MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 152

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	GCCA	2	8	1925	1932	25 %	0 %	25 %	50 %	198241690
2	NC_011204	CCAG	2	8	2141	2148	25 %	0 %	25 %	50 %	198241690
3	NC_011204	TTTC	2	8	2895	2902	0 %	75 %	0 %	25 %	198241658
4	NC_011204	ACCA	2	8	5318	5325	50 %	0 %	0 %	50 %	198241715
5	NC_011204	AAAC	2	8	5353	5360	75 %	0 %	0 %	25 %	198241715
6	NC_011204	TGTC	2	8	5378	5385	0 %	50 %	25 %	25 %	198241715
7	NC_011204	GTAT	2	8	6002	6009	25 %	50 %	25 %	0 %	198241715
8	NC_011204	GGAA	2	8	6672	6679	50 %	0 %	50 %	0 %	198241672
9	NC_011204	CGCC	2	8	6746	6753	0 %	0 %	25 %	75 %	198241672
10	NC_011204	AAAT	2	8	7074	7081	75 %	25 %	0 %	0 %	198241725
11	NC_011204	GATT	2	8	7151	7158	25 %	50 %	25 %	0 %	198241725
12	NC_011204	GGCA	2	8	7617	7624	25 %	0 %	50 %	25 %	198241725
13	NC_011204	CTGG	2	8	7821	7828	0 %	25 %	50 %	25 %	198241725
14	NC_011204	GGTG	2	8	7911	7918	0 %	25 %	75 %	0 %	198241725
15	NC_011204	ATGT	2	8	8017	8024	25 %	50 %	25 %	0 %	198241725
16	NC_011204	CTGA	2	8	8374	8381	25 %	25 %	25 %	25 %	198241725
17	NC_011204	TGTT	2	8	8835	8842	0 %	75 %	25 %	0 %	198241704
18	NC_011204	CGGT	2	8	9402	9409	0 %	25 %	50 %	25 %	198241704
19	NC_011204	CCAG	2	8	9822	9829	25 %	0 %	25 %	50 %	198241729
20	NC_011204	CGCC	2	8	9889	9896	0 %	0 %	25 %	75 %	198241729
21	NC_011204	TGTA	2	8	9897	9904	25 %	50 %	25 %	0 %	198241729
22	NC_011204	ATAA	2	8	9929	9936	75 %	25 %	0 %	0 %	198241729
23	NC_011204	CTGC	2	8	10230	10237	0 %	25 %	25 %	50 %	198241729
24	NC_011204	CAGC	2	8	10330	10337	25 %	0 %	25 %	50 %	198241729
25	NC_011204	ACAA	2	8	11668	11675	75 %	0 %	0 %	25 %	198241670
26	NC_011204	TTAT	2	8	11755	11762	25 %	75 %	0 %	0 %	198241670
27	NC_011204	TTCT	2	8	11773	11780	0 %	75 %	0 %	25 %	198241670
28	NC_011204	TTAT	2	8	12653	12660	25 %	75 %	0 %	0 %	198241717
29	NC_011204	CCGA	2	8	13241	13248	25 %	0 %	25 %	50 %	198241717
30	NC_011204	AGTA	2	8	16391	16398	50 %	25 %	25 %	0 %	198241705
31	NC_011204	ACAT	2	8	16903	16910	50 %	25 %	0 %	25 %	198241655
32	NC_011204	TCTG	2	8	17447	17454	0 %	50 %	25 %	25 %	198241738
33	NC_011204	CCAT	2	8	17668	17675	25 %	25 %	0 %	50 %	198241738
34	NC_011204	CTTA	2	8	17799	17806	25 %	50 %	0 %	25 %	198241738
35	NC_011204	CTGC	2	8	19481	19488	0 %	25 %	25 %	50 %	198241652
36	NC_011204	CGGG	2	8	19521	19528	0 %	0 %	75 %	25 %	198241652
37	NC_011204	TCAC	2	8	19567	19574	25 %	25 %	0 %	50 %	198241652
38	NC_011204	CCCG	2	8	19578	19585	0 %	0 %	25 %	75 %	198241652
39	NC_011204	CGGG	2	8	19617	19624	0 %	0 %	75 %	25 %	198241652
40	NC_011204	CTGC	2	8	19899	19906	0 %	25 %	25 %	50 %	198241652
41	NC_011204	GGCT	2	8	19978	19985	0 %	25 %	50 %	25 %	198241681
42	NC_011204	CGGA	2	8	20355	20362	25 %	0 %	50 %	25 %	198241681
43	NC_011204	CGGC	2	8	20416	20423	0 %	0 %	50 %	50 %	198241681
44	NC_011204	CAGC	2	8	20553	20560	25 %	0 %	25 %	50 %	198241681
45	NC_011204	CGGT	2	8	20970	20977	0 %	25 %	50 %	25 %	198241686
46	NC_011204	GCTG	2	8	21112	21119	0 %	25 %	50 %	25 %	198241686
47	NC_011204	CCGC	2	8	21157	21164	0 %	0 %	25 %	75 %	198241686
