MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 1106

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	CTTTTG	2	12	2083	2094	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334085
2	NC_011184	TTGTGA	2	12	3686	3697	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197333980
3	NC_011184	GTTTGT	2	12	3772	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197333980
4	NC_011184	TTCAGT	2	12	11276	11287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197334084
5	NC_011184	AAAGCA	2	12	11991	12002	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197334084
6	NC_011184	CCGATG	2	12	12568	12579	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197334084
7	NC_011184	AAGATG	2	12	12718	12729	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197334084
8	NC_011184	CTTCCT	2	12	16751	16762	0 %	50 %	0 %	50 %	197333992
9	NC_011184	GCGAGT	2	12	20261	20272	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197333981
10	NC_011184	AAAGAG	2	12	32158	32169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197334035
11	NC_011184	TTATCA	2	12	32832	32843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	197334035
12	NC_011184	TAAAAG	2	12	39362	39373	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197333936
13	NC_011184	CTGAGG	2	12	39584	39595	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197333936
14	NC_011184	ATGGCA	2	12	39947	39958	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334226
15	NC_011184	ATCATA	2	12	43100	43111	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197334078
16	NC_011184	GCATTG	2	12	43641	43652	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334078
17	NC_011184	TTAAGG	2	12	47962	47973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334131
18	NC_011184	ATTGTT	2	12	48297	48308	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197334131
19	NC_011184	AAAAAG	2	12	48736	48747	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	197334099
20	NC_011184	GTTTTG	2	12	49036	49047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334099
21	NC_011184	GATAAA	2	12	50453	50464	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197333931
22	NC_011184	ACTGAT	2	12	53360	53371	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334031
23	NC_011184	ATGGTG	2	12	57518	57529	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334052
24	NC_011184	GTGCTG	2	12	57699	57710	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	197334052
25	NC_011184	GCAATG	2	12	58461	58472	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334158
26	NC_011184	GTGCTT	2	12	59055	59066	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	197334158
27	NC_011184	CTGTAT	2	12	63544	63555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197333984
28	NC_011184	GATTTG	2	12	69407	69418	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197334140
29	NC_011184	AGACCT	2	12	71053	71064	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197333951
30	NC_011184	TGAAAC	2	12	73287	73298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197333925
31	NC_011184	AATCAT	2	12	80807	80818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197334141
32	NC_011184	AGGTAA	2	12	84661	84672	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197334225
33	NC_011184	TCAACT	2	12	86858	86869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333942
34	NC_011184	CGGTGC	2	12	95148	95159	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	197334240
35	NC_011184	GTATTG	2	12	97891	97902	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197334154
36	NC_011184	TTTATT	2	12	103241	103252	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197333927
37	NC_011184	TTATTT	2	12	103482	103493	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197333927
38	NC_011184	AATTTG	2	12	104192	104203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197334009
39	NC_011184	GCAATG	2	12	106328	106339	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334048
40	NC_011184	TTATTT	2	12	109391	109402	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197334242
41	NC_011184	ACGTTG	2	12	113869	113880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334122
42	NC_011184	ATCCGT	2	12	115032	115043	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197334122
43	NC_011184	TTCATT	2	12	115631	115642	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197333895
44	NC_011184	GCATCT	2	12	118418	118429	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197334204
45	NC_011184	GTTAGC	2	12	122578	122589	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197333893
46	NC_011184	AATGAA	2	12	126405	126416	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197334189
47	NC_011184	AGGGTT	2	12	130392	130403	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334116
48	NC_011184	CAGTGT	2	12	134621	134632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334124
49	NC_011184	CTTCGC	2	12	135224	135235	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	197334228
50	NC_011184	ACTTTT	2	12	135429	135440	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197334228
51	NC_011184	TTGGCT	2	12	136109	136120	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	197334228
52	NC_011184	GAATCC	2	12	139071	139082	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197334039
53	NC_011184	TACCAT	2	12	145050	145061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197334049
54	NC_011184	CTTCAT	2	12	146969	146980	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	197333891
55	NC_011184	TAATTC	2	12	153484	153495	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	197333956
56	NC_011184	ATAAAG	2	12	154062	154073	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197333956
57	NC_011184	TTTTTG	2	12	155773	155784	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197334045
58	NC_011184	AAAGAG	2	12	162952	162963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	197333993
59	NC_011184	TACCTC	2	12	172803	172814	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197334108
60	NC_011184	TAAAAC	2	12	180224	180235	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197334097
61	NC_011184	ACACAA	2	12	180448	180459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	197334097
62	NC_011184	AAAAAT	2	12	181357	181368	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197334106
63	NC_011184	AAATTG	2	12	182535	182546	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197334001
64	NC_011184	CAGTTT	2	12	184638	184649	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197333883
