MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 214

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	GCAA	2	8	45	52	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_011204	GCTG	2	8	580	587	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_011204	GCAG	2	8	827	834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011204	CTGA	2	8	1080	1087	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_011204	GCCA	2	8	1185	1192	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_011204	CCGG	2	8	1345	1352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_011204	GCCA	2	8	1589	1596	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_011204	CCTG	2	8	1644	1651	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_011204	GCCA	2	8	1925	1932	25 %	0 %	25 %	50 %	198241690
10	NC_011204	CCAG	2	8	2141	2148	25 %	0 %	25 %	50 %	198241690
11	NC_011204	CTGA	2	8	2299	2306	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_011204	TCTG	2	8	2587	2594	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_011204	CAGC	2	8	2624	2631	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_011204	GGCT	2	8	2694	2701	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_011204	TTTC	2	8	2895	2902	0 %	75 %	0 %	25 %	198241658
16	NC_011204	CAAA	2	8	3947	3954	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_011204	ACTA	2	8	3966	3973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_011204	ACAA	2	8	3974	3981	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_011204	CGGG	2	8	4065	4072	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_011204	AGAC	2	8	4157	4164	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_011204	CAGG	2	8	4440	4447	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_011204	ACAG	2	8	4628	4635	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_011204	AAAT	2	8	4710	4717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011204	ACCA	2	8	5318	5325	50 %	0 %	0 %	50 %	198241715
25	NC_011204	AAAC	2	8	5353	5360	75 %	0 %	0 %	25 %	198241715
26	NC_011204	TGTC	2	8	5378	5385	0 %	50 %	25 %	25 %	198241715
27	NC_011204	GTAT	2	8	6002	6009	25 %	50 %	25 %	0 %	198241715
28	NC_011204	GGAA	2	8	6672	6679	50 %	0 %	50 %	0 %	198241672
29	NC_011204	CGCC	2	8	6746	6753	0 %	0 %	25 %	75 %	198241672
30	NC_011204	AAAT	2	8	7074	7081	75 %	25 %	0 %	0 %	198241725
31	NC_011204	GATT	2	8	7151	7158	25 %	50 %	25 %	0 %	198241725
32	NC_011204	GGCA	2	8	7617	7624	25 %	0 %	50 %	25 %	198241725
33	NC_011204	CTGG	2	8	7821	7828	0 %	25 %	50 %	25 %	198241725
34	NC_011204	GGTG	2	8	7911	7918	0 %	25 %	75 %	0 %	198241725
35	NC_011204	ATGT	2	8	8017	8024	25 %	50 %	25 %	0 %	198241725
36	NC_011204	CTGA	2	8	8374	8381	25 %	25 %	25 %	25 %	198241725
37	NC_011204	TGTT	2	8	8835	8842	0 %	75 %	25 %	0 %	198241704
38	NC_011204	CGGT	2	8	9402	9409	0 %	25 %	50 %	25 %	198241704
39	NC_011204	CCAG	2	8	9822	9829	25 %	0 %	25 %	50 %	198241729
40	NC_011204	CGCC	2	8	9889	9896	0 %	0 %	25 %	75 %	198241729
41	NC_011204	TGTA	2	8	9897	9904	25 %	50 %	25 %	0 %	198241729
42	NC_011204	ATAA	2	8	9929	9936	75 %	25 %	0 %	0 %	198241729
43	NC_011204	CTGC	2	8	10230	10237	0 %	25 %	25 %	50 %	198241729
44	NC_011204	CAGC	2	8	10330	10337	25 %	0 %	25 %	50 %	198241729
45	NC_011204	TTCG	2	8	10799	10806	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011204	ACAA	2	8	11668	11675	75 %	0 %	0 %	25 %	198241670
47	NC_011204	TTAT	2	8	11755	11762	25 %	75 %	0 %	0 %	198241670
48	NC_011204	TTCT	2	8	11773	11780	0 %	75 %	0 %	25 %	198241670
