MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 2772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	AGGTA	2	10	2553	2562	40 %	20 %	40 %	0 %	197250740
2	NC_011149	CGCTG	2	10	3112	3121	0 %	20 %	40 %	40 %	197249934
3	NC_011149	ATTGC	2	10	3396	3405	20 %	40 %	20 %	20 %	197249934
4	NC_011149	CGGCG	2	10	4144	4153	0 %	0 %	60 %	40 %	197249168
5	NC_011149	CCGCG	2	10	7183	7192	0 %	0 %	40 %	60 %	197248129
6	NC_011149	TCTTT	2	10	11322	11331	0 %	80 %	0 %	20 %	197247366
7	NC_011149	ATTTA	2	10	11364	11373	40 %	60 %	0 %	0 %	197247366
8	NC_011149	GCGTG	2	10	13990	13999	0 %	20 %	60 %	20 %	197250919
9	NC_011149	GTGAT	2	10	14913	14922	20 %	40 %	40 %	0 %	197251887
10	NC_011149	CCTTG	2	10	17192	17201	0 %	40 %	20 %	40 %	197251520
11	NC_011149	GGCTG	2	10	18852	18861	0 %	20 %	60 %	20 %	197248226
12	NC_011149	AGAGC	2	10	19373	19382	40 %	0 %	40 %	20 %	197248226
13	NC_011149	CCTGA	2	10	19914	19923	20 %	20 %	20 %	40 %	197248226
14	NC_011149	TACCG	2	10	21052	21061	20 %	20 %	20 %	40 %	197248849
15	NC_011149	GGCCG	2	10	21676	21685	0 %	0 %	60 %	40 %	197248849
16	NC_011149	CTTTT	2	10	23395	23404	0 %	80 %	0 %	20 %	197250746
17	NC_011149	CGGTA	2	10	24563	24572	20 %	20 %	40 %	20 %	197250118
18	NC_011149	CTGTT	2	10	24602	24611	0 %	60 %	20 %	20 %	197250118
19	NC_011149	TATTT	2	10	25436	25445	20 %	80 %	0 %	0 %	449785010
20	NC_011149	CGGCG	2	10	28633	28642	0 %	0 %	60 %	40 %	197250867
21	NC_011149	ATCTG	2	10	30967	30976	20 %	40 %	20 %	20 %	449785011
22	NC_011149	TTACG	2	10	31022	31031	20 %	40 %	20 %	20 %	449785011
23	NC_011149	AAAAG	2	10	32564	32573	80 %	0 %	20 %	0 %	197247417
24	NC_011149	TATAA	2	10	34167	34176	60 %	40 %	0 %	0 %	197249381
25	NC_011149	TTTTC	2	10	34476	34485	0 %	80 %	0 %	20 %	197250600
26	NC_011149	ATCGT	2	10	34917	34926	20 %	40 %	20 %	20 %	197251863
27	NC_011149	ATTTT	2	10	34961	34970	20 %	80 %	0 %	0 %	197251863
28	NC_011149	AGCGA	2	10	35590	35599	40 %	0 %	40 %	20 %	197251278
29	NC_011149	TCCTG	2	10	35800	35809	0 %	40 %	20 %	40 %	197251278
30	NC_011149	GGTCA	2	10	38035	38044	20 %	20 %	40 %	20 %	197250571
31	NC_011149	TTCAT	2	10	39307	39316	20 %	60 %	0 %	20 %	197248673
32	NC_011149	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	197249148
33	NC_011149	ACGGC	2	10	44484	44493	20 %	0 %	40 %	40 %	197248163
34	NC_011149	TTTTA	2	10	44810	44819	20 %	80 %	0 %	0 %	197248163
35	NC_011149	GGGCT	2	10	46558	46567	0 %	20 %	60 %	20 %	197251902
36	NC_011149	GCGTA	2	10	48434	48443	20 %	20 %	40 %	20 %	197248810
