %	50 %	0 %	0 %	203288297
64	NC_011246	AT	3	6	36980	36985	50 %	50 %	0 %	0 %	203288298
65	NC_011246	CT	3	6	37372	37377	0 %	50 %	0 %	50 %	203288298
66	NC_011246	AG	3	6	37916	37921	50 %	0 %	50 %	0 %	203288299
67	NC_011246	AT	3	6	38239	38244	50 %	50 %	0 %	0 %	203288299
68	NC_011246	CT	3	6	38526	38531	0 %	50 %	0 %	50 %	203288300
69	NC_011246	AT	3	6	38853	38858	50 %	50 %	0 %	0 %	203288301
70	NC_011246	CT	3	6	39180	39185	0 %	50 %	0 %	50 %	203288301
71	NC_011246	AT	3	6	39188	39193	50 %	50 %	0 %	0 %	203288301
72	NC_011246	TA	3	6	40149	40154	50 %	50 %	0 %	0 %	203288302
73	NC_011246	AT	3	6	40494	40499	50 %	50 %	0 %	0 %	203288302
74	NC_011246	CA	3	6	40573	40578	50 %	0 %	0 %	50 %	203288303
75	NC_011246	AT	3	6	40699	40704	50 %	50 %	0 %	0 %	203288303
76	NC_011246	AT	3	6	41297	41302	50 %	50 %	0 %	0 %	203288304
77	NC_011246	TA	3	6	41472	41477	50 %	50 %	0 %	0 %	203288304
78	NC_011246	CT	3	6	41725	41730	0 %	50 %	0 %	50 %	203288304
79	NC_011246	TC	3	6	41762	41767	0 %	50 %	0 %	50 %	203288304
80	NC_011246	AT	3	6	43536	43541	50 %	50 %	0 %	0 %	203288305
81	NC_011246	AT	3	6	43731	43736	50 %	50 %	0 %	0 %	203288305
82	NC_011246	AT	3	6	44159	44164	50 %	50 %	0 %	0 %	203288306
83	NC_011246	AG	3	6	44726	44731	50 %	0 %	50 %	0 %	203288306
84	NC_011246	CT	3	6	44733	44738	0 %	50 %	0 %	50 %	203288306
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86	NC_011246	AT	3	6	45015	45020	50 %	50 %	0 %	0 %	203288307
87	NC_011246	TA	3	6	45301	45306	50 %	50 %	0 %	0 %	203288307
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91	NC_011246	TA	3	6	47177	47182	50 %	50 %	0 %	0 %	203288309
92	NC_011246	CA	3	6	47357	47362	50 %	0 %	0 %	50 %	203288309
93	NC_011246	TC	4	8	47385	47392	0 %	50 %	0 %	50 %	203288309
94	NC_011246	AT	3	6	47737	47742	50 %	50 %	0 %	0 %	203288309
95	NC_011246	TC	4	8	47940	47947	0 %	50 %	0 %	50 %	203288309
96	NC_011246	GA	3	6	48173	48178	50 %	0 %	50 %	0 %	203288310
97	NC_011246	GA	3	6	48633	48638	50 %	0 %	50 %	0 %	203288310
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102	NC_011246	TC	3	6	51344	51349	0 %	50 %	0 %	50 %	203288312
103	NC_011246	AT	3	6	53362	53367	50 %	50 %	0 %	0 %	203288314
104	NC_011246	AC	3	6	53706	53711	50 %	0 %	0 %	50 %	203288314
105	NC_011246	AT	3	6	54119	54124	50 %	50 %	0 %	0 %	203288315
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108	NC_011246	CT	3	6	56588	56593	0 %	50 %	0 %	50 %	203288317
109	NC_011246	GA	3	6	57975	57980	50 %	0 %	50 %	0 %	203288318
110	NC_011246	AT	3	6	59836	59841	50 %	50 %	0 %	0 %	203288321
111	NC_011246	TC	3	6	60370	60375	0 %	50 %	0 %	50 %	203288322
112	NC_011246	TC	3	6	60750	60755	0 %	50 %	0 %	50 %	203288323
113	NC_011246	CT	3	6	60798	60803	0 %	50 %	0 %	50 %	203288323
114	NC_011246	AT	3	6	62003	62008	50 %	50 %	0 %	0 %	203288324
115	NC_011246	AT	3	6	62360	62365	50 %	50 %	0 %	0 %	203288325
116	NC_011246	AT	3	6	62508	62513	50 %	50 %	0 %	0 %	203288325
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119	NC_011246	TC	3	6	63599	63604	0 %	50 %	0 %	50 %	203288327
120	NC_011246	TC	3	6	63690	63695	0 %	50 %	0 %	50 %	203288327
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126	NC_011246	TA	3	6	72221	72226	50 %	50 %	0 %	0 %	203288331
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.