MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 70066

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011205	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011205	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011205	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011205	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011205	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
7	NC_011205	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
8	NC_011205	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
9	NC_011205	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
10	NC_011205	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
11	NC_011205	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
12	NC_011205	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
13	NC_011205	CCG	2	6	908	913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
14	NC_011205	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
15	NC_011205	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
16	NC_011205	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
17	NC_011205	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
18	NC_011205	GCT	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
19	NC_011205	TTC	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
20	NC_011205	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
21	NC_011205	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
22	NC_011205	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
23	NC_011205	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
24	NC_011205	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
25	NC_011205	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198244353
26	NC_011205	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
27	NC_011205	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
28	NC_011205	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244353
29	NC_011205	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
30	NC_011205	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198244353
31	NC_011205	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198244353
32	NC_011205	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
33	NC_011205	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198244353
34	NC_011205	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
35	NC_011205	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
36	NC_011205	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244353
37	NC_011205	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
38	NC_011205	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244353
39	NC_011205	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198244353
40	NC_011205	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
41	NC_011205	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198244353
42	NC_011205	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
43	NC_011205	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
44	NC_011205	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
45	NC_011205	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244353
46	NC_011205	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244353
47	NC_011205	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
48	NC_011205	TAT	2	6	2686	2691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244353
49	NC_011205	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244353
50	NC_011205	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244353
51	NC_011205	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244353
52	NC_011205	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
53	NC_011205	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
54	NC_011205	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198244850
55	NC_011205	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
56	NC_011205	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
57	NC_011205	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
58	NC_011205	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198244850
59	NC_011205	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198244850
60	NC_011205	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198244850
61	NC_011205	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
62	NC_011205	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198244850
63	NC_011205	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
64	NC_011205	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198244850
65	NC_011205	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198244850
66	NC_011205	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242395
67	NC_011205	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
68	NC_011205	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198242395
69	NC_011205	GGA	2	6	3949	3954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242395
70	NC_011205	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
71	NC_011205	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
72	NC_011205	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
73	NC_011205	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
74	NC_011205	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
75	NC_011205	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
76	NC_011205	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242395
77	NC_011205	GCT	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
78	NC_011205	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
79	NC_011205	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198242395
80	NC_011205	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
81	NC_011205	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
82	NC_011205	GAT	2	6	4727	4732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
83	NC_011205	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198242395
84	NC_011205	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242395
85	NC_011205	GCT	2	6	4954	4959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242395
86	NC_011205	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242395
87	NC_011205	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198242395
88	NC_011205	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198242395
89	NC_011205	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
90	NC_011205	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198242886
91	NC_011205	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
92	NC_011205	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242886
93	NC_011205	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198242886
94	NC_011205	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198242886
95	NC_011205	ACC	2	6	5388	5393	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198242886
96	NC_011205	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198242886
97	NC_011205	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242886
98	NC_011205	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198242886
99	NC_011205	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198242886
100	NC_011205	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_011205	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198245613
102	NC_011205	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198245613
103	NC_011205	TGA	2	6	6187	6192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245613
104	NC_011205	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
105	NC_011205	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
106	NC_011205	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245613
107	NC_011205	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245613
108	NC_011205	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
109	NC_011205	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245613
110	NC_011205	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245613
111	NC_011205	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
112	NC_011205	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245613
113	NC_011205	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198245613
114	NC_011205	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245613
115	NC_011205	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198245613
116	NC_011205	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198245613
117	NC_011205	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198245613
118	NC_011205	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198245613
119	NC_011205	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198245613
120	NC_011205	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011205	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011205	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011205	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011205	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011205	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241895
126	NC_011205	AGC	2	6	7843	7848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241895
127	NC_011205	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241895
128	NC_011205	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241895
129	NC_011205	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241895
130	NC_011205	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241895
131	NC_011205	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241895
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157	NC_011205	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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258	NC_011205	CAT	2	6	15592	15597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198245711
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261	NC_011205	TGA	2	6	15737	15742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198245711
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382	NC_011205	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_011205	CTC	2	6	31956	31961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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