MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 742

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	TGA	2	6	171	176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241669
2	NC_011204	ACG	2	6	204	209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241669
3	NC_011204	CGC	2	6	1795	1800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241690
4	NC_011204	GCT	2	6	1814	1819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241690
5	NC_011204	TCT	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241690
6	NC_011204	AAT	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241690
7	NC_011204	CTC	2	6	1858	1863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241690
8	NC_011204	GGA	2	6	1868	1873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241690
9	NC_011204	CGA	2	6	1886	1891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241690
10	NC_011204	CCT	2	6	1901	1906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241690
11	NC_011204	GCC	2	6	1936	1941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241690
12	NC_011204	CAC	2	6	2052	2057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241690
13	NC_011204	TCA	2	6	2180	2185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241663
14	NC_011204	ACC	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241663
15	NC_011204	CGG	2	6	2262	2267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241663
16	NC_011204	TCA	3	9	2785	2793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241658
17	NC_011204	GCC	2	6	2831	2836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241658
18	NC_011204	CAC	2	6	2874	2879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241658
19	NC_011204	CAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241658
20	NC_011204	GAG	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241658
21	NC_011204	GCT	2	6	3043	3048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241658
22	NC_011204	TGC	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241658
23	NC_011204	TGC	2	6	3146	3151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241658
24	NC_011204	TTC	2	6	3232	3237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241658
25	NC_011204	GCA	2	6	3336	3341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241658
26	NC_011204	TCT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241658
27	NC_011204	CAT	2	6	3429	3434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241658
28	NC_011204	GCT	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241658
29	NC_011204	TTC	2	6	3511	3516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241658
30	NC_011204	GTC	2	6	3520	3525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241658
31	NC_011204	GCG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241658
32	NC_011204	GCA	2	6	3581	3586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241658
33	NC_011204	GCG	2	6	3674	3679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241658
34	NC_011204	CTT	2	6	3693	3698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241658
35	NC_011204	GAC	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241658
36	NC_011204	GCC	2	6	3796	3801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241658
37	NC_011204	AAT	2	6	3871	3876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241658
38	NC_011204	AAT	2	6	5304	5309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241715
39	NC_011204	ACG	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241715
40	NC_011204	GGC	2	6	5394	5399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241715
41	NC_011204	CGC	2	6	5424	5429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241715
42	NC_011204	CTG	2	6	5576	5581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241715
43	NC_011204	CGG	2	6	5615	5620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241715
44	NC_011204	GCA	2	6	5699	5704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241715
45	NC_011204	AGT	2	6	5736	5741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241715
46	NC_011204	GCT	2	6	5817	5822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241715
47	NC_011204	AAC	2	6	5963	5968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241715
48	NC_011204	GAA	2	6	5979	5984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241715
49	NC_011204	GCT	2	6	6327	6332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241672
50	NC_011204	ATT	2	6	6342	6347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241672
51	NC_011204	GCT	3	9	6398	6406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241672
52	NC_011204	GCA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241672
53	NC_011204	CTG	2	6	6694	6699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241672
54	NC_011204	AGC	2	6	6802	6807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241672
55	NC_011204	GCC	2	6	6867	6872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241725
56	NC_011204	ACG	2	6	6934	6939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241725
57	NC_011204	TGC	2	6	7050	7055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241725
58	NC_011204	GCC	2	6	7085	7090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241725
59	NC_011204	GCT	2	6	7116	7121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241725
60	NC_011204	CGG	2	6	7250	7255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241725
61	NC_011204	GCC	2	6	7514	7519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241725
62	NC_011204	GAC	2	6	7638	7643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241725
63	NC_011204	AGG	2	6	7688	7693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241725
64	NC_011204	GGA	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241725
65	NC_011204	CTG	2	6	7990	7995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241725
66	NC_011204	TTA	2	6	8052	8057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241725
67	NC_011204	TGA	2	6	8205	8210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241725
68	NC_011204	CAG	2	6	8215	8220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241725
69	NC_011204	CGA	2	6	8310	8315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241725
70	NC_011204	TAT	2	6	8510	8515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241704
71	NC_011204	AGC	2	6	8532	8537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241704
72	NC_011204	TGA	2	6	8538	8543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241704
73	NC_011204	GAC	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241704
74	NC_011204	GTG	2	6	8594	8599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241704
75	NC_011204	GCA	3	9	8632	8640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241704
76	NC_011204	CTG	2	6	8642	8647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241704
77	NC_011204	CGC	2	6	8780	8785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241704
78	NC_011204	CGG	2	6	8911	8916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241704
79	NC_011204	CGT	2	6	8929	8934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241704
80	NC_011204	CGT	2	6	8969	8974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241704
81	NC_011204	CGA	2	6	8976	8981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241704
82	NC_011204	GGA	2	6	8983	8988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241704
83	NC_011204	GCT	2	6	9058	9063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241704
84	NC_011204	CTG	2	6	9122	9127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241704
85	NC_011204	TGG	2	6	9303	9308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241704
86	NC_011204	ATT	2	6	9343	9348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241704
87	NC_011204	TAA	2	6	9349	9354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241704
88	NC_011204	TGA	2	6	9713	9718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241729
89	NC_011204	GAT	2	6	9853	9858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241729
90	NC_011204	CCA	2	6	9870	9875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241729
91	NC_011204	TGC	3	9	9948	9956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241729
92	NC_011204	TTC	2	6	10171	10176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241729
93	NC_011204	TGA	2	6	10290	10295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241729