37	NC_011149	GACCA	2	10	49039	49048	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
38	NC_011149	CCGGC	2	10	49181	49190	0 %	0 %	40 %	60 %	197248810
39	NC_011149	CAGAC	2	10	50371	50380	40 %	0 %	20 %	40 %	197248810
40	NC_011149	TGTGC	2	10	53132	53141	0 %	40 %	40 %	20 %	197248853
41	NC_011149	GTTTG	2	10	54526	54535	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
42	NC_011149	GTTTG	2	10	55454	55463	0 %	60 %	40 %	0 %	197248475
43	NC_011149	CACTA	2	10	56585	56594	40 %	20 %	0 %	40 %	197248475
44	NC_011149	CGGCG	2	10	57123	57132	0 %	0 %	60 %	40 %	197247967
45	NC_011149	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	197249530
46	NC_011149	TTCAC	2	10	57378	57387	20 %	40 %	0 %	40 %	197249034
47	NC_011149	AAAAT	2	10	58949	58958	80 %	20 %	0 %	0 %	197250613
48	NC_011149	GGAAA	2	10	59736	59745	60 %	0 %	40 %	0 %	197247355
49	NC_011149	CGCTG	2	10	60226	60235	0 %	20 %	40 %	40 %	197250636
50	NC_011149	CGGCG	2	10	63992	64001	0 %	0 %	60 %	40 %	197250360
51	NC_011149	GCCTG	2	10	64785	64794	0 %	20 %	40 %	40 %	197250360
52	NC_011149	GCGCG	2	10	64942	64951	0 %	0 %	60 %	40 %	197250006
53	NC_011149	CGTGC	2	10	71355	71364	0 %	20 %	40 %	40 %	197249273
54	NC_011149	TTGAT	2	10	71525	71534	20 %	60 %	20 %	0 %	197249273
55	NC_011149	ACCGC	2	10	72085	72094	20 %	0 %	20 %	60 %	197249273
56	NC_011149	CGATG	2	10	77569	77578	20 %	20 %	40 %	20 %	197250511
57	NC_011149	GCGAA	2	10	78510	78519	40 %	0 %	40 %	20 %	197250511
58	NC_011149	TTGCC	2	10	81036	81045	0 %	40 %	20 %	40 %	197248515
59	NC_011149	CGTCC	2	10	81146	81155	0 %	20 %	20 %	60 %	197248515
60	NC_011149	TCAGC	2	10	84265	84274	20 %	20 %	20 %	40 %	197250411
61	NC_011149	GGCCA	2	10	84413	84422	20 %	0 %	40 %	40 %	197250411
62	NC_011149	GTACG	2	10	86984	86993	20 %	20 %	40 %	20 %	197249408
63	NC_011149	CAGAA	2	10	87697	87706	60 %	0 %	20 %	20 %	197249408
64	NC_011149	CCGCA	2	10	89816	89825	20 %	0 %	20 %	60 %	197250896
65	NC_011149	CGGTT	2	10	90321	90330	0 %	40 %	40 %	20 %	197251386
66	NC_011149	GCTCC	2	10	91457	91466	0 %	20 %	20 %	60 %	197251386
67	NC_011149	TGGCG	2	10	92101	92110	0 %	20 %	60 %	20 %	449785012
68	NC_011149	TTTCC	2	10	96012	96021	0 %	60 %	0 %	40 %	197247800
69	NC_011149	GTGGC	2	10	96581	96590	0 %	20 %	60 %	20 %	197247800
70	NC_011149	TGCAC	2	10	98645	98654	20 %	20 %	20 %	40 %	197247954
71	NC_011149	TGGCA	2	10	98714	98723	20 %	20 %	40 %	20 %	197247954
72	NC_011149	TCTGT	2	10	99040	99049	0 %	60 %	20 %	20 %	197251104
73	NC_011149	GCGCT	2	10	99350	99359	0 %	20 %	40 %	40 %	197251104
74	NC_011149	GGCGC	2	10	99764	99773	0 %	0 %	60 %	40 %	197251104
