MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011229	AATTAA	2	12	219	230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011229	TTTAAA	2	12	1590	1601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011229	ATCTTA	2	12	1712	1723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_011229	TTTATT	2	12	2081	2092	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011229	CCTTCT	2	12	11077	11088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011229	TAACAT	2	12	11775	11786	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011229	TATAAT	2	12	109587	109598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011229	ACAATA	2	12	119194	119205	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011229	TTACTA	2	12	124126	124137	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_011229	AAATAA	2	12	159232	159243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011229	ATATTT	2	12	164726	164737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011229	TAAGAA	2	12	216353	216364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011229	ATAACA	2	12	242455	242466	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011229	AAATGT	2	12	256811	256822	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011229	ACAAAA	2	12	256885	256896	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011229	AAAGGA	2	12	257808	257819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011229	ATTATA	2	12	354254	354265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011229	ATCTTT	2	12	354520	354531	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011229	ATATTT	2	12	372964	372975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011229	TTTACA	2	12	373084	373095	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011229	AAATTG	2	12	373130	373141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011229	TAACAA	2	12	373491	373502	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011229	ATTTAT	2	12	428256	428267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011229	ATAACA	2	12	428440	428451	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011229	AAACAT	2	12	428691	428702	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011229	TTAAAA	2	12	430235	430246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011229	AAAAAT	2	12	440780	440791	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011229	ATTAGT	2	12	448232	448243	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011229	ATATTT	2	12	450724	450735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011229	TTCGCC	2	12	457552	457563	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_011229	TTATTT	2	12	458279	458290	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011229	TTATAT	2	12	459651	459662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011229	TCAAAA	2	12	469726	469737	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_011229	GTATTT	2	12	497538	497549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011229	TTTTAA	2	12	497664	497675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011229	AGATAT	2	12	505854	505865	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011229	TAATTT	2	12	545570	545581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011229	GGTAAT	2	12	554950	554961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011229	TTATTT	2	12	563005	563016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011229	TATATT	2	12	602273	602284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011229	TTAGTT	2	12	616196	616207	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011229	TTTTTG	2	12	666502	666513	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011229	ATTTCC	2	12	669817	669828	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011229	TTAAAA	2	12	687943	687954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011229	TATAAA	2	12	751007	751018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011229	TTGATT	2	12	751084	751095	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011229	GGTGTT	2	12	786671	786682	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011229	ATTGTA	2	12	807078	807089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011229	AGTATG	2	12	807099	807110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011229	TTGATT	2	12	808823	808834	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011229	AGATTT	2	12	808884	808895	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011229	TAATTA	2	12	815877	815888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011229	ATTTAA	2	12	833965	833976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011229	TTATTT	2	12	877666	877677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011229	TTTAAT	2	12	921359	921370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011229	TTTTAA	2	12	931224	931235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.