MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 4450

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	AATT	2	8	262	269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011186	AATA	2	8	434	441	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011186	TTTC	2	8	460	467	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011186	CATC	2	8	674	681	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011186	CTTT	2	8	1002	1009	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_011186	AACT	2	8	1621	1628	50 %	25 %	0 %	25 %	197337153
7	NC_011186	TTTA	2	8	1780	1787	25 %	75 %	0 %	0 %	197337153
8	NC_011186	CAAA	2	8	1835	1842	75 %	0 %	0 %	25 %	197337153
9	NC_011186	CTCG	2	8	2300	2307	0 %	25 %	25 %	50 %	197337153
10	NC_011186	TAAG	2	8	2895	2902	50 %	25 %	25 %	0 %	197337153
11	NC_011186	TATT	2	8	3377	3384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011186	ATTT	2	8	3468	3475	25 %	75 %	0 %	0 %	197337738
13	NC_011186	AGCA	2	8	3559	3566	50 %	0 %	25 %	25 %	197337738
14	NC_011186	AATG	2	8	3632	3639	50 %	25 %	25 %	0 %	197337738
15	NC_011186	AAAT	2	8	3886	3893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011186	TATT	3	12	4039	4050	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011186	ATTT	2	8	4352	4359	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011186	TTAT	2	8	4476	4483	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011186	GAAA	2	8	4558	4565	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
20	NC_011186	TTGA	2	8	4649	4656	25 %	50 %	25 %	0 %	197337026
21	NC_011186	AGAA	2	8	4996	5003	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
22	NC_011186	AAAG	2	8	5094	5101	75 %	0 %	25 %	0 %	197337026
23	NC_011186	ATAA	2	8	5320	5327	75 %	25 %	0 %	0 %	197337026
24	NC_011186	TTTG	2	8	5859	5866	0 %	75 %	25 %	0 %	197337332
25	NC_011186	TTAT	2	8	7024	7031	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011186	TGAT	2	8	7083	7090	25 %	50 %	25 %	0 %	197336944
27	NC_011186	AAAG	2	8	7195	7202	75 %	0 %	25 %	0 %	197336944
28	NC_011186	CAAC	2	8	7498	7505	50 %	0 %	0 %	50 %	197337210
29	NC_011186	ATTT	2	8	7564	7571	25 %	75 %	0 %	0 %	197337210
30	NC_011186	AGCT	2	8	8172	8179	25 %	25 %	25 %	25 %	197336816
31	NC_011186	TAAG	2	8	8365	8372	50 %	25 %	25 %	0 %	197336816
32	NC_011186	TAAA	2	8	8776	8783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011186	TTTC	2	8	8871	8878	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_011186	AAAG	2	8	9498	9505	75 %	0 %	25 %	0 %	197337668
35	NC_011186	TCGC	2	8	9791	9798	0 %	25 %	25 %	50 %	197337668
36	NC_011186	TAGT	2	8	10099	10106	25 %	50 %	25 %	0 %	197337088
37	NC_011186	GTTT	2	8	10511	10518	0 %	75 %	25 %	0 %	197337088
38	NC_011186	GAAA	2	8	10999	11006	75 %	0 %	25 %	0 %	197337088
39	NC_011186	GGAA	2	8	12260	12267	50 %	0 %	50 %	0 %	197337088
40	NC_011186	AGTT	2	8	12332	12339	25 %	50 %	25 %	0 %	197337088
41	NC_011186	AGTT	2	8	12854	12861	25 %	50 %	25 %	0 %	197337088
42	NC_011186	CGTT	2	8	13005	13012	0 %	50 %	25 %	25 %	197337088
43	NC_011186	GAGT	2	8	13114	13121	25 %	25 %	50 %	0 %	197337088
44	NC_011186	TTTG	2	8	14492	14499	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011186	GAGT	2	8	14788	14795	25 %	25 %	50 %	0 %	197337628
46	NC_011186	TGGT	2	8	16243	16250	0 %	50 %	50 %	0 %	197337628
47	NC_011186	TGGT	2	8	16504	16511	0 %	50 %	50 %	0 %	197337628
