MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 138

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	ATAACT	2	12	219	230	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_011184	TTATTT	2	12	13676	13687	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011184	ATATAA	2	12	31681	31692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011184	ATTTGG	2	12	48324	48335	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011184	TGATCA	2	12	54566	54577	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_011184	TTTGCT	2	12	116644	116655	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_011184	AAGAGC	2	12	117729	117740	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_011184	TTTGCT	2	12	117750	117761	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_011184	CGCTAG	2	12	118678	118689	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_011184	TGCTTT	2	12	132985	132996	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_011184	GCTCTT	2	12	161186	161197	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011184	GTTCTT	2	12	165456	165467	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_011184	TTACTC	2	12	172618	172629	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_011184	GTTATA	2	12	186714	186725	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011184	TTCACT	2	12	220623	220634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_011184	ATAAAA	2	12	230183	230194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011184	AGTATA	2	12	298906	298917	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011184	GATGGA	2	12	298972	298983	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011184	TGAAAT	2	12	340575	340586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011184	TGAAAT	2	12	345537	345548	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011184	CTTTTT	2	12	421573	421584	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_011184	TATTGA	2	12	483064	483075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011184	GTAATG	2	12	493585	493596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011184	GTAAAT	2	12	501460	501471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011184	TTTTAT	2	12	571696	571707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011184	AAGTTG	2	12	606914	606925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011184	TGAAAT	2	12	609263	609274	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011184	ATTGAA	2	12	611676	611687	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011184	GATGTT	2	12	625197	625208	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011184	GTTAAT	2	12	644887	644898	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011184	ATTTTT	2	12	648791	648802	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011184	GTTATT	2	12	650569	650580	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011184	TTTTGG	2	12	678144	678155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011184	TCTTTA	2	12	686317	686328	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_011184	AAAATG	2	12	694375	694386	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011184	ATGAAT	2	12	728806	728817	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011184	TAAGAT	2	12	767136	767147	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011184	AACAAA	2	12	776383	776394	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_011184	GAGAAA	2	12	819924	819935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011184	TTAAAA	3	18	833909	833926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011184	GTTTTT	2	12	870041	870052	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011184	CTTTGT	2	12	882636	882647	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_011184	AAATAA	2	12	946938	946949	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011184	ATTTAT	2	12	980925	980936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011184	ATAATT	2	12	1033280	1033291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_011184	TGATCT	2	12	1081058	1081069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_011184	AATGAT	2	12	1097091	1097102	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011184	TCCTTA	2	12	1133330	1133341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_011184	GTTTTT	2	12	1149937	1149948	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011184	TATAAA	2	12	1151398	1151409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011184	CAATTT	2	12	1173114	1173125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_011184	AAAAGC	3	18	1176961	1176978	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_011184	ATTAAA	2	12	1178608	1178619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011184	ATTAAC	2	12	1227384	1227395	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_011184	TTCTCA	2	12	1228743	1228754	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011184	CTAAAC	2	12	1299632	1299643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_011184	ATATAG	2	12	1346946	1346957	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011184	CTTAAG	2	12	1358880	1358891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_011184	ATTGAT	2	12	1359012	1359023	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011184	TAAAAA	2	12	1362148	1362159	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011184	TCATTT	2	12	1393388	1393399	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_011184	TTTAAT	2	12	1418539	1418550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011184	ATATTT	2	12	1464991	1465002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011184	ATTTTT	2	12	1485591	1485602	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011184	GTTAAT	2	12	1489746	1489757	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011184	TAATGC	2	12	1516050	1516061	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_011184	TCAATT	2	12	1517716	1517727	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_011184	TAACTA	2	12	1602039	1602050	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_011184	CTAAAA	2	12	1610594	1610605	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_011184	AAAACA	2	12	1615081	1615092	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_011184	TGTATT	2	12	1625391	1625402	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011184	TAAAAA	2	12	1631990	1632001	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011184	TTTTAG	2	12	1635073	1635084	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011184	TTTATA	2	12	1640612	1640623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011184	AACTCA	2	12	1642504	1642515	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_011184	AGACTT	2	12	1656949	1656960	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_011184	TAAAAA	2	12	1657238	1657249	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011184	TATTTT	2	12	1683162	1683173	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011184	TATAAA	2	12	1733324	1733335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011184	TAAAAA	2	12	1813594	1813605	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011184	ACAAAT	2	12	1825116	1825127	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_011184	TAAAAT	2	12	1839694	1839705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011184	ATCCCT	2	12	1884844	1884855	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_011184	GAAAAT	2	12	1885024	1885035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011184	ATCCCT	2	12	1885370	1885381	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_011184	ATCCCT	2	12	1886666	1886677	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_011184	ATCCCT	2	12	1887052	1887063	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_011184	AAAAAG	2	12	1920917	1920928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011184	GAGCAA	2	12	1924428	1924439	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_011184	ATCACT	2	12	1949400	1949411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_011184	AAAAAG	2	12	1959105	1959116	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011184	AAACGT	2	12	1979069	1979080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_011184	TAAAAG	2	12	2058055	2058066	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011184	ACCTTA	2	12	2063277	2063288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011184	TAAAAA	2	12	2063381	2063392	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011184	TAAAAT	2	12	2072750	2072761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011184	AATTAT	2	12	2083651	2083662	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011184	ACTTCT	2	12	2097778	2097789	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_011184	AATAAC	2	12	2126912	2126923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_011184	CAAAAA	2	12	2130485	2130496	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_011184	ATTTTT	2	12	2141278	2141289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011184	AACTCT	2	12	2142336	2142347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_011184	ACAAAA	2	12	2142550	2142561	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_011184	AATAAA	2	12	2150792	2150803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011184	TATAAA	2	12	2153295	2153306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011184	GGAAAT	2	12	2183821	2183832	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011184	TCTATG	2	12	2255926	2255937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_011184	TCAGGT	2	12	2260327	2260338	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_011184	ATTTCA	2	12	2379697	2379708	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_011184	AGTGTC	2	12	2382986	2382997	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_011184	GATAAC	2	12	2422907	2422918	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_011184	TTAAAA	2	12	2428188	2428199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011184	ATTTCA	2	12	2432515	2432526	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_011184	AGTGTC	2	12	2435917	2435928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_011184	ATATGT	2	12	2455408	2455419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011184	TTTTAG	2	12	2521380	2521391	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011184	TTAATT	2	12	2554398	2554409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011184	TATAAA	2	12	2558923	2558934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011184	ACTCAA	2	12	2602199	2602210	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_011184	CAAAAA	2	12	2606339	2606350	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_011184	TGTAAT	2	12	2620860	2620871	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011184	CAGATA	2	12	2627799	2627810	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_011184	AATTTC	2	12	2640471	2640482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_011184	TTTTAT	2	12	2641704	2641715	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011184	TATAGA	2	12	2704520	2704531	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011184	ATTTCA	2	12	2729979	2729990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_011184	AGTGTC	2	12	2733498	2733509	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_011184	ATTTCA	2	12	2735134	2735145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_011184	AGTGTC	2	12	2738357	2738368	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_011184	CGTTTC	2	12	2739305	2739316	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011184	GCTATT	2	12	2782698	2782709	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_011184	ACCACT	2	12	2782729	2782740	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_011184	GAAAAA	2	12	2798032	2798043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011184	ATTTCA	2	12	2849889	2849900	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_011184	AGTGTC	2	12	2853307	2853318	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_011184	ATTTCA	2	12	2854943	2854954	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_011184	AGTGTC	2	12	2858062	2858073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_011184	CTTTTT	2	12	2874514	2874525	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.