MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	TCCATT	2	12	1015	1026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011186	AACTTT	2	12	8622	8633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_011186	TTTTAT	2	12	14399	14410	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011186	CAAAAA	2	12	59317	59328	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_011186	AATATA	2	12	72709	72720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011186	TTTATA	2	12	83086	83097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011186	AATATA	2	12	105027	105038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011186	TTAAAA	2	12	135833	135844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011186	AAAAAT	2	12	199061	199072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011186	TTGTTA	2	12	201797	201808	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011186	CTTTTT	2	12	210998	211009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_011186	GCATTC	2	12	224972	224983	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011186	TGGAAT	2	12	241984	241995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011186	TTTTAT	2	12	287561	287572	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011186	TTCGAA	2	12	306831	306842	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_011186	AAATGG	2	12	313262	313273	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011186	TTTGAT	2	12	316761	316772	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011186	TCGTTT	2	12	321317	321328	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_011186	ATTTTC	2	12	350336	350347	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_011186	ATTTTC	2	12	350542	350553	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_011186	AGGGAT	2	12	350929	350940	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011186	CTATCG	2	12	351713	351724	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011186	TTTGTT	2	12	379053	379064	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011186	TCATTT	2	12	413909	413920	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_011186	TAAATA	2	12	421272	421283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011186	TTTAAT	2	12	421351	421362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011186	CTTTTA	2	12	433982	433993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_011186	TTTTTG	2	12	458169	458180	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011186	TGAAAT	2	12	528029	528040	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011186	ATTCTT	2	12	532203	532214	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_011186	ATTTAT	2	12	567882	567893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011186	TTGGTT	2	12	597034	597045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011186	GAAAAA	2	12	641948	641959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011186	TTTTAT	2	12	657737	657748	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011186	GTATTC	2	12	664678	664689	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_011186	ATAAAA	2	12	720482	720493	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011186	TACCGA	2	12	728807	728818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_011186	TCATTA	2	12	747659	747670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011186	AAATAT	2	12	759268	759279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011186	ACTAAA	2	12	772247	772258	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_011186	TTAACT	2	12	789118	789129	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_011186	TACCGA	2	12	801216	801227	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011186	ATTAGT	2	12	810874	810885	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011186	ATAATG	2	12	863544	863555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011186	TCACTT	2	12	876997	877008	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_011186	TATTTT	2	12	932018	932029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011186	AACAAA	2	12	932174	932185	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_011186	TCACAA	2	12	946166	946177	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011186	ACAAAA	2	12	961319	961330	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_011186	ACTTAA	2	12	995382	995393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_011186	CATGAT	2	12	1066296	1066307	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011186	CCTGAA	2	12	1080673	1080684	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011186	ATTTCT	2	12	1106696	1106707	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_011186	CATTAA	2	12	1145573	1145584	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011186	ATATAA	2	12	1167243	1167254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011186	TATAAT	2	12	1206297	1206308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011186	TAAAAT	3	18	1243031	1243048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011186	AGGGAT	2	12	1258060	1258071	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_011186	AAAACA	2	12	1289486	1289497	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_011186	GTATAA	2	12	1332379	1332390	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011186	GCTTGA	2	12	1340081	1340092	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011186	TTACTT	2	12	1340164	1340175	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_011186	ATATTT	2	12	1345364	1345375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011186	TTTTAT	2	12	1349653	1349664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011186	TAATAT	2	12	1350084	1350095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011186	CAATCT	2	12	1365297	1365308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.