MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993 chromosome

Total Repeats: 4550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011206	GC	3	6	1219	1224	0 %	0 %	50 %	50 %	198282149
2	NC_011206	AC	3	6	2142	2147	50 %	0 %	0 %	50 %	198282150
3	NC_011206	GC	3	6	5729	5734	0 %	0 %	50 %	50 %	198282152
4	NC_011206	CG	3	6	5938	5943	0 %	0 %	50 %	50 %	198282152
5	NC_011206	CG	3	6	6449	6454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011206	CG	3	6	6663	6668	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
7	NC_011206	CG	4	8	6919	6926	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
8	NC_011206	GC	3	6	7710	7715	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
9	NC_011206	GC	3	6	8158	8163	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
10	NC_011206	GC	3	6	8344	8349	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
11	NC_011206	CG	3	6	8751	8756	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
12	NC_011206	GC	3	6	9416	9421	0 %	0 %	50 %	50 %	198282153
13	NC_011206	GC	3	6	11637	11642	0 %	0 %	50 %	50 %	198282156
14	NC_011206	GC	3	6	13619	13624	0 %	0 %	50 %	50 %	198282156
15	NC_011206	AT	3	6	14405	14410	50 %	50 %	0 %	0 %	198282158
16	NC_011206	GC	3	6	16821	16826	0 %	0 %	50 %	50 %	198282162
17	NC_011206	GC	3	6	17090	17095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011206	GC	4	8	17649	17656	0 %	0 %	50 %	50 %	198282164
19	NC_011206	CG	3	6	18099	18104	0 %	0 %	50 %	50 %	198282164
20	NC_011206	GC	3	6	18273	18278	0 %	0 %	50 %	50 %	198282164
21	NC_011206	GC	3	6	18734	18739	0 %	0 %	50 %	50 %	198282164
22	NC_011206	GT	3	6	18748	18753	0 %	50 %	50 %	0 %	198282164
23	NC_011206	GC	3	6	18886	18891	0 %	0 %	50 %	50 %	198282164
24	NC_011206	GC	3	6	20237	20242	0 %	0 %	50 %	50 %	198282165
25	NC_011206	AG	3	6	20243	20248	50 %	0 %	50 %	0 %	198282165
26	NC_011206	CG	3	6	20751	20756	0 %	0 %	50 %	50 %	198282166
27	NC_011206	GC	3	6	21054	21059	0 %	0 %	50 %	50 %	198282166
28	NC_011206	GC	3	6	22897	22902	0 %	0 %	50 %	50 %	198282168
29	NC_011206	CG	3	6	23466	23471	0 %	0 %	50 %	50 %	198282169
30	NC_011206	GC	3	6	24460	24465	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
31	NC_011206	GC	3	6	24565	24570	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
32	NC_011206	GC	3	6	24573	24578	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
33	NC_011206	GC	3	6	24623	24628	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
34	NC_011206	GC	3	6	25297	25302	0 %	0 %	50 %	50 %	198282170
35	NC_011206	CG	3	6	25859	25864	0 %	0 %	50 %	50 %	198282171
36	NC_011206	CG	3	6	26950	26955	0 %	0 %	50 %	50 %	198282172
37	NC_011206	GC	3	6	27396	27401	0 %	0 %	50 %	50 %	198282172
38	NC_011206	AG	3	6	27763	27768	50 %	0 %	50 %	0 %	198282172
39	NC_011206	GT	3	6	27969	27974	0 %	50 %	50 %	0 %	198282172
40	NC_011206	CG	3	6	28732	28737	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
41	NC_011206	GC	3	6	28934	28939	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
42	NC_011206	GC	4	8	29410	29417	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
43	NC_011206	GC	3	6	29431	29436	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
