MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly

Total Repeats: 291

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011229	ATAC	2	8	52	59	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011229	TAAA	2	8	367	374	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011229	TAAT	2	8	481	488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011229	ATTG	2	8	1789	1796	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011229	TTAC	2	8	2095	2102	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011229	CAAA	3	12	4550	4561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_011229	AAAT	2	8	4562	4569	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011229	GAAT	2	8	4582	4589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011229	CTTT	2	8	5163	5170	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_011229	ACTA	2	8	5458	5465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_011229	TCTT	2	8	5510	5517	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011229	TTTA	2	8	5849	5856	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011229	TTTA	2	8	5873	5880	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011229	ATTA	2	8	6031	6038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011229	TAAA	2	8	6248	6255	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011229	AAAT	2	8	6260	6267	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011229	ATAA	2	8	6270	6277	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011229	TAAA	2	8	6646	6653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011229	ATAA	2	8	6821	6828	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011229	TTAA	2	8	6875	6882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011229	CAAA	3	12	8212	8223	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011229	AAAT	2	8	8224	8231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011229	ATGA	3	12	8246	8257	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011229	CTTT	2	8	8830	8837	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_011229	TTGT	2	8	10802	10809	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011229	CTTT	2	8	10845	10852	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_011229	TACC	2	8	10959	10966	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_011229	ATTT	2	8	11274	11281	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011229	ATGA	2	8	11306	11313	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011229	ATTA	2	8	11479	11486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011229	TAAT	2	8	11526	11533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011229	ATTA	2	8	11892	11899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011229	ATTA	2	8	12017	12024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011229	TAAA	2	8	12748	12755	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011229	TCCC	2	8	19365	19372	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_011229	ATTA	2	8	19431	19438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011229	TAAT	2	8	32024	32031	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011229	AGAA	2	8	36604	36611	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011229	TAAA	2	8	42523	42530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011229	TAAT	2	8	50840	50847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011229	TAAA	3	12	51774	51785	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011229	TAAA	2	8	53946	53953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011229	AATA	2	8	56466	56473	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011229	TACT	2	8	57443	57450	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011229	AAAT	2	8	58034	58041	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011229	AAAC	2	8	58053	58060	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_011229	TAAA	2	8	60222	60229	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011229	AATT	2	8	64417	64424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011229	ATTA	2	8	67662	67669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011229	AAAT	2	8	68145	68152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011229	AAGC	2	8	73963	73970	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_011229	TTTA	2	8	73995	74002	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011229	ATAA	2	8	91801	91808	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011229	AATT	2	8	124272	124279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011229	AATA	2	8	124293	124300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011229	TAAC	2	8	124326	124333	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_011229	CAAT	2	8	124337	124344	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_011229	ATCA	2	8	124462	124469	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_011229	TAAA	2	8	133918	133925	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011229	TTAT	2	8	143256	143263	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011229	AACA	2	8	149965	149972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_011229	ACAA	2	8	157118	157125	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_011229	ATAA	2	8	162517	162524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011229	TTAT	2	8	162551	162558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011229	TAAA	2	8	170219	170226	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011229	TTAA	2	8	179484	179491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011229	ATTT	2	8	181582	181589	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011229	ATAA	2	8	192903	192910	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011229	TTTA	2	8	198685	198692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011229	ATAC	2	8	199996	200003	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_011229	TTAT	2	8	203797	203804	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011229	ATTT	2	8	212688	212695	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011229	ACTA	2	8	212795	212802	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_011229	CAAA	2	8	212927	212934	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_011229	ATAA	2	8	216278	216285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011229	ATTT	2	8	216338	216345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011229	TAAA	2	8	216380	216387	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011229	ATTA	2	8	216396	216403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011229	ACAA	2	8	216436	216443	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_011229	TTTC	2	8	231508	231515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_011229	ATTT	2	8	240061	240068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011229	AATT	2	8	242376	242383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011229	AAAT	2	8	242410	242417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011229	ATTA	2	8	243218	243225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011229	AACA	2	8	256357	256364	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_011229	TAAT	2	8	256394	256401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011229	AATC	2	8	256511	256518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_011229	TCAA	2	8	256769	256776	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_011229	GTTT	2	8	256899	256906	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011229	GTTA	2	8	256919	256926	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011229	ATTA	2	8	259329	259336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011229	ATTA	2	8	263554	263561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011229	ATCA	2	8	265663	265670	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_011229	TAAT	2	8	287901	287908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011229	TTTA	2	8	287934	287941	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011229	CAAT	2	8	332194	332201	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_011229	TCAA	2	8	342146	342153	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_011229	AAAC	2	8	344962	344969	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_011229	TTTA	3	12	350482	350493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011229	AACA	2	8	352190	352197	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_011229	TTAA	2	8	352301	352308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011229	ATAC	2	8	352359	352366	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_011229	TTAA	2	8	354350	354357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011229	AATA	2	8	360718	360725	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011229	AAAT	2	8	371343	371350	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011229	TAAA	2	8	373313	373320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011229	AGAT	2	8	385378	385385	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011229	TAAG	2	8	385391	385398	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011229	TAAT	2	8	387464	387471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011229	ATAG	2	8	397478	397485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011229	AAAC	2	8	401124	401131	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_011229	ACAT	2	8	404530	404537	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011229	TATT	2	8	404549	404556	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011229	TAAA	2	8	404756	404763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011229	AATC	2	8	409205	409212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011229	ATTT	2	8	410165	410172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011229	ACAA	2	8	420744	420751	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_011229	TAAT	2	8	428139	428146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011229	ATTT	2	8	428315	428322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011229	TTAT	2	8	428497	428504	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011229	AATT	2	8	433278	433285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011229	TTTA	2	8	441483	441490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011229	TTAA	2	8	448903	448910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011229	GTAT	2	8	449381	449388	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011229	ACCT	2	8	449442	449449	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_011229	CTAC	2	8	449512	449519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011229	GTTT	2	8	450274	450281	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011229	CTAA	2	8	450409	450416	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_011229	TCGC	2	8	450902	450909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_011229	CTAA	2	8	451011	451018	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_011229	AATT	2	8	456360	456367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011229	CAAA	2	8	456378	456385	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_011229	TTAA	2	8	456451	456458	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011229	AAAT	2	8	456579	456586	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011229	CTTA	2	8	458339	458346	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_011229	CAAT	2	8	458725	458732	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_011229	ATTT	2	8	459638	459645	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011229	TTTA	2	8	461116	461123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011229	TAAT	2	8	461128	461135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011229	TACA	2	8	468199	468206	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_011229	AGAA	2	8	469788	469795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011229	AGGG	2	8	469965	469972	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011229	TTGT	2	8	476578	476585	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011229	TATT	2	8	477845	477852	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011229	TATT	2	8	477942	477949	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011229	TTAA	2	8	478446	478453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011229	TGTT	2	8	485421	485428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011229	TATT	2	8	487553	487560	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011229	ATTT	2	8	494426	494433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011229	ATTT	2	8	494758	494765	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011229	TAAT	2	8	494837	494844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011229	GTTT	2	8	497491	497498	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.