MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 14473

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011244	CTT	2	6	24	29	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011244	ACT	2	6	67	72	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011244	CAT	2	6	187	192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011244	CCT	2	6	218	223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011244	ATC	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011244	ATA	2	6	287	292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011244	CTT	2	6	313	318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011244	TCT	2	6	344	349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011244	CCT	2	6	390	395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_011244	ATC	2	6	435	440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011244	CCT	2	6	489	494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_011244	TCT	2	6	543	548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011244	TCT	2	6	562	567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011244	CTT	2	6	568	573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011244	CTT	2	6	609	614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011244	AAC	2	6	680	685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011244	TTA	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011244	CTG	2	6	894	899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_011244	AAC	2	6	916	921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011244	ATT	2	6	925	930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011244	AGC	2	6	931	936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011244	TCC	2	6	988	993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011244	AGA	2	6	1087	1092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011244	GAA	2	6	1173	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011244	CTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011244	CTT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011244	TAC	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011244	GCT	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011244	ACC	2	6	1411	1416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011244	CCT	2	6	1442	1447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011244	ACT	2	6	1522	1527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011244	GCT	2	6	1589	1594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011244	CTT	2	6	1597	1602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011244	ATC	2	6	1653	1658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011244	TAT	2	6	1697	1702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011244	CTA	2	6	1742	1747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011244	CAG	2	6	1790	1795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011244	AGC	4	12	1807	1818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_011244	CAA	2	6	1970	1975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011244	TTA	2	6	1978	1983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011244	ATA	2	6	2086	2091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011244	CTT	2	6	2209	2214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
43	NC_011244	TCT	2	6	2245	2250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
44	NC_011244	CTG	2	6	2299	2304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287472
45	NC_011244	TTA	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203287472
46	NC_011244	CCT	2	6	2349	2354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203287472
47	NC_011244	TCC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203287472
48	NC_011244	CTG	3	9	2389	2397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287472
49	NC_011244	GCT	2	6	2424	2429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287472
50	NC_011244	TCT	2	6	2499	2504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
51	NC_011244	CTG	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287472
52	NC_011244	CTG	2	6	2599	2604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287472
53	NC_011244	TCT	2	6	2857	2862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
54	NC_011244	TTC	2	6	2951	2956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
55	NC_011244	CTT	2	6	3011	3016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
56	NC_011244	TTG	2	6	3146	3151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203287472
57	NC_011244	CAT	2	6	3176	3181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287472
58	NC_011244	CTC	2	6	3205	3210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203287472
59	NC_011244	TCT	2	6	3237	3242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
60	NC_011244	CTT	2	6	3284	3289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287472
61	NC_011244	CTT	2	6	3510	3515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011244	TTA	2	6	3653	3658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011244	AAT	2	6	3662	3667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011244	ATT	2	6	3784	3789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011244	AGC	2	6	3826	3831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011244	AGG	2	6	3843	3848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011244	GGT	2	6	3861	3866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011244	TTA	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011244	TAT	2	6	3988	3993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011244	CTG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011244	AAC	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011244	CAT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011244	TCC	2	6	4284	4289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_011244	TCC	2	6	4298	4303	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_011244	CAA	2	6	4349	4354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011244	CAG	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011244	TAA	2	6	4502	4507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011244	ACT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011244	CTT	2	6	4630	4635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011244	TCT	2	6	4735	4740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_011244	AAC	2	6	4814	4819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011244	TAC	2	6	5226	5231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_011244	TCT	2	6	5288	5293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011244	AAG	2	6	5315	5320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011244	ATT	2	6	5367	5372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011244	TCT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011244	CTT	2	6	5432	5437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_011244	CTG	2	6	5516	5521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011244	AAT	2	6	5579	5584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011244	TCA	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011244	AAT	2	6	5657	5662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011244	ACT	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011244	ATG	2	6	5753	5758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011244	AAT	2	6	5773	5778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011244	ATA	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011244	TAA	2	6	5857	5862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011244	GAA	2	6	5871	5876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011244	GCA	2	6	5979	5984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011244	AAT	2	6	5999	6004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011244	ATT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011244	ATG	2	6	6230	6235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011244	TAA	2	6	6237	6242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011244	ACA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011244	TGC	2	6	6348	6353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011244	AAC	2	6	6358	6363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011244	TTA	2	6	6509	6514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011244	CTT	2	6	6516	6521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011244	AAG	2	6	6539	6544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011244	TAA	2	6	6591	6596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011244	TCT	2	6	6613	6618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011244	TCC	2	6	6736	6741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011244	TAA	3	9	6747	6755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011244	TGC	2	6	6762	6767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011244	TCC	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_011244	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011244	TCC	2	6	6867	6872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_011244	GCT	3	9	6880	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011244	GCT	2	6	6916	6921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287473