44	NC_011206	CG	3	6	29476	29481	0 %	0 %	50 %	50 %	198282173
45	NC_011206	CA	3	6	29509	29514	50 %	0 %	0 %	50 %	198282173
46	NC_011206	AT	3	6	29670	29675	50 %	50 %	0 %	0 %	198282174
47	NC_011206	GA	3	6	29906	29911	50 %	0 %	50 %	0 %	198282175
48	NC_011206	TG	3	6	29957	29962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011206	CA	3	6	30411	30416	50 %	0 %	0 %	50 %	198282176
50	NC_011206	TC	3	6	30672	30677	0 %	50 %	0 %	50 %	198282176
51	NC_011206	GA	3	6	30875	30880	50 %	0 %	50 %	0 %	198282176
52	NC_011206	CA	3	6	31524	31529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011206	TG	3	6	32540	32545	0 %	50 %	50 %	0 %	198282177
54	NC_011206	AG	3	6	32726	32731	50 %	0 %	50 %	0 %	198282177
55	NC_011206	AC	3	6	33551	33556	50 %	0 %	0 %	50 %	198282178
56	NC_011206	GC	3	6	33838	33843	0 %	0 %	50 %	50 %	198282178
57	NC_011206	AT	3	6	35002	35007	50 %	50 %	0 %	0 %	198282179
58	NC_011206	TC	3	6	35084	35089	0 %	50 %	0 %	50 %	198282179
59	NC_011206	AT	3	6	35280	35285	50 %	50 %	0 %	0 %	198282179
60	NC_011206	GC	3	6	35719	35724	0 %	0 %	50 %	50 %	198282179
61	NC_011206	AT	3	6	35883	35888	50 %	50 %	0 %	0 %	198282179
62	NC_011206	AT	3	6	35919	35924	50 %	50 %	0 %	0 %	198282179
63	NC_011206	GA	3	6	36130	36135	50 %	0 %	50 %	0 %	198282179
64	NC_011206	GC	4	8	36597	36604	0 %	0 %	50 %	50 %	198282180
65	NC_011206	CG	3	6	39592	39597	0 %	0 %	50 %	50 %	198282182
66	NC_011206	TC	3	6	39612	39617	0 %	50 %	0 %	50 %	198282183
67	NC_011206	GC	3	6	40389	40394	0 %	0 %	50 %	50 %	198282185
68	NC_011206	GC	3	6	40964	40969	0 %	0 %	50 %	50 %	198282185
69	NC_011206	GC	3	6	41453	41458	0 %	0 %	50 %	50 %	198282185
70	NC_011206	GC	3	6	41775	41780	0 %	0 %	50 %	50 %	198282185
71	NC_011206	CT	3	6	42298	42303	0 %	50 %	0 %	50 %	198282186
72	NC_011206	GC	3	6	43810	43815	0 %	0 %	50 %	50 %	198282187
73	NC_011206	CG	3	6	44120	44125	0 %	0 %	50 %	50 %	198282188
74	NC_011206	GC	3	6	44515	44520	0 %	0 %	50 %	50 %	198282188
75	NC_011206	GC	3	6	45361	45366	0 %	0 %	50 %	50 %	198282188
76	NC_011206	GC	3	6	47774	47779	0 %	0 %	50 %	50 %	198282190
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78	NC_011206	GC	3	6	53269	53274	0 %	0 %	50 %	50 %	198282196
79	NC_011206	AG	3	6	53957	53962	50 %	0 %	50 %	0 %	198282197
80	NC_011206	GC	3	6	54727	54732	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011206	GA	3	6	56012	56017	50 %	0 %	50 %	0 %	198282199
82	NC_011206	TC	3	6	56589	56594	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_011206	AG	3	6	57064	57069	50 %	0 %	50 %	0 %	198282200
84	NC_011206	CG	3	6	57167	57172	0 %	0 %	50 %	50 %	198282201
85	NC_011206	GC	3	6	57580	57585	0 %	0 %	50 %	50 %	198282201
86	NC_011206	GC	3	6	58115	58120	0 %	0 %	50 %	50 %	198282202
87	NC_011206	GC	3	6	58928	58933	0 %	0 %	50 %	50 %	198282202
88	NC_011206	AT	3	6	59575	59580	50 %	50 %	0 %	0 %	198282203
89	NC_011206	CG	3	6	59621	59626	0 %	0 %	50 %	50 %	198282203
90	NC_011206	GC	4	8	60148	60155	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_011206	AC	3	6	60233	60238	50 %	0 %	0 %	50 %	198282205
92	NC_011206	GC	3	6	60515	60520	0 %	0 %	50 %	50 %	198282205
93	NC_011206	GC	3	6	61129	61134	0 %	0 %	50 %	50 %	198282205
