MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl28

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011245	A	6	6	55	60	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011245	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	203288470
3	NC_011245	A	8	8	361	368	100 %	0 %	0 %	0 %	203288470
4	NC_011245	T	6	6	1619	1624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011245	A	6	6	1656	1661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011245	A	6	6	1810	1815	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011245	T	6	6	1816	1821	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011245	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	203288472
9	NC_011245	T	7	7	1914	1920	0 %	100 %	0 %	0 %	203288472
10	NC_011245	T	6	6	2083	2088	0 %	100 %	0 %	0 %	203288472
11	NC_011245	A	6	6	2113	2118	100 %	0 %	0 %	0 %	203288472
12	NC_011245	T	6	6	2381	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	203288472
13	NC_011245	T	7	7	2669	2675	0 %	100 %	0 %	0 %	203288473
14	NC_011245	A	6	6	2707	2712	100 %	0 %	0 %	0 %	203288473
15	NC_011245	T	6	6	2742	2747	0 %	100 %	0 %	0 %	203288473
16	NC_011245	A	8	8	2781	2788	100 %	0 %	0 %	0 %	203288473
17	NC_011245	T	6	6	2808	2813	0 %	100 %	0 %	0 %	203288473
18	NC_011245	A	6	6	2817	2822	100 %	0 %	0 %	0 %	203288473
19	NC_011245	T	7	7	3237	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	203288473
20	NC_011245	T	7	7	3324	3330	0 %	100 %	0 %	0 %	203288473
21	NC_011245	T	6	6	3500	3505	0 %	100 %	0 %	0 %	203288474
22	NC_011245	A	6	6	3610	3615	100 %	0 %	0 %	0 %	203288474
23	NC_011245	A	6	6	3656	3661	100 %	0 %	0 %	0 %	203288474
24	NC_011245	A	6	6	3701	3706	100 %	0 %	0 %	0 %	203288474
25	NC_011245	T	7	7	3819	3825	0 %	100 %	0 %	0 %	203288474
26	NC_011245	T	6	6	4112	4117	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
27	NC_011245	T	6	6	4121	4126	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
28	NC_011245	T	7	7	4141	4147	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
29	NC_011245	T	6	6	4398	4403	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
30	NC_011245	T	6	6	4510	4515	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
31	NC_011245	T	6	6	4667	4672	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
32	NC_011245	T	6	6	4709	4714	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
33	NC_011245	T	8	8	4841	4848	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
34	NC_011245	T	6	6	4980	4985	0 %	100 %	0 %	0 %	203288475
35	NC_011245	T	6	6	5014	5019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011245	A	6	6	5082	5087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011245	A	6	6	5093	5098	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011245	T	6	6	5099	5104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011245	A	6	6	5178	5183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011245	A	8	8	5235	5242	100 %	0 %	0 %	0 %	203288476
41	NC_011245	A	6	6	5566	5571	100 %	0 %	0 %	0 %	203288476
42	NC_011245	T	6	6	5835	5840	0 %	100 %	0 %	0 %	203288476
43	NC_011245	A	6	6	6271	6276	100 %	0 %	0 %	0 %	203288476
44	NC_011245	A	6	6	6655	6660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011245	T	6	6	6923	6928	0 %	100 %	0 %	0 %	203288477
46	NC_011245	T	9	9	7711	7719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011245	A	7	7	7796	7802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011245	T	6	6	7860	7865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011245	T	7	7	7922	7928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011245	A	6	6	7956	7961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011245	T	6	6	8292	8297	0 %	100 %	0 %	0 %	203288479
52	NC_011245	T	7	7	9055	9061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011245	T	7	7	9112	9118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011245	T	8	8	9297	9304	0 %	100 %	0 %	0 %	203288480
55	NC_011245	A	6	6	9390	9395	100 %	0 %	0 %	0 %	203288480
56	NC_011245	A	6	6	9432	9437	100 %	0 %	0 %	0 %	203288480
57	NC_011245	T	6	6	9446	9451	0 %	100 %	0 %	0 %	203288480
58	NC_011245	T	6	6	9493	9498	0 %	100 %	0 %	0 %	203288480
59	NC_011245	T	7	7	9558	9564	0 %	100 %	0 %	0 %	203288480
60	NC_011245	T	6	6	10085	10090	0 %	100 %	0 %	0 %	203288481
61	NC_011245	A	6	6	10456	10461	100 %	0 %	0 %	0 %	203288482
