MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 26

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	ATTAT	2	10	322	331	40 %	60 %	0 %	0 %	203288470
2	NC_011245	ATTTT	2	10	764	773	20 %	80 %	0 %	0 %	203288471
3	NC_011245	AATAC	2	10	1834	1843	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011245	TTTTA	2	10	3168	3177	20 %	80 %	0 %	0 %	203288473
5	NC_011245	TTCTA	2	10	4361	4370	20 %	60 %	0 %	20 %	203288475
6	NC_011245	TATTT	2	10	4886	4895	20 %	80 %	0 %	0 %	203288475
7	NC_011245	ATTGT	2	10	4898	4907	20 %	60 %	20 %	0 %	203288475
8	NC_011245	CTTTT	2	10	5069	5078	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_011245	AATTA	2	10	6146	6155	60 %	40 %	0 %	0 %	203288476
10	NC_011245	ATTAG	2	10	7388	7397	40 %	40 %	20 %	0 %	203288478
11	NC_011245	ATTTT	2	10	9007	9016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011245	AATAA	2	10	9942	9951	80 %	20 %	0 %	0 %	203288481
13	NC_011245	AATTT	2	10	12952	12961	40 %	60 %	0 %	0 %	203288484
14	NC_011245	AAGAT	2	10	14176	14185	60 %	20 %	20 %	0 %	203288485
15	NC_011245	AAAAG	2	10	15713	15722	80 %	0 %	20 %	0 %	203288488
16	NC_011245	CAAAT	2	10	15903	15912	60 %	20 %	0 %	20 %	203288488
17	NC_011245	AAATT	2	10	16089	16098	60 %	40 %	0 %	0 %	203288488
18	NC_011245	ATCAA	2	10	16743	16752	60 %	20 %	0 %	20 %	203288489
19	NC_011245	CACAA	2	10	20098	20107	60 %	0 %	0 %	40 %	203288494
20	NC_011245	ATTCA	2	10	20856	20865	40 %	40 %	0 %	20 %	203288496
21	NC_011245	ACTTT	2	10	22511	22520	20 %	60 %	0 %	20 %	203288498
22	NC_011245	TTAAC	2	10	22837	22846	40 %	40 %	0 %	20 %	203288499
23	NC_011245	AAAGA	2	10	23506	23515	80 %	0 %	20 %	0 %	203288500
24	NC_011245	AAAGA	2	10	23563	23572	80 %	0 %	20 %	0 %	203288500
25	NC_011245	ACAAA	2	10	25113	25122	80 %	0 %	0 %	20 %	203288501
26	NC_011245	ATTCT	2	10	27393	27402	20 %	60 %	0 %	20 %	203288505

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.