MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio fischeri MJ11 chromosome I

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011184	TTACG	2	10	4539	4548	20 %	40 %	20 %	20 %	197334034
2	NC_011184	AATGC	2	10	5412	5421	40 %	20 %	20 %	20 %	197334117
3	NC_011184	AAATC	2	10	6207	6216	60 %	20 %	0 %	20 %	197333922
4	NC_011184	ATTTG	2	10	6855	6864	20 %	60 %	20 %	0 %	197334002
5	NC_011184	TGCTT	2	10	8118	8127	0 %	60 %	20 %	20 %	197334133
6	NC_011184	TAATT	2	10	8805	8814	40 %	60 %	0 %	0 %	197334133
7	NC_011184	GAGTT	2	10	10498	10507	20 %	40 %	40 %	0 %	197334005
8	NC_011184	CAATA	2	10	12834	12843	60 %	20 %	0 %	20 %	197334084
9	NC_011184	ATTAC	2	10	15216	15225	40 %	40 %	0 %	20 %	197333917
10	NC_011184	AATTA	2	10	16022	16031	60 %	40 %	0 %	0 %	197333992
11	NC_011184	TTCGT	2	10	16371	16380	0 %	60 %	20 %	20 %	197333992
12	NC_011184	ATTCA	2	10	17413	17422	40 %	40 %	0 %	20 %	197334221
13	NC_011184	ATGCA	2	10	22336	22345	40 %	20 %	20 %	20 %	197333985
14	NC_011184	AAGAG	2	10	23915	23924	60 %	0 %	40 %	0 %	197334120
15	NC_011184	TCACT	2	10	29824	29833	20 %	40 %	0 %	40 %	197334156
16	NC_011184	TTAAC	2	10	30814	30823	40 %	40 %	0 %	20 %	197334103
17	NC_011184	TATTT	2	10	32704	32713	20 %	80 %	0 %	0 %	197334035
18	NC_011184	CAATT	2	10	39119	39128	40 %	40 %	0 %	20 %	197333936
19	NC_011184	AAAAC	2	10	40246	40255	80 %	0 %	0 %	20 %	197334226
20	NC_011184	TTAGA	2	10	42099	42108	40 %	40 %	20 %	0 %	197334211
21	NC_011184	TAACA	2	10	45175	45184	60 %	20 %	0 %	20 %	197334179
22	NC_011184	CAACC	2	10	47650	47659	40 %	0 %	0 %	60 %	197334131
23	NC_011184	TGAAG	2	10	49847	49856	40 %	20 %	40 %	0 %	197334099
24	NC_011184	AAAAG	2	10	50874	50883	80 %	0 %	20 %	0 %	197333938
25	NC_011184	TCTTT	2	10	50919	50928	0 %	80 %	0 %	20 %	197333938
26	NC_011184	ATCAC	2	10	51427	51436	40 %	20 %	0 %	40 %	197334207
27	NC_011184	AATGC	2	10	52029	52038	40 %	20 %	20 %	20 %	197334207
28	NC_011184	GTTTG	2	10	53825	53834	0 %	60 %	40 %	0 %	197334101
29	NC_011184	TGATT	2	10	56860	56869	20 %	60 %	20 %	0 %	197334052
30	NC_011184	ATTGC	2	10	58788	58797	20 %	40 %	20 %	20 %	197334158
31	NC_011184	GTACC	2	10	58878	58887	20 %	20 %	20 %	40 %	197334158
32	NC_011184	GCCTG	2	10	60704	60713	0 %	20 %	40 %	40 %	197334079
33	NC_011184	TAAAT	2	10	61144	61153	60 %	40 %	0 %	0 %	197334006
34	NC_011184	CGATG	2	10	62718	62727	20 %	20 %	40 %	20 %	197334080
35	NC_011184	AAAGT	2	10	66494	66503	60 %	20 %	20 %	0 %	197333973
36	NC_011184	TTCTT	2	10	69872	69881	0 %	80 %	0 %	20 %	197334036
37	NC_011184	TGGGT	2	10	70079	70088	0 %	40 %	60 %	0 %	197334036
38	NC_011184	GTGAT	2	10	74199	74208	20 %	40 %	40 %	0 %	197334239
39	NC_011184	TTTCT	2	10	74214	74223	0 %	80 %	0 %	20 %	197334239
40	NC_011184	TGTGA	2	10	74927	74936	20 %	40 %	40 %	0 %	197334239
41	NC_011184	TACCG	2	10	75321	75330	20 %	20 %	20 %	40 %	197334239
42	NC_011184	GAGCA	2	10	79996	80005	40 %	0 %	40 %	20 %	197334053
43	NC_011184	TCTTT	2	10	80168	80177	0 %	80 %	0 %	20 %	197334141
44	NC_011184	TTCTT	2	10	81048	81057	0 %	80 %	0 %	20 %	197334141
45	NC_011184	CCATC	2	10	81093	81102	20 %	20 %	0 %	60 %	197334141
46	NC_011184	CAAAA	2	10	81176	81185	80 %	0 %	0 %	20 %	197334141