65	NC_011184	ATCGTA	2	12	189102	189113	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334123
66	NC_011184	AGGTTT	2	12	195768	195779	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197334165
67	NC_011184	GAAAAA	2	12	199250	199261	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	197334112
68	NC_011184	CTATTC	2	12	200486	200497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	197334046
69	NC_011184	TGTTTT	2	12	209155	209166	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197333962
70	NC_011184	TTCTTG	2	12	215707	215718	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197333986
71	NC_011184	CAATCT	2	12	223911	223922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333998
72	NC_011184	TCTAAG	2	12	229456	229467	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334069
73	NC_011184	CTTTAT	2	12	230426	230437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197334171
74	NC_011184	AAAGCC	2	12	232141	232152	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	197334091
75	NC_011184	TCACGA	2	12	233371	233382	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197333935
76	NC_011184	GCAAGA	2	12	239179	239190	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	197334243
77	NC_011184	CTGCAG	2	12	244353	244364	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	197334113
78	NC_011184	TGAAGT	2	12	244542	244553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197334063
79	NC_011184	AGACTT	2	12	244662	244673	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334063
80	NC_011184	AAAAGC	2	12	247743	247754	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197334010
81	NC_011184	AAAGGT	2	12	250405	250416	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197333960
82	NC_011184	AGGTCT	2	12	251425	251436	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334161
83	NC_011184	CTGGTC	2	12	254259	254270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334125
84	NC_011184	CAAAAG	2	12	256200	256211	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197334216
85	NC_011184	TTTATC	2	12	258894	258905	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197334019
86	NC_011184	TTTGAT	2	12	261718	261729	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197334167
87	NC_011184	TTTAGG	2	12	263568	263579	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197333950
88	NC_011184	TATGAT	2	12	264529	264540	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197333950
89	NC_011184	CAAGCT	2	12	264712	264723	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197333950
90	NC_011184	AATCAA	2	12	267904	267915	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	197333881
91	NC_011184	AGCACC	2	12	269684	269695	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	197333881
92	NC_011184	CCATTT	2	12	272224	272235	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	197334083
93	NC_011184	AAAGAT	2	12	273176	273187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197334203
94	NC_011184	ACCATT	2	12	273890	273901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197333941
95	NC_011184	ATTGAT	2	12	276069	276080	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197334219
96	NC_011184	GTATTG	2	12	277798	277809	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197334223
97	NC_011184	ATAACG	2	12	279394	279405	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197334092
98	NC_011184	GCAATG	2	12	281719	281730	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334044
99	NC_011184	TCAACA	2	12	284652	284663	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197334166
100	NC_011184	TACCGA	2	12	289149	289160	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197334096
101	NC_011184	ACCTTC	2	12	290227	290238	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	197334111
102	NC_011184	CTAATG	2	12	292928	292939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334212
103	NC_011184	AATGAA	2	12	293440	293451	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197334212
104	NC_011184	TTTCTT	2	12	296360	296371	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	197333906
105	NC_011184	TTTTGA	2	12	297303	297314	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197333906
106	NC_011184	TCGATT	2	12	298756	298767	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197334128
107	NC_011184	CTGAAT	2	12	303971	303982	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334032
108	NC_011184	TTTTGT	2	12	305865	305876	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	197334184
109	NC_011184	GTATTG	2	12	306473	306484	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	197334068
110	NC_011184	AATTAA	2	12	308050	308061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	197333897
111	NC_011184	AGCGGC	2	12	308666	308677	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	197333971
112	NC_011184	AGATAA	2	12	309452	309463	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197333971
113	NC_011184	CAGGTA	2	12	309793	309804	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197333971
114	NC_011184	CATTGC	2	12	310936	310947	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197334193
115	NC_011184	AATGAA	2	12	311858	311869	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197334193
116	NC_011184	AGCGCC	2	12	313050	313061	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	197334119
117	NC_011184	GGTATA	2	12	317489	317500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197333978
118	NC_011184	ATCGGT	2	12	318753	318764	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197333978
119	NC_011184	TAGACC	2	12	318795	318806	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197333978
120	NC_011184	AAGATA	2	12	326050	326061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197334027
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229	NC_011184	ATGCTT	2	12	596425	596436	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197334648
230	NC_011184	CTTGAG	2	12	600194	600205	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334835
231	NC_011184	CATTAG	2	12	602342	602353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197335143
232	NC_011184	TAAAGT	2	12	611236	611247	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	197336281
233	NC_011184	AATCTG	2	12	611922	611933	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334562
234	NC_011184	TTTTTA	2	12	612154	612165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197334562
