MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 3413

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	197250740
2	NC_011149	CGCTG	2	10	3112	3121	0 %	20 %	40 %	40 %	197249934
3	NC_011149	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	197249934
4	NC_011149	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	197249168
5	NC_011149	CCGCG	2	10	7183	7192	0 %	0 %	40 %	60 %	197248129
6	NC_011149	CCTTC	2	10	8673	8682	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_011149	GAAAA	2	10	10060	10069	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011149	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	197247366
9	NC_011149	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	197247366
10	NC_011149	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	197250919
11	NC_011149	GTGAT	2	10	14913	14922	20 %	40 %	40 %	0 %	197251887
12	NC_011149	CCTTG	2	10	17192	17201	0 %	40 %	20 %	40 %	197251520
13	NC_011149	TATTG	2	10	17577	17586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011149	GGCTG	2	10	18852	18861	0 %	20 %	60 %	20 %	197248226
15	NC_011149	AGAGC	2	10	19373	19382	40 %	0 %	40 %	20 %	197248226
16	NC_011149	CCTGA	2	10	19914	19923	20 %	20 %	20 %	40 %	197248226
17	NC_011149	TACCG	2	10	21052	21061	20 %	20 %	20 %	40 %	197248849
18	NC_011149	GGCCG	2	10	21676	21685	0 %	0 %	60 %	40 %	197248849
19	NC_011149	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	197250746
20	NC_011149	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	197250118
21	NC_011149	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	197250118
22	NC_011149	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	449785010
23	NC_011149	CGGCG	2	10	28633	28642	0 %	0 %	60 %	40 %	197250867
24	NC_011149	ATCTG	2	10	30967	30976	20 %	40 %	20 %	20 %	449785011
25	NC_011149	TTACG	2	10	31022	31031	20 %	40 %	20 %	20 %	449785011
26	NC_011149	GGGCG	2	10	31791	31800	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
27	NC_011149	TGCGT	2	10	32170	32179	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_011149	AAAAG	2	10	32564	32573	80 %	0 %	20 %	0 %	197247417
29	NC_011149	TATAA	2	10	34167	34176	60 %	40 %	0 %	0 %	197249381
30	NC_011149	TTTTC	2	10	34476	34485	0 %	80 %	0 %	20 %	197250600
31	NC_011149	ATCGT	2	10	34917	34926	20 %	40 %	20 %	20 %	197251863
32	NC_011149	ATTTT	2	10	34961	34970	20 %	80 %	0 %	0 %	197251863
33	NC_011149	TTTTA	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011149	AGCGA	2	10	35590	35599	40 %	0 %	40 %	20 %	197251278
35	NC_011149	TCCTG	2	10	35800	35809	0 %	40 %	20 %	40 %	197251278
36	NC_011149	GGTCA	2	10	38035	38044	20 %	20 %	40 %	20 %	197250571
37	NC_011149	TTCAT	2	10	39307	39316	20 %	60 %	0 %	20 %	197248673
38	NC_011149	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	197249148
39	NC_011149	TAAAA	2	10	44188	44197	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011149	ACGGC	2	10	44484	44493	20 %	0 %	40 %	40 %	197248163
41	NC_011149	TTTTA	2	10	44810	44819	20 %	80 %	0 %	0 %	197248163
42	NC_011149	GGGCT	2	10	46558	46567	0 %	20 %	60 %	20 %	197251902
43	NC_011149	GCGTA	2	10	48434	48443	20 %	20 %	40 %	20 %	197248810
44	NC_011149	GACCA	2	10	49039	49048	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
45	NC_011149	CCGGC	2	10	49181	49190	0 %	0 %	40 %	60 %	197248810
46	NC_011149	CAGAC	2	10	50371	50380	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
47	NC_011149	TGTGC	2	10	53132	53141	0 %	40 %	40 %	20 %	197248853
48	NC_011149	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
49	NC_011149	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
50	NC_011149	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	197248475
51	NC_011149	CGGCG	2	10	57123	57132	0 %	0 %	60 %	40 %	197247967
52	NC_011149	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	197249530
53	NC_011149	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	197249034
54	NC_011149	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	197250613
55	NC_011149	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	197247355
56	NC_011149	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	197250636
57	NC_011149	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	197250360
58	NC_011149	GCCTG	2	10	64785	64794	0 %	20 %	40 %	40 %	197250360
