MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853 plasmid pCT02021853_74

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011204	T	6	6	124	129	0 %	100 %	0 %	0 %	198241669
2	NC_011204	A	6	6	5910	5915	100 %	0 %	0 %	0 %	198241715
3	NC_011204	A	6	6	8810	8815	100 %	0 %	0 %	0 %	198241704
4	NC_011204	T	6	6	10950	10955	0 %	100 %	0 %	0 %	198241695
5	NC_011204	A	7	7	11177	11183	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
6	NC_011204	T	6	6	11218	11223	0 %	100 %	0 %	0 %	198241670
7	NC_011204	A	8	8	11237	11244	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
8	NC_011204	A	6	6	11272	11277	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
9	NC_011204	A	6	6	11571	11576	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
10	NC_011204	A	6	6	11609	11614	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
11	NC_011204	A	6	6	11767	11772	100 %	0 %	0 %	0 %	198241670
12	NC_011204	T	7	7	11871	11877	0 %	100 %	0 %	0 %	198241670
13	NC_011204	T	6	6	15554	15559	0 %	100 %	0 %	0 %	198241653
14	NC_011204	A	6	6	15568	15573	100 %	0 %	0 %	0 %	198241653
15	NC_011204	A	8	8	15605	15612	100 %	0 %	0 %	0 %	198241653
16	NC_011204	A	6	6	16709	16714	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
17	NC_011204	A	6	6	17175	17180	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
18	NC_011204	A	7	7	17243	17249	100 %	0 %	0 %	0 %	198241655
19	NC_011204	T	6	6	19985	19990	0 %	100 %	0 %	0 %	198241681
20	NC_011204	C	6	6	20059	20064	0 %	0 %	0 %	100 %	198241681
21	NC_011204	C	6	6	20229	20234	0 %	0 %	0 %	100 %	198241681
22	NC_011204	T	6	6	21509	21514	0 %	100 %	0 %	0 %	198241703
23	NC_011204	T	6	6	23162	23167	0 %	100 %	0 %	0 %	198241691
24	NC_011204	A	6	6	24450	24455	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
25	NC_011204	A	6	6	24578	24583	100 %	0 %	0 %	0 %	198241675
26	NC_011204	A	6	6	25134	25139	100 %	0 %	0 %	0 %	198241671
27	NC_011204	A	7	7	25843	25849	100 %	0 %	0 %	0 %	198241668
28	NC_011204	T	6	6	27217	27222	0 %	100 %	0 %	0 %	198241693
29	NC_011204	A	7	7	27851	27857	100 %	0 %	0 %	0 %	198241647
30	NC_011204	A	8	8	30316	30323	100 %	0 %	0 %	0 %	198241644
31	NC_011204	T	6	6	30372	30377	0 %	100 %	0 %	0 %	198241644
32	NC_011204	T	6	6	36484	36489	0 %	100 %	0 %	0 %	198241698
33	NC_011204	C	7	7	37637	37643	0 %	0 %	0 %	100 %	198241694
34	NC_011204	T	7	7	38174	38180	0 %	100 %	0 %	0 %	198241727
35	NC_011204	A	6	6	38638	38643	100 %	0 %	0 %	0 %	198241638
36	NC_011204	T	6	6	45030	45035	0 %	100 %	0 %	0 %	198241692
37	NC_011204	T	6	6	45275	45280	0 %	100 %	0 %	0 %	198241730
38	NC_011204	T	6	6	47435	47440	0 %	100 %	0 %	0 %	198241648
39	NC_011204	T	6	6	49073	49078	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
40	NC_011204	T	6	6	49103	49108	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
41	NC_011204	T	6	6	49726	49731	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
42	NC_011204	T	7	7	49804	49810	0 %	100 %	0 %	0 %	198241731
43	NC_011204	T	6	6	51352	51357	0 %	100 %	0 %	0 %	198241697
44	NC_011204	T	6	6	51649	51654	0 %	100 %	0 %	0 %	198241737
45	NC_011204	A	7	7	51670	51676	100 %	0 %	0 %	0 %	198241737
46	NC_011204	T	6	6	51931	51936	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
