MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio fischeri MJ11 plasmid pMJ100

Total Repeats: 275

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011185	AT	3	6	914	919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011185	TA	3	6	1013	1018	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011185	TA	3	6	1623	1628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011185	CA	3	6	2497	2502	50 %	0 %	0 %	50 %	197336538
5	NC_011185	TG	3	6	3814	3819	0 %	50 %	50 %	0 %	197336634
6	NC_011185	AG	3	6	3879	3884	50 %	0 %	50 %	0 %	197336634
7	NC_011185	TA	3	6	4880	4885	50 %	50 %	0 %	0 %	197336485
8	NC_011185	TG	3	6	7453	7458	0 %	50 %	50 %	0 %	197336576
9	NC_011185	TA	3	6	7604	7609	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
10	NC_011185	AG	3	6	7794	7799	50 %	0 %	50 %	0 %	197336517
11	NC_011185	AT	3	6	7984	7989	50 %	50 %	0 %	0 %	197336517
12	NC_011185	CT	3	6	8094	8099	0 %	50 %	0 %	50 %	197336517
13	NC_011185	AG	3	6	9440	9445	50 %	0 %	50 %	0 %	197336573
14	NC_011185	CT	3	6	10599	10604	0 %	50 %	0 %	50 %	197336664
15	NC_011185	TG	3	6	10839	10844	0 %	50 %	50 %	0 %	197336664
16	NC_011185	CT	3	6	11130	11135	0 %	50 %	0 %	50 %	197336569
17	NC_011185	TG	3	6	12820	12825	0 %	50 %	50 %	0 %	197336569
18	NC_011185	TA	3	6	13480	13485	50 %	50 %	0 %	0 %	197336490
19	NC_011185	AG	3	6	13523	13528	50 %	0 %	50 %	0 %	197336490
20	NC_011185	TA	3	6	14558	14563	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011185	CT	3	6	15411	15416	0 %	50 %	0 %	50 %	197336574
22	NC_011185	TA	4	8	18289	18296	50 %	50 %	0 %	0 %	197336596
23	NC_011185	AT	3	6	18371	18376	50 %	50 %	0 %	0 %	197336596
24	NC_011185	TG	3	6	18380	18385	0 %	50 %	50 %	0 %	197336596
25	NC_011185	AT	3	6	18760	18765	50 %	50 %	0 %	0 %	197336499
26	NC_011185	GA	3	6	19602	19607	50 %	0 %	50 %	0 %	197336509
27	NC_011185	AT	3	6	20480	20485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011185	CT	3	6	20576	20581	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
29	NC_011185	CT	3	6	21293	21298	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
30	NC_011185	GT	3	6	21459	21464	0 %	50 %	50 %	0 %	197336637
31	NC_011185	CT	3	6	21492	21497	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
32	NC_011185	GA	3	6	21815	21820	50 %	0 %	50 %	0 %	197336637
33	NC_011185	AC	3	6	22123	22128	50 %	0 %	0 %	50 %	197336637
34	NC_011185	AC	4	8	22286	22293	50 %	0 %	0 %	50 %	197336637
35	NC_011185	TC	4	8	22754	22761	0 %	50 %	0 %	50 %	197336637
36	NC_011185	GT	3	6	23304	23309	0 %	50 %	50 %	0 %	197336637
37	NC_011185	AT	3	6	23539	23544	50 %	50 %	0 %	0 %	197336637
38	NC_011185	AT	3	6	25291	25296	50 %	50 %	0 %	0 %	197336513
39	NC_011185	GT	3	6	25633	25638	0 %	50 %	50 %	0 %	197336513
40	NC_011185	TC	3	6	25842	25847	0 %	50 %	0 %	50 %	197336539
41	NC_011185	AT	3	6	26431	26436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011185	GA	3	6	26664	26669	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011185	TA	3	6	26821	26826	50 %	50 %	0 %	0 %	197336647
44	NC_011185	TA	3	6	26993	26998	50 %	50 %	0 %	0 %	197336518
45	NC_011185	GA	3	6	27550	27555	50 %	0 %	50 %	0 %	197336501
46	NC_011185	GT	3	6	27740	27745	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_011185	AT	3	6	28578	28583	50 %	50 %	0 %	0 %	197336656
48	NC_011185	AT	3	6	29677	29682	50 %	50 %	0 %	0 %	197336554
49	NC_011185	TA	3	6	30484	30489	50 %	50 %	0 %	0 %	197336487
50	NC_011185	AG	3	6	31222	31227	50 %	0 %	50 %	0 %	197336487
51	NC_011185	AT	3	6	32071	32076	50 %	50 %	0 %	0 %	197336541
52	NC_011185	GT	3	6	32433	32438	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011185	TA	3	6	32500	32505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011185	TA	3	6	32730	32735	50 %	50 %	0 %	0 %	197336484
55	NC_011185	CT	3	6	32759	32764	0 %	50 %	0 %	50 %	197336484
56	NC_011185	AT	4	8	33659	33666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011185	AT	3	6	34473	34478	50 %	50 %	0 %	0 %	197336616
58	NC_011185	AT	3	6	34598	34603	50 %	50 %	0 %	0 %	197336616
59	NC_011185	AT	3	6	36255	36260	50 %	50 %	0 %	0 %	197336523
60	NC_011185	CT	3	6	36674	36679	0 %	50 %	0 %	50 %	197336628
