MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	AT	4	8	97	104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011245	TA	3	6	143	148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011245	TA	3	6	508	513	50 %	50 %	0 %	0 %	203288470
4	NC_011245	AT	3	6	672	677	50 %	50 %	0 %	0 %	203288471
5	NC_011245	CT	3	6	1898	1903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011245	CT	3	6	2098	2103	0 %	50 %	0 %	50 %	203288472
7	NC_011245	TC	3	6	2294	2299	0 %	50 %	0 %	50 %	203288472
8	NC_011245	TA	3	6	2943	2948	50 %	50 %	0 %	0 %	203288473
9	NC_011245	AT	3	6	3134	3139	50 %	50 %	0 %	0 %	203288473
10	NC_011245	TA	3	6	3439	3444	50 %	50 %	0 %	0 %	203288474
11	NC_011245	AT	3	6	3467	3472	50 %	50 %	0 %	0 %	203288474
12	NC_011245	TG	3	6	3709	3714	0 %	50 %	50 %	0 %	203288474
13	NC_011245	AT	3	6	4081	4086	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
14	NC_011245	CT	3	6	4355	4360	0 %	50 %	0 %	50 %	203288475
15	NC_011245	AG	3	6	4439	4444	50 %	0 %	50 %	0 %	203288475
16	NC_011245	TC	3	6	4753	4758	0 %	50 %	0 %	50 %	203288475
17	NC_011245	TA	3	6	4807	4812	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
18	NC_011245	TA	3	6	4922	4927	50 %	50 %	0 %	0 %	203288475
19	NC_011245	AG	3	6	5958	5963	50 %	0 %	50 %	0 %	203288476
20	NC_011245	AT	3	6	6338	6343	50 %	50 %	0 %	0 %	203288476
21	NC_011245	AT	3	6	6404	6409	50 %	50 %	0 %	0 %	203288476
22	NC_011245	GT	3	6	6614	6619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011245	GA	3	6	6907	6912	50 %	0 %	50 %	0 %	203288477
24	NC_011245	TA	3	6	7222	7227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011245	AT	3	6	7240	7245	50 %	50 %	0 %	0 %	203288478
26	NC_011245	CT	3	6	7830	7835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_011245	AT	3	6	8184	8189	50 %	50 %	0 %	0 %	203288479
28	NC_011245	TC	3	6	8863	8868	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011245	GA	3	6	9038	9043	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011245	TC	3	6	9471	9476	0 %	50 %	0 %	50 %	203288480
31	NC_011245	AT	3	6	9665	9670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011245	AG	5	10	10133	10142	50 %	0 %	50 %	0 %	203288481
33	NC_011245	AT	3	6	10322	10327	50 %	50 %	0 %	0 %	203288482
34	NC_011245	AG	3	6	11785	11790	50 %	0 %	50 %	0 %	203288483
35	NC_011245	TA	3	6	12393	12398	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
36	NC_011245	TG	3	6	12648	12653	0 %	50 %	50 %	0 %	203288484
37	NC_011245	AT	3	6	12684	12689	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
38	NC_011245	AT	3	6	12762	12767	50 %	50 %	0 %	0 %	203288484
39	NC_011245	GA	3	6	13119	13124	50 %	0 %	50 %	0 %	203288484
40	NC_011245	TC	3	6	13428	13433	0 %	50 %	0 %	50 %	203288484
41	NC_011245	AT	3	6	18585	18590	50 %	50 %	0 %	0 %	203288493
42	NC_011245	GT	3	6	18677	18682	0 %	50 %	50 %	0 %	203288493
43	NC_011245	AC	4	8	20636	20643	50 %	0 %	0 %	50 %	203288496
44	NC_011245	AT	3	6	20815	20820	50 %	50 %	0 %	0 %	203288496
45	NC_011245	AC	3	6	21083	21088	50 %	0 %	0 %	50 %	203288497
46	NC_011245	AT	3	6	21239	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	203288497
47	NC_011245	AT	3	6	21347	21352	50 %	50 %	0 %	0 %	203288498
48	NC_011245	GC	3	6	21804	21809	0 %	0 %	50 %	50 %	203288498
49	NC_011245	GT	3	6	22897	22902	0 %	50 %	50 %	0 %	203288499
50	NC_011245	TA	3	6	23648	23653	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
51	NC_011245	TA	3	6	23665	23670	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
52	NC_011245	TA	3	6	24163	24168	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
53	NC_011245	AT	3	6	24400	24405	50 %	50 %	0 %	0 %	203288500
54	NC_011245	TA	3	6	24910	24915	50 %	50 %	0 %	0 %	203288501
55	NC_011245	CA	3	6	24970	24975	50 %	0 %	0 %	50 %	203288501
56	NC_011245	AC	3	6	25840	25845	50 %	0 %	0 %	50 %	203288503
57	NC_011245	AT	3	6	26402	26407	50 %	50 %	0 %	0 %	203288503
58	NC_011245	TA	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011245	TA	3	6	27973	27978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011245	TA	3	6	28324	28329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.