MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	TTG	2	6	9	14	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011185	TGT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011185	GTG	2	6	159	164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011185	CTA	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_011185	AGT	2	6	257	262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011185	CTG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_011185	CTG	2	6	505	510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_011185	ATT	2	6	799	804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011185	TAC	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011185	ATT	2	6	953	958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011185	AAC	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011185	TAA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011185	TTA	2	6	1346	1351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011185	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011185	GAA	2	6	1720	1725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011185	TTA	2	6	10025	10030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011185	TGT	2	6	13116	13121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011185	ATA	2	6	16753	16758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011185	TAA	2	6	17039	17044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011185	GAG	2	6	17074	17079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011185	CAT	2	6	18045	18050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_011185	CTT	2	6	20417	20422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_011185	ATA	2	6	20448	20453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011185	TTA	2	6	20488	20493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011185	TGA	2	6	26255	26260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011185	TTC	2	6	26280	26285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011185	CTT	2	6	26292	26297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_011185	GCT	2	6	26410	26415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011185	ATT	2	6	26468	26473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011185	AGT	2	6	26507	26512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011185	TTC	2	6	26539	26544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_011185	GAT	2	6	26566	26571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011185	TTA	2	6	26941	26946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011185	ATC	2	6	26951	26956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_011185	AAT	2	6	27993	27998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011185	ACT	2	6	29036	29041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_011185	ATA	2	6	29105	29110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011185	TGG	2	6	29136	29141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011185	TTA	2	6	29249	29254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011185	TTC	2	6	31748	31753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_011185	ATT	2	6	31766	31771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011185	CTC	2	6	31862	31867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_011185	TTA	2	6	31900	31905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011185	TTG	2	6	32549	32554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011185	TTG	2	6	33601	33606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011185	ATC	2	6	33635	33640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011185	TAA	2	6	33697	33702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011185	TAC	2	6	33736	33741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011185	AAT	2	6	35046	35051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011185	TAT	2	6	35648	35653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011185	ATA	2	6	36464	36469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011185	ATA	3	9	36478	36486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011185	TAA	2	6	36540	36545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011185	TGG	2	6	36558	36563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011185	ATA	2	6	37905	37910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011185	CTT	2	6	38435	38440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011185	AAT	2	6	38514	38519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011185	AAC	2	6	42789	42794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011185	ATC	2	6	42860	42865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_011185	GGT	2	6	44559	44564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011185	CAT	2	6	44626	44631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011185	ACG	2	6	44673	44678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011185	AAT	2	6	44722	44727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011185	CTA	2	6	44753	44758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_011185	TTA	2	6	44769	44774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011185	TAA	2	6	44788	44793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011185	ATT	2	6	44813	44818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011185	AGT	2	6	44828	44833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011185	CTA	2	6	44880	44885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_011185	CAT	2	6	44940	44945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011185	AAC	2	6	44978	44983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_011185	AAT	2	6	47821	47826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011185	ATT	2	6	50986	50991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011185	TAG	2	6	51033	51038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011185	GTT	2	6	51334	51339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011185	CTC	2	6	54724	54729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_011185	TTG	2	6	54743	54748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011185	GCA	2	6	54769	54774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_011185	TAT	2	6	54784	54789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011185	TAA	2	6	54803	54808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011185	TTC	2	6	54849	54854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011185	ATT	2	6	54953	54958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011185	GAT	2	6	55002	55007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011185	TTA	2	6	55582	55587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011185	ATT	2	6	55880	55885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011185	ATT	2	6	56471	56476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011185	AGT	2	6	56520	56525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011185	TGT	2	6	56580	56585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011185	AGT	2	6	56616	56621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011185	ACC	2	6	56690	56695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_011185	TCA	2	6	56705	56710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_011185	CCG	2	6	57140	57145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_011185	TGA	2	6	58151	58156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011185	ATT	3	9	58191	58199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011185	TAG	2	6	58207	58212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011185	TAC	2	6	58289	58294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_011185	TAT	2	6	58449	58454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011185	TGG	2	6	58961	58966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011185	GGT	2	6	59357	59362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011185	AGG	2	6	59436	59441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011185	ATT	2	6	59526	59531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011185	TTG	2	6	59538	59543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011185	AAC	2	6	59563	59568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011185	TAT	2	6	60089	60094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011185	CTA	2	6	60108	60113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011185	TTG	2	6	60752	60757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011185	TAC	2	6	61439	61444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011185	AAG	2	6	61453	61458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011185	TAC	2	6	62549	62554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011185	ATG	2	6	62601	62606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011185	ATG	2	6	62644	62649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011185	ATG	2	6	62708	62713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011185	TAA	2	6	62744	62749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011185	AAT	2	6	62803	62808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011185	CCA	2	6	62839	62844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_011185	GAT	2	6	62862	62867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011185	TGG	2	6	62872	62877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011185	GTA	2	6	62898	62903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011185	TAC	2	6	62910	62915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011185	GTA	2	6	63629	63634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011185	CCA	2	6	63700	63705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_011185	TAC	2	6	65021	65026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_011185	TAC	2	6	65044	65049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_011185	CAT	2	6	65253	65258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011185	ATT	2	6	65268	65273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011185	CCA	2	6	66511	66516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_011185	GTG	2	6	66536	66541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011185	CTT	2	6	67006	67011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_011185	ATA	3	9	68401	68409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011185	CTT	2	6	68471	68476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011185	CCA	2	6	68937	68942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_011185	TTA	2	6	69039	69044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011185	TGT	2	6	69053	69058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011185	GCT	2	6	70569	70574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_011185	ATG	2	6	70993	70998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011185	TAA	2	6	72295	72300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011185	TAA	2	6	72316	72321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011185	CAT	2	6	72393	72398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011185	TAT	2	6	72459	72464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011185	ATT	2	6	72823	72828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011185	CTT	2	6	73220	73225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_011185	ATG	2	6	73272	73277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_011185	ATT	2	6	75887	75892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011185	CCA	2	6	76018	76023	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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150	NC_011185	TAA	2	6	76136	76141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011185	ATA	2	6	92475	92480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_011185	ATA	2	6	109239	109244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_011185	ATT	2	6	123239	123244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011185	TAT	2	6	125594	125599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.