MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 417

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	TTAAA	2	10	13897	13906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011184	AAGGA	2	10	20924	20933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011184	GAAAA	2	10	24110	24119	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_011184	TTTCA	2	10	24324	24333	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_011184	TAATG	2	10	24406	24415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011184	TTAAG	2	10	24595	24604	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011184	AAATT	2	10	28245	28254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011184	TCTCT	2	10	34975	34984	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_011184	CATTT	2	10	36647	36656	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_011184	TCGCT	2	10	57803	57812	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_011184	TGCGC	2	10	57862	57871	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_011184	GAAGC	2	10	58023	58032	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_011184	GTTTT	2	10	61354	61363	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011184	AGCTA	2	10	61369	61378	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_011184	ATTTC	2	10	61451	61460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_011184	CATTT	2	10	66051	66060	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_011184	GGTGA	2	10	71386	71395	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011184	TTATT	2	10	81517	81526	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011184	AGCAA	2	10	83131	83140	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_011184	GTTAC	2	10	86062	86071	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_011184	AGTGG	2	10	88432	88441	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011184	CGCTT	2	10	91744	91753	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_011184	TTGGT	2	10	91811	91820	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011184	TAGCG	2	10	92090	92099	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_011184	TAAGA	2	10	92615	92624	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011184	ATTTT	2	10	96394	96403	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011184	AGCGC	2	10	104093	104102	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011184	CTTTA	2	10	111287	111296	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_011184	TATAA	2	10	112747	112756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011184	ATTAA	2	10	113127	113136	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011184	TAGCG	2	10	116709	116718	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_011184	TAGCG	2	10	118788	118797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_011184	ACGCT	2	10	126309	126318	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_011184	CGCTT	2	10	128770	128779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_011184	TAGCG	2	10	129145	129154	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_011184	CGCTT	2	10	130529	130538	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_011184	AAGCG	2	10	130865	130874	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_011184	AGCGA	2	10	131033	131042	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_011184	AAGCG	2	10	133001	133010	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_011184	ATTTA	2	10	137547	137556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011184	TTTTA	2	10	137673	137682	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011184	TCGCT	2	10	139848	139857	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_011184	AGTTC	2	10	139893	139902	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
44	NC_011184	CGCTT	2	10	142913	142922	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_011184	CGCTT	2	10	143105	143114	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
46	NC_011184	AAGCG	2	10	151067	151076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_011184	AATAA	2	10	171373	171382	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011184	GAAAA	2	10	209567	209576	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011184	AGCGA	2	10	211155	211164	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_011184	AACCT	2	10	211227	211236	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_011184	GCGCT	2	10	212261	212270	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_011184	AAGCG	2	10	212337	212346	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_011184	TAGCG	2	10	213493	213502	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_011184	CTTCG	2	10	215255	215264	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_011184	GAAGC	2	10	215555	215564	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_011184	GCGCT	2	10	217125	217134	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_011184	TAAAA	2	10	221713	221722	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011184	AAGCG	2	10	221789	221798	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_011184	GCTTC	2	10	223561	223570	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_011184	AGCGC	2	10	223644	223653	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
61	NC_011184	TAAGA	2	10	238998	239007	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011184	GTTTC	2	10	254384	254393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_011184	TTAAT	2	10	257720	257729	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011184	AGCGT	2	10	279067	279076	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_011184	TTTTG	2	10	287448	287457	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011184	TTTGT	2	10	316842	316851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011184	TTATC	2	10	325025	325034	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011184	TTGTT	2	10	329518	329527	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011184	TCAAA	2	10	338413	338422	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_011184	TCAAA	2	10	343375	343384	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_011184	CAGTT	2	10	346849	346858	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_011184	TAGTT	2	10	347036	347045	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011184	ATTTT	2	10	348694	348703	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011184	CTTTT	2	10	354213	354222	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_011184	ATGAA	2	10	361329	361338	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011184	ATAGA	2	10	373117	373126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011184	TAAAA	2	10	374087	374096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011184	AGAAT	2	10	377058	377067	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011184	TAGAT	2	10	407884	407893	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011184	GAGAA	2	10	422726	422735	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011184	CAATC	2	10	441417	441426	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_011184	TTTAG	2	10	443387	443396	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011184	AAGCG	2	10	443429	443438	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_011184	ACGCT	2	10	450431	