48	NC_011204	CTGC	2	8	21430	21437	0 %	25 %	25 %	50 %	198241686
49	NC_011204	ACAG	2	8	21440	21447	50 %	0 %	25 %	25 %	198241686
50	NC_011204	GAGC	2	8	23661	23668	25 %	0 %	50 %	25 %	198241645
51	NC_011204	GTTC	2	8	23857	23864	0 %	50 %	25 %	25 %	198241645
52	NC_011204	CACC	2	8	24950	24957	25 %	0 %	0 %	75 %	198241671
53	NC_011204	CCGT	2	8	25407	25414	0 %	25 %	25 %	50 %	198241671
54	NC_011204	GGTC	2	8	25441	25448	0 %	25 %	50 %	25 %	198241671
55	NC_011204	GCCA	2	8	25610	25617	25 %	0 %	25 %	50 %	198241671
56	NC_011204	ATTC	2	8	25933	25940	25 %	50 %	0 %	25 %	198241668
57	NC_011204	CATT	2	8	26143	26150	25 %	50 %	0 %	25 %	198241684
58	NC_011204	TCAG	2	8	26583	26590	25 %	25 %	25 %	25 %	198241687
59	NC_011204	CCGG	2	8	27269	27276	0 %	0 %	50 %	50 %	198241693
60	NC_011204	TGGC	2	8	27427	27434	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
61	NC_011204	TCAC	2	8	27613	27620	25 %	25 %	0 %	50 %	198241693
62	NC_011204	GGCT	2	8	27757	27764	0 %	25 %	50 %	25 %	198241693
63	NC_011204	TCCC	2	8	28452	28459	0 %	25 %	0 %	75 %	198241700
64	NC_011204	CGGC	2	8	28561	28568	0 %	0 %	50 %	50 %	198241700
65	NC_011204	GCCC	2	8	28730	28737	0 %	0 %	25 %	75 %	198241700
66	NC_011204	CAGC	2	8	28994	29001	25 %	0 %	25 %	50 %	198241651
67	NC_011204	CTGA	2	8	29007	29014	25 %	25 %	25 %	25 %	198241651
68	NC_011204	TGCC	2	8	29156	29163	0 %	25 %	25 %	50 %	198241651
69	NC_011204	GAAA	2	8	29223	29230	75 %	0 %	25 %	0 %	198241651
70	NC_011204	GGGA	2	8	30439	30446	25 %	0 %	75 %	0 %	198241644
71	NC_011204	AGAA	2	8	30581	30588	75 %	0 %	25 %	0 %	198241646
72	NC_011204	TGAA	2	8	32111	32118	50 %	25 %	25 %	0 %	198241676
73	NC_011204	GAAT	2	8	32689	32696	50 %	25 %	25 %	0 %	198241709
74	NC_011204	TTAT	3	12	34830	34841	25 %	75 %	0 %	0 %	198241674
75	NC_011204	TCGG	2	8	35582	35589	0 %	25 %	50 %	25 %	198241702
76	NC_011204	GGTA	2	8	35625	35632	25 %	25 %	50 %	0 %	198241702
77	NC_011204	CGAA	3	12	35854	35865	50 %	0 %	25 %	25 %	198241702
78	NC_011204	GTCA	2	8	36019	36026	25 %	25 %	25 %	25 %	198241702
79	NC_011204	CTTT	2	8	36433	36440	0 %	75 %	0 %	25 %	198241698
80	NC_011204	CACG	2	8	38228	38235	25 %	0 %	25 %	50 %	198241727
81	NC_011204	CTGC	2	8	39657	39664	0 %	25 %	25 %	50 %	198241643
82	NC_011204	CAGC	2	8	39861	39868	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
83	NC_011204	CGGC	2	8	40124	40131	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
84	NC_011204	CTGA	2	8	41956	41963	25 %	25 %	25 %	25 %	198241643
85	NC_011204	CAGG	2	8	42330	42337	25 %	0 %	50 %	25 %	198241643
86	NC_011204	CCGG	2	8	42486	42493	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
87	NC_011204	CCAG	2	8	42690	42697	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
88	NC_011204	CACG	2	8	42792	42799	25 %	0 %	25 %	50 %	198241643
89	NC_011204	GACA	2	8	43432	43439	50 %	0 %	25 %	25 %	198241643
90	NC_011204	GAAT	2	8	43816	43823	50 %	25 %	25 %	0 %	198241673
91	NC_011204	TGAG	2	8	44022	44029	25 %	25 %	50 %	0 %	198241673
92	NC_011204	AGTA	2	8	44312	44319	50 %	25 %	25 %	0 %	198241673
93	NC_011204	CAAC	2	8	46221	46228	50 %	0 %	0 %	50 %	198241661
