MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl15

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011226	TTA	2	6	75	80	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011226	AAT	2	6	807	812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011226	TAT	2	6	3075	3080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011226	ACT	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011226	TAG	2	6	5510	5515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011226	ATT	2	6	5584	5589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011226	AGT	2	6	5592	5597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011226	CAT	2	6	5617	5622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011226	CTG	2	6	5633	5638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011226	ATG	2	6	5690	5695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011226	TAA	2	6	6373	6378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011226	CAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011226	ATT	2	6	6552	6557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011226	TTA	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011226	TAA	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011226	TAG	2	6	9822	9827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011226	TAC	2	6	9839	9844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011226	ATT	2	6	10034	10039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011226	ATT	2	6	10140	10145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011226	TAG	2	6	10271	10276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011226	TAT	3	9	10330	10338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011226	TTG	2	6	10403	10408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011226	TAA	2	6	10471	10476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011226	TAT	2	6	10572	10577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011226	TTG	2	6	10685	10690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011226	AAG	2	6	10734	10739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011226	AAG	2	6	10754	10759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011226	GTT	2	6	10830	10835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011226	AAT	2	6	10852	10857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011226	TTA	2	6	10882	10887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011226	AAC	2	6	10991	10996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011226	ATC	2	6	11053	11058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_011226	GTA	2	6	11064	11069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011226	GAA	2	6	11073	11078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011226	TGT	2	6	11156	11161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011226	AGG	2	6	11260	11265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011226	AGA	2	6	11268	11273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011226	ATA	2	6	12362	12367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011226	TTA	2	6	12450	12455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011226	AGG	2	6	12555	12560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011226	GAA	2	6	12562	12567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011226	TAA	3	9	13289	13297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011226	TTA	2	6	13420	13425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011226	ATT	2	6	13484	13489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011226	AGT	2	6	13597	13602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011226	TGT	2	6	13776	13781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011226	TTA	2	6	13816	13821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011226	TAT	2	6	13860	13865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011226	ATA	2	6	13884	13889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011226	ATT	2	6	13936	13941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011226	TAA	2	6	14095	14100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011226	ATC	2	6	14102	14107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011226	AGG	2	6	14239	14244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011226	AGA	2	6	14247	14252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011226	TAA	2	6	14290	14295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011226	TGA	4	12	14308	14319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011226	GGA	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011226	AGG	3	9	14357	14365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011226	GAG	2	6	14374	14379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011226	AGA	2	6	14549	14554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011226	AGA	2	6	14558	14563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011226	GGT	2	6	14586	14591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011226	TCA	2	6	14604	14609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_011226	TAG	2	6	14791	14796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011226	ATA	2	6	14866	14871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011226	AGG	2	6	14872	14877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011226	ATA	2	6	14899	14904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011226	ATC	2	6	14948	14953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011226	GAA	2	6	14964	14969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011226	GAA	2	6	14994	14999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011226	AGG	2	6	15014	15019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011226	GAT	2	6	15030	15035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.