119	NC_011244	CTA	2	6	6972	6977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287473
120	NC_011244	TGC	2	6	6979	6984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287473
121	NC_011244	CAT	2	6	7065	7070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287473
122	NC_011244	ATT	2	6	7081	7086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203287473
123	NC_011244	ACA	2	6	7109	7114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203287473
124	NC_011244	TCT	2	6	7122	7127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287473
125	NC_011244	CAG	2	6	7131	7136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203287473
126	NC_011244	ACA	2	6	7145	7150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203287473
127	NC_011244	CTG	2	6	7188	7193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287473
128	NC_011244	AAT	2	6	7195	7200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203287473
129	NC_011244	ATC	2	6	7231	7236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287473
130	NC_011244	AGC	2	6	7270	7275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203287473
131	NC_011244	GCT	3	9	7325	7333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203287473
132	NC_011244	TTC	2	6	7451	7456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287473
133	NC_011244	ATC	3	9	7459	7467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287473
134	NC_011244	TCC	2	6	7498	7503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	203287473
135	NC_011244	TAA	2	6	7506	7511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203287473
136	NC_011244	GCA	2	6	7580	7585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203287473
137	NC_011244	CCA	2	6	7613	7618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	203287473
138	NC_011244	AGC	2	6	7630	7635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	203287473
139	NC_011244	CTT	2	6	7647	7652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287473
140	NC_011244	GTT	2	6	7748	7753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203287473
141	NC_011244	CTT	2	6	7798	7803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287473
142	NC_011244	TTC	2	6	7907	7912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	203287473
143	NC_011244	CTA	2	6	7999	8004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011244	AAT	2	6	8049	8054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011244	TGC	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_011244	ATG	3	9	8073	8081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011244	TGG	2	6	8086	8091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011244	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_011244	GTT	2	6	8141	8146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011244	TAA	2	6	8232	8237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011244	ATA	2	6	8257	8262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011244	ACT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_011244	CTA	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011244	GAG	2	6	8440	8445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011244	TCT	2	6	8530	8535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011244	TAT	2	6	8600	8605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_011244	AGC	2	6	8681	8686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_011244	ACA	2	6	8726	8731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_011244	AAT	2	6	8782	8787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011244	TAG	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_011244	CTG	2	6	9016	9021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_011244	CTT	2	6	9054	9059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_011244	TTA	2	6	9092	9097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011244	CTA	2	6	9114	9119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_011244	CTG	2	6	9144	9149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_011244	ATC	2	6	9172	9177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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170	NC_011244	TAA	2	6	9259	9264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011244	ATT	2	6	9370	9375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011244	CTA	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_011244	AGT	2	6	9416	9421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011244	CTT	2	6	9442	9447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_011244	CTT	2	6	9477	9482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_011244	TTG	2	6	9523	9528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
177	NC_011244	CAG	3	9	9556	9564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_011244	CCT	2	6	9588	9593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_011244	TCC	2	6	9617	9622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_011244	CAG	2	6	9763	9768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_011244	GCA	4	12	9780	9791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_011244	CAG	2	6	9826	9831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_011244	CTT	2	6	9889	9894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_011244	ACT	2	6	9897	9902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_011244	CTA	2	6	9907	9912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_011244	GCA	2	6	9954	9959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_011244	CCA	2	6	9960	9965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
189	NC_011244	GCA	2	6	9975	9980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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191	NC_011244	TAT	2	6	10040	10045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_011244	TTA	2	6	10137	10142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_011244	TAT	2	6	10348	10353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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232	NC_011244	TTA	2	6	11553	11558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
233	NC_011244	TAT	2	6	11598	11603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_011244	GTT	2	6	12433	12438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_011244	AAT	2	6	12596	12601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_011244	AAT	2	6	13167	13172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203287474
260	NC_011244	CAT	2	6	13197	13202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203287474
261	NC_011244	TAT	2	6	13235	13240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203287474
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269	NC_011244	TAT	2	6	13638	13643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203287475
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281	NC_011244	ATA	2	6	14800	14805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203287476
282	NC_011244	TAA	2	6	14813	14818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203287476
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