94	NC_011204	TGAC	2	8	46344	46351	25 %	25 %	25 %	25 %	198241661
95	NC_011204	GGAA	2	8	48306	48313	50 %	0 %	50 %	0 %	198241734
96	NC_011204	ACTC	2	8	48655	48662	25 %	25 %	0 %	50 %	198241731
97	NC_011204	CAGG	2	8	48934	48941	25 %	0 %	50 %	25 %	198241731
98	NC_011204	CGGT	2	8	49899	49906	0 %	25 %	50 %	25 %	198241731
99	NC_011204	GACA	2	8	50063	50070	50 %	0 %	25 %	25 %	198241731
100	NC_011204	AGGG	2	8	50931	50938	25 %	0 %	75 %	0 %	198241665
101	NC_011204	GCCA	2	8	50995	51002	25 %	0 %	25 %	50 %	198241665
102	NC_011204	TTTC	2	8	51134	51141	0 %	75 %	0 %	25 %	198241665
103	NC_011204	TTAA	2	8	51525	51532	50 %	50 %	0 %	0 %	198241737
104	NC_011204	CACT	2	8	51695	51702	25 %	25 %	0 %	50 %	198241737
105	NC_011204	CTTG	2	8	52559	52566	0 %	50 %	25 %	25 %	198241714
106	NC_011204	CTGA	2	8	52709	52716	25 %	25 %	25 %	25 %	198241714
107	NC_011204	TTTC	2	8	53716	53723	0 %	75 %	0 %	25 %	198241714
108	NC_011204	AACA	2	8	55495	55502	75 %	0 %	0 %	25 %	198241662
109	NC_011204	CCTG	2	8	55844	55851	0 %	25 %	25 %	50 %	198241662
110	NC_011204	TTCT	2	8	56239	56246	0 %	75 %	0 %	25 %	198241662
111	NC_011204	TTCC	2	8	56736	56743	0 %	50 %	0 %	50 %	198241736
112	NC_011204	AACA	2	8	56847	56854	75 %	0 %	0 %	25 %	198241736
113	NC_011204	ATTC	2	8	56856	56863	25 %	50 %	0 %	25 %	198241736
114	NC_011204	GTTT	2	8	56956	56963	0 %	75 %	25 %	0 %	198241736
115	NC_011204	GAAG	2	8	57163	57170	50 %	0 %	50 %	0 %	198241736
116	NC_011204	AGAC	2	8	57808	57815	50 %	0 %	25 %	25 %	198241718
117	NC_011204	ATTC	2	8	57859	57866	25 %	50 %	0 %	25 %	198241718
118	NC_011204	ATCC	2	8	58928	58935	25 %	25 %	0 %	50 %	198241713
119	NC_011204	AACC	2	8	59359	59366	50 %	0 %	0 %	50 %	198241679
120	NC_011204	ACTG	2	8	60081	60088	25 %	25 %	25 %	25 %	198241710
121	NC_011204	CCTG	2	8	60267	60274	0 %	25 %	25 %	50 %	198241710
122	NC_011204	GTAA	2	8	60455	60462	50 %	25 %	25 %	0 %	198241712
123	NC_011204	AGAT	2	8	60649	60656	50 %	25 %	25 %	0 %	198241712
124	NC_011204	CTCC	2	8	61274	61281	0 %	25 %	0 %	75 %	198241712
125	NC_011204	GAAA	2	8	61851	61858	75 %	0 %	25 %	0 %	198241712
126	NC_011204	TCAT	2	8	62329	62336	25 %	50 %	0 %	25 %	198241712
127	NC_011204	TCAT	2	8	62488	62495	25 %	50 %	0 %	25 %	198241712
128	NC_011204	CCAG	2	8	62946	62953	25 %	0 %	25 %	50 %	198241712
129	NC_011204	CATA	2	8	62966	62973	50 %	25 %	0 %	25 %	198241712
130	NC_011204	GCTG	2	8	65224	65231	0 %	25 %	50 %	25 %	198241726
131	NC_011204	TTCT	2	8	65752	65759	0 %	75 %	0 %	25 %	198241726
132	NC_011204	TCAT	2	8	65915	65922	25 %	50 %	0 %	25 %	198241726
133	NC_011204	CTGC	2	8	66655	66662	0 %	25 %	25 %	50 %	198241650
134	NC_011204	TACG	2	8	66981	66988	25 %	25 %	25 %	25 %	198241664
135	NC_011204	TTTA	2	8	67413	67420	25 %	75 %	0 %	0 %	198241739
136	NC_011204	CTTT	2	8	67730	67737	0 %	75 %	0 %	25 %	198241722
137	NC_011204	ATTA	2	8	67850	67857	50 %	50 %	0 %	0 %	198241642
138	NC_011204	AGAA	2	8	68080	68087	75 %	0 %	25 %	0 %	198241642
139	NC_011204	AATA	2	8	68323	68330	75 %	25 %	0 %	0 %	198241678
140	NC_011204	CTTT	2	8	68374	68381	0 %	75 %	0 %	25 %	198241678
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.