MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly

Total Repeats: 119

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011229	CTAAT	2	10	4	13	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_011229	TATGG	2	10	1696	1705	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011229	ACAGA	2	10	1724	1733	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_011229	CTTTA	2	10	3288	3297	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011229	TTATT	2	10	4727	4736	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011229	TCCTC	2	10	5721	5730	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011229	CCTTT	2	10	5967	5976	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_011229	TCCTT	2	10	6685	6694	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011229	ACTAT	2	10	6748	6757	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011229	TTATT	2	10	8395	8404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011229	TTCTT	2	10	9190	9199	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_011229	TTCAT	2	10	9202	9211	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011229	TAATA	2	10	9615	9624	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011229	TTCTT	2	10	10457	10466	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011229	TTTTA	2	10	10559	10568	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011229	TTGCT	2	10	10968	10977	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011229	CTCTT	2	10	11224	11233	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_011229	CAAAA	2	10	11642	11651	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_011229	AAAGT	2	10	19401	19410	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011229	ATTTA	2	10	20341	20350	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011229	ATTAT	2	10	20415	20424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011229	AGTAA	2	10	27834	27843	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011229	TAAAA	2	10	34147	34156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011229	CTTAT	2	10	34780	34789	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011229	AAATA	2	10	50737	50746	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011229	ATATA	2	10	68125	68134	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011229	AAAAT	2	10	68931	68940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011229	ATAAA	2	10	90412	90421	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011229	TAAAA	2	10	90440	90449	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011229	TTAAT	2	10	91773	91782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011229	TGAAA	2	10	94968	94977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011229	ATATA	2	10	133887	133896	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011229	AAAAC	2	10	143234	143243	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_011229	ATTTA	2	10	144478	144487	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011229	TAAAT	2	10	160401	160410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011229	TAAAA	2	10	192925	192934	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011229	AAAAT	2	10	201602	201611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011229	ACATA	2	10	203637	203646	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011229	TAAAT	2	10	231478	231487	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011229	TAAAA	2	10	242393	242402	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011229	AACAT	2	10	248095	248104	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_011229	ACAAA	2	10	253293	253302	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_011229	CATTA	2	10	263536	263545	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011229	AGTCC	2	10	269767	269776	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011229	TATAC	2	10	290687	290696	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_011229	AATTA	2	10	291249	291258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011229	TAAAA	2	10	307639	307648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011229	AAAGT	2	10	343775	343784	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011229	AATTA	2	10	345002	345011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011229	ATACA	2	10	352174	352183	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_011229	ATTTT	2	10	352415	352424	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011229	AAAAC	2	10	352482	352491	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011229	AATAT	2	10	354361	354370	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011229	AAATT	2	10	358511	358520	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011229	TAGTT	2	10	372798	372807	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011229	TACAA	2	10	372949	372958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_011229	TAAAA	2	10	375494	375503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011229	CATAT	2	10	401112	401121	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011229	TTTAA	2	10	403050	403059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011229	TTAAC	2	10	418252	418261	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_011229	TCAAA	2	10	428485	428494	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_011229	TAATT	2	10	433368	433377	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011229	AATTA	2	10	449894	449903	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011229	CTCCC	2	10	450579	450588	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
65	NC_011229	AATTA	2	10	452193	452202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011229	TATTT	2	10	458317	458326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011229	ATTAA	2	10	460526	460535	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011229	AATAT	2	10	468072	468081	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011229	TATAA	2	10	469815	469824	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011229	TATAA	2	10	472534	472543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011229	ATTGT	2	10	472545	472554	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011229	CTTTA	2	10	493501	493510	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_011229	ATAAA	2	10	494845	494854	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011229	ATTTA	2	10	494876	494885	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011229	TTTTA	2	10	507984	507993	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011229	TTAAG	2	10	508036	508045	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011229	TTGTT	2	10	560117	560126	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011229	TTTTA	2	10	563029	563038	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011229	TTTTA	2	10	565978	565987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011229	TAAAG	2	10	569434	569443	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011229	TAATT	2	10	581963	581972	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011229	AATTT	2	10	585321	585330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011229	TATTT	2	10	591963	591972	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011229	ATTGT	2	10	592679	592688	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011229	ATTGT	2	10	592723	592732	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011229	ACTAT	2	10	602328	602337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_011229	ATTTT	2	10	607154	607163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011229	TAAAT	2	10	641793	641802	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011229	TGTTT	2	10	661079	661088	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011229	TCTTT	2	10	669856	669865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_011229	ATTTG	2	10	685512	685521	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011229	AATTT	2	10	687135	687144	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011229	GGATG	2	10	687635	687644	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011229	TTTTG	2	10	687674	687683	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011229	AAATT	2	10	687921	687930	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011229	TTAAC	2	10	702373	702382	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_011229	TTAAT	2	10	709194	709203	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011229	TTTAT	2	10	726417	726426	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011229	CATAT	2	10	735649	735658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011229	ATTAA	2	10	742113	742122	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011229	AATAC	2	10	751179	751188	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_011229	TATTT	2	10	757081	757090	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011229	TTAAT	2	10	757398	757407	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011229	TTCTT	2	10	769874	769883	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_011229	TATTG	2	10	769920	769929	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011229	ATTTT	2	10	774402	774411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011229	AATAT	2	10	807051	807060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011229	ATTTT	2	10	808768	808777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011229	TTTAT	2	10	809203	809212	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011229	ATTAT	2	10	814610	814619	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011229	TAAAT	2	10	819633	819642	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011229	TGATG	2	10	828669	828678	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011229	TGAAA	2	10	830147	830156	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011229	ATAAA	2	10	832730	832739	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011229	AATTA	2	10	912944	912953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011229	GTATA	2	10	928476	928485	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011229	TGTAC	2	10	930462	930471	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011229	TTTAT	2	10	930871	930880	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011229	TATAT	2	10	931132	931141	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.