MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011206	TCATTT	2	12	33162	33173	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011206	GTGCTG	2	12	85964	85975	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011206	TTGCGC	2	12	90975	90986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011206	GGCTGG	2	12	107759	107770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011206	TTCGAC	2	12	108960	108971	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011206	TTCGAT	2	12	138262	138273	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011206	CGTAAG	2	12	144471	144482	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011206	CCGTAT	2	12	168139	168150	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_011206	TATGGA	2	12	200188	200199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011206	GGCCCC	2	12	205246	205257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_011206	CTCTTG	2	12	219678	219689	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011206	ACTGGT	2	12	243254	243265	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011206	TCAGGG	2	12	287040	287051	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011206	GGTTCT	2	12	316251	316262	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_011206	TTTCCG	2	12	457293	457304	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011206	GCGCCG	2	12	537805	537816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_011206	AGGGCG	2	12	552527	552538	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011206	GAGATG	2	12	598729	598740	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011206	AAGGGC	2	12	626849	626860	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011206	CGAAAT	2	12	847740	847751	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011206	GGATGT	2	12	862879	862890	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011206	CGGATG	2	12	970061	970072	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_011206	GGCATG	2	12	975066	975077	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_011206	TGCCGG	2	12	1059197	1059208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011206	GCGCTT	2	12	1101632	1101643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011206	GCGGGT	2	12	1119984	1119995	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_011206	TTATTG	2	12	1197153	1197164	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011206	AGGGCG	2	12	1286677	1286688	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011206	GGTCTG	2	12	1357051	1357062	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_011206	ATTGCT	2	12	1359203	1359214	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011206	CGCCAA	2	12	1359428	1359439	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_011206	CTCCGT	2	12	1415377	1415388	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
33	NC_011206	TGGCGC	2	12	1443886	1443897	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011206	CCCTGC	2	12	1460061	1460072	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_011206	GTTCTG	2	12	1465569	1465580	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011206	GTTTTT	2	12	1493923	1493934	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011206	TAGTTA	2	12	1587193	1587204	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011206	TTTTGC	2	12	1623637	1623648	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011206	CTTTGC	2	12	1767777	1767788	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011206	CCTGCC	2	12	2100361	2100372	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_011206	CTGTCG	2	12	2100471	2100482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011206	TCCCTG	2	12	2124765	2124776	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011206	GGCAGC	2	12	2124986	2124997	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011206	TTAACG	3	18	2126889	2126906	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_011206	ATAGCC	2	12	2163890	2163901	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011206	GCATTT	2	12	2208993	2209004	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011206	GTTCCA	2	12	2246980	2246991	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_011206	CTTCGG	2	12	2331043	2331054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011206	ACCTGA	2	12	2369493	2369504	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011206	CGGCCT	2	12	2370608	2370619	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
51	NC_011206	CCGTAT	2	12	2376106	2376117	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011206	TTGCAT	2	12	2391793	2391804	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011206	CCCATG	2	12	2418872	2418883	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
54	NC_011206	CAGCCG	2	12	2434735	2434746	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011206	GGTAGC	2	12	2455690	2455701	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011206	CCATAC	2	12	2468080	2468091	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_011206	AGCGTG	2	12	2482893	2482904	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_011206	TCCGAC	2	12	2495634	2495645	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_011206	GCATAA	2	12	2542843	2542854	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011206	ATGGAA	2	12	2700341	2700352	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011206	GCCATG	2	12	2746749	2746760	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011206	CCGCTT	2	12	2765261	2765272	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011206	GCGCCA	2	12	2839061	2839072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.