49	NC_011204	GAAT	2	8	12392	12399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011204	ATAA	2	8	12545	12552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011204	TTAT	2	8	12653	12660	25 %	75 %	0 %	0 %	198241717
52	NC_011204	CCGA	2	8	13241	13248	25 %	0 %	25 %	50 %	198241717
53	NC_011204	AGTC	2	8	13689	13696	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_011204	CGGA	2	8	13900	13907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_011204	TGGG	2	8	14052	14059	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011204	CGCC	2	8	14468	14475	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_011204	AGTA	2	8	16391	16398	50 %	25 %	25 %	0 %	198241705
58	NC_011204	ACAT	2	8	16903	16910	50 %	25 %	0 %	25 %	198241655
59	NC_011204	GCGG	2	8	17387	17394	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
60	NC_011204	TCTG	2	8	17447	17454	0 %	50 %	25 %	25 %	198241738
61	NC_011204	CCAT	2	8	17668	17675	25 %	25 %	0 %	50 %	198241738
62	NC_011204	CTTA	2	8	17799	17806	25 %	50 %	0 %	25 %	198241738
63	NC_011204	GTCA	2	8	18404	18411	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_011204	GCTG	2	8	18466	18473	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_011204	TGGC	2	8	18965	18972	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_011204	CAGC	2	8	19152	19159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_011204	CTGC	2	8	19337	19344	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_011204	CTGC	2	8	19481	19488	0 %	25 %	25 %	50 %	198241652
69	NC_011204	CGGG	2	8	19521	19528	0 %	0 %	75 %	25 %	198241652
70	NC_011204	TCAC	2	8	19567	19574	25 %	25 %	0 %	50 %	198241652
71	NC_011204	CCCG	2	8	19578	19585	0 %	0 %	25 %	75 %	198241652
72	NC_011204	CGGG	2	8	19617	19624	0 %	0 %	75 %	25 %	198241652
73	NC_011204	CTGC	2	8	19899	19906	0 %	25 %	25 %	50 %	198241652
74	NC_011204	GGCT	2	8	19978	19985	0 %	25 %	50 %	25 %	198241681
75	NC_011204	CGGA	2	8	20355	20362	25 %	0 %	50 %	25 %	198241681
76	NC_011204	CGGC	2	8	20416	20423	0 %	0 %	50 %	50 %	198241681
77	NC_011204	CAGC	2	8	20553	20560	25 %	0 %	25 %	50 %	198241681
78	NC_011204	CGGT	2	8	20970	20977	0 %	25 %	50 %	25 %	198241686
79	NC_011204	GCTG	2	8	21112	21119	0 %	25 %	50 %	25 %	198241686
80	NC_011204	CCGC	2	8	21157	21164	0 %	0 %	25 %	75 %	198241686
81	NC_011204	CTGC	2	8	21430	21437	0 %	25 %	25 %	50 %	198241686
82	NC_011204	ACAG	2	8	21440	21447	50 %	0 %	25 %	25 %	198241686
83	NC_011204	GAGC	2	8	23661	23668	25 %	0 %	50 %	25 %	198241645
84	NC_011204	GTTC	2	8	23857	23864	0 %	50 %	25 %	25 %	198241645
85	NC_011204	CACC	2	8	24950	24957	25 %	0 %	0 %	75 %	198241671
86	NC_011204	CCGT	2	8	25407	25414	0 %	25 %	25 %	50 %	198241671
87	NC_011204	GGTC	2	8	25441	25448	0 %	25 %	50 %	25 %	198241671
88	NC_011204	GCCA	2	8	25610	25617	25 %	0 %	25 %	50 %	198241671
89	NC_011204	ATTC	2	8	25933	25940	25 %	50 %	0 %	25 %	198241668
90	NC_011204	CATT	2	8	26143	26150	25 %	50 %	0 %	25 %	198241684
91	NC_011204	TCAG	2	8	26583	26590	25 %	25 %	25 %	25 %	198241687
92	NC_011204	CCGG	2	8	27269	27276	0 %	0 %	50 %	50 %	198241693
93	NC_011204	TGGC	2	8	27427	27434	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
94	NC_011204	TCAC	2	8	27613	27620	25 %	25 %	0 %	50 %	198241693
95	NC_011204	GGCT	2	8	27757	27764	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
96	NC_011204	TCCC	2	8	28452	28459	0 %	25 %	0 %	75 %	198241700
97	NC_011204	CGGC	2	8	28561	28568	0 %	0 %	50 %	50 %	198241700
98	NC_011204	GCCC	2	8	28730	28737	0 %	0 %	25 %	75 %	198241700
99	NC_011204	CAGC	2	8	28994	29001	25 %	0 %	25 %	50 %	198241651
