MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 132

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	A	6	6	63	68	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011204	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	198241669
3	NC_011204	A	6	6	510	515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011204	C	6	6	5000	5005	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_011204	A	6	6	5910	5915	100 %	0 %	0 %	0 %	198241715
6	NC_011204	T	6	6	6129	6134	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011204	A	6	6	8810	8815	100 %	0 %	0 %	0 %	198241704
8	NC_011204	G	6	6	9568	9573	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011204	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	198241695
10	NC_011204	A	7	7	11177	11183	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
11	NC_011204	T	6	6	11218	11223	0 %	100 %	0 %	0 %	198241670
12	NC_011204	A	8	8	11237	11244	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
13	NC_011204	A	6	6	11272	11277	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
14	NC_011204	A	6	6	11571	11576	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
15	NC_011204	A	6	6	11609	11614	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
16	NC_011204	A	6	6	11767	11772	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
17	NC_011204	T	7	7	11871	11877	0 %	100 %	0 %	0 %	198241670
18	NC_011204	T	6	6	15554	15559	0 %	100 %	0 %	0 %	198241653
19	NC_011204	A	6	6	15568	15573	100 %	0 %	0 %	0 %	198241653
20	NC_011204	A	8	8	15605	15612	100 %	0 %	0 %	0 %	198241653
21	NC_011204	T	6	6	16595	16600	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011204	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
23	NC_011204	A	6	6	17175	17180	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
24	NC_011204	A	7	7	17243	17249	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
25	NC_011204	T	6	6	17311	17316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011204	A	6	6	18098	18103	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011204	T	6	6	19985	19990	0 %	100 %	0 %	0 %	198241681
28	NC_011204	C	6	6	20059	20064	0 %	0 %	0 %	100 %	198241681
29	NC_011204	C	6	6	20229	20234	0 %	0 %	0 %	100 %	198241681
30	NC_011204	T	6	6	21509	21514	0 %	100 %	0 %	0 %	198241703
31	NC_011204	T	6	6	22850	22855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011204	T	6	6	23162	23167	0 %	100 %	0 %	0 %	198241691
33	NC_011204	A	6	6	24450	24455	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
34	NC_011204	A	6	6	24578	24583	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
35	NC_011204	G	6	6	24786	24791	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011204	A	6	6	25134	25139	100 %	0 %	0 %	0 %	198241671
37	NC_011204	A	7	7	25843	25849	100 %	0 %	0 %	0 %	198241668
38	NC_011204	A	6	6	25968	25973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011204	T	6	6	27217	27222	0 %	100 %	0 %	0 %	198241693
40	NC_011204	A	7	7	27851	27857	100 %	0 %	0 %	0 %	198241647
41	NC_011204	C	6	6	30249	30254	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
42	NC_011204	A	8	8	30316	30323	100 %	0 %	0 %	0 %	198241644
43	NC_011204	T	6	6	30372	30377	0 %	100 %	0 %	0 %	198241644
44	NC_011204	T	6	6	30945	30950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011204	A	6	6	30968	30973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011204	A	6	6	31075	31080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011204	A	8	8	31147	31154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011204	T	6	6	36484	36489	0 %	100 %	0 %	0 %	198241698
49	NC_011204	T	6	6	36993	36998	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011204	C	6	6	37025	37030	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_011204	C	7	7	37637	37643	0 %	0 %	0 %	100 %	198241694
52	NC_011204	T	7	7	38174	38180	0 %	100 %	0 %	0 %	198241727
53	NC_011204	A	6	6	38638	38643	100 %	0 %	0 %	0 %	198241638
54	NC_011204	A	6	6	44940	44945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011204	T	7	7	44964	44970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011204	T	6	6	45030	45035	0 %	100 %	0 %	0 %	198241692
57	NC_011204	T	6	6	45106	45111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011204	A	7	7	45139	45145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011204	T	6	6	45275	45280	0 %	100 %	0 %	0 %	198241730
60	NC_011204	T	6	6	46899	46904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011204	T	6	6	47143	47148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011204	A	9	9	47193	47201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011204	T	7	7	47271	47277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011204	T	6	6	47435	47440	0 %	100 %	0 %	0 %	198241648