62	NC_011245	T	9	9	12220	12228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011245	T	6	6	12233	12238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011245	T	6	6	12255	12260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011245	T	6	6	12290	12295	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011245	T	6	6	13343	13348	0 %	100 %	0 %	0 %	203288484
67	NC_011245	T	6	6	13563	13568	0 %	100 %	0 %	0 %	203288484
68	NC_011245	A	8	8	14288	14295	100 %	0 %	0 %	0 %	203288485
69	NC_011245	A	6	6	14341	14346	100 %	0 %	0 %	0 %	203288486
70	NC_011245	A	6	6	15097	15102	100 %	0 %	0 %	0 %	203288487
71	NC_011245	A	6	6	15650	15655	100 %	0 %	0 %	0 %	203288487
72	NC_011245	A	6	6	17023	17028	100 %	0 %	0 %	0 %	203288489
73	NC_011245	A	6	6	17672	17677	100 %	0 %	0 %	0 %	203288490
74	NC_011245	A	6	6	17770	17775	100 %	0 %	0 %	0 %	203288491
75	NC_011245	A	7	7	17791	17797	100 %	0 %	0 %	0 %	203288491
76	NC_011245	A	6	6	18389	18394	100 %	0 %	0 %	0 %	203288492
77	NC_011245	T	6	6	18801	18806	0 %	100 %	0 %	0 %	203288493
78	NC_011245	A	7	7	18863	18869	100 %	0 %	0 %	0 %	203288493
79	NC_011245	A	6	6	19141	19146	100 %	0 %	0 %	0 %	203288494
80	NC_011245	T	6	6	19271	19276	0 %	100 %	0 %	0 %	203288494
81	NC_011245	A	6	6	20413	20418	100 %	0 %	0 %	0 %	203288495
82	NC_011245	A	8	8	20559	20566	100 %	0 %	0 %	0 %	203288495
83	NC_011245	A	6	6	20627	20632	100 %	0 %	0 %	0 %	203288496
84	NC_011245	A	6	6	20897	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	203288496
85	NC_011245	A	6	6	21116	21121	100 %	0 %	0 %	0 %	203288497
86	NC_011245	A	6	6	21404	21409	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
87	NC_011245	A	8	8	21431	21438	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
88	NC_011245	A	6	6	21488	21493	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
89	NC_011245	A	9	9	21521	21529	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
90	NC_011245	A	8	8	21540	21547	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
91	NC_011245	A	8	8	21575	21582	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
92	NC_011245	A	6	6	21608	21613	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
93	NC_011245	A	6	6	21759	21764	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
94	NC_011245	A	8	8	21936	21943	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
95	NC_011245	A	8	8	22341	22348	100 %	0 %	0 %	0 %	203288498
96	NC_011245	T	6	6	22563	22568	0 %	100 %	0 %	0 %	203288498
97	NC_011245	A	6	6	23473	23478	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
98	NC_011245	A	6	6	23761	23766	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
99	NC_011245	A	6	6	24205	24210	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
100	NC_011245	A	7	7	24221	24227	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
101	NC_011245	A	7	7	24297	24303	100 %	0 %	0 %	0 %	203288500
102	NC_011245	T	6	6	24570	24575	0 %	100 %	0 %	0 %	203288500
103	NC_011245	A	6	6	24975	24980	100 %	0 %	0 %	0 %	203288501
104	NC_011245	A	6	6	26071	26076	100 %	0 %	0 %	0 %	203288503
105	NC_011245	T	7	7	26217	26223	0 %	100 %	0 %	0 %	203288503
106	NC_011245	A	6	6	26477	26482	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
107	NC_011245	A	6	6	26658	26663	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
108	NC_011245	A	7	7	26844	26850	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
109	NC_011245	A	7	7	26866	26872	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
110	NC_011245	A	6	6	26908	26913	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
111	NC_011245	A	6	6	26971	26976	100 %	0 %	0 %	0 %	203288504
112	NC_011245	A	7	7	27239	27245	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
113	NC_011245	A	6	6	27367	27372	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
114	NC_011245	T	6	6	27469	27474	0 %	100 %	0 %	0 %	203288505
115	NC_011245	A	7	7	27497	27503	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
116	NC_011245	A	6	6	27785	27790	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
117	NC_011245	A	7	7	27903	27909	100 %	0 %	0 %	0 %	203288505
118	NC_011245	G	6	6	27913	27918	0 %	0 %	100 %	0 %	203288505
119	NC_011245	A	8	8	28272	28279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011245	A	6	6	28284	28289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011245	T	7	7	28294	28300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.