235	NC_011184	TAACCG	2	12	621067	621078	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197334516
236	NC_011184	GAGGTT	2	12	622671	622682	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334998
237	NC_011184	CAGGTA	2	12	625305	625316	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197334387
238	NC_011184	TGATTA	2	12	628678	628689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	197334387
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242	NC_011184	TCAAAT	2	12	635255	635266	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	197335661
243	NC_011184	TCGATG	2	12	643552	643563	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197334744
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248	NC_011184	GGCATT	2	12	668028	668039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197335156
249	NC_011184	TACAAG	2	12	673678	673689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	197334852
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251	NC_011184	TGATGC	2	12	678656	678667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	197336109
252	NC_011184	TGAAGA	2	12	678848	678859	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	197336109
253	NC_011184	AGGTGC	2	12	683518	683529	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	197335855
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255	NC_011184	TAGGTG	2	12	686663	686674	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334658
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257	NC_011184	TAACGT	2	12	693411	693422	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197335212
258	NC_011184	GGCCTT	2	12	693870	693881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197335212
259	NC_011184	TAACGT	2	12	697398	697409	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197334971
260	NC_011184	GGCCTT	2	12	697857	697868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	197334971
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262	NC_011184	CTTGAA	2	12	698774	698785	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197335382
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264	NC_011184	CTTGTT	2	12	700334	700345	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334593
265	NC_011184	ATCAGC	2	12	702514	702525	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197334539
266	NC_011184	CTGAAG	2	12	707710	707721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197336261
267	NC_011184	ATCACT	2	12	709420	709431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	197336027
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334	NC_011184	CTTTTG	2	12	887088	887099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334426
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338	NC_011184	AAGGTC	2	12	893866	893877	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	197335361
339	NC_011184	TTATTT	2	12	898140	898151	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197335507
340	NC_011184	TAAAAA	2	12	899770	899781	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	197335507
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342	NC_011184	CAGAAA	2	12	904638	904649	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	197336315
343	NC_011184	TAAAGA	2	12	906940	906951	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197336315
344	NC_011184	TAATGG	2	12	908005	908016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	197335815
345	NC_011184	ACGTCA	2	12	908526	908537	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197335083
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349	NC_011184	TGCATC	2	12	912759	912770	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197335183
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443	NC_011184	TTGCTT	2	12	1186067	1186078	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197336289
444	NC_011184	GATCCT	2	12	1190064	1190075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197334248
445	NC_011184	TCTGCT	2	12	1192132	1192143	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	197335020
446	NC_011184	CATCAC	2	12	1192707	1192718	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	197335356
447	NC_011184	AACTAC	2	12	1194578	1194589	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197335687
448	NC_011184	TGTACC	2	12	1198435	1198446	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	197335253
449	NC_011184	TTTGGC	2	12	1202147	1202158	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	197336206
450	NC_011184	GATGGT	2	12	1205460	1205471	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	197334427
451	NC_011184	ATCTTT	2	12	1208505	1208516	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	197335741
452	NC_011184	TTGATT	2	12	1211891	1211902	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197336355
453	NC_011184	TTTTGC	2	12	1212243	1212254	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	197334687
454	NC_011184	TTGGTT	2	12	1212491	1212502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	197334687
455	NC_011184	AGAAAT	2	12	1213935	1213946	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	197335663
456	NC_011184	CCTAAA	2	12	1214943	1214954	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	197336130
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458	NC_011184	ACATGC	2	12	1219533	1219544	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197335764
459	NC_011184	TTATGC	2	12	1221218	1221229	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	197335954
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461	NC_011184	TTTAAT	2	12	1225284	1225295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	197336176
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463	NC_011184	TGCTAA	2	12	1230131	1230142	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197336162
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472	NC_011184	GTATTT	2	12	1252186	1252197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	197334824
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481	NC_011184	AATCGC	2	12	1294621	1294632	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	197336133
482	NC_011184	ATTTTT	2	12	1296803	1296814	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	197335489
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487	NC_011184	TCAAGT	2	12	1314553	1314564	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	197335299
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