MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 2346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011185	TGT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011185	GTG	2	6	159	164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011185	CTA	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011185	AGT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011185	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011185	CTG	2	6	505	510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011185	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011185	TAC	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011185	ATT	2	6	953	958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011185	AAC	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011185	TAA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011185	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011185	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011185	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011185	TAA	2	6	2019	2024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
17	NC_011185	TGA	2	6	2094	2099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
18	NC_011185	TCG	2	6	2208	2213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336538
19	NC_011185	AGC	2	6	2274	2279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336538
20	NC_011185	GAT	2	6	2446	2451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
21	NC_011185	TGA	2	6	2456	2461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
22	NC_011185	ATT	2	6	2472	2477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
23	NC_011185	ACA	2	6	2505	2510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336538
24	NC_011185	GAT	2	6	2566	2571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
25	NC_011185	ACA	2	6	2659	2664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336538
26	NC_011185	AAT	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
27	NC_011185	ATT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
28	NC_011185	TAA	2	6	2864	2869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
29	NC_011185	TCC	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197336538
30	NC_011185	ATT	2	6	3151	3156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
31	NC_011185	GAA	2	6	3196	3201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336538
32	NC_011185	TGT	2	6	3211	3216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336538
33	NC_011185	GAT	2	6	3373	3378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336538
34	NC_011185	TTA	2	6	3479	3484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
35	NC_011185	CTA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336538
36	NC_011185	ATC	2	6	3600	3605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336538
37	NC_011185	ATA	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336538
38	NC_011185	ATT	2	6	3654	3659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336538
39	NC_011185	ATT	2	6	3767	3772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336634
40	NC_011185	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336634
41	NC_011185	TAA	2	6	3927	3932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336634
42	NC_011185	AAC	3	9	4263	4271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336634
43	NC_011185	TTC	2	6	4336	4341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336634
44	NC_011185	AAT	2	6	4366	4371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336634
45	NC_011185	ACG	2	6	4381	4386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336634
46	NC_011185	TGA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336634
47	NC_011185	TTA	2	6	4581	4586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336634
48	NC_011185	CCA	2	6	4623	4628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336634
49	NC_011185	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336485
50	NC_011185	TAA	2	6	4765	4770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
51	NC_011185	TGC	2	6	4816	4821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
52	NC_011185	ATG	2	6	4836	4841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336485
53	NC_011185	AAT	2	6	4911	4916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
54	NC_011185	TCT	2	6	5005	5010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336485
55	NC_011185	TCA	2	6	5089	5094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
56	NC_011185	TTC	2	6	5106	5111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336485
57	NC_011185	TAT	2	6	5159	5164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336485
58	NC_011185	CTC	2	6	5364	5369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197336485
59	NC_011185	GAT	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336485
60	NC_011185	CTG	2	6	5447	5452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
61	NC_011185	TGT	2	6	5520	5525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
62	NC_011185	CTG	2	6	5531	5536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336485
63	NC_011185	ATA	2	6	5566	5571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
64	NC_011185	TGT	2	6	5610	5615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
65	NC_011185	ATA	2	6	5688	5693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
66	NC_011185	ATC	2	6	5694	5699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
67	NC_011185	GTT	2	6	5737	5742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336485
68	NC_011185	TAC	2	6	5823	5828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336485
69	NC_011185	TAA	2	6	5918	5923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336485
70	NC_011185	ATA	2	6	6093	6098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
71	NC_011185	CAT	2	6	6137	6142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
72	NC_011185	ATC	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
73	NC_011185	CTT	2	6	6247	6252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336564
74	NC_011185	AAT	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
75	NC_011185	ATA	2	6	6301	6306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
76	NC_011185	CAT	2	6	6361	6366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
77	NC_011185	TGT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336564
78	NC_011185	TTG	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336564
79	NC_011185	ATT	2	6	6600	6605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336564
80	NC_011185	GTA	2	6	6648	6653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336564
81	NC_011185	CAA	2	6	6712	6717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336564
82	NC_011185	TCA	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336564
83	NC_011185	TAA	2	6	6888	6893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336564
84	NC_011185	AGC	2	6	7157	7162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336576
85	NC_011185	GTT	2	6	7177	7182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336576
86	NC_011185	TAC	2	6	7314	7319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336576
87	NC_011185	ATT	2	6	7353	7358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336576
88	NC_011185	GCT	2	6	7447	7452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336576
89	NC_011185	CTA	2	6	7466	7471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336576
90	NC_011185	TTC	3	9	7574	7582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336517
91	NC_011185	CTT	2	6	7588	7593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336517
92	NC_011185	ATA	2	6	7628	7633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336517
93	NC_011185	GAA	2	6	7680	7685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336517
94	NC_011185	GTT	2	6	7835	7840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336517