47	NC_011184	TAAGG	2	10	81341	81350	40 %	20 %	40 %	0 %	197334141
48	NC_011184	CATTT	2	10	84640	84649	20 %	60 %	0 %	20 %	197334225
49	NC_011184	TTAAT	2	10	88290	88299	40 %	60 %	0 %	0 %	197334047
50	NC_011184	GCAAA	2	10	89323	89332	60 %	0 %	20 %	20 %	197334137
51	NC_011184	TGATC	2	10	90121	90130	20 %	40 %	20 %	20 %	197333989
52	NC_011184	AAAAG	2	10	93270	93279	80 %	0 %	20 %	0 %	197334213
53	NC_011184	GGATA	2	10	93675	93684	40 %	20 %	40 %	0 %	197334135
54	NC_011184	GTGTT	2	10	93739	93748	0 %	60 %	40 %	0 %	197334135
55	NC_011184	ATCTA	2	10	94160	94169	40 %	40 %	0 %	20 %	197334107
56	NC_011184	GAATT	2	10	95390	95399	40 %	40 %	20 %	0 %	197334240
57	NC_011184	TTCTC	2	10	96522	96531	0 %	60 %	0 %	40 %	197334154
58	NC_011184	ATTCA	2	10	97588	97597	40 %	40 %	0 %	20 %	197334154
59	NC_011184	ATTGG	2	10	98198	98207	20 %	40 %	40 %	0 %	197334154
60	NC_011184	TTTAT	2	10	99284	99293	20 %	80 %	0 %	0 %	197333987
61	NC_011184	AAAAG	2	10	102358	102367	80 %	0 %	20 %	0 %	197333927
62	NC_011184	AATGG	2	10	103821	103830	40 %	20 %	40 %	0 %	197333927
63	NC_011184	TTGTG	2	10	105687	105696	0 %	60 %	40 %	0 %	197334048
64	NC_011184	AAACC	2	10	106173	106182	60 %	0 %	0 %	40 %	197334048
65	NC_011184	GTCAT	2	10	106595	106604	20 %	40 %	20 %	20 %	197334048
66	NC_011184	AATTC	2	10	109807	109816	40 %	40 %	0 %	20 %	197334242
67	NC_011184	TTGAG	2	10	110423	110432	20 %	40 %	40 %	0 %	197334242
68	NC_011184	ATAAG	2	10	111035	111044	60 %	20 %	20 %	0 %	197333972
69	NC_011184	GCACT	2	10	112499	112508	20 %	20 %	20 %	40 %	197334234
70	NC_011184	TCGTT	2	10	113603	113612	0 %	60 %	20 %	20 %	197334122
71	NC_011184	AAACC	2	10	113970	113979	60 %	0 %	0 %	40 %	197334122
72	NC_011184	ATAAA	2	10	115237	115246	80 %	20 %	0 %	0 %	197333895
73	NC_011184	TTGGT	2	10	118256	118265	0 %	60 %	40 %	0 %	197334204
74	NC_011184	CAGCT	2	10	119414	119423	20 %	20 %	20 %	40 %	197333966
75	NC_011184	CTATC	2	10	122494	122503	20 %	40 %	0 %	40 %	197333893
76	NC_011184	TTACA	2	10	122530	122539	40 %	40 %	0 %	20 %	197333893
77	NC_011184	GAAAG	2	10	123679	123688	60 %	0 %	40 %	0 %	197334026
78	NC_011184	GTTTG	2	10	124271	124280	0 %	60 %	40 %	0 %	197334026
79	NC_011184	GCGTA	2	10	128120	128129	20 %	20 %	40 %	20 %	197334071
80	NC_011184	AGCAA	2	10	130053	130062	60 %	0 %	20 %	20 %	197334116
81	NC_011184	TAGCA	2	10	136865	136874	40 %	20 %	20 %	20 %	197334228
82	NC_011184	ATCAG	2	10	140972	140981	40 %	20 %	20 %	20 %	197333918
83	NC_011184	AAAAG	2	10	143608	143617	80 %	0 %	20 %	0 %	197334073
84	NC_011184	TTTGA	2	10	143983	143992	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
85	NC_011184	TTTGA	2	10	144228	144237	20 %	60 %	20 %	0 %	197334049
86	NC_011184	AACGA	2	10	152503	152512	60 %	0 %	20 %	20 %	197334029
87	NC_011184	GCAAA	2	10	152741	152750	60 %	0 %	20 %	20 %	197334029
88	NC_011184	CTTGT	2	10	153724	153733	0 %	60 %	20 %	20 %	197333956
89	NC_011184	CATTA	2	10	154572	154581	40 %	40 %	0 %	20 %	197334205
90	NC_011184	TATAC	2	10	155749	155758	40 %	40 %	0 %	20 %	197334045
91	NC_011184	TAAGT	2	10	156188	156197	40 %	40 %	20 %	0 %	197334045
92	NC_011184	ATGCA	2	10	156367	156376	40 %	20 %	20 %	20 %	197334045
93	NC_011184	CTTTT	2	10	156636	156645	0 %	80 %	0 %	20 %	197334030
