MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 200

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	TCTTAA	2	12	23205	23216	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011205	CACGAA	2	12	59348	59359	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011205	TGTGGT	2	12	74852	74863	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011205	AAAGAA	2	12	75168	75179	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011205	TGCCAG	2	12	80574	80585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011205	CGGGTG	2	12	112064	112075	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011205	AATGCT	2	12	116690	116701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011205	AAGAGG	2	12	123879	123890	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011205	GGATAA	2	12	129839	129850	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011205	CAATAT	2	12	227433	227444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011205	TTTTTA	2	12	248005	248016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011205	TATCGG	2	12	317821	317832	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011205	CGATGA	2	12	332666	332677	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_011205	GACGCA	2	12	333497	333508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011205	CAACGG	2	12	334049	334060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011205	ATGACC	2	12	334840	334851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011205	CTGTTG	2	12	343799	343810	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_011205	AGATGA	2	12	354502	354513	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011205	TTCTCA	2	12	362490	362501	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_011205	TGGCTG	2	12	373812	373823	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011205	CTCATT	2	12	381582	381593	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011205	TAATAT	2	12	429011	429022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011205	CGTTGC	2	12	461213	461224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_011205	GTGATA	2	12	481087	481098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011205	TGCTAT	2	12	531336	531347	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_011205	CAGGCG	2	12	543467	543478	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011205	TGCAAT	2	12	594742	594753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011205	TAACGT	2	12	669095	669106	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_011205	CGCTGG	2	12	672235	672246	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_011205	TGCAAA	2	12	681340	681351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011205	ACCAGT	2	12	718626	718637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011205	TTTTTA	2	12	787084	787095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011205	CTGGCT	2	12	787182	787193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_011205	CAAAAA	2	12	834041	834052	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011205	TGAAAA	2	12	924177	924188	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011205	ATTTTT	2	12	930798	930809	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011205	TCATCG	2	12	971664	971675	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011205	GATGAC	2	12	993283	993294	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011205	ACCCAA	2	12	1085836	1085847	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_011205	TAAATG	2	12	1121958	1121969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011205	ATCTCG	2	12	1122424	1122435	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_011205	AAAAAT	2	12	1141473	1141484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011205	CGTTTA	2	12	1153497	1153508	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_011205	TGAGTA	2	12	1155937	1155948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011205	CGAAAC	2	12	1203245	1203256	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011205	GATGGT	2	12	1226353	1226364	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011205	TTGAAC	2	12	1236009	1236020	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011205	AAGTCA	2	12	1240889	1240900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_011205	TATCAA	2	12	1278011	1278022	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011205	GCTTTA	2	12	1295602	1295613	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011205	TACCTG	2	12	1313909	1313920	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011205	TATTTT	2	12	1397093	1397104	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011205	TGAAGA	2	12	1408461	1408472	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011205	CGACCA	2	12	1428333	1428344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
55	NC_011205	ACGTTG	2	12	1431828	1431839	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_011205	TTAACA	2	12	1467936	1467947	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_011205	AGCCAA	2	12	1472659	1472670	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_011205	CGCTCC	2	12	1474610	1474621	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_011205	CGCAGA	2	12	1556120	1556131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011205	CATTTC	2	12	1565508	1565519	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_011205	ACTATA	2	12	1568725	1568736	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011205	TGGCAG	2	12	1640134	1640145	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011205	ACATAA	2	12	1649456	1649467	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_011205	GGGGAA	2	12	1696375	1696386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011205	TTAATG	2	12	1699288	1699299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011205	AATATC	2	12	1713855	1713866	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011205	TGGGCG	2	12	1717338	1717349	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011205	ACTAAA	2	12	1720964	1720975	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011205	TCGCCT	2	12	1763893	1763904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_011205	CAAAAA	2	12	1770193	1770204	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011205	CGCCAA	2	12	1832553	1832564	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_011205	AAGACT	2	12	1896658	1896669	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_011205	GCGAGC	2	12	1911561	1911572	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_011205	ATCACC	2	12	2002891	2002902	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_011205	GCGCTT	2	12	2005175	2005186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011205	TAAACC	2	12	2028192	2028203	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_011205	ATAATT	2	12	2124468	2124479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011205	CTCCAG	2	12	2157942	2157953	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011205	ACATAT	2	12	2191202	2191213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_011205	TCAACC	2	12	2197092	2197103	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_011205	TATGCC	2	12	2208665	2208676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011205	AATATA	2	12	2208703	2208714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011205	GATTCG	2	