95	NC_011185	AAT	2	6	7857	7862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336517
96	NC_011185	TGT	2	6	7895	7900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336517
97	NC_011185	CAC	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336517
98	NC_011185	TAT	2	6	8179	8184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336517
99	NC_011185	CTG	2	6	8185	8190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336517
100	NC_011185	TCA	3	9	8235	8243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336517
101	NC_011185	ATT	2	6	8390	8395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336517
102	NC_011185	TAA	3	9	8425	8433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336573
103	NC_011185	TTG	2	6	8470	8475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336573
104	NC_011185	TAA	2	6	8642	8647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336573
105	NC_011185	TAC	2	6	8665	8670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336573
106	NC_011185	ATA	2	6	8709	8714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336573
107	NC_011185	GAA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336573
108	NC_011185	TCA	2	6	8786	8791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336573
109	NC_011185	AGT	2	6	8932	8937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336573
110	NC_011185	TCA	2	6	8994	8999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336573
111	NC_011185	CGG	2	6	9120	9125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	197336573
112	NC_011185	GTT	2	6	9188	9193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336573
113	NC_011185	CTT	2	6	9201	9206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336573
114	NC_011185	TAA	2	6	9301	9306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336573
115	NC_011185	GTT	2	6	9315	9320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336573
116	NC_011185	AGC	2	6	9481	9486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336573
117	NC_011185	TCT	2	6	9521	9526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336573
118	NC_011185	AAT	2	6	9591	9596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336573
119	NC_011185	GCA	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336573
120	NC_011185	TGT	3	9	9754	9762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336573
121	NC_011185	CCT	2	6	9795	9800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	197336573
122	NC_011185	GCT	2	6	9857	9862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336573
123	NC_011185	TCA	2	6	9920	9925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336573
124	NC_011185	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011185	TGC	2	6	10119	10124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336664
126	NC_011185	TGT	2	6	10180	10185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336664
127	NC_011185	TGC	2	6	10209	10214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336664
128	NC_011185	CTT	2	6	10220	10225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336664
129	NC_011185	TTC	2	6	10233	10238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336664
130	NC_011185	TTA	2	6	10252	10257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336664
131	NC_011185	TAA	2	6	10290	10295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336664
132	NC_011185	ATC	3	9	10371	10379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336664
133	NC_011185	TGC	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336664
134	NC_011185	TGT	2	6	10632	10637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336664
135	NC_011185	ATC	2	6	10653	10658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336664
136	NC_011185	TTG	2	6	10747	10752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336664
137	NC_011185	TAA	2	6	10827	10832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336664
138	NC_011185	AGC	2	6	10878	10883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336664
139	NC_011185	CAC	2	6	10884	10889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336664
140	NC_011185	TCA	2	6	10945	10950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336664
141	NC_011185	ATT	2	6	11043	11048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336664
142	NC_011185	ATT	2	6	11050	11055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336664
143	NC_011185	TTC	2	6	11183	11188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336569
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148	NC_011185	ATG	2	6	11634	11639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336569
149	NC_011185	ACA	2	6	11655	11660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336569
150	NC_011185	CAA	2	6	11860	11865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336569
151	NC_011185	TAA	2	6	11905	11910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336569
152	NC_011185	TTC	2	6	12008	12013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336569
153	NC_011185	TCA	2	6	12186	12191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336569
154	NC_011185	TAA	2	6	12223	12228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336569
155	NC_011185	TGT	2	6	12325	12330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336569
156	NC_011185	TTC	2	6	12356	12361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336569
157	NC_011185	AAG	2	6	12406	12411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197336569
158	NC_011185	TAA	2	6	12413	12418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336569
159	NC_011185	AAT	2	6	12475	12480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336569
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161	NC_011185	TTC	2	6	12747	12752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336569
162	NC_011185	GTA	2	6	12773	12778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336569
163	NC_011185	CTG	2	6	12871	12876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336569
164	NC_011185	TGT	2	6	13116	13121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011185	ATG	2	6	13224	13229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197336490
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168	NC_011185	GGT	2	6	13623	13628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197336490
169	NC_011185	AAC	2	6	13637	13642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336490
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172	NC_011185	TAC	2	6	13978	13983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336490
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233	NC_011185	CTT	2	6	18174	18179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	197336526
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245	NC_011185	TAT	3	9	19220	19228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336509
246	NC_011185	TGT	2	6	19435	19440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197336509
247	NC_011185	GCA	2	6	19501	19506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	197336509
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249	NC_011185	CCA	2	6	19698	19703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	197336509
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251	NC_011185	ATT	2	6	19810	19815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336509
252	NC_011185	TGG	2	6	19961	19966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	197336509
253	NC_011185	CTG	2	6	20118	20123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197336509
254	NC_011185	CAA	2	6	20130	20135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197336509
255	NC_011185	AAT	2	6	20178	20183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197336509
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257	NC_011185	TAC	2	6	20307	20312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336509
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