MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly

Total Repeats: 608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011229	GCAGTA	2	12	2834	2845	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203283928
2	NC_011229	TAATTA	2	12	3333	3344	50 %	50 %	0 %	0 %	203283929
3	NC_011229	AAATTA	2	12	12859	12870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283932
4	NC_011229	CATATT	2	12	13281	13292	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203283932
5	NC_011229	TTTTCA	2	12	13405	13416	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203283932
6	NC_011229	ATAATC	2	12	13728	13739	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203283932
7	NC_011229	TAAAAT	2	12	14257	14268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283933
8	NC_011229	CAATAA	2	12	21102	21113	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283938
9	NC_011229	TCCTAT	2	12	21562	21573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	203283939
10	NC_011229	TATGAA	2	12	22169	22180	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203283939
11	NC_011229	AAAGGA	2	12	22341	22352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	203283940
12	NC_011229	AATAAA	2	12	24187	24198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203283942
13	NC_011229	TTTTAA	2	12	26170	26181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283944
14	NC_011229	ACTCAT	2	12	27198	27209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283945
15	NC_011229	AACCCT	2	12	27408	27419	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203283946
16	NC_011229	ACAAAT	2	12	28783	28794	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283947
17	NC_011229	TTAAAT	2	12	30203	30214	50 %	50 %	0 %	0 %	203283949
18	NC_011229	TGAATT	2	12	31660	31671	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203283950
19	NC_011229	GCTGAT	2	12	32552	32563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	203283951
20	NC_011229	TTAAAA	2	12	32829	32840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283951
21	NC_011229	TTTAAA	2	12	33120	33131	50 %	50 %	0 %	0 %	203283952
22	NC_011229	TTGTTC	2	12	34197	34208	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	203283953
23	NC_011229	TTAAAA	2	12	34217	34228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283953
24	NC_011229	TTTCAA	2	12	39579	39590	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203283960
25	NC_011229	CATCCT	2	12	39882	39893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203283960
26	NC_011229	TAAAAA	2	12	40709	40720	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203283961
27	NC_011229	GATTTG	2	12	40823	40834	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	203283961
28	NC_011229	AAAGAA	2	12	42285	42296	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203283962
29	NC_011229	TATCAA	2	12	43897	43908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203283964
30	NC_011229	ATATGC	2	12	45407	45418	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203283965
31	NC_011229	AACACA	2	12	51226	51237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	203283969
32	NC_011229	CAATAA	2	12	51322	51333	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283969
33	NC_011229	AAAAAC	2	12	52510	52521	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203283971
34	NC_011229	TAAATT	2	12	53127	53138	50 %	50 %	0 %	0 %	203283971
35	NC_011229	CAAAAG	2	12	53471	53482	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	203283971
36	NC_011229	ATATTA	2	12	53878	53889	50 %	50 %	0 %	0 %	203283972
37	NC_011229	TAAATT	2	12	54839	54850	50 %	50 %	0 %	0 %	203283973
38	NC_011229	TTTAAT	2	12	54978	54989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283973
39	NC_011229	GCATTT	2	12	58428	58439	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203283976
40	NC_011229	AGCTAC	2	12	59700	59711	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	203283978
41	NC_011229	ATTTAT	2	12	59933	59944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203283978
42	NC_011229	TAAAAA	2	12	60597	60608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203283979
43	NC_011229	ACAAAA	2	12	61173	61184	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203283980
44	NC_011229	GCTCGT	2	12	63767	63778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	203283983
45	NC_011229	CACTAT	2	12	64590	64601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283984
46	NC_011229	TTTTTA	2	12	67168	67179	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	203283985
47	NC_011229	ATCAAA	2	12	68360	68371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283988
48	NC_011229	AAAATT	2	12	68589	68600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203283988
49	NC_011229	AAACAG	2	12	68824	68835	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	203283988
50	NC_011229	CTTTTA	2	12	69096	69107	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203283989
51	NC_011229	TTCCGA	2	12	71529	71540	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	203283992
52	NC_011229	AATAAA	2	12	72147	72158	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203283992
53	NC_011229	CTTCAA	2	12	73222	73233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203283993
54	NC_011229	AAATCA	2	12	73245	73256	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283993
55	NC_011229	ACATAA	2	12	74538	74549	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203283994
56	NC_011229	ATCAAT	2	12	74771	74782	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203283994
57	NC_011229	TATCAA	2	12	77512	77523	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203283997
58	NC_011229	CAGGAG	2	12	81815	81826	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	203284000
59	NC_011229	TTAAAA	2	12	82501	82512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203284001
60	NC_011229	AATTGA	2	12	83150	83161	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203284001
61	NC_011229	ATTAAT	2	12	84487	84498	50 %	50 %	0 %	0 %	203284003
62	NC_011229	GGAATT	2	12	85785	85796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203284004
63	NC_011229	AGATAT	2	12	86138	86149	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203284004
64	NC_011229	ATTTAA	2	12	86845	86856	50 %	50 %	0 %	0 %	203284005
65	NC_011229	AAAGAA	2	12	88676	88687	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203284006
66	NC_011229	AATACA	2	12	89766	89777	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203284007
67	NC_011229	TTGAAG	2	12	92366	92377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203284011
68	NC_011229	AAAATA	2	12	92591	92602	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284011
69	NC_011229	TAGCAG	2	12	92939	92950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203284011
70	NC_011229	AAAATT	2	12	93868	93879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203284012