94	NC_011204	GGC	2	6	10489	10494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241729
95	NC_011204	GCA	2	6	10536	10541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241729
96	NC_011204	TTG	2	6	10585	10590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241729
97	NC_011204	TTC	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241729
98	NC_011204	TGC	2	6	10630	10635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241729
99	NC_011204	TAA	2	6	10856	10861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241695
100	NC_011204	ATT	2	6	11228	11233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241670
101	NC_011204	TAT	2	6	11250	11255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241670
102	NC_011204	TAA	2	6	11268	11273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241670
103	NC_011204	GAA	2	6	11412	11417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241670
104	NC_011204	AAC	2	6	11528	11533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241670
105	NC_011204	ATA	2	6	11539	11544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241670
106	NC_011204	ATA	2	6	11647	11652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241670
107	NC_011204	GAA	2	6	11653	11658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241670
108	NC_011204	ATT	2	6	11699	11704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241670
109	NC_011204	ACA	2	6	11952	11957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241670
110	NC_011204	CCT	2	6	12053	12058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241670
111	NC_011204	CAG	2	6	12118	12123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241670
112	NC_011204	TCC	2	6	12220	12225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241688
113	NC_011204	ACC	2	6	12674	12679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241717
114	NC_011204	ATT	3	9	12744	12752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241717
115	NC_011204	TTA	2	6	12789	12794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241717
116	NC_011204	GCA	2	6	12919	12924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241717
117	NC_011204	CGG	2	6	12964	12969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241717
118	NC_011204	TGG	2	6	13014	13019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241717
119	NC_011204	ATG	2	6	13023	13028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241717
120	NC_011204	CTG	2	6	13052	13057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241717
121	NC_011204	CTG	2	6	13094	13099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241717
122	NC_011204	AGC	2	6	13136	13141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241717
123	NC_011204	AGC	2	6	13227	13232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241717
124	NC_011204	ACA	2	6	13254	13259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241717
125	NC_011204	CCG	2	6	13311	13316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241717
126	NC_011204	AGT	2	6	13443	13448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241728
127	NC_011204	AGC	2	6	13450	13455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241728
128	NC_011204	CGG	2	6	13514	13519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241728
129	NC_011204	CTT	2	6	15516	15521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241653
130	NC_011204	TAA	2	6	15628	15633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241653
131	NC_011204	TCG	2	6	15936	15941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241705
132	NC_011204	CAA	2	6	16102	16107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	198241705
133	NC_011204	CGT	2	6	16178	16183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241705
134	NC_011204	TGG	2	6	16332	16337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	198241705
135	NC_011204	TGA	2	6	16382	16387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241705
136	NC_011204	TTA	2	6	16461	16466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241667
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138	NC_011204	AAT	3	9	16719	16727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241655
139	NC_011204	ATA	2	6	16843	16848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241655
140	NC_011204	TAT	2	6	16879	16884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241655
141	NC_011204	GAA	2	6	16934	16939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	198241655
142	NC_011204	TTG	2	6	16975	16980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	198241655
143	NC_011204	AAT	2	6	17120	17125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241655
144	NC_011204	TCA	3	9	17256	17264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241655
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149	NC_011204	CGA	2	6	17580	17585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241738
150	NC_011204	ATT	2	6	17598	17603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241738
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157	NC_011204	CGG	2	6	19603	19608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241652
158	NC_011204	CAC	2	6	19644	19649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241652
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161	NC_011204	CCA	2	6	19818	19823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241652
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247	NC_011204	TAA	2	6	26499	26504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241687
248	NC_011204	GCC	2	6	26517	26522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241687
249	NC_011204	GCA	2	6	26635	26640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
250	NC_011204	GGA	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	198241687
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252	NC_011204	GCA	2	6	26761	26766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241687
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375	NC_011204	GCT	2	6	39627	39632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
376	NC_011204	CGG	2	6	39641	39646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
377	NC_011204	CTG	2	6	39722	39727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
378	NC_011204	GCC	2	6	39751	39756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	198241643
379	NC_011204	CAC	3	9	39802	39810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
380	NC_011204	CCT	2	6	39846	39851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	198241643
381	NC_011204	CGG	2	6	39999	40004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	198241643
382	NC_011204	GCA	2	6	40113	40118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
383	NC_011204	TCG	2	6	40271	40276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
384	NC_011204	TGC	2	6	40439	40444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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388	NC_011204	CCA	2	6	40746	40751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	198241643
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392	NC_011204	CGA	2	6	40895	40900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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396	NC_011204	CTG	2	6	41260	41265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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408	NC_011204	CAG	2	6	41944	41949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	198241643
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493	NC_011204	ATA	2	6	50505	50510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	198241731
494	NC_011204	CAT	2	6	50557	50562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241731
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496	NC_011204	TTC	2	6	50688	50693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241665
497	NC_011204	ATG	2	6	50863	50868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	198241665
498	NC_011204	TCA	2	6	50872	50877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	198241665
499	NC_011204	TTA	2	6	50882	50887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	198241665
500	NC_011204	TCT	2	6	50906	50911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	198241665

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