100	NC_011204	CTGA	2	8	29007	29014	25 %	25 %	25 %	25 %	198241651
101	NC_011204	TGCC	2	8	29156	29163	0 %	25 %	25 %	50 %	198241651
102	NC_011204	GAAA	2	8	29223	29230	75 %	0 %	25 %	0 %	198241651
103	NC_011204	TAAT	2	8	29694	29701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011204	CTGA	2	8	29765	29772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_011204	CTGC	2	8	29887	29894	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_011204	GGGA	2	8	30439	30446	25 %	0 %	75 %	0 %	198241644
107	NC_011204	AGAA	2	8	30581	30588	75 %	0 %	25 %	0 %	198241646
108	NC_011204	CCAC	2	8	30721	30728	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_011204	TGAT	2	8	31486	31493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011204	TGAA	2	8	32111	32118	50 %	25 %	25 %	0 %	198241676
111	NC_011204	GAAT	2	8	32689	32696	50 %	25 %	25 %	0 %	198241709
112	NC_011204	CTGG	2	8	33795	33802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_011204	AGAA	2	8	34042	34049	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011204	CGAG	2	8	34270	34277	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_011204	GTCA	2	8	34347	34354	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_011204	TTTC	2	8	34384	34391	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_011204	TTAT	3	12	34830	34841	25 %	75 %	0 %	0 %	198241674
118	NC_011204	TCGG	2	8	35582	35589	0 %	25 %	50 %	25 %	198241702
119	NC_011204	GGTA	2	8	35625	35632	25 %	25 %	50 %	0 %	198241702
120	NC_011204	CGAA	3	12	35854	35865	50 %	0 %	25 %	25 %	198241702
121	NC_011204	GTCA	2	8	36019	36026	25 %	25 %	25 %	25 %	198241702
122	NC_011204	CTGC	2	8	36030	36037	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_011204	GCCA	2	8	36259	36266	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
124	NC_011204	CTTT	2	8	36433	36440	0 %	75 %	0 %	25 %	198241698
125	NC_011204	ACTT	2	8	36657	36664	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_011204	GCCA	2	8	37068	37075	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_011204	ACGG	2	8	37186	37193	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_011204	CACG	2	8	38228	38235	25 %	0 %	25 %	50 %	198241727
129	NC_011204	CTGC	2	8	39657	39664	0 %	25 %	25 %	50 %	198241643
130	NC_011204	CAGC	2	8	39861	39868	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
131	NC_011204	CGGC	2	8	40124	40131	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
132	NC_011204	CTGA	2	8	41956	41963	25 %	25 %	25 %	25 %	198241643
133	NC_011204	CAGG	2	8	42330	42337	25 %	0 %	50 %	25 %	198241643
134	NC_011204	CCGG	2	8	42486	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
135	NC_011204	CCAG	2	8	42690	42697	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
136	NC_011204	CACG	2	8	42792	42799	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
137	NC_011204	GACA	2	8	43432	43439	50 %	0 %	25 %	25 %	198241643
138	NC_011204	GAAT	2	8	43816	43823	50 %	25 %	25 %	0 %	198241673
139	NC_011204	TGAG	2	8	44022	44029	25 %	25 %	50 %	0 %	198241673
140	NC_011204	AGTA	2	8	44312	44319	50 %	25 %	25 %	0 %	198241673
141	NC_011204	CCAG	2	8	44707	44714	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011204	ACTG	2	8	44780	44787	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_011204	CTAT	2	8	45299	45306	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_011204	CAAC	2	8	46221	46228	50 %	0 %	0 %	50 %	198241661
145	NC_011204	TGAC	2	8	46344	46351	25 %	25 %	25 %	25 %	198241661
146	NC_011204	AGAA	2	8	46836	46843	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.