MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 chromosome

Total Repeats: 10163

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011205	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011205	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011205	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011205	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011205	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011205	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_011205	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011205	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011205	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011205	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011205	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011205	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011205	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011205	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_011205	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011205	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_011205	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011205	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011205	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011205	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011205	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011205	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011205	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011205	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011205	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_011205	TTG	2	6	14836	14841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011205	TAT	2	6	14972	14977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011205	ATG	2	6	16003	16008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011205	CCT	2	6	16024	16029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_011205	ATT	2	6	16057	16062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011205	ATT	2	6	17614	17619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011205	GTT	2	6	17706	17711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011205	GTT	2	6	17730	17735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011205	ATC	2	6	17759	17764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011205	GAT	2	6	17771	17776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011205	CCA	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_011205	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011205	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011205	ACA	2	6	24197	24202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011205	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011205	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011205	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011205	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_011205	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011205	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011205	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011205	TAT	2	6	31271	31276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011205	TAT	2	6	31278	31283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011205	CGC	2	6	31352	31357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_011205	CGG	2	6	31390	31395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011205	GGT	2	6	31433	31438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011205	CGC	2	6	31475	31480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_011205	CAG	2	6	31503	31508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_011205	CAA	2	6	31515	31520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_011205	AGC	2	6	31569	31574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011205	GCG	2	6	31605	31610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011205	GTG	2	6	31611	31616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011205	GTG	2	6	31640	31645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011205	GGC	2	6	31754	31759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011205	GCC	2	6	31911	31916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011205	AAG	2	6	31921	31926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011205	AGC	2	6	31932	31937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011205	ATG	2	6	31948	31953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011205	CTC	2	6	31956	31961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_011205	GCA	2	6	31979	31984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_011205	GTC	2	6	32013	32018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_011205	GTT	2	6	32258	32263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011205	ATA	2	6	32310	32315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011205	TAT	2	6	32335	32340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011205	ATT	2	6	32394	32399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011205	ATA	2	6	33135	33140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011205	CAT	2	6	33202	33207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_011205	TAA	2	6	33256	33261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011205	GTG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011205	ATG	2	6	33328	33333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011205	TAG	2	6	34996	35001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011205	TTG	2	6	35044	35049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011205	AAT	2	6	35056	35061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011205	TAG	2	6	35153	35158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011205	ATT	2	6	35235	35240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011205	TTG	2	6	35254	35259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011205	TGT	2	6	35293	35298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011205	GCT	2	6	35300	35305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_011205	TCA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_011205	TGT	2	6	39568	39573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011205	AAG	2	6	39577	39582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011205	TGT	2	6	39673	39678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011205	TTA	2	6	39679	39684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011205	TGT	2	6	39718	39723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011205	AAT	2	6	39769	39774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011205	AAT	2	6	39981	39986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011205	GAA	2	6	40011	40016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011205	AAT	2	6	41626	41631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011205	GTA	2	6	42914	42919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011205	TGA	2	6	44203	44208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011205	GTT	2	6	44212	44217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011205	ATC	2	6	46032	46037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_011205	TCA	2	6	46102	46107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011205	TAG	2	6	46148	46153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011205	GAA	2	6	46158	46163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011205	TCT	2	6	50481	50486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_011205	AGT	2	6	50516	50521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011205	GCA	2	6	50591	50596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011205	GGC	2	6	50641	50646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011205	TGC	2	6	50688	50693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011205	GGC	2	6	50818	50823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_011205	TGT	2	6	50838	50843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011205	CAT	2	6	50857	50862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_011205	CGC	2	6	50865	50870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_011205	CAG	2	6	50884	50889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011205	AAG	2	6	50930	50935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011205	GAT	2	6	50944	50949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011205	TCG	2	6	50964	50969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_011205	ATA	2	6	51022	51027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011205	GCT	2	6	51045	51050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011205	AGA	2	6	51063	51068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011205	CGC	2	6	51115	51120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_011205	ATC	2	6	51259	51264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_011205	TAA	2	6	51310	51315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011205	TCA	2	6	51381	51386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011205	GTG	2	6	51405	51410	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011205	TGC	2	6	51454	51459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011205	GAC	2	6	51552	51557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011205	GAT	3	9	51586	51594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011205	ATA	2	6	51623	51628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011205	CAG	3	9	51634	51642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_011205	CAG	2	6	51721	51726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_011205	GTA	2	6	51765	51770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011205	ATG	2	6	51777	51782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011205	AAC	2	6	51860	51865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011205	ATT	2	6	51892	51897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011205	AGT	2	6	51957	51962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011205	ATT	2	6	51983	51988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011205	TTA	2	6	52011	52016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011205	GGT	2	6	52049	52054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011205	CTT	2	6	52605	52610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_011205	GCA	2	6	52649	52654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_011205	GTG	2	6	57254	57259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011205	TGA	2	6	58769	58774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_011205	TGA	2	6	186433	186438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011205	ATA	2	6	186531	186536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_011205	GTC	2	6	186576	186581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
277	NC_011205	AAT	2	6	187123	187128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
278	NC_011205	TGC	2	6	187187	187192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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281	NC_011205	CCT	2	6	192655	192660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
282	NC_011205	CAT	2	6	193571	193576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_011205	GTA	2	6	198132	198137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_011205	TTA	2	6	198414	198419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_011205	ATT	2	6	199781	199786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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298	NC_011205	ATT	2	6	206751	206756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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300	NC_011205	GGA	2	6	206933	206938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_011205	CTT	2	6	209066	209071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
303	NC_011205	TGA	2	6	210034	210039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
304	NC_011205	CTC	2	6	212873	212878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
305	NC_011205	TAA	2	6	212949	212954	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
306	NC_011205	CAT	2	6	213026	213031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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308	NC_011205	TAA	2	6	214660	214665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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312	NC_011205	TCC	2	6	221206	221211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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318	NC_011205	CTT	2	6	228175	228180	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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