MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	AG	3	6	2147	2152	50 %	0 %	50 %	0 %	198241690
2	NC_011204	TG	3	6	2948	2953	0 %	50 %	50 %	0 %	198241658
3	NC_011204	GC	4	8	3080	3087	0 %	0 %	50 %	50 %	198241658
4	NC_011204	AC	3	6	5754	5759	50 %	0 %	0 %	50 %	198241715
5	NC_011204	GT	4	8	7425	7432	0 %	50 %	50 %	0 %	198241725
6	NC_011204	AT	3	6	9046	9051	50 %	50 %	0 %	0 %	198241704
7	NC_011204	AG	3	6	11383	11388	50 %	0 %	50 %	0 %	198241670
8	NC_011204	AT	3	6	15641	15646	50 %	50 %	0 %	0 %	198241653
9	NC_011204	TA	3	6	16141	16146	50 %	50 %	0 %	0 %	198241705
10	NC_011204	AG	3	6	16778	16783	50 %	0 %	50 %	0 %	198241655
11	NC_011204	AT	3	6	16921	16926	50 %	50 %	0 %	0 %	198241655
12	NC_011204	GC	3	6	20076	20081	0 %	0 %	50 %	50 %	198241681
13	NC_011204	GC	3	6	20151	20156	0 %	0 %	50 %	50 %	198241681
14	NC_011204	GC	3	6	20990	20995	0 %	0 %	50 %	50 %	198241686
15	NC_011204	GC	3	6	21712	21717	0 %	0 %	50 %	50 %	198241703
16	NC_011204	CA	3	6	22259	22264	50 %	0 %	0 %	50 %	198241699
17	NC_011204	AG	3	6	23383	23388	50 %	0 %	50 %	0 %	198241724
18	NC_011204	GA	3	6	23575	23580	50 %	0 %	50 %	0 %	198241645
19	NC_011204	TA	3	6	24586	24591	50 %	50 %	0 %	0 %	198241675
20	NC_011204	AG	3	6	25107	25112	50 %	0 %	50 %	0 %	198241671
21	NC_011204	TC	3	6	25177	25182	0 %	50 %	0 %	50 %	198241671
22	NC_011204	GA	3	6	25491	25496	50 %	0 %	50 %	0 %	198241671
23	NC_011204	TG	3	6	28675	28680	0 %	50 %	50 %	0 %	198241700
24	NC_011204	CA	3	6	28785	28790	50 %	0 %	0 %	50 %	198241700
25	NC_011204	AT	3	6	30214	30219	50 %	50 %	0 %	0 %	198241639
26	NC_011204	TA	3	6	30519	30524	50 %	50 %	0 %	0 %	198241646
27	NC_011204	TA	3	6	30530	30535	50 %	50 %	0 %	0 %	198241646
28	NC_011204	AG	3	6	31948	31953	50 %	0 %	50 %	0 %	198241676
29	NC_011204	AT	3	6	32735	32740	50 %	50 %	0 %	0 %	198241709
30	NC_011204	GT	3	6	32957	32962	0 %	50 %	50 %	0 %	198241709
31	NC_011204	AT	4	8	33073	33080	50 %	50 %	0 %	0 %	198241709
32	NC_011204	GC	3	6	34785	34790	0 %	0 %	50 %	50 %	198241674
33	NC_011204	AG	3	6	34843	34848	50 %	0 %	50 %	0 %	198241674
34	NC_011204	GA	3	6	35048	35053	50 %	0 %	50 %	0 %	198241680
35	NC_011204	GC	3	6	37701	37706	0 %	0 %	50 %	50 %	198241694
36	NC_011204	CG	3	6	37989	37994	0 %	0 %	50 %	50 %	198241727
37	NC_011204	TC	3	6	39364	39369	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
38	NC_011204	TC	3	6	39546	39551	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
39	NC_011204	GC	3	6	40758	40763	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
40	NC_011204	TG	3	6	42227	42232	0 %	50 %	50 %	0 %	198241643
41	NC_011204	TC	3	6	42540	42545	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
42	NC_011204	CT	3	6	42818	42823	0 %	50 %	0 %	50 %	198241643
43	NC_011204	GC	3	6	42969	42974	0 %	0 %	50 %	50 %	198241643
44	NC_011204	GA	3	6	43864	43869	50 %	0 %	50 %	0 %	198241673
45	NC_011204	AC	3	6	45217	45222	50 %	0 %	0 %	50 %	198241730
46	NC_011204	AT	3	6	45783	45788	50 %	50 %	0 %	0 %	198241661
47	NC_011204	TC	3	6	52438	52443	0 %	50 %	0 %	50 %	198241714
48	NC_011204	AT	3	6	52924	52929	50 %	50 %	0 %	0 %	198241714
49	NC_011204	GT	3	6	53462	53467	0 %	50 %	50 %	0 %	198241714
50	NC_011204	AG	3	6	53571	53576	50 %	0 %	50 %	0 %	198241714
51	NC_011204	TA	3	6	53686	53691	50 %	50 %	0 %	0 %	198241714
52	NC_011204	GA	3	6	53837	53842	50 %	0 %	50 %	0 %	198241714
53	NC_011204	AG	3	6	53862	53867	50 %	0 %	50 %	0 %	198241714
54	NC_011204	CT	3	6	53904	53909	0 %	50 %	0 %	50 %	198241714
55	NC_011204	AT	3	6	53950	53955	50 %	50 %	0 %	0 %	198241714
56	NC_011204	TA	3	6	55595	55600	50 %	50 %	0 %	0 %	198241662
57	NC_011204	TA	3	6	57649	57654	50 %	50 %	0 %	0 %	198241718
58	NC_011204	TC	3	6	57865	57870	0 %	50 %	0 %	50 %	198241718
59	NC_011204	TG	3	6	60721	60726	0 %	50 %	50 %	0 %	198241712
60	NC_011204	AC	3	6	62650	62655	50 %	0 %	0 %	50 %	198241712
61	NC_011204	AT	3	6	63133	63138	50 %	50 %	0 %	0 %	198241689
62	NC_011204	AT	3	6	63214	63219	50 %	50 %	0 %	0 %	198241689
63	NC_011204	AT	3	6	63460	63465	50 %	50 %	0 %	0 %	198241677
64	NC_011204	AT	3	6	65069	65074	50 %	50 %	0 %	0 %	198241726
65	NC_011204	TG	3	6	65885	65890	0 %	50 %	50 %	0 %	198241726
66	NC_011204	AT	3	6	67084	67089	50 %	50 %	0 %	0 %	198241664
67	NC_011204	CT	3	6	67801	67806	0 %	50 %	0 %	50 %	198241722
68	NC_011204	CA	3	6	68517	68522	50 %	0 %	0 %	50 %	198241721
69	NC_011204	AT	3	6	71372	71377	50 %	50 %	0 %	0 %	198241649
70	NC_011204	AT	3	6	71408	71413	50 %	50 %	0 %	0 %	198241649
71	NC_011204	GA	3	6	71712	71717	50 %	0 %	50 %	0 %	198241649
72	NC_011204	TG	3	6	72091	72096	0 %	50 %	50 %	0 %	198241637
73	NC_011204	AG	3	6	73163	73168	50 %	0 %	50 %	0 %	198241706

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.