47	NC_011204	T	6	6	51992	51997	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
48	NC_011204	A	6	6	52016	52021	100 %	0 %	0 %	0 %	198241701
49	NC_011204	T	7	7	52232	52238	0 %	100 %	0 %	0 %	198241701
50	NC_011204	T	6	6	52279	52284	0 %	100 %	0 %	0 %	198241714
51	NC_011204	T	6	6	52321	52326	0 %	100 %	0 %	0 %	198241714
52	NC_011204	T	7	7	55959	55965	0 %	100 %	0 %	0 %	198241662
53	NC_011204	T	6	6	57501	57506	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
54	NC_011204	A	6	6	57623	57628	100 %	0 %	0 %	0 %	198241718
55	NC_011204	T	6	6	57703	57708	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
56	NC_011204	T	7	7	57884	57890	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
57	NC_011204	T	6	6	57922	57927	0 %	100 %	0 %	0 %	198241718
58	NC_011204	A	7	7	59234	59240	100 %	0 %	0 %	0 %	198241713
59	NC_011204	T	6	6	59453	59458	0 %	100 %	0 %	0 %	198241679
60	NC_011204	C	6	6	61300	61305	0 %	0 %	0 %	100 %	198241712
61	NC_011204	A	7	7	61345	61351	100 %	0 %	0 %	0 %	198241712
62	NC_011204	T	6	6	61362	61367	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
63	NC_011204	C	6	6	61586	61591	0 %	0 %	0 %	100 %	198241712
64	NC_011204	T	6	6	62370	62375	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
65	NC_011204	T	6	6	62701	62706	0 %	100 %	0 %	0 %	198241712
66	NC_011204	A	6	6	62904	62909	100 %	0 %	0 %	0 %	198241712
67	NC_011204	A	6	6	63268	63273	100 %	0 %	0 %	0 %	198241689
68	NC_011204	A	6	6	63289	63294	100 %	0 %	0 %	0 %	198241689
69	NC_011204	T	7	7	63540	63546	0 %	100 %	0 %	0 %	198241677
70	NC_011204	T	6	6	63696	63701	0 %	100 %	0 %	0 %	198241677
71	NC_011204	T	6	6	64125	64130	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
72	NC_011204	T	6	6	64199	64204	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
73	NC_011204	T	6	6	64280	64285	0 %	100 %	0 %	0 %	198241723
74	NC_011204	C	6	6	65424	65429	0 %	0 %	0 %	100 %	198241726
75	NC_011204	T	6	6	65683	65688	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
76	NC_011204	T	6	6	65800	65805	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
77	NC_011204	T	7	7	65892	65898	0 %	100 %	0 %	0 %	198241726
78	NC_011204	A	6	6	66633	66638	100 %	0 %	0 %	0 %	198241650
79	NC_011204	T	6	6	66795	66800	0 %	100 %	0 %	0 %	198241650
80	NC_011204	T	6	6	67240	67245	0 %	100 %	0 %	0 %	198241664
81	NC_011204	T	7	7	67439	67445	0 %	100 %	0 %	0 %	198241739
82	NC_011204	T	7	7	67660	67666	0 %	100 %	0 %	0 %	198241722
83	NC_011204	T	8	8	68063	68070	0 %	100 %	0 %	0 %	198241642
84	NC_011204	T	7	7	68280	68286	0 %	100 %	0 %	0 %	198241678
85	NC_011204	T	8	8	69708	69715	0 %	100 %	0 %	0 %	198241720
86	NC_011204	T	6	6	69905	69910	0 %	100 %	0 %	0 %	198241641
87	NC_011204	T	6	6	70575	70580	0 %	100 %	0 %	0 %	198241682
88	NC_011204	T	6	6	70609	70614	0 %	100 %	0 %	0 %	198241682
89	NC_011204	A	7	7	71650	71656	100 %	0 %	0 %	0 %	198241649
90	NC_011204	A	6	6	71662	71667	100 %	0 %	0 %	0 %	198241649
91	NC_011204	T	6	6	72524	72529	0 %	100 %	0 %	0 %	198241716
92	NC_011204	A	6	6	73121	73126	100 %	0 %	0 %	0 %	198241706
93	NC_011204	T	8	8	73622	73629	0 %	100 %	0 %	0 %	198241666

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.