MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	AAAGA	2	10	1097	1106	80 %	0 %	20 %	0 %	197337153
2	NC_011186	AAACA	2	10	3424	3433	80 %	0 %	0 %	20 %	197337738
3	NC_011186	AACAA	2	10	5123	5132	80 %	0 %	0 %	20 %	197337026
4	NC_011186	ATTTT	2	10	6730	6739	20 %	80 %	0 %	0 %	197337332
5	NC_011186	TTTAT	2	10	8405	8414	20 %	80 %	0 %	0 %	197337104
6	NC_011186	CTATG	2	10	8982	8991	20 %	40 %	20 %	20 %	197337668
7	NC_011186	AATCA	2	10	9968	9977	60 %	20 %	0 %	20 %	197337088
8	NC_011186	TGTTA	2	10	10592	10601	20 %	60 %	20 %	0 %	197337088
9	NC_011186	CAAGT	2	10	11017	11026	40 %	20 %	20 %	20 %	197337088
10	NC_011186	CACAT	2	10	11216	11225	40 %	20 %	0 %	40 %	197337088
11	NC_011186	AGGTG	2	10	13187	13196	20 %	20 %	60 %	0 %	197337088
12	NC_011186	TCAAC	2	10	13572	13581	40 %	20 %	0 %	40 %	197337088
13	NC_011186	TATGA	2	10	14091	14100	40 %	40 %	20 %	0 %	197337088
14	NC_011186	TATGA	2	10	14145	14154	40 %	40 %	20 %	0 %	197337088
15	NC_011186	AATAA	2	10	14598	14607	80 %	20 %	0 %	0 %	197337628
16	NC_011186	ACTTA	2	10	18031	18040	40 %	40 %	0 %	20 %	197337628
17	NC_011186	TTTTC	2	10	19121	19130	0 %	80 %	0 %	20 %	197337567
18	NC_011186	TGAAT	2	10	20600	20609	40 %	40 %	20 %	0 %	197336847
19	NC_011186	TAATT	2	10	21063	21072	40 %	60 %	0 %	0 %	197336847
20	NC_011186	ATTTG	2	10	22695	22704	20 %	60 %	20 %	0 %	197337534
21	NC_011186	TGAAA	2	10	23373	23382	60 %	20 %	20 %	0 %	197337196
22	NC_011186	CAGTT	2	10	24212	24221	20 %	40 %	20 %	20 %	197337196
23	NC_011186	AACGA	2	10	25162	25171	60 %	0 %	20 %	20 %	197337640
24	NC_011186	TTTCT	2	10	26541	26550	0 %	80 %	0 %	20 %	197337091
25	NC_011186	ATGAA	2	10	29666	29675	60 %	20 %	20 %	0 %	197337076
26	NC_011186	TTAGC	2	10	33309	33318	20 %	40 %	20 %	20 %	197336764
27	NC_011186	GGCAG	2	10	33358	33367	20 %	0 %	60 %	20 %	197336764
28	NC_011186	TGAAG	2	10	35547	35556	40 %	20 %	40 %	0 %	197336984
29	NC_011186	TGGTG	2	10	36488	36497	0 %	40 %	60 %	0 %	197337514
30	NC_011186	AACTA	2	10	37149	37158	60 %	20 %	0 %	20 %	197337108
31	NC_011186	AATGA	2	10	42096	42105	60 %	20 %	20 %	0 %	197336673
32	NC_011186	CCATT	2	10	42800	42809	20 %	40 %	0 %	40 %	197337433
33	NC_011186	AAATC	2	10	42890	42899	60 %	20 %	0 %	20 %	197337433
34	NC_011186	TTCTC	2	10	44952	44961	0 %	60 %	0 %	40 %	197337067
35	NC_011186	GTTTT	2	10	44995	45004	0 %	80 %	20 %	0 %	197337067
36	NC_011186	AAAGG	2	10	46969	46978	60 %	0 %	40 %	0 %	197337160
37	NC_011186	GAGCA	2	10	47617	47626	40 %	0 %	40 %	20 %	197337160
38	NC_011186	GCAAG	2	10	47766	47775	40 %	0 %	40 %	20 %	197337160
39	NC_011186	TTGGT	2	10	49339	49348	0 %	60 %	40 %	0 %	197337707
40	NC_011186	AAGCC	2	10	51409	51418	40 %	0 %	20 %	40 %	197337447
41	NC_011186	TTATT	2	10	53039	53048	20 %	80 %	0 %	0 %	197337239
42	NC_011186	TCGTT	2	10	55483	55492	0 %	60 %	20 %	20 %	197336947
43	NC_011186	TTCAT	2	10	57754	57763	20 %	60 %	0 %	20 %	197336991
44	NC_011186	TCTGT	2	10	58870	58879	0 %	60 %	20 %	20 %	197337862
45	NC_011186	AGAGA	2	10	60200	60209	60 %	0 %	40 %	0 %	197337369
46	NC_011186	GCAAC	2	10	60428	60437	40 %	0 %	20 %	40 %	197337369
