MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 3962

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011206	TTC	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011206	CGC	2	6	51	56	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_011206	GCC	2	6	57	62	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011206	CTA	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011206	TAG	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011206	ATT	2	6	1830	1835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011206	GAT	2	6	6493	6498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011206	TCC	2	6	6502	6507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_011206	CAG	2	6	6543	6548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011206	ATT	2	6	10108	10113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011206	GTA	2	6	10167	10172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011206	CGG	2	6	14350	14355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011206	TTC	2	6	14973	14978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011206	CCG	2	6	22587	22592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011206	AAT	2	6	22644	22649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011206	AGG	2	6	28183	28188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011206	TGC	2	6	33146	33151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011206	TGA	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011206	TGC	2	6	40143	40148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011206	CCG	2	6	41864	41869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_011206	GGC	2	6	47154	47159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011206	CCG	2	6	47172	47177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_011206	GAT	2	6	47247	47252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011206	GCA	2	6	47272	47277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011206	GAT	2	6	47310	47315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011206	TAT	2	6	47330	47335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011206	ACA	2	6	47537	47542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011206	GTG	2	6	48753	48758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011206	CCG	2	6	52558	52563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011206	CGC	2	6	53568	53573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_011206	TGA	2	6	54697	54702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011206	CTC	2	6	55759	55764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011206	CTC	2	6	58985	58990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_011206	GCG	2	6	59823	59828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011206	CAA	2	6	59860	59865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_011206	TTG	2	6	60203	60208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011206	GCG	2	6	64657	64662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011206	CGC	2	6	65858	65863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_011206	GGA	2	6	73469	73474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011206	ATG	2	6	74038	74043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011206	CGC	2	6	74044	74049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_011206	GCC	2	6	75517	75522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011206	CAT	2	6	75575	75580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011206	GCT	2	6	75657	75662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_011206	CCG	3	9	76973	76981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011206	CGC	2	6	77010	77015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_011206	GGT	2	6	85710	85715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011206	ATA	2	6	85758	85763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011206	AGC	2	6	85818	85823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011206	CCG	2	6	85857	85862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_011206	CCA	2	6	85866	85871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_011206	GAA	2	6	86031	86036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011206	ATG	2	6	86050	86055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011206	CAG	2	6	86147	86152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011206	TGT	2	6	86281	86286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011206	TGT	2	6	86343	86348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011206	CAT	2	6	86383	86388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011206	AAC	2	6	87470	87475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011206	AGG	2	6	88319	88324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011206	AAG	2	6	88365	88370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011206	CGT	2	6	88511	88516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011206	AGG	2	6	88562	88567	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011206	ATT	2	6	89895	89900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011206	CAG	2	6	89913	89918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011206	TGA	2	6	90034	90039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011206	CAC	2	6	90080	90085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_011206	GAA	2	6	90219	90224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011206	TGG	2	6	90227	90232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011206	CGC	2	6	90272	90277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_011206	TGG	2	6	90309	90314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011206	CCT	2	6	90688	90693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_011206	TCG	2	6	90938	90943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011206	TCA	2	6	90950	90955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011206	ACG	2	6	91031	91036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_011206	ACT	2	6	91937	91942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011206	TGC	2	6	92009	92014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011206	CAG	2	6	94315	94320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_011206	TAT	2	6	94363	94368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011206	CAT	2	6	94382	94387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_011206	GAG	2	6	94422	94427	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011206	CCG	2	6	94881	94886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_011206	AAG	2	6	97956	97961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011206	GCC	2	6	98040	98045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_011206	AGC	2	6	98068	98073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011206	GGC	2	6	98383	98388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_011206	TGC	2	6	98390	98395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_011206	TGT	2	6	101774	101779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011206	AAC	2	6	108147	108152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_011206	GTC	3	9	109015	109023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_011206	GTC	2	6	109027	109032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011206	CTC	2	6	111831	111836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_011206	CAA	2	6	111854	111859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_011206	CTT	2	6	111911	111916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011206	GGC	2	6	112022	112027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011206	TCA	2	6	112082	112087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011206	CAT	2	6	112145	112150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011206	AGC	2	6	112207	112212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011206	TTG	2	6	112231	112236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011206	TGC	2	6	112261	112266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_011206	GGC	2	6	113299	113304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_011206	CGC	2	6	113305	113310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_011206	CAG	2	6	113362	113367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011206	TGG	2	6	113412	113417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011206	CGG	2	6	113469	113474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011206	TCC	2	6	113485	113490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_011206	TGG	2	6	113519	113524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011206	GGT	2	6	113958	113963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011206	CAT	2	6	115342	115347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011206	CAC	2	6	115467	115472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011206	TTC	2	6	116582	116587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011206	GCA	2	6	116610	116615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_011206	TGG	2	6	116639	116644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011206	TGA	2	6	116690	116695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011206	TAG	2	6	116714	116719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011206	TTA	2	6	119324	119329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011206	GCG	2	6	119341	119346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011206	ATG	2	6	123323	123328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011206	TGA	2	6	123347	123352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011206	CTG	2	6	123409	123414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011206	CGG	2	6	123446	123451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011206	TGA	2	6	123469	123474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011206	CCG	2	6	124197	124202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011206	GCC	2	6	124909	124914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_011206	GAC	2	6	124935	124940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011206	GCC	2	6	124949	124954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_011206	CAC	2	6	125066	125071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011206	ACG	2	6	129935	129940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011206	GAT	2	6	129982	129987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011206	TAT	2	6	130127	130132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011206	GCG	2	6	130268	130273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011206	GAT	2	6	130282	130287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011206	CAA	2	6	130402	130407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011206	AAG	2	6	130568	130573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011206	AGC	2	6	136784	136789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011206	TCA	2	6	136833	136838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_011206	CTT	2	6	137411	137416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011206	GCC	2	6	138084	138089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011206	CGG	2	6	138106	138111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011206	AGA	2	6	138134	138139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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142	NC_011206	GGA	2	6	141064	141069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011206	CCG	2	6	141080	141085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_011206	CCA	2	6	141137	141142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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