65	NC_011204	G	6	6	47561	47566	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011204	T	7	7	47975	47981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011204	T	6	6	49073	49078	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
68	NC_011204	T	6	6	49103	49108	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
69	NC_011204	T	6	6	49726	49731	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
70	NC_011204	T	7	7	49804	49810	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
71	NC_011204	T	6	6	51352	51357	0 %	100 %	0 %	0 %	198241697
72	NC_011204	T	6	6	51649	51654	0 %	100 %	0 %	0 %	198241737
73	NC_011204	A	7	7	51670	51676	100 %	0 %	0 %	0 %	198241737
74	NC_011204	T	6	6	51931	51936	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
75	NC_011204	T	6	6	51992	51997	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
76	NC_011204	A	6	6	52016	52021	100 %	0 %	0 %	0 %	198241701
77	NC_011204	T	7	7	52232	52238	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
78	NC_011204	T	6	6	52279	52284	0 %	100 %	0 %	0 %	198241714
79	NC_011204	T	6	6	52321	52326	0 %	100 %	0 %	0 %	198241714
80	NC_011204	T	7	7	55959	55965	0 %	100 %	0 %	0 %	198241662
81	NC_011204	T	6	6	57501	57506	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
82	NC_011204	A	6	6	57623	57628	100 %	0 %	0 %	0 %	198241718
83	NC_011204	T	6	6	57703	57708	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
84	NC_011204	T	7	7	57884	57890	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
85	NC_011204	T	6	6	57922	57927	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
86	NC_011204	A	7	7	59234	59240	100 %	0 %	0 %	0 %	198241713
87	NC_011204	T	6	6	59453	59458	0 %	100 %	0 %	0 %	198241679
88	NC_011204	C	6	6	61300	61305	0 %	0 %	0 %	100 %	198241712
89	NC_011204	A	7	7	61345	61351	100 %	0 %	0 %	0 %	198241712
90	NC_011204	T	6	6	61362	61367	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
91	NC_011204	C	6	6	61586	61591	0 %	0 %	0 %	100 %	198241712
92	NC_011204	T	6	6	62370	62375	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
93	NC_011204	T	6	6	62701	62706	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
94	NC_011204	A	6	6	62904	62909	100 %	0 %	0 %	0 %	198241712
95	NC_011204	A	6	6	63268	63273	100 %	0 %	0 %	0 %	198241689
96	NC_011204	A	6	6	63289	63294	100 %	0 %	0 %	0 %	198241689
97	NC_011204	T	7	7	63540	63546	0 %	100 %	0 %	0 %	198241677
98	NC_011204	T	6	6	63696	63701	0 %	100 %	0 %	0 %	198241677
99	NC_011204	T	6	6	64125	64130	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
100	NC_011204	T	6	6	64199	64204	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
101	NC_011204	T	6	6	64280	64285	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
102	NC_011204	A	6	6	64404	64409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011204	T	6	6	64960	64965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011204	C	6	6	65424	65429	0 %	0 %	0 %	100 %	198241726
105	NC_011204	T	6	6	65683	65688	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
106	NC_011204	T	6	6	65800	65805	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
107	NC_011204	T	7	7	65892	65898	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
108	NC_011204	A	6	6	66633	66638	100 %	0 %	0 %	0 %	198241650
109	NC_011204	T	6	6	66795	66800	0 %	100 %	0 %	0 %	198241650
110	NC_011204	T	6	6	67240	67245	0 %	100 %	0 %	0 %	198241664
111	NC_011204	T	7	7	67439	67445	0 %	100 %	0 %	0 %	198241739
112	NC_011204	T	7	7	67660	67666	0 %	100 %	0 %	0 %	198241722
113	NC_011204	T	8	8	68063	68070	0 %	100 %	0 %	0 %	198241642
114	NC_011204	T	7	7	68280	68286	0 %	100 %	0 %	0 %	198241678
115	NC_011204	A	6	6	68744	68749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011204	T	8	8	69708	69715	0 %	100 %	0 %	0 %	198241720
117	NC_011204	T	6	6	69905	69910	0 %	100 %	0 %	0 %	198241641
118	NC_011204	T	6	6	70095	70100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011204	T	6	6	70428	70433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011204	T	6	6	70458	70463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011204	T	7	7	70467	70473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011204	T	6	6	70575	70580	0 %	100 %	0 %	0 %	198241682
123	NC_011204	T	6	6	70609	70614	0 %	100 %	0 %	0 %	198241682
124	NC_011204	A	6	6	70959	70964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011204	A	7	7	71650	71656	100 %	0 %	0 %	0 %	198241649
126	NC_011204	A	6	6	71662	71667	100 %	0 %	0 %	0 %	198241649
127	NC_011204	T	6	6	72524	72529	0 %	100 %	0 %	0 %	198241716
128	NC_011204	G	6	6	72933	72938	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011204	T	6	6	72975	72980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011204	A	6	6	73121	73126	100 %	0 %	0 %	0 %	198241706
131	NC_011204	T	8	8	73622	73629	0 %	100 %	0 %	0 %	198241666
132	NC_011204	T	8	8	74529	74536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.