MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia recurrentis A1

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011244	CT	3	6	465	470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_011244	TA	3	6	719	724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011244	AT	3	6	1104	1109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011244	AT	3	6	1545	1550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011244	CT	3	6	1922	1927	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011244	TA	3	6	2050	2055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011244	AC	3	6	2068	2073	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011244	CT	3	6	3355	3360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011244	TC	3	6	3811	3816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_011244	TG	3	6	4066	4071	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011244	TA	3	6	4072	4077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011244	AT	3	6	4178	4183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011244	TC	4	8	4718	4725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011244	CT	3	6	4739	4744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_011244	TC	4	8	4759	4766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_011244	AC	3	6	4858	4863	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011244	AC	4	8	4873	4880	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011244	AT	3	6	4914	4919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011244	AT	3	6	5058	5063	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011244	TA	4	8	5252	5259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011244	TC	4	8	5674	5681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_011244	TA	3	6	6064	6069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011244	TA	3	6	6476	6481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011244	GT	3	6	8467	8472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011244	AT	3	6	8707	8712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011244	AG	3	6	8732	8737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011244	CT	3	6	8746	8751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011244	AC	3	6	9276	9281	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_011244	AT	3	6	9496	9501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011244	CT	3	6	10236	10241	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011244	AT	3	6	10614	10619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011244	AT	3	6	11272	11277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011244	CT	3	6	12226	12231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011244	CT	3	6	12262	12267	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011244	TA	3	6	12415	12420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011244	AT	3	6	12492	12497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011244	AT	4	8	21237	21244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011244	AT	3	6	21255	21260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011244	TA	3	6	58280	58285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011244	CT	3	6	58732	58737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_011244	TA	3	6	61159	61164	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011244	TA	3	6	61880	61885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011244	TA	3	6	68571	68576	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011244	AT	3	6	69801	69806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011244	GA	3	6	81991	81996	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011244	AC	3	6	91286	91291	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_011244	TA	3	6	92667	92672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011244	AT	3	6	95817	95822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011244	TC	3	6	99226	99231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_011244	TC	3	6	106951	106956	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011244	AT	3	6	107129	107134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011244	TC	4	8	107136	107143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011244	TA	3	6	107892	107897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011244	CT	3	6	110428	110433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011244	TA	3	6	113066	113071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011244	TA	3	6	113143	113148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011244	AT	3	6	113237	113242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011244	AT	3	6	117753	117758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011244	AT	3	6	120119	120124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011244	AT	3	6	124795	124800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011244	TA	3	6	124805	124810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011244	TA	3	6	124814	124819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011244	TC	3	6	125299	125304	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_011244	AT	3	6	125488	125493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011244	TA	3	6	125583	125588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011244	AT	3	6	126312	126317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011244	AT	3	6	127279	127284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011244	AT	3	6	127534	127539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011244	AT	3	6	127585	127590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011244	AT	3	6	127934	127939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011244	AT	3	6	128029	128034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011244	TA	3	6	132331	132336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011244	CT	3	6	137079	137084	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_011244	CT	3	6	140176	140181	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011244	TA	3	6	144064	144069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011244	TA	4	8	144162	144169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011244	AT	3	6	150783	150788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011244	TA	3	6	150866	150871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011244	AT	4	8	165573	165580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011244	CT	3	6	179090	179095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011244	TA	3	6	179174	179179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011244	CA	3	6	179502	179507	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011244	AC	3	6	180419	180424	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011244	TA	3	6	182088	182093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011244	AT	3	6	204529	204534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011244	TA	3	6	204567	204572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011244	TA	3	6	204630	204635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011244	AT	3	6	204727	204732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011244	TA	3	6	213575	213580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011244	TA	3	6	217192	217197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011244	TA	3	6	217283	217288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011244	AG	3	6	219982	219987	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011244	CT	3	6	247383	247388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_011244	TA	4	8	254174	254181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011244	AT	3	6	254223	254228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011244	AT	3	6	254230	254235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011244	TA	3	6	254239	254244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011244	TA	3	6	257301	257306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011244	TA	3	6	257426	257431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011244	GA	3	6	257788	257793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011244	AT	3	6	258781	258786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011244	GA	3	6	259222	259227	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011244	AT	3	6	259436	259441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011244	AT	3	6	260326	260331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011244	AT	3	6	261782	261787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011244	AT	3	6	261792	261797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011244	CA	3	6	263024	263029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_011244	AT	3	6	264088	264093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011244	CT	3	6	266710	266715	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011244	AT	3	6	275650	275655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011244	AC	4	8	285473	285480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_011244	AT	3	6	286876	286881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011244	AT	3	6	286909	286914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011244	AT	3	6	287270	287275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011244	TA	4	8	295597	295604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011244	CT	3	6	311877	311882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_011244	TA	3	6	325226	325231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011244	AT	3	6	327625	327630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011244	TC	3	6	328268	328273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_011244	CT	3	6	334629	334634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_011244	CT	3	6	343542	343547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011244	AC	3	6	343551	343556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011244	AT	3	6	358178	358183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011244	TA	3	6	358202	358207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011244	AT	3	6	358482	358487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011244	CA	3	6	358510	358515	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011244	AT	3	6	358554	358559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011244	TA	3	6	359063	359068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011244	CT	3	6	359805	359810	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011244	AT	3	6	360066	360071	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011244	AT	3	6	360090	360095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011244	AT	3	6	360185	360190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011244	TA	3	6	362231	362236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011244	AT	3	6	367095	367100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011244	TA	3	6	368484	368489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011244	AT	3	6	378973	378978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011244	TA	3	6	380582	380587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011244	AT	3	6	380654	380659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011244	AT	3	6	380732	380737	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011244	TA	3	6	393097	393102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011244	AT	3	6	395202	395207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011244	CT	3	6	398508	398513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011244	AC	3	6	398705	398710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_011244	CT	3	6	399568	399573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011244	TA	3	6	399624	399629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011244	AT	3	6	399900	399905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011244	AT	3	6	408820	408825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011244	AT	3	6	413539	413544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011244	TA	3	6	414768	414773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011244	AT	3	6	414794	414799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011244	AT	3	6	416957	416962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011244	CT	3	6	428463	428468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_011244	AT	3	6	432878	432883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011244	AT	4	8	435808	435815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011244	AT	3	6	436377	436382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_011244	TA	3	6	445153	445158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_011244	TA	3	6	449283	449288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.