48	NC_011186	TGGT	2	8	16765	16772	0 %	50 %	50 %	0 %	197337628
49	NC_011186	TGGT	2	8	17026	17033	0 %	50 %	50 %	0 %	197337628
50	NC_011186	TGGT	2	8	17287	17294	0 %	50 %	50 %	0 %	197337628
51	NC_011186	GCCA	2	8	17469	17476	25 %	0 %	25 %	50 %	197337628
52	NC_011186	GAAG	2	8	18141	18148	50 %	0 %	50 %	0 %	197337628
53	NC_011186	ACTT	2	8	18662	18669	25 %	50 %	0 %	25 %	197337567
54	NC_011186	AAAT	2	8	19075	19082	75 %	25 %	0 %	0 %	197337567
55	NC_011186	CTTT	2	8	19143	19150	0 %	75 %	0 %	25 %	197337567
56	NC_011186	ATTT	2	8	19220	19227	25 %	75 %	0 %	0 %	197337567
57	NC_011186	GTTG	2	8	19285	19292	0 %	50 %	50 %	0 %	197337567
58	NC_011186	TAAC	2	8	19299	19306	50 %	25 %	0 %	25 %	197337567
59	NC_011186	ATGA	2	8	19521	19528	50 %	25 %	25 %	0 %	197337567
60	NC_011186	TATT	2	8	20313	20320	25 %	75 %	0 %	0 %	197336847
61	NC_011186	TAAT	2	8	20404	20411	50 %	50 %	0 %	0 %	197336847
62	NC_011186	AAAG	2	8	20577	20584	75 %	0 %	25 %	0 %	197336847
63	NC_011186	TAAA	2	8	20983	20990	75 %	25 %	0 %	0 %	197336847
64	NC_011186	TGGT	2	8	20995	21002	0 %	50 %	50 %	0 %	197336847
65	NC_011186	AGAT	2	8	21232	21239	50 %	25 %	25 %	0 %	197336847
66	NC_011186	TTTA	2	8	21417	21424	25 %	75 %	0 %	0 %	197336687
67	NC_011186	ATGT	2	8	22145	22152	25 %	50 %	25 %	0 %	197337534
68	NC_011186	TTTG	2	8	22463	22470	0 %	75 %	25 %	0 %	197337534
69	NC_011186	TTTA	2	8	22515	22522	25 %	75 %	0 %	0 %	197337534
70	NC_011186	TAAT	2	8	22802	22809	50 %	50 %	0 %	0 %	197337534
71	NC_011186	AGTT	2	8	22814	22821	25 %	50 %	25 %	0 %	197337534
72	NC_011186	TAAC	2	8	22909	22916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_011186	TGTT	2	8	23063	23070	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011186	TAAG	2	8	23150	23157	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011186	TTAT	2	8	23195	23202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011186	AGTT	2	8	23224	23231	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011186	ATTA	2	8	24775	24782	50 %	50 %	0 %	0 %	197337196
78	NC_011186	TGCT	2	8	24849	24856	0 %	50 %	25 %	25 %	197337399
79	NC_011186	CGGT	2	8	25296	25303	0 %	25 %	50 %	25 %	197337640
80	NC_011186	AAAG	2	8	26291	26298	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011186	TTAA	2	8	27602	27609	50 %	50 %	0 %	0 %	197337091
82	NC_011186	TATT	2	8	27781	27788	25 %	75 %	0 %	0 %	197336971
83	NC_011186	TTTA	2	8	28117	28124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011186	TATT	2	8	28144	28151	25 %	75 %	0 %	0 %	197337525
85	NC_011186	CATG	2	8	28420	28427	25 %	25 %	25 %	25 %	197337525
86	NC_011186	TAGT	2	8	28777	28784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011186	TATG	2	8	29427	29434	25 %	50 %	25 %	0 %	197337076
88	NC_011186	ATTC	2	8	29778	29785	25 %	50 %	0 %	25 %	197337076
89	NC_011186	AAAC	2	8	30277	30284	75 %	0 %	0 %	25 %	197337683
90	NC_011186	TTGA	2	8	30892	30899	25 %	50 %	25 %	0 %	197337683
91	NC_011186	TAAA	2	8	31539	31546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011186	GAAA	2	8	32499	32506	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011186	ACTT	2	8	32965	32972	25 %	50 %	0 %	25 %	197336764
94	NC_011186	AACC	2	8	33174	33181	50 %	0 %	0 %	50 %	197336764
95	NC_011186	TATG	2	8	33430	33437	25 %	50 %	25 %	0 %	197336764
96	NC_011186	CAAA	2	8	33456	33463	75 %	0 %	0 %	25 %	197336764
97	NC_011186	CTTT	2	8	33497	33504	0 %	75 %	0 %	25 %	197336764
