MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome II

Total Repeats: 17529

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011186	CAA	2	6	1158	1163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
2	NC_011186	AAT	2	6	1288	1293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337153
3	NC_011186	AAC	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
4	NC_011186	GCA	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337153
5	NC_011186	CTG	2	6	1347	1352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337153
6	NC_011186	ATT	2	6	1363	1368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
7	NC_011186	CAA	2	6	1370	1375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
8	NC_011186	TTA	2	6	1428	1433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
9	NC_011186	CCT	2	6	1577	1582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197337153
10	NC_011186	TGA	2	6	1591	1596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
11	NC_011186	GTA	2	6	1610	1615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
12	NC_011186	CCA	2	6	1658	1663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197337153
13	NC_011186	ATT	2	6	1718	1723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
14	NC_011186	TCT	2	6	1733	1738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
15	NC_011186	CAT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
16	NC_011186	TGA	2	6	1756	1761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
17	NC_011186	ATC	3	9	1809	1817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
18	NC_011186	TGA	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
19	NC_011186	AAG	2	6	2079	2084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337153
20	NC_011186	CAT	2	6	2139	2144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337153
21	NC_011186	ATG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
22	NC_011186	ATT	2	6	2155	2160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
23	NC_011186	CTT	2	6	2173	2178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
24	NC_011186	CTT	2	6	2233	2238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
25	NC_011186	AAC	2	6	2515	2520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
26	NC_011186	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337153
27	NC_011186	TGA	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
28	NC_011186	TGA	2	6	2821	2826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337153
29	NC_011186	ATT	2	6	2853	2858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337153
30	NC_011186	TTC	2	6	3027	3032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337153
31	NC_011186	CAA	2	6	3499	3504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337738
32	NC_011186	TCT	2	6	3548	3553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337738
33	NC_011186	AGA	2	6	4735	4740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
34	NC_011186	TAA	2	6	4747	4752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337026
35	NC_011186	TAG	2	6	4843	4848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337026
36	NC_011186	TAA	2	6	4855	4860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337026
37	NC_011186	AGA	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
38	NC_011186	ATT	2	6	4955	4960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
39	NC_011186	TTA	2	6	5025	5030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
40	NC_011186	AAG	2	6	5138	5143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337026
41	NC_011186	TTA	2	6	5168	5173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337026
42	NC_011186	CTA	2	6	5176	5181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337026
43	NC_011186	TCA	2	6	5246	5251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337026
44	NC_011186	TTC	2	6	5411	5416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
45	NC_011186	GCT	2	6	5451	5456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337332
46	NC_011186	CAA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337332
47	NC_011186	TTA	2	6	5487	5492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
48	NC_011186	TCT	2	6	5634	5639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
49	NC_011186	ACG	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337332
50	NC_011186	CTT	2	6	5772	5777	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
51	NC_011186	CAA	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337332
52	NC_011186	TGC	2	6	5837	5842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337332
53	NC_011186	TAA	2	6	5852	5857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
54	NC_011186	CAG	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337332
55	NC_011186	ATT	2	6	6020	6025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
56	NC_011186	CTT	2	6	6073	6078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
57	NC_011186	TTC	2	6	6134	6139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
58	NC_011186	TGT	2	6	6152	6157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337332
59	NC_011186	ATT	2	6	6348	6353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
60	NC_011186	TCC	2	6	6362	6367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197337332
61	NC_011186	TCA	2	6	6376	6381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337332
62	NC_011186	ATT	2	6	6420	6425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
63	NC_011186	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197337332
64	NC_011186	TAA	2	6	6440	6445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
65	NC_011186	CTT	2	6	6538	6543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337332
66	NC_011186	ATC	2	6	6659	6664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337332
67	NC_011186	ATT	2	6	6740	6745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337332
68	NC_011186	AAT	2	6	6776	6781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337332
69	NC_011186	ATT	2	6	7092	7097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336944
70	NC_011186	CGA	2	6	7129	7134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336944
71	NC_011186	AAT	2	6	7182	7187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336944