12	2264429	2264440	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_011205	AATCAG	2	12	2274468	2274479	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_011205	GTAGAT	2	12	2306079	2306090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011205	GTTATT	2	12	2320066	2320077	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011205	ATAACA	2	12	2356894	2356905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_011205	ACATAA	2	12	2357112	2357123	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_011205	TGTTTA	2	12	2364205	2364216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011205	TAAACA	2	12	2378376	2378387	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_011205	TTTATC	2	12	2394027	2394038	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_011205	GAAATT	2	12	2407444	2407455	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011205	TATCCA	2	12	2416312	2416323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_011205	CATCGC	2	12	2417423	2417434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011205	CCTTCA	2	12	2488421	2488432	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_011205	TAACGC	2	12	2494677	2494688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011205	TGGCCG	2	12	2564268	2564279	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011205	AGAAAA	2	12	2597594	2597605	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011205	CCAGGC	2	12	2606259	2606270	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
100	NC_011205	GGCGAT	2	12	2617311	2617322	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011205	ATTTTT	2	12	2625885	2625896	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011205	CTCCCC	2	12	2627887	2627898	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
103	NC_011205	TACCGC	2	12	2637512	2637523	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
104	NC_011205	TGGCGT	2	12	2640762	2640773	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_011205	GTAAGT	2	12	2641973	2641984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011205	TTTTCA	2	12	2651285	2651296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_011205	CAAGTG	2	12	2668392	2668403	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011205	CTCAAC	2	12	2750647	2750658	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011205	CCTGCG	2	12	2757045	2757056	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
110	NC_011205	AACTGG	2	12	2757419	2757430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011205	CTCGCC	2	12	2758856	2758867	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011205	CTCGCC	2	12	2759045	2759056	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_011205	CGATGA	2	12	2760152	2760163	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011205	CCGTCG	2	12	2760408	2760419	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
115	NC_011205	TATCCG	2	12	2762494	2762505	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011205	TCAGCG	2	12	2765245	2765256	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011205	TTCACC	2	12	2766300	2766311	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_011205	CGGTGA	2	12	2767891	2767902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_011205	ATGGTG	2	12	2772827	2772838	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011205	GCTACA	2	12	2786084	2786095	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011205	TCCAGC	2	12	2795728	2795739	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_011205	TTCGCC	2	12	2797107	2797118	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011205	CGCCAG	2	12	2800326	2800337	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011205	GCCGCT	2	12	2834739	2834750	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
125	NC_011205	TTTGTT	2	12	2859172	2859183	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011205	ACAAAA	2	12	2875443	2875454	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011205	GCAACA	2	12	2956860	2956871	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011205	CTTAGG	2	12	2971223	2971234	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011205	GCCCGC	2	12	2987390	2987401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_011205	CAATAA	2	12	2987648	2987659	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_011205	CGCTTC	2	12	3071491	3071502	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
132	NC_011205	CCATCG	2	12	3091026	3091037	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011205	GATTAT	2	12	3137394	3137405	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011205	GCGATC	2	12	3188671	3188682	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011205	CCACCG	2	12	3232957	3232968	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_011205	TTTTAT	2	12	3234391	3234402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011205	TCGATA	2	12	3248234	3248245	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_011205	TTCAGT	2	12	3300099	3300110	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_011205	TTGCAG	2	12	3370669	3370680	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_011205	TATTCT	2	12	3373522	3373533	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_011205	AGTTGT	2	12	3421353	3421364	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011205	AATGAT	2	12	3427020	3427031	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011205	TAACCA	2	12	3465094	3465105	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_011205	CCAGCG	2	12	3465962	3465973	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
145	NC_011205	GGACAG	2	12	3492087	3492098	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_011205	AACCCT	2	12	3492593	3492604	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_011205	AATGCC	2	12	3513178	3513189	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_011205	CAACTC	2	12	3538012	3538023	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_011205	TTCGGC	2	12	3538625	3538636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_011205	CGTAGT	2	12	3539777	3539788	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_011205	TCCAGT	2	12	3552608	3552619	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_011205	TGTTAT	2	12	3555505	3555516	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011205	GCGGCT	2	12	3602272	3602283	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_011205	ATGGTG	2	12	3602883	3602894	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011205	TGTCGC	2	12	3637653	3637664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011205	ATAGCG	2	12	3793345	3793356	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_011205	CTGGCG	2	12	3794881	3794892	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
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159	NC_011205	GTTGTA	2	12	3864629	3864640	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_011205	TAAAAA	2	12	3872696	3872707	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011205	GCGATC	2	12	3888198	3888209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_011205	ATTATA	2	12	3920552	3920563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011205	ATCAAC	2	12	3931270	3931281	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_011205	AGCGCC	2	12	4819718	4819729	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.