94	NC_011206	GC	3	6	63002	63007	0 %	0 %	50 %	50 %	198282206
95	NC_011206	GC	3	6	63672	63677	0 %	0 %	50 %	50 %	198282207
96	NC_011206	GC	3	6	64948	64953	0 %	0 %	50 %	50 %	198282209
97	NC_011206	GC	3	6	64984	64989	0 %	0 %	50 %	50 %	198282209
98	NC_011206	GC	3	6	66501	66506	0 %	0 %	50 %	50 %	198282211
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100	NC_011206	GC	3	6	67004	67009	0 %	0 %	50 %	50 %	198282212
101	NC_011206	CG	3	6	67107	67112	0 %	0 %	50 %	50 %	198282212
102	NC_011206	TC	3	6	68081	68086	0 %	50 %	0 %	50 %	198282214
103	NC_011206	GC	3	6	68937	68942	0 %	0 %	50 %	50 %	198282215
104	NC_011206	CG	3	6	68994	68999	0 %	0 %	50 %	50 %	198282215
105	NC_011206	GC	3	6	71077	71082	0 %	0 %	50 %	50 %	198282217
106	NC_011206	AG	3	6	71272	71277	50 %	0 %	50 %	0 %	198282217
107	NC_011206	GC	3	6	71839	71844	0 %	0 %	50 %	50 %	198282218
108	NC_011206	GC	3	6	72490	72495	0 %	0 %	50 %	50 %	198282219
109	NC_011206	GC	3	6	72670	72675	0 %	0 %	50 %	50 %	198282219
110	NC_011206	GC	3	6	73028	73033	0 %	0 %	50 %	50 %	198282220
111	NC_011206	TC	3	6	73707	73712	0 %	50 %	0 %	50 %	198282221
112	NC_011206	CG	3	6	76989	76994	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_011206	GC	3	6	78783	78788	0 %	0 %	50 %	50 %	198282228
114	NC_011206	TC	3	6	79563	79568	0 %	50 %	0 %	50 %	198282228
115	NC_011206	AC	3	6	80098	80103	50 %	0 %	0 %	50 %	198282229
116	NC_011206	TA	3	6	80664	80669	50 %	50 %	0 %	0 %	198282229
117	NC_011206	CT	3	6	81279	81284	0 %	50 %	0 %	50 %	198282230
118	NC_011206	AT	3	6	81926	81931	50 %	50 %	0 %	0 %	198282230
119	NC_011206	TA	3	6	82158	82163	50 %	50 %	0 %	0 %	198282231
120	NC_011206	GC	3	6	82214	82219	0 %	0 %	50 %	50 %	198282231
121	NC_011206	CG	3	6	83606	83611	0 %	0 %	50 %	50 %	198282232
122	NC_011206	GC	3	6	83831	83836	0 %	0 %	50 %	50 %	198282232
123	NC_011206	GC	3	6	84206	84211	0 %	0 %	50 %	50 %	198282232
124	NC_011206	GC	4	8	85310	85317	0 %	0 %	50 %	50 %	198282234
125	NC_011206	GC	3	6	86821	86826	0 %	0 %	50 %	50 %	198282236
126	NC_011206	GC	4	8	87103	87110	0 %	0 %	50 %	50 %	198282237
127	NC_011206	TG	3	6	87186	87191	0 %	50 %	50 %	0 %	198282237
128	NC_011206	GA	3	6	88761	88766	50 %	0 %	50 %	0 %	198282242
129	NC_011206	GC	3	6	91360	91365	0 %	0 %	50 %	50 %	198282245
130	NC_011206	GC	3	6	92734	92739	0 %	0 %	50 %	50 %	198282247
131	NC_011206	GA	3	6	92933	92938	50 %	0 %	50 %	0 %	198282247
132	NC_011206	GC	3	6	93561	93566	0 %	0 %	50 %	50 %	198282247
133	NC_011206	TG	3	6	94810	94815	0 %	50 %	50 %	0 %	198282248
134	NC_011206	TA	3	6	94899	94904	50 %	50 %	0 %	0 %	198282249
135	NC_011206	TG	3	6	94937	94942	0 %	50 %	50 %	0 %	198282249
136	NC_011206	AT	3	6	95355	95360	50 %	50 %	0 %	0 %	198282249
137	NC_011206	GC	3	6	95714	95719	0 %	0 %	50 %	50 %	198282249
138	NC_011206	GC	3	6	96283	96288	0 %	0 %	50 %	50 %	198282250
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140	NC_011206	TC	3	6	96973	96978	0 %	50 %	0 %	50 %	198282251
141	NC_011206	CG	3	6	97289	97294	0 %	0 %	50 %	50 %	198282251
142	NC_011206	GC	3	6	98185	98190	0 %	0 %	50 %	50 %	198282252
143	NC_011206	TC	3	6	98231	98236	0 %	50 %	0 %	50 %	198282252
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