MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 9246

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	198244353
2	NC_011205	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	198244353
3	NC_011205	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	198244850
4	NC_011205	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	198242395
5	NC_011205	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	198242395
6	NC_011205	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	198242395
7	NC_011205	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	198242395
8	NC_011205	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	198242395
9	NC_011205	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	198245613
10	NC_011205	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	198245613
11	NC_011205	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	198245613
12	NC_011205	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	198241895
13	NC_011205	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	198241895
14	NC_011205	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	198245990
15	NC_011205	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	198243756
16	NC_011205	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	198244504
17	NC_011205	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	198244504
18	NC_011205	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	198242776
19	NC_011205	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	198242776
20	NC_011205	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	198242776
21	NC_011205	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	198242776
22	NC_011205	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	198242776
23	NC_011205	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	198242776
24	NC_011205	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	198243023
25	NC_011205	TCAG	2	8	15245	15252	25 %	25 %	25 %	25 %	198245711
26	NC_011205	TTTG	2	8	15535	15542	0 %	75 %	25 %	0 %	198245711
27	NC_011205	CGAA	2	8	15750	15757	50 %	0 %	25 %	25 %	198245711
28	NC_011205	ATTG	2	8	15762	15769	25 %	50 %	25 %	0 %	198245711
29	NC_011205	ATTA	2	8	16430	16437	50 %	50 %	0 %	0 %	198244921
30	NC_011205	ATAA	2	8	16522	16529	75 %	25 %	0 %	0 %	198243700
31	NC_011205	AATA	2	8	17998	18005	75 %	25 %	0 %	0 %	198242422
32	NC_011205	GGGC	2	8	18584	18591	0 %	0 %	75 %	25 %	198242422
33	NC_011205	CGTG	2	8	19284	19291	0 %	25 %	50 %	25 %	198242422
34	NC_011205	CCAA	2	8	21285	21292	50 %	0 %	0 %	50 %	198242908
35	NC_011205	GACG	2	8	21631	21638	25 %	0 %	50 %	25 %	198242908
36	NC_011205	TGGC	2	8	22284	22291	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
37	NC_011205	TGGC	2	8	22390	22397	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
38	NC_011205	CGCC	2	8	22656	22663	0 %	0 %	25 %	75 %	198242908
39	NC_011205	CTGG	2	8	23002	23009	0 %	25 %	50 %	25 %	198242908
40	NC_011205	TTTA	2	8	23500	23507	25 %	75 %	0 %	0 %	198243657
41	NC_011205	TCTG	2	8	23957	23964	0 %	50 %	25 %	25 %	198243657
42	NC_011205	TGAA	2	8	24468	24475	50 %	25 %	25 %	0 %	198242187
43	NC_011205	CCAG	2	8	24739	24746	25 %	0 %	25 %	50 %	198242187
