MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	CCAGCG	2	12	3462	3473	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	198241658
2	NC_011204	GGTAAG	2	12	9077	9088	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	198241704
3	NC_011204	CAGATT	2	12	12194	12205	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	198241688
4	NC_011204	ACAGGG	2	12	19838	19849	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	198241652
5	NC_011204	CAGGCT	2	12	20379	20390	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	198241681
6	NC_011204	GCTGTC	2	12	22801	22812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241708
7	NC_011204	CACTGT	2	12	22813	22824	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198241708
8	NC_011204	CAGGGT	2	12	25238	25249	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198241671
9	NC_011204	CTGCCA	2	12	27657	27668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198241693
10	NC_011204	CGGATG	2	12	27770	27781	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	198241693
11	NC_011204	ACCGTC	2	12	28873	28884	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	198241651
12	NC_011204	TCAGCA	2	12	29063	29074	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	198241651
13	NC_011204	ACCATT	2	12	30175	30186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241639
14	NC_011204	GGATTT	2	12	35972	35983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	198241702
15	NC_011204	ACCAGC	2	12	38839	38850	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	198241638
16	NC_011204	CATCGT	2	12	39318	39329	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	198241638
17	NC_011204	GCCCCA	2	12	41535	41546	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	198241643
18	NC_011204	CCACAT	2	12	41841	41852	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	198241643
19	NC_011204	CCCGCT	2	12	43263	43274	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	198241643
20	NC_011204	TTGATA	2	12	45966	45977	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	198241661
21	NC_011204	TCTTTA	2	12	49080	49091	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	198241731
22	NC_011204	TTGCTT	2	12	55758	55769	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	198241662
23	NC_011204	CATAAT	2	12	57597	57608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	198241718
24	NC_011204	AGTAAT	2	12	58758	58769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	198241713
25	NC_011204	AGTAGA	2	12	64018	64029	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	198241677
26	NC_011204	AAGCGC	2	12	67061	67072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241664
27	NC_011204	ATCTTT	2	12	67623	67634	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	198241722
28	NC_011204	CCTTCA	2	12	69678	69689	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	198241720
29	NC_011204	TATGGC	2	12	71078	71089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	198241649

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.