71	NC_011229	TAAAAA	2	12	97802	97813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284014
72	NC_011229	AAACAA	2	12	98177	98188	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203284015
73	NC_011229	CAAAAA	2	12	98727	98738	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203284016
74	NC_011229	TCAAAT	2	12	99641	99652	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284016
75	NC_011229	TTCTAA	2	12	100352	100363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284017
76	NC_011229	CAGCAA	2	12	101427	101438	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	203284018
77	NC_011229	ATCACC	2	12	103324	103335	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	203284019
78	NC_011229	ATTAAC	2	12	103938	103949	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284020
79	NC_011229	TTCAAA	2	12	104189	104200	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284020
80	NC_011229	ATTTCA	2	12	104544	104555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284021
81	NC_011229	TGGAAT	2	12	106761	106772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203284023
82	NC_011229	GTATTA	2	12	108674	108685	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203284024
83	NC_011229	AAAATT	2	12	109236	109247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203284025
84	NC_011229	TGGACT	2	12	110913	110924	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	203284026
85	NC_011229	TAAAAA	2	12	111314	111325	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284027
86	NC_011229	AAAGAA	2	12	113728	113739	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203284029
87	NC_011229	AGCTAA	2	12	113923	113934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203284029
88	NC_011229	TCATAT	2	12	114812	114823	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284031
89	NC_011229	CATTAA	2	12	118143	118154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284034
90	NC_011229	CATTAT	2	12	119849	119860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284035
91	NC_011229	CTTCAC	2	12	124918	124929	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	203284041
92	NC_011229	AAAAGA	2	12	127403	127414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	203284043
93	NC_011229	ATTTTA	2	12	128304	128315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203284043
94	NC_011229	AGATCA	2	12	129482	129493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203284045
95	NC_011229	TAAACT	2	12	130008	130019	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284045
96	NC_011229	CGATCT	2	12	133568	133579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	203284051
97	NC_011229	CTGAAG	2	12	136831	136842	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	203284054
98	NC_011229	ACCAAT	2	12	139252	139263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203284057
99	NC_011229	AACTGA	2	12	143997	144008	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203284060
100	NC_011229	TCAATT	2	12	144887	144898	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284061
101	NC_011229	AAATTA	2	12	145082	145093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	203284061
102	NC_011229	TTTTGG	2	12	147088	147099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	203284062
103	NC_011229	CTATAT	2	12	152298	152309	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	203284065
104	NC_011229	CCAAAT	2	12	153241	153252	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	203284065
105	NC_011229	TGACAA	2	12	155005	155016	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	203284067
106	NC_011229	TTTCAT	2	12	158971	158982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	203284071
107	NC_011229	TTTGCA	2	12	159000	159011	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	203284071
108	NC_011229	GAGCTG	2	12	159599	159610	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	203284072
109	NC_011229	GAGCTG	2	12	159617	159628	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	203284072
110	NC_011229	CATATG	2	12	159882	159893	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	203284072
111	NC_011229	TATGGA	2	12	162799	162810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203284074
112	NC_011229	AATTTA	2	12	165280	165291	50 %	50 %	0 %	0 %	203284076
113	NC_011229	TACAAT	2	12	169483	169494	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284079
114	NC_011229	TAAAAA	2	12	170836	170847	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284081
115	NC_011229	TCTTTT	2	12	172140	172151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203284082
116	NC_011229	ACAAAA	2	12	175083	175094	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	203284085
117	NC_011229	TAAAAA	2	12	175462	175473	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284085
118	NC_011229	TAAAAA	2	12	175483	175494	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	203284085
119	NC_011229	ATACAA	2	12	175584	175595	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203284085
120	NC_011229	TTTTTA	2	12	175734	175745	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	203284085
121	NC_011229	AATCAA	2	12	178328	178339	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203284087
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237	NC_011229	TAACAA	2	12	339170	339181	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	203284238
238	NC_011229	CTACAT	2	12	340536	340547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	203284239
239	NC_011229	TCAATA	2	12	341579	341590	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	203284240
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464	NC_011229	TATTGG	2	12	708608	708619	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	203284555
465	NC_011229	TCTTTT	2	12	712220	712231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203284558
466	NC_011229	GATTTT	2	12	716467	716478	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	203284564
467	NC_011229	TTGATA	2	12	719022	719033	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203284567
468	NC_011229	TGGTAA	2	12	720805	720816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	203284567
469	NC_011229	ATGATA	2	12	721370	721381	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	203284568
470	NC_011229	TTTTAA	2	12	723461	723472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	203284571
471	NC_011229	CTTTTT	2	12	723855	723866	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	203284572
472	NC_011229	GAATTT	2	12	723946	723957	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	203284572
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474	NC_011229	TGGTAT	2	12	726800	726811	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	203284575
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