44	NC_011205	ACCG	2	8	25416	25423	25 %	0 %	25 %	50 %	198242340
45	NC_011205	AAAT	2	8	25476	25483	75 %	25 %	0 %	0 %	198242340
46	NC_011205	TCTG	2	8	25933	25940	0 %	50 %	25 %	25 %	198245430
47	NC_011205	GCCT	2	8	26114	26121	0 %	25 %	25 %	50 %	198245430
48	NC_011205	CCTT	2	8	26620	26627	0 %	50 %	0 %	50 %	198245430
49	NC_011205	TCAG	2	8	26979	26986	25 %	25 %	25 %	25 %	198245430
50	NC_011205	ATCA	2	8	27392	27399	50 %	25 %	0 %	25 %	198245430
51	NC_011205	CAGC	2	8	27436	27443	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
52	NC_011205	AGCC	2	8	27926	27933	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
53	NC_011205	CCGA	2	8	28133	28140	25 %	0 %	25 %	50 %	198245430
54	NC_011205	ATTA	2	8	28526	28533	50 %	50 %	0 %	0 %	198246163
55	NC_011205	GGCG	2	8	28768	28775	0 %	0 %	75 %	25 %	198246163
56	NC_011205	ATGA	2	8	29973	29980	50 %	25 %	25 %	0 %	198245849
57	NC_011205	TATC	2	8	30599	30606	25 %	50 %	0 %	25 %	198243542
58	NC_011205	GTAA	2	8	30636	30643	50 %	25 %	25 %	0 %	198243542
59	NC_011205	TTCG	2	8	30898	30905	0 %	50 %	25 %	25 %	198243542
60	NC_011205	CCTG	2	8	32701	32708	0 %	25 %	25 %	50 %	198245062
61	NC_011205	AACA	2	8	32717	32724	75 %	0 %	0 %	25 %	198245062
62	NC_011205	CGCA	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	198245062
63	NC_011205	TAAA	2	8	32961	32968	75 %	25 %	0 %	0 %	198245062
64	NC_011205	TTAT	2	8	33530	33537	25 %	75 %	0 %	0 %	198244833
65	NC_011205	TTGG	2	8	33914	33921	0 %	50 %	50 %	0 %	198244833
66	NC_011205	CTTT	2	8	34294	34301	0 %	75 %	0 %	25 %	198244833
67	NC_011205	GAAG	2	8	34334	34341	50 %	0 %	50 %	0 %	198244833
68	NC_011205	ATAA	2	8	34665	34672	75 %	25 %	0 %	0 %	198244219
69	NC_011205	GTGC	2	8	34788	34795	0 %	25 %	50 %	25 %	198244219
70	NC_011205	TTAA	2	8	34798	34805	50 %	50 %	0 %	0 %	198244219
71	NC_011205	TGGA	2	8	35550	35557	25 %	25 %	50 %	0 %	198242535
72	NC_011205	GGGA	2	8	36494	36501	25 %	0 %	75 %	0 %	198242535
73	NC_011205	ATAC	2	8	37479	37486	50 %	25 %	0 %	25 %	198242289
74	NC_011205	GAAG	2	8	37551	37558	50 %	0 %	50 %	0 %	198242289
75	NC_011205	CACG	2	8	38114	38121	25 %	0 %	25 %	50 %	198242289
76	NC_011205	TAAT	2	8	38216	38223	50 %	50 %	0 %	0 %	198242289
77	NC_011205	CCAT	2	8	38672	38679	25 %	25 %	0 %	50 %	198242289
78	NC_011205	GCGG	2	8	40537	40544	0 %	0 %	75 %	25 %	198243820
79	NC_011205	CTGG	2	8	40755	40762	0 %	25 %	50 %	25 %	198243820
80	NC_011205	CCGA	2	8	41272	41279	25 %	0 %	25 %	50 %	198243820
81	NC_011205	ATCG	2	8	41428	41435	25 %	25 %	25 %	25 %	198243820
82	NC_011205	TCAA	2	8	41489	41496	50 %	25 %	0 %	25 %	198243820
83	NC_011205	AACC	2	8	41755	41762	50 %	0 %	0 %	50 %	198243215
84	NC_011205	GAAA	2	8	41807	41814	75 %	0 %	25 %	0 %	198243215
85	NC_011205	GGTC	2	8	42379	42386	0 %	25 %	50 %	25 %	198243215
86	NC_011205	TTTG	2	8	42903	42910	0 %	75 %	25 %	0 %	198243215
87	NC_011205	GTAT	2	8	43198	43205	25 %	50 %	25 %	0 %	198244819
88	NC_011205	TCCG	2	8	43592	43599	0 %	25 %	25 %	50 %	198244819
89	NC_011205	ATGA	2	8	45654	45661	50 %	25 %	25 %	0 %	198244177
90	NC_011205	AACG	2	8	45956	45963	50 %	0 %	25 %	25 %	198244177
91	NC_011205	GAAA	2	8	46904	46911	75 %	0 %	25 %	0 %	198245761