98	NC_011186	AGCA	2	8	34029	34036	50 %	0 %	25 %	25 %	197337308
99	NC_011186	TCAT	2	8	34581	34588	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_011186	ACCA	2	8	35205	35212	50 %	0 %	0 %	50 %	197336984
101	NC_011186	GACA	2	8	35293	35300	50 %	0 %	25 %	25 %	197336984
102	NC_011186	TGTA	2	8	35313	35320	25 %	50 %	25 %	0 %	197336984
103	NC_011186	CAAG	2	8	35503	35510	50 %	0 %	25 %	25 %	197336984
104	NC_011186	TTTA	2	8	36342	36349	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011186	AATG	2	8	36611	36618	50 %	25 %	25 %	0 %	197337514
106	NC_011186	ATTT	2	8	37016	37023	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011186	ACTG	2	8	38316	38323	25 %	25 %	25 %	25 %	197337108
108	NC_011186	ATTT	2	8	38409	38416	25 %	75 %	0 %	0 %	197337108
109	NC_011186	TATT	2	8	38614	38621	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011186	TGAG	2	8	39036	39043	25 %	25 %	50 %	0 %	197337238
111	NC_011186	TGAG	2	8	39168	39175	25 %	25 %	50 %	0 %	197337238
112	NC_011186	TAGA	2	8	39273	39280	50 %	25 %	25 %	0 %	197337238
113	NC_011186	TAAC	2	8	40207	40214	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_011186	ATTG	2	8	40316	40323	25 %	50 %	25 %	0 %	197337775
115	NC_011186	GATG	2	8	40361	40368	25 %	25 %	50 %	0 %	197337775
116	NC_011186	TTGG	2	8	40416	40423	0 %	50 %	50 %	0 %	197337775
117	NC_011186	ATTA	2	8	40731	40738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011186	TTTA	2	8	40815	40822	25 %	75 %	0 %	0 %	197337546
119	NC_011186	AGTA	2	8	41026	41033	50 %	25 %	25 %	0 %	197337546
120	NC_011186	ATAA	2	8	41342	41349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011186	TTGG	2	8	41681	41688	0 %	50 %	50 %	0 %	197336673
122	NC_011186	TAAG	2	8	42022	42029	50 %	25 %	25 %	0 %	197336673
123	NC_011186	ATAA	2	8	42126	42133	75 %	25 %	0 %	0 %	197336673
124	NC_011186	AAAT	2	8	42149	42156	75 %	25 %	0 %	0 %	197336673
125	NC_011186	ATTA	2	8	42168	42175	50 %	50 %	0 %	0 %	197336673
126	NC_011186	TTGT	2	8	42246	42253	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011186	AATG	2	8	42326	42333	50 %	25 %	25 %	0 %	197337433
128	NC_011186	TGGC	2	8	42466	42473	0 %	25 %	50 %	25 %	197337433
129	NC_011186	GTTT	2	8	42864	42871	0 %	75 %	25 %	0 %	197337433
130	NC_011186	ATCA	2	8	43138	43145	50 %	25 %	0 %	25 %	197337433
131	NC_011186	ATTG	2	8	43401	43408	25 %	50 %	25 %	0 %	197337204
132	NC_011186	AATT	2	8	43430	43437	50 %	50 %	0 %	0 %	197337204
133	NC_011186	AAAG	2	8	43666	43673	75 %	0 %	25 %	0 %	197337204
134	NC_011186	ATTC	2	8	44371	44378	25 %	50 %	0 %	25 %	197337901
135	NC_011186	TGTT	2	8	44548	44555	0 %	75 %	25 %	0 %	197337901
136	NC_011186	TGAT	2	8	44683	44690	25 %	50 %	25 %	0 %	197337901
137	NC_011186	ATTA	2	8	44904	44911	50 %	50 %	0 %	0 %	197337067
138	NC_011186	TGAT	2	8	45115	45122	25 %	50 %	25 %	0 %	197337067
139	NC_011186	TTTA	2	8	45307	45314	25 %	75 %	0 %	0 %	197337067
140	NC_011186	AAAT	2	8	45356	45363	75 %	25 %	0 %	0 %	197337067
141	NC_011186	GTTC	2	8	46159	46166	0 %	50 %	25 %	25 %	197336858
142	NC_011186	TTAT	2	8	46410	46417	25 %	75 %	0 %	0 %	197336858
143	NC_011186	GAGT	2	8	46452	46459	25 %	25 %	50 %	0 %	197336858
144	NC_011186	CCTA	2	8	46657	46664	25 %	25 %	0 %	50 %	197336858
145	NC_011186	CATT	2	8	46712	46719	25 %	50 %	0 %	25 %	197337160
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