47	NC_011186	AATCA	2	10	60833	60842	60 %	20 %	0 %	20 %	197337369
48	NC_011186	ATGAA	2	10	61026	61035	60 %	20 %	20 %	0 %	197337369
49	NC_011186	ATTTT	2	10	61437	61446	20 %	80 %	0 %	0 %	197337742
50	NC_011186	GCAAT	2	10	61595	61604	40 %	20 %	20 %	20 %	197337742
51	NC_011186	TTCTA	2	10	61774	61783	20 %	60 %	0 %	20 %	197337742
52	NC_011186	ATCTT	2	10	61811	61820	20 %	60 %	0 %	20 %	197337742
53	NC_011186	ATTGT	2	10	63314	63323	20 %	60 %	20 %	0 %	197337526
54	NC_011186	CATGG	2	10	63991	64000	20 %	20 %	40 %	20 %	197337526
55	NC_011186	AGTTA	2	10	67664	67673	40 %	40 %	20 %	0 %	197337913
56	NC_011186	AGGTG	2	10	68462	68471	20 %	20 %	60 %	0 %	197337209
57	NC_011186	CATTC	2	10	70672	70681	20 %	40 %	0 %	40 %	197336679
58	NC_011186	CAGTT	2	10	70855	70864	20 %	40 %	20 %	20 %	197337371
59	NC_011186	CATTG	2	10	72107	72116	20 %	40 %	20 %	20 %	197336798
60	NC_011186	GTTTT	2	10	72240	72249	0 %	80 %	20 %	0 %	197336798
61	NC_011186	CAAAA	2	10	76281	76290	80 %	0 %	0 %	20 %	197337013
62	NC_011186	AGTTA	2	10	78541	78550	40 %	40 %	20 %	0 %	197337487
63	NC_011186	GGTGT	2	10	78678	78687	0 %	40 %	60 %	0 %	197337487
64	NC_011186	GTGTT	2	10	78987	78996	0 %	60 %	40 %	0 %	197337487
65	NC_011186	ATATT	2	10	79645	79654	40 %	60 %	0 %	0 %	197337487
66	NC_011186	ATCAA	2	10	80389	80398	60 %	20 %	0 %	20 %	197337487
67	NC_011186	TATTT	2	10	80612	80621	20 %	80 %	0 %	0 %	197337487
68	NC_011186	GTTTT	2	10	81388	81397	0 %	80 %	20 %	0 %	197337637
69	NC_011186	TTTTG	2	10	86322	86331	0 %	80 %	20 %	0 %	197336745
70	NC_011186	CTTTG	2	10	87697	87706	0 %	60 %	20 %	20 %	197337590
71	NC_011186	GTAAA	2	10	89954	89963	60 %	20 %	20 %	0 %	197336735
72	NC_011186	GAGAA	2	10	91425	91434	60 %	0 %	40 %	0 %	197337429
73	NC_011186	AAATG	2	10	92032	92041	60 %	20 %	20 %	0 %	197337429
74	NC_011186	ACCAG	2	10	92733	92742	40 %	0 %	20 %	40 %	197337352
75	NC_011186	TTAAT	2	10	93215	93224	40 %	60 %	0 %	0 %	197337352
76	NC_011186	TAATG	2	10	93857	93866	40 %	40 %	20 %	0 %	197337352
77	NC_011186	AAATT	2	10	94965	94974	60 %	40 %	0 %	0 %	197337415
78	NC_011186	TTTTG	2	10	95168	95177	0 %	80 %	20 %	0 %	197337415
79	NC_011186	GAATT	2	10	100526	100535	40 %	40 %	20 %	0 %	197337863
80	NC_011186	TCACT	2	10	100973	100982	20 %	40 %	0 %	40 %	197337863
81	NC_011186	TTAAA	2	10	101250	101259	60 %	40 %	0 %	0 %	197337203
82	NC_011186	ACATG	2	10	103787	103796	40 %	20 %	20 %	20 %	197337350
83	NC_011186	ATGCC	2	10	104279	104288	20 %	20 %	20 %	40 %	197337350
84	NC_011186	TATTT	2	10	105879	105888	20 %	80 %	0 %	0 %	197336828
85	NC_011186	CGATA	2	10	107693	107702	40 %	20 %	20 %	20 %	197337907
86	NC_011186	GAAAT	2	10	109822	109831	60 %	20 %	20 %	0 %	197337228
87	NC_011186	TAGTT	2	10	110337	110346	20 %	60 %	20 %	0 %	197337228
88	NC_011186	TTGTT	2	10	111413	111422	0 %	80 %	20 %	0 %	197336985
89	NC_011186	ATAAG	2	10	111455	111464	60 %	20 %	20 %	0 %	197336985
90	NC_011186	ATTCA	2	10	112038	112047	40 %	40 %	0 %	20 %	197337462
91	NC_011186	TAATT	2	10	112287	112296	40 %	60 %	0 %	0 %	197337462
92	NC_011186	AAATT	2	10	112814	112823	60 %	40 %	0 %	0 %	197337462