92	NC_011205	TCGC	2	8	46919	46926	0 %	25 %	25 %	50 %	198245761
93	NC_011205	GCTG	2	8	47110	47117	0 %	25 %	50 %	25 %	198245761
94	NC_011205	CACG	2	8	47808	47815	25 %	0 %	25 %	50 %	198242822
95	NC_011205	CAGC	2	8	47835	47842	25 %	0 %	25 %	50 %	198242822
96	NC_011205	CTGC	2	8	47972	47979	0 %	25 %	25 %	50 %	198242822
97	NC_011205	CATG	2	8	48540	48547	25 %	25 %	25 %	25 %	198242197
98	NC_011205	AAGT	2	8	49334	49341	50 %	25 %	25 %	0 %	198242197
99	NC_011205	CCAG	2	8	49392	49399	25 %	0 %	25 %	50 %	198242197
100	NC_011205	TTGA	2	8	50173	50180	25 %	50 %	25 %	0 %	198242197
101	NC_011205	CATA	2	8	52887	52894	50 %	25 %	0 %	25 %	198244244
102	NC_011205	TCAG	2	8	52898	52905	25 %	25 %	25 %	25 %	198244244
103	NC_011205	TGGC	2	8	53612	53619	0 %	25 %	50 %	25 %	198244244
104	NC_011205	GTTC	2	8	56029	56036	0 %	50 %	25 %	25 %	198245825
105	NC_011205	AGCC	2	8	57439	57446	25 %	0 %	25 %	50 %	198245423
106	NC_011205	AAAG	2	8	57518	57525	75 %	0 %	25 %	0 %	198245423
107	NC_011205	ATGG	2	8	57651	57658	25 %	25 %	50 %	0 %	198245423
108	NC_011205	TGAT	2	8	58323	58330	25 %	50 %	25 %	0 %	198242816
109	NC_011205	TGGA	2	8	58992	58999	25 %	25 %	50 %	0 %	198242213
110	NC_011205	CTGC	2	8	60777	60784	0 %	25 %	25 %	50 %	198242945
111	NC_011205	CTGG	2	8	60884	60891	0 %	25 %	50 %	25 %	198242945
112	NC_011205	GTGG	2	8	61049	61056	0 %	25 %	75 %	0 %	198242945
113	NC_011205	CTGC	2	8	61259	61266	0 %	25 %	25 %	50 %	198245736
114	NC_011205	ACCA	2	8	61895	61902	50 %	0 %	0 %	50 %	198243185
115	NC_011205	GTGG	2	8	61930	61937	0 %	25 %	75 %	0 %	198243185
116	NC_011205	CATT	2	8	62120	62127	25 %	50 %	0 %	25 %	198243185
117	NC_011205	TCAA	2	8	63161	63168	50 %	25 %	0 %	25 %	198243185
118	NC_011205	GCCA	2	8	64747	64754	25 %	0 %	25 %	50 %	198242548
119	NC_011205	GCTG	2	8	65132	65139	0 %	25 %	50 %	25 %	198242442
120	NC_011205	CAGC	2	8	65411	65418	25 %	0 %	25 %	50 %	198242442
121	NC_011205	CGCC	2	8	65969	65976	0 %	0 %	25 %	75 %	198242442
122	NC_011205	CCAG	2	8	66164	66171	25 %	0 %	25 %	50 %	198242442
123	NC_011205	CCGC	2	8	66320	66327	0 %	0 %	25 %	75 %	198242442
124	NC_011205	TTCA	2	8	66879	66886	25 %	50 %	0 %	25 %	198241866
125	NC_011205	GAAG	2	8	67631	67638	50 %	0 %	50 %	0 %	198243689
126	NC_011205	CAGA	2	8	67804	67811	50 %	0 %	25 %	25 %	198243689
127	NC_011205	TTTC	2	8	68077	68084	0 %	75 %	0 %	25 %	198243689
128	NC_011205	AACA	2	8	68207	68214	75 %	0 %	0 %	25 %	198243689
129	NC_011205	AGTC	2	8	68236	68243	25 %	25 %	25 %	25 %	198243689
130	NC_011205	TAAT	2	8	68278	68285	50 %	50 %	0 %	0 %	198243689
131	NC_011205	ATTT	2	8	68664	68671	25 %	75 %	0 %	0 %	198243054
132	NC_011205	GTCG	2	8	68696	68703	0 %	25 %	50 %	25 %	198243054
133	NC_011205	GCAG	2	8	68981	68988	25 %	0 %	50 %	25 %	198243054
134	NC_011205	ACCG	2	8	69207	69214	25 %	0 %	25 %	50 %	198243054
135	NC_011205	GATC	2	8	69353	69360	25 %	25 %	25 %	25 %	198243054
136	NC_011205	GGCA	2	8	69727	69734	25 %	0 %	50 %	25 %	198244910
137	NC_011205	TCCA	2	8	69769	69776	25 %	25 %	0 %	50 %	198244910
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139	NC_011205	AAGG	2	8	70862	70869	50 %	0 %	50 %	0 %	198244342
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