94	NC_011184	ACTTT	2	10	156843	156852	20 %	60 %	0 %	20 %	197334030
95	NC_011184	ATCAC	2	10	157977	157986	40 %	20 %	0 %	40 %	197333968
96	NC_011184	AAGAA	2	10	158133	158142	80 %	0 %	20 %	0 %	197333968
97	NC_011184	TGAAT	2	10	158828	158837	40 %	40 %	20 %	0 %	197334004
98	NC_011184	AACGC	2	10	159166	159175	40 %	0 %	20 %	40 %	197334004
99	NC_011184	AGCTA	2	10	159308	159317	40 %	20 %	20 %	20 %	197334004
100	NC_011184	GGAAT	2	10	161857	161866	40 %	20 %	40 %	0 %	197333894
101	NC_011184	CCCAT	2	10	162993	163002	20 %	20 %	0 %	60 %	197333993
102	NC_011184	GAAGC	2	10	163083	163092	40 %	0 %	40 %	20 %	197333993
103	NC_011184	TGATT	2	10	163892	163901	20 %	60 %	20 %	0 %	197333993
104	NC_011184	CGGTA	2	10	170513	170522	20 %	20 %	40 %	20 %	197334075
105	NC_011184	GTGAA	2	10	170902	170911	40 %	20 %	40 %	0 %	197334075
106	NC_011184	TTAGA	2	10	173660	173669	40 %	40 %	20 %	0 %	197334108
107	NC_011184	TGAAA	2	10	176569	176578	60 %	20 %	20 %	0 %	197333967
108	NC_011184	AAATG	2	10	176719	176728	60 %	20 %	20 %	0 %	197333967
109	NC_011184	AGCGA	2	10	177597	177606	40 %	0 %	40 %	20 %	197334022
110	NC_011184	GCATT	2	10	179225	179234	20 %	40 %	20 %	20 %	197334217
111	NC_011184	AAGTT	2	10	179927	179936	40 %	40 %	20 %	0 %	197334097
112	NC_011184	ATTTT	2	10	180603	180612	20 %	80 %	0 %	0 %	197334097
113	NC_011184	ATTGA	2	10	181253	181262	40 %	40 %	20 %	0 %	197334106
114	NC_011184	AAAGA	2	10	181702	181711	80 %	0 %	20 %	0 %	197334001
115	NC_011184	TTTGG	2	10	184657	184666	0 %	60 %	40 %	0 %	197333883
116	NC_011184	GTTTG	2	10	186990	186999	0 %	60 %	40 %	0 %	197333933
117	NC_011184	GTAAT	2	10	189408	189417	40 %	40 %	20 %	0 %	197334123
118	NC_011184	AACAA	2	10	192218	192227	80 %	0 %	0 %	20 %	197334132
119	NC_011184	GGTTT	2	10	194243	194252	0 %	60 %	40 %	0 %	197334012
120	NC_011184	ATTGT	2	10	194536	194545	20 %	60 %	20 %	0 %	197333900
121	NC_011184	GAAAA	2	10	195033	195042	80 %	0 %	20 %	0 %	197333900
122	NC_011184	TTGGC	2	10	197799	197808	0 %	40 %	40 %	20 %	197334175
123	NC_011184	TAATA	2	10	199903	199912	60 %	40 %	0 %	0 %	197334046
124	NC_011184	GAATA	2	10	200508	200517	60 %	20 %	20 %	0 %	197334046
125	NC_011184	TCTTA	2	10	200576	200585	20 %	60 %	0 %	20 %	197334046
126	NC_011184	TTATA	2	10	201799	201808	40 %	60 %	0 %	0 %	197333975
127	NC_011184	AACTA	2	10	206036	206045	60 %	20 %	0 %	20 %	197334197
128	NC_011184	AAAAT	2	10	206156	206165	80 %	20 %	0 %	0 %	197334197
129	NC_011184	AAATA	2	10	206225	206234	80 %	20 %	0 %	0 %	197333884
130	NC_011184	GTTTT	2	10	206453	206462	0 %	80 %	20 %	0 %	197333884
131	NC_011184	TTTAA	2	10	207210	207219	40 %	60 %	0 %	0 %	197334149
132	NC_011184	GTTAT	2	10	207992	208001	20 %	60 %	20 %	0 %	197333962
133	NC_011184	AGTTT	2	10	208575	208584	20 %	60 %	20 %	0 %	197333962
134	NC_011184	TTCAA	2	10	210660	210669	40 %	40 %	0 %	20 %	197333886
135	NC_011184	TAATT	2	10	211681	211690	40 %	60 %	0 %	0 %	197334020
136	NC_011184	GTATT	2	10	212752	212761	20 %	60 %	20 %	0 %	197334181
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261	NC_011184	TTGAT	2	10	424631	424640	20 %	60 %	20 %	0 %	197336360
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