72	NC_011186	GTA	2	6	7225	7230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336944
73	NC_011186	TTA	2	6	7507	7512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
74	NC_011186	TAT	2	6	7527	7532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
75	NC_011186	TTC	2	6	7545	7550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337210
76	NC_011186	ATA	2	6	7604	7609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337210
77	NC_011186	TCT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337210
78	NC_011186	ATT	2	6	7716	7721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
79	NC_011186	TTA	2	6	7722	7727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337210
80	NC_011186	TGA	2	6	7770	7775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337210
81	NC_011186	ATA	2	6	7806	7811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337210
82	NC_011186	AAT	2	6	7873	7878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336816
83	NC_011186	CAC	2	6	7902	7907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336816
84	NC_011186	ACC	2	6	8116	8121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336816
85	NC_011186	ATT	2	6	8156	8161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336816
86	NC_011186	CAT	2	6	8302	8307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336816
87	NC_011186	TCG	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336816
88	NC_011186	CTA	2	6	8468	8473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337104
89	NC_011186	ATT	2	6	8490	8495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337104
90	NC_011186	CTT	2	6	8552	8557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337104
91	NC_011186	ATT	2	6	8948	8953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337668
92	NC_011186	TTG	2	6	9026	9031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337668
93	NC_011186	TGA	3	9	9057	9065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337668
94	NC_011186	ATG	2	6	9128	9133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337668
95	NC_011186	ATA	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337668
96	NC_011186	GGT	2	6	9400	9405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197337668
97	NC_011186	TTA	2	6	9488	9493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337668
98	NC_011186	GTT	3	9	9517	9525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337668
99	NC_011186	GTT	2	6	9562	9567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337668
100	NC_011186	TAC	2	6	9594	9599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337668
101	NC_011186	GAA	2	6	9604	9609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337668
102	NC_011186	TAG	2	6	9636	9641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337668
103	NC_011186	CTG	2	6	9881	9886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337668
104	NC_011186	GAA	2	6	9890	9895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197337668
105	NC_011186	ATG	2	6	9990	9995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337088
106	NC_011186	TTA	2	6	10021	10026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337088
107	NC_011186	TGA	2	6	10076	10081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337088
108	NC_011186	CAT	2	6	10340	10345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337088
109	NC_011186	GTT	2	6	10383	10388	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337088
110	NC_011186	CAA	2	6	10437	10442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337088
111	NC_011186	CAG	2	6	10477	10482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337088
112	NC_011186	TTA	2	6	10483	10488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337088
113	NC_011186	TGG	2	6	10520	10525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197337088
114	NC_011186	CTG	3	9	10561	10569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337088
115	NC_011186	ACA	2	6	10703	10708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337088
116	NC_011186	AAC	2	6	10739	10744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197337088
117	NC_011186	ATG	2	6	10759	10764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337088
118	NC_011186	TAA	2	6	10877	10882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337088
119	NC_011186	CTT	2	6	10885	10890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197337088
120	NC_011186	TGT	2	6	10907	10912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337088
121	NC_011186	CAG	2	6	11158	11163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197337088
122	NC_011186	GTT	2	6	11169	11174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337088
123	NC_011186	TGA	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337088
124	NC_011186	TGT	2	6	11267	11272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337088
125	NC_011186	TTG	2	6	11320	11325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197337088
126	NC_011186	GTA	2	6	11385	11390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337088
127	NC_011186	GCG	2	6	11421	11426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197337088
128	NC_011186	TAA	2	6	11555	11560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197337088
129	NC_011186	CTA	2	6	11572	11577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197337088
130	NC_011186	CTG	3	9	11677	11685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197337088
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255	NC_011186	TAT	2	6	19000	19005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337567
256	NC_011186	AGG	2	6	19109	19114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	197337567
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259	NC_011186	ATT	2	6	19353	19358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337567
260	NC_011186	TTA	2	6	19414	19419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197337567
261	NC_011186	GTA	2	6	19428	19433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197337567
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288	NC_011186	ATT	2	6	21015	21020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336847
289	NC_011186	CTT	2	6	21099	21104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336847
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