93	NC_011186	TTAAA	2	10	112904	112913	60 %	40 %	0 %	0 %	197337462
94	NC_011186	AATTA	2	10	113232	113241	60 %	40 %	0 %	0 %	197337462
95	NC_011186	CTTTG	2	10	113242	113251	0 %	60 %	20 %	20 %	197337462
96	NC_011186	GTAAT	2	10	113254	113263	40 %	40 %	20 %	0 %	197337462
97	NC_011186	AAGGT	2	10	116971	116980	40 %	20 %	40 %	0 %	197337597
98	NC_011186	CATCA	2	10	117899	117908	40 %	20 %	0 %	40 %	197337892
99	NC_011186	GGTTT	2	10	119596	119605	0 %	60 %	40 %	0 %	197337765
100	NC_011186	TTTTC	2	10	121204	121213	0 %	80 %	0 %	20 %	197337231
101	NC_011186	CAATA	2	10	121652	121661	60 %	20 %	0 %	20 %	197337231
102	NC_011186	AATTA	2	10	126363	126372	60 %	40 %	0 %	0 %	197337764
103	NC_011186	GTTGG	2	10	127761	127770	0 %	40 %	60 %	0 %	197336776
104	NC_011186	AATTG	2	10	127967	127976	40 %	40 %	20 %	0 %	197336776
105	NC_011186	AAACA	2	10	128647	128656	80 %	0 %	0 %	20 %	197337331
106	NC_011186	ACAAA	2	10	129486	129495	80 %	0 %	0 %	20 %	197337457
107	NC_011186	GTCTC	2	10	129864	129873	0 %	40 %	20 %	40 %	197337457
108	NC_011186	GATTT	2	10	129945	129954	20 %	60 %	20 %	0 %	197337457
109	NC_011186	CATGG	2	10	131885	131894	20 %	20 %	40 %	20 %	197337056
110	NC_011186	CAATC	2	10	132005	132014	40 %	20 %	0 %	40 %	197337056
111	NC_011186	AAGCG	2	10	133508	133517	40 %	0 %	40 %	20 %	197337320
112	NC_011186	AGTTC	2	10	134531	134540	20 %	40 %	20 %	20 %	197336937
113	NC_011186	AGAAA	2	10	135055	135064	80 %	0 %	20 %	0 %	197336937
114	NC_011186	CTTTG	2	10	135151	135160	0 %	60 %	20 %	20 %	197336937
115	NC_011186	GGTGA	2	10	136860	136869	20 %	20 %	60 %	0 %	197336778
116	NC_011186	AGGCG	2	10	142109	142118	20 %	0 %	60 %	20 %	197337220
117	NC_011186	TTGCT	2	10	143156	143165	0 %	60 %	20 %	20 %	197337220
118	NC_011186	TCTAA	2	10	147150	147159	40 %	40 %	0 %	20 %	197337614
119	NC_011186	TGATT	2	10	148807	148816	20 %	60 %	20 %	0 %	197336670
120	NC_011186	TTCAA	2	10	150901	150910	40 %	40 %	0 %	20 %	197337217
121	NC_011186	GAATA	2	10	154757	154766	60 %	20 %	20 %	0 %	197337626
122	NC_011186	ATCGT	2	10	157378	157387	20 %	40 %	20 %	20 %	197336760
123	NC_011186	AGGGA	2	10	158528	158537	40 %	0 %	60 %	0 %	197337326
124	NC_011186	TGATT	2	10	161633	161642	20 %	60 %	20 %	0 %	197336689
125	NC_011186	GAACG	2	10	163551	163560	40 %	0 %	40 %	20 %	197337174
126	NC_011186	GCCTT	2	10	167440	167449	0 %	40 %	20 %	40 %	197337489
127	NC_011186	TTCTT	2	10	168266	168275	0 %	80 %	0 %	20 %	197337838
128	NC_011186	ACCAC	2	10	168464	168473	40 %	0 %	0 %	60 %	197337838
129	NC_011186	TTGGT	2	10	168848	168857	0 %	60 %	40 %	0 %	197337838
130	NC_011186	TATGG	2	10	170502	170511	20 %	40 %	40 %	0 %	197337402
131	NC_011186	GGTTG	2	10	171270	171279	0 %	40 %	60 %	0 %	197337402
132	NC_011186	CAAAC	2	10	171316	171325	60 %	0 %	0 %	40 %	197337402
133	NC_011186	CTAAG	2	10	173948	173957	40 %	20 %	20 %	20 %	197337592
134	NC_011186	AGTAT	2	10	176900	176909	40 %	40 %	20 %	0 %	197337287
135	NC_011186	TGCAT	2	10	177945	177954	20 %	40 %	20 %	20 %	197337167
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