59	NC_011149	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	197250006
60	NC_011149	CGTGC	2	10	71355	71364	0 %	20 %	40 %	40 %	197249273
61	NC_011149	TTGAT	2	10	71525	71534	20 %	60 %	20 %	0 %	197249273
62	NC_011149	ACCGC	2	10	72085	72094	20 %	0 %	20 %	60 %	197249273
63	NC_011149	CGATG	2	10	77569	77578	20 %	20 %	40 %	20 %	197250511
64	NC_011149	GCGAA	2	10	78510	78519	40 %	0 %	40 %	20 %	197250511
65	NC_011149	TTGCC	2	10	81036	81045	0 %	40 %	20 %	40 %	197248515
66	NC_011149	CGTCC	2	10	81146	81155	0 %	20 %	20 %	60 %	197248515
67	NC_011149	AAGCG	2	10	81510	81519	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_011149	TCAGC	2	10	84265	84274	20 %	20 %	20 %	40 %	197250411
69	NC_011149	GGCCA	2	10	84413	84422	20 %	0 %	40 %	40 %	197250411
70	NC_011149	GTACG	2	10	86984	86993	20 %	20 %	40 %	20 %	197249408
71	NC_011149	CAGAA	2	10	87697	87706	60 %	0 %	20 %	20 %	197249408
72	NC_011149	CCGCA	2	10	89816	89825	20 %	0 %	20 %	60 %	197250896
73	NC_011149	CGGTT	2	10	90321	90330	0 %	40 %	40 %	20 %	197251386
74	NC_011149	GCTCC	2	10	91457	91466	0 %	20 %	20 %	60 %	197251386
75	NC_011149	TGGCG	2	10	92101	92110	0 %	20 %	60 %	20 %	449785012
76	NC_011149	TAAAA	2	10	95573	95582	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011149	TTTCC	2	10	96012	96021	0 %	60 %	0 %	40 %	197247800
78	NC_011149	GTGGC	2	10	96581	96590	0 %	20 %	60 %	20 %	197247800
79	NC_011149	GCGCT	2	10	97880	97889	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_011149	AGCGC	2	10	97947	97956	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
81	NC_011149	TGCAC	2	10	98645	98654	20 %	20 %	20 %	40 %	197247954
82	NC_011149	TGGCA	2	10	98714	98723	20 %	20 %	40 %	20 %	197247954
83	NC_011149	TCTGT	2	10	99040	99049	0 %	60 %	20 %	20 %	197251104
84	NC_011149	GCGCT	2	10	99350	99359	0 %	20 %	40 %	40 %	197251104
85	NC_011149	GGCGC	2	10	99764	99773	0 %	0 %	60 %	40 %	197251104
86	NC_011149	GCGAC	2	10	100077	100086	20 %	0 %	40 %	40 %	197251104
87	NC_011149	AACGT	2	10	102534	102543	40 %	20 %	20 %	20 %	197250718
88	NC_011149	CCCAA	2	10	104684	104693	40 %	0 %	0 %	60 %	197248833
89	NC_011149	TTGTT	2	10	105391	105400	0 %	80 %	20 %	0 %	197248833
90	NC_011149	GCTTC	2	10	106771	106780	0 %	40 %	20 %	40 %	197250730
91	NC_011149	TGCGT	2	10	107058	107067	0 %	40 %	40 %	20 %	197250730
92	NC_011149	TGATC	2	10	108758	108767	20 %	40 %	20 %	20 %	197249861
93	NC_011149	AAGCG	2	10	109254	109263	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_011149	GCTGA	2	10	110268	110277	20 %	20 %	40 %	20 %	197248148
95	NC_011149	TGGCG	2	10	111918	111927	0 %	20 %	60 %	20 %	197248148
96	NC_011149	AGCGC	2	10	112478	112487	20 %	0 %	40 %	40 %	197248148
97	NC_011149	CCGCG	2	10	113564	113573	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
98	NC_011149	GGGGT	2	10	114960	114969	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011149	ACGGT	2	10	116789	116798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
100	NC_011149	TGGCG	2	10	117157	117166	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_011149	TAATT	2	10	118299	118308	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011149	ATTTT	2	10	118325	118334	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011149	CAGCG	2	10	119683	119692	20 %	0 %	40 %	40 %	197251437
104	NC_011149	GCCGG	2	10	119983	119992	0 %	0 %	60 %	40 %	197251437
105	NC_011149	ATTTG	2	10	120551	120560	20 %	60 %	20 %	0 %	197251437
106	NC_011149	TTGCC	2	10	125055	125064	0 %	40 %	20 %	40 %	197248796
107	NC_011149	AGCAG	2	10	125732	125741	40 %	0 %	40 %	20 %	197248623
108	NC_011149	AGTTT	2	10	127962	127971	20 %	60 %	20 %	0 %	197250327
109	NC_011149	TAGTG	2	10	128380	128389	20 %	40 %	40 %	0 %	197249885
110	NC_011149	TCGAT	2	10	129810	129819	20 %	40 %	20 %	20 %	197251499
111	NC_011149	CGGCG	2	10	132121	132130	0 %	0 %	60 %	40 %	197247828
112	NC_011149	CGTTT	2	10	132583	132592	0 %	60 %	20 %	20 %	197247828
113	NC_011149	GGTTT	2	10	135739	135748	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011149	ATTCC	2	10	137684	137693	20 %	40 %	0 %	40 %	197248826
115	NC_011149	CCCAA	2	10	139753	139762	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
116	NC_011149	AAAGC	2	10	139981	139990	60 %	0 %	20 %	20 %	197247480
