MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl15

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011226	ATAC	2	8	145	152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011226	GGAT	2	8	305	312	25 %	25 %	50 %	0 %	203283913
3	NC_011226	TGAT	2	8	991	998	25 %	50 %	25 %	0 %	203283914
4	NC_011226	ATAC	2	8	1215	1222	50 %	25 %	0 %	25 %	203283914
5	NC_011226	ATCT	2	8	1320	1327	25 %	50 %	0 %	25 %	203283914
6	NC_011226	TAAA	2	8	1333	1340	75 %	25 %	0 %	0 %	203283914
7	NC_011226	TCTT	2	8	1692	1699	0 %	75 %	0 %	25 %	203283915
8	NC_011226	TATG	2	8	2103	2110	25 %	50 %	25 %	0 %	203283915
9	NC_011226	TTTA	2	8	2301	2308	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
10	NC_011226	ATTG	2	8	2770	2777	25 %	50 %	25 %	0 %	203283915
11	NC_011226	TATT	2	8	2798	2805	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
12	NC_011226	ATTT	2	8	2943	2950	25 %	75 %	0 %	0 %	203283915
13	NC_011226	AAGA	2	8	3348	3355	75 %	0 %	25 %	0 %	203283916
14	NC_011226	AGTA	2	8	3830	3837	50 %	25 %	25 %	0 %	203283916
15	NC_011226	ATCA	2	8	3852	3859	50 %	25 %	0 %	25 %	203283916
16	NC_011226	GATA	2	8	4188	4195	50 %	25 %	25 %	0 %	203283916
17	NC_011226	CAAG	2	8	4204	4211	50 %	0 %	25 %	25 %	203283916
18	NC_011226	TAGT	2	8	4964	4971	25 %	50 %	25 %	0 %	203283917
19	NC_011226	GATT	2	8	5319	5326	25 %	50 %	25 %	0 %	203283918
20	NC_011226	GTAA	2	8	5370	5377	50 %	25 %	25 %	0 %	203283918
21	NC_011226	AAAT	2	8	5609	5616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011226	GTAA	2	8	6354	6361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011226	ACAA	2	8	6704	6711	75 %	0 %	0 %	25 %	203283920
24	NC_011226	AAGA	2	8	6965	6972	75 %	0 %	25 %	0 %	203283920
25	NC_011226	AATA	2	8	6989	6996	75 %	25 %	0 %	0 %	203283920
26	NC_011226	AAGA	2	8	7115	7122	75 %	0 %	25 %	0 %	203283920
27	NC_011226	AAAC	2	8	7327	7334	75 %	0 %	0 %	25 %	203283920
28	NC_011226	AGAC	2	8	7663	7670	50 %	0 %	25 %	25 %	203283920
29	NC_011226	CAAT	2	8	7702	7709	50 %	25 %	0 %	25 %	203283920
30	NC_011226	TTAA	2	8	7782	7789	50 %	50 %	0 %	0 %	203283920
31	NC_011226	GAAA	2	8	8219	8226	75 %	0 %	25 %	0 %	203283921
32	NC_011226	GATA	2	8	8451	8458	50 %	25 %	25 %	0 %	203283922
33	NC_011226	TAAC	2	8	9715	9722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011226	TTAA	2	8	9880	9887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011226	TTAA	2	8	9907	9914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011226	TTTA	2	8	9932	9939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011226	ATTT	2	8	9984	9991	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011226	TTAG	2	8	10227	10234	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011226	AAAG	2	8	10243	10250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011226	AAAC	2	8	10745	10752	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_011226	GTAA	2	8	11409	11416	50 %	25 %	25 %	0 %	203283924
42	NC_011226	GAAG	2	8	11576	11583	50 %	0 %	50 %	0 %	203283924
43	NC_011226	AGTA	2	8	12197	12204	50 %	25 %	25 %	0 %	203283924
44	NC_011226	TCAT	2	8	12485	12492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_011226	ATTT	2	8	12507	12514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011226	TTTG	2	8	12520	12527	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011226	GAAG	2	8	12601	12608	50 %	0 %	50 %	0 %	203283925
48	NC_011226	AGGA	2	8	12733	12740	50 %	0 %	50 %	0 %	203283925
49	NC_011226	AGTA	2	8	12772	12779	50 %	25 %	25 %	0 %	203283925
50	NC_011226	GAAA	2	8	12870	12877	75 %	0 %	25 %	0 %	203283925
51	NC_011226	AAAG	2	8	13117	13124	75 %	0 %	25 %	0 %	203283925
52	NC_011226	TAAA	2	8	13179	13186	75 %	25 %	0 %	0 %	203283925
53	NC_011226	AATA	2	8	13306	13313	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011226	AAGA	2	8	13570	13577	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011226	ATTT	2	8	13795	13802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011226	ATTT	2	8	13852	13859	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011226	GTTT	2	8	14155	14162	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011226	TGAG	2	8	14386	14393	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011226	AAAG	2	8	14489	14496	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011226	TTAA	2	8	14616	14623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011226	TAAG	2	8	14761	14768	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.