450440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_011184	CGAAG	2	10	462231	462240	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_011184	TAATT	2	10	464420	464429	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011184	CTTTT	2	10	466063	466072	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_011184	CATTT	2	10	487771	487780	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_011184	TAAAT	2	10	493716	493725	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011184	AGATT	2	10	498633	498642	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011184	TTTTG	2	10	501487	501496	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011184	CTTTT	2	10	517732	517741	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_011184	TATTT	2	10	530504	530513	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011184	ATTAT	2	10	560700	560709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011184	TGTTT	2	10	560734	560743	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011184	ATAGA	2	10	565588	565597	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011184	TTAAT	2	10	572465	572474	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011184	AATTT	2	10	586757	586766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011184	ATAAA	2	10	588860	588869	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011184	TATTT	2	10	599282	599291	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011184	TCCTT	2	10	602202	602211	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_011184	AAAGC	2	10	605104	605113	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_011184	AAAAC	2	10	607038	607047	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_011184	ATTTT	2	10	620339	620348	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011184	AAGCG	2	10	635798	635807	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
106	NC_011184	TTTAT	2	10	650532	650541	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011184	TATTT	2	10	656827	656836	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011184	TAATT	2	10	656990	656999	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011184	TTGTT	2	10	670874	670883	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011184	GCAAT	2	10	690477	690486	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_011184	TAAAT	2	10	697010	697019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011184	TCATT	2	10	699837	699846	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_011184	ATTGA	2	10	706098	706107	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011184	TTTTG	2	10	710608	710617	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011184	AAATA	2	10	713913	713922	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011184	GAATA	2	10	713976	713985	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011184	TTTCT	2	10	749635	749644	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_011184	TGAAC	2	10	749824	749833	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_011184	AATAA	2	10	776327	776336	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011184	ATAAA	2	10	780610	780619	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011184	GTGTC	2	10	780922	780931	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
122	NC_011184	TTAAG	2	10	790874	790883	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011184	AATTT	2	10	792686	792695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011184	ATTCT	2	10	792959	792968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_011184	ATTAA	2	10	793087	793096	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011184	ATTTT	2	10	821818	821827	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011184	TAAAA	2	10	848295	848304	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011184	TAGGT	2	10	857405	857414	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011184	GTTTT	2	10	859456	859465	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011184	CATTC	2	10	866015	866024	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_011184	TTGGT	2	10	870237	870246	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_011184	ATTCA	2	10	881131	881140	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_011184	TTATA	2	10	888193	888202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011184	AAAGC	2	10	936691	936700	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_011184	ATTCA	2	10	937186	937195	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_011184	TTTCG	2	10	937805	937814	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_011184	ATCAA	2	10	937916	937925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_011184	AGCTT	2	10	943454	943463	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
139	NC_011184	TTTGA	2	10	944184	944193	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011184	ATCAC	2	10	945614	945623	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_011184	GATTA	2	10	945697	945706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011184	AATTA	2	10	947512	947521	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011184	GTTGA	2	10	950571	950580	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011184	GTGAT	2	10	954077	954086	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011184	CATCG	2	10	954094	954103	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
146	NC_011184	TCCTG	2	10	958820	958829	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_011184	TTTTA	2	10	958833	958842	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011184	GATAA	2	10	968228	968237	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011184	AGAAA	2	10	969869	969878	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011184	TTTTA	2	10	988948	988957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011184	GTATC	2	10	989022	989031	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_011184	CAATT	2	10	1011530	1011539	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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163	NC_011184	CATTC	2	10	1065904	1065913	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_011184	TGAAA	2	10	1065952	1065961	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011184	TGTGA	2	10	1067490	1067499	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_011184	ATTTT	2	10	1096920	1096929	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_011184	TTATC	2	10	1290941	1290950	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_011184	TTATC	2	10	1300700	1300709	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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267	NC_011184	TTTAA	2	10	1887413	1887422	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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270	NC_011184	TTTCT	2	10	1932943	1932952	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_011184	TTTAA	2	10	1937293	1937302	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_011184	TTTAT	2	10	1937317	1937326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_011184	TGTAG	2	10	1949414	1949423	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
275	NC_011184	TTTGA	2	10	1954182	1954191	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_011184	TTAAT	2	10	2063496	2063505	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.