117	NC_011149	CCGCA	2	10	140514	140523	20 %	0 %	20 %	60 %	197247480
118	NC_011149	TTGTT	2	10	141100	141109	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011149	AGTTC	2	10	142885	142894	20 %	40 %	20 %	20 %	197248687
120	NC_011149	TGCCT	2	10	142985	142994	0 %	40 %	20 %	40 %	197250573
121	NC_011149	AAGCG	2	10	147638	147647	40 %	0 %	40 %	20 %	197251461
122	NC_011149	GTTTG	2	10	149541	149550	0 %	60 %	40 %	0 %	197248149
123	NC_011149	CGTAT	2	10	151012	151021	20 %	40 %	20 %	20 %	197248187
124	NC_011149	ATCAG	2	10	152848	152857	40 %	20 %	20 %	20 %	197247646
125	NC_011149	CTGCC	2	10	154857	154866	0 %	20 %	20 %	60 %	197247549
126	NC_011149	CGGCG	2	10	157587	157596	0 %	0 %	60 %	40 %	197249720
127	NC_011149	CGCGG	2	10	160237	160246	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
128	NC_011149	CCGGC	2	10	160941	160950	0 %	0 %	40 %	60 %	197248857
129	NC_011149	GATCA	2	10	165984	165993	40 %	20 %	20 %	20 %	197247589
130	NC_011149	CGTCA	2	10	166730	166739	20 %	20 %	20 %	40 %	197251746
131	NC_011149	ATCCC	2	10	168430	168439	20 %	20 %	0 %	60 %	197250502
132	NC_011149	TAGCG	2	10	169137	169146	20 %	20 %	40 %	20 %	197250502
133	NC_011149	TGAGC	2	10	170987	170996	20 %	20 %	40 %	20 %	197250845
134	NC_011149	CGCAT	2	10	171249	171258	20 %	20 %	20 %	40 %	197251731
135	NC_011149	CGAAC	2	10	171978	171987	40 %	0 %	20 %	40 %	197247687
136	NC_011149	GTTCA	2	10	172244	172253	20 %	40 %	20 %	20 %	197247687
137	NC_011149	ATGAC	2	10	173210	173219	40 %	20 %	20 %	20 %	197248432
138	NC_011149	CTGGA	2	10	173800	173809	20 %	20 %	40 %	20 %	197248970
139	NC_011149	CAGAA	2	10	175919	175928	60 %	0 %	20 %	20 %	197250232
140	NC_011149	CGAAG	2	10	178790	178799	40 %	0 %	40 %	20 %	197249231
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149	NC_011149	CGGCG	2	10	198837	198846	0 %	0 %	60 %	40 %	197249954
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151	NC_011149	GCGCA	2	10	202501	202510	20 %	0 %	40 %	40 %	197251561
152	NC_011149	ATCGG	2	10	203892	203901	20 %	20 %	40 %	20 %	197247727
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165	NC_011149	CGCGT	2	10	220937	220946	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_011149	GGCGT	2	10	236674	236683	0 %	20 %	60 %	20 %	197247572
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178	NC_011149	ATATA	2	10	239102	239111	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_011149	TCACC	2	10	242727	242736	20 %	20 %	0 %	60 %	197248634
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258	NC_011149	TGAGC	2	10	354938	354947	20 %	20 %	40 %	20 %	197249845
259	NC_011149	TTTCA	2	10	355115	355124	20 %	60 %	0 %	20 %	197249845
260	NC_011149	CAACG	2	10	357312	357321	40 %	0 %	20 %	40 %	197251116
261	NC_011149	GCGTT	2	10	360501	360510	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
262	NC_011149	AATGT	2	10	360997	361006	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
263	NC_011149	TGAAA	2	10	361281	361290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
264	NC_011149	GACTG	2	10	364589	364598	20 %	20 %	40 %	20 %	197248725
265	NC_011149	ATTTT	2	10	366716	366725	20 %	80 %	0 %	0 %	197249620
266	NC_011149	TCCTG	2	10	371233	371242	0 %	40 %	20 %	40 %	197250980
267	NC_011149	GATGC	2	10	372956	372965	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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281	NC_011149	CGTTT	2	10	391491	391500	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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384	NC_011149	TTCAA	2	10	521173	521182	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
385	NC_011149	TTAAG	2	10	521341	521350	40 %	40 %	20 %	0 %	197251436
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394	NC_011149	ATGGG	2	10	535044	535053	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
395	NC_011149	TAACT	2	10	538735	538744	40 %	40 %	0 %	20 %	197247448
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398	NC_011149	ACGCG	2	10	544063	544072	20 %	0 %	40 %	40 %	197247478
399	NC_011149	GCCGA	2	10	544407	544416	20 %	0 %	40 %	40 %	197251816
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402	NC_011149	GCGCC	2	10	548139	548148	0 %	0 %	40 %	60 %	197249276
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