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62	NC_011185	TG	3	6	38137	38142	0 %	50 %	50 %	0 %	197336577
63	NC_011185	GT	3	6	38470	38475	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011185	AT	3	6	39754	39759	50 %	50 %	0 %	0 %	197336606
65	NC_011185	AT	3	6	40726	40731	50 %	50 %	0 %	0 %	197336606
66	NC_011185	TA	3	6	41542	41547	50 %	50 %	0 %	0 %	197336497
67	NC_011185	AT	3	6	41901	41906	50 %	50 %	0 %	0 %	197336506
68	NC_011185	CT	3	6	44521	44526	0 %	50 %	0 %	50 %	197336546
69	NC_011185	AT	3	6	44735	44740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011185	TG	3	6	45647	45652	0 %	50 %	50 %	0 %	197336572
71	NC_011185	GT	3	6	45700	45705	0 %	50 %	50 %	0 %	197336572
72	NC_011185	AT	3	6	46894	46899	50 %	50 %	0 %	0 %	197336491
73	NC_011185	AT	3	6	47394	47399	50 %	50 %	0 %	0 %	197336491
74	NC_011185	CT	3	6	48513	48518	0 %	50 %	0 %	50 %	197336588
75	NC_011185	GT	3	6	48785	48790	0 %	50 %	50 %	0 %	197336588
76	NC_011185	TC	3	6	49052	49057	0 %	50 %	0 %	50 %	197336588
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78	NC_011185	GT	3	6	49816	49821	0 %	50 %	50 %	0 %	197336588
79	NC_011185	TA	3	6	51134	51139	50 %	50 %	0 %	0 %	197336542
80	NC_011185	GT	3	6	51359	51364	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011185	TA	3	6	51681	51686	50 %	50 %	0 %	0 %	197336591
82	NC_011185	AG	3	6	51707	51712	50 %	0 %	50 %	0 %	197336591
83	NC_011185	AT	3	6	52974	52979	50 %	50 %	0 %	0 %	197336591
84	NC_011185	TA	3	6	53093	53098	50 %	50 %	0 %	0 %	197336591
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88	NC_011185	AT	3	6	57899	57904	50 %	50 %	0 %	0 %	197336615
89	NC_011185	AC	3	6	58091	58096	50 %	0 %	0 %	50 %	197336615
90	NC_011185	TG	3	6	58319	58324	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011185	TG	3	6	58809	58814	0 %	50 %	50 %	0 %	197336661
92	NC_011185	TG	3	6	58970	58975	0 %	50 %	50 %	0 %	197336579
93	NC_011185	AT	3	6	59376	59381	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_011185	TA	3	6	60267	60272	50 %	50 %	0 %	0 %	197336559
96	NC_011185	TC	3	6	62355	62360	0 %	50 %	0 %	50 %	197336557
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103	NC_011185	CA	3	6	69115	69120	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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105	NC_011185	TC	3	6	70161	70166	0 %	50 %	0 %	50 %	197336578
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107	NC_011185	TG	3	6	70752	70757	0 %	50 %	50 %	0 %	197336544
108	NC_011185	CT	3	6	71057	71062	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_011185	TA	3	6	72443	72448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011185	TC	3	6	72870	72875	0 %	50 %	0 %	50 %	197336548
111	NC_011185	TA	3	6	74222	74227	50 %	50 %	0 %	0 %	197336651
112	NC_011185	CA	3	6	74803	74808	50 %	0 %	0 %	50 %	197336635
113	NC_011185	AT	3	6	75602	75607	50 %	50 %	0 %	0 %	197336635
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115	NC_011185	TA	3	6	76206	76211	50 %	50 %	0 %	0 %	197336522
116	NC_011185	AT	3	6	76426	76431	50 %	50 %	0 %	0 %	197336522
117	NC_011185	TA	3	6	76772	76777	50 %	50 %	0 %	0 %	197336522
118	NC_011185	AT	3	6	76960	76965	50 %	50 %	0 %	0 %	197336522
119	NC_011185	AG	3	6	77091	77096	50 %	0 %	50 %	0 %	197336522
120	NC_011185	AG	3	6	77858	77863	50 %	0 %	50 %	0 %	197336522
121	NC_011185	AT	4	8	78172	78179	50 %	50 %	0 %	0 %	197336522
122	NC_011185	TC	3	6	78845	78850	0 %	50 %	0 %	50 %	197336641
123	NC_011185	TG	3	6	81071	81076	0 %	50 %	50 %	0 %	197336641
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125	NC_011185	CT	3	6	82217	82222	0 %	50 %	0 %	50 %	197336641
126	NC_011185	TC	3	6	82517	82522	0 %	50 %	0 %	50 %	197336641
127	NC_011185	AT	3	6	82602	82607	50 %	50 %	0 %	0 %	197336641
128	NC_011185	AT	3	6	82746	82751	50 %	50 %	0 %	0 %	197336641
129	NC_011185	AT	3	6	84804	84809	50 %	50 %	0 %	0 %	197336665
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131	NC_011185	AG	3	6	86304	86309	50 %	0 %	50 %	0 %	197336568
132	NC_011185	TA	3	6	87253	87258	50 %	50 %	0 %	0 %	197336494
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135	NC_011185	AT	3	6	87637	87642	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.