75	NC_011149	GCGAC	2	10	100077	100086	20 %	0 %	40 %	40 %	197251104
76	NC_011149	AACGT	2	10	102534	102543	40 %	20 %	20 %	20 %	197250718
77	NC_011149	CCCAA	2	10	104684	104693	40 %	0 %	0 %	60 %	197248833
78	NC_011149	TTGTT	2	10	105391	105400	0 %	80 %	20 %	0 %	197248833
79	NC_011149	GCTTC	2	10	106771	106780	0 %	40 %	20 %	40 %	197250730
80	NC_011149	TGCGT	2	10	107058	107067	0 %	40 %	40 %	20 %	197250730
81	NC_011149	TGATC	2	10	108758	108767	20 %	40 %	20 %	20 %	197249861
82	NC_011149	GCTGA	2	10	110268	110277	20 %	20 %	40 %	20 %	197248148
83	NC_011149	TGGCG	2	10	111918	111927	0 %	20 %	60 %	20 %	197248148
84	NC_011149	AGCGC	2	10	112478	112487	20 %	0 %	40 %	40 %	197248148
85	NC_011149	CAGCG	2	10	119683	119692	20 %	0 %	40 %	40 %	197251437
86	NC_011149	GCCGG	2	10	119983	119992	0 %	0 %	60 %	40 %	197251437
87	NC_011149	ATTTG	2	10	120551	120560	20 %	60 %	20 %	0 %	197251437
88	NC_011149	TTGCC	2	10	125055	125064	0 %	40 %	20 %	40 %	197248796
89	NC_011149	AGCAG	2	10	125732	125741	40 %	0 %	40 %	20 %	197248623
90	NC_011149	AGTTT	2	10	127962	127971	20 %	60 %	20 %	0 %	197250327
91	NC_011149	TAGTG	2	10	128380	128389	20 %	40 %	40 %	0 %	197249885
92	NC_011149	TCGAT	2	10	129810	129819	20 %	40 %	20 %	20 %	197251499
93	NC_011149	CGGCG	2	10	132121	132130	0 %	0 %	60 %	40 %	197247828
94	NC_011149	CGTTT	2	10	132583	132592	0 %	60 %	20 %	20 %	197247828
95	NC_011149	ATTCC	2	10	137684	137693	20 %	40 %	0 %	40 %	197248826
96	NC_011149	AAAGC	2	10	139981	139990	60 %	0 %	20 %	20 %	197247480
97	NC_011149	CCGCA	2	10	140514	140523	20 %	0 %	20 %	60 %	197247480
98	NC_011149	AGTTC	2	10	142885	142894	20 %	40 %	20 %	20 %	197248687
99	NC_011149	TGCCT	2	10	142985	142994	0 %	40 %	20 %	40 %	197250573
100	NC_011149	AAGCG	2	10	147638	147647	40 %	0 %	40 %	20 %	197251461
101	NC_011149	GTTTG	2	10	149541	149550	0 %	60 %	40 %	0 %	197248149
102	NC_011149	CGTAT	2	10	151012	151021	20 %	40 %	20 %	20 %	197248187
103	NC_011149	ATCAG	2	10	152848	152857	40 %	20 %	20 %	20 %	197247646
104	NC_011149	CTGCC	2	10	154857	154866	0 %	20 %	20 %	60 %	197247549
105	NC_011149	CGGCG	2	10	157587	157596	0 %	0 %	60 %	40 %	197249720
106	NC_011149	CCGGC	2	10	160941	160950	0 %	0 %	40 %	60 %	197248857
107	NC_011149	GATCA	2	10	165984	165993	40 %	20 %	20 %	20 %	197247589
108	NC_011149	CGTCA	2	10	166730	166739	20 %	20 %	20 %	40 %	197251746
109	NC_011149	ATCCC	2	10	168430	168439	20 %	20 %	0 %	60 %	197250502
110	NC_011149	TAGCG	2	10	169137	169146	20 %	20 %	40 %	20 %	197250502
111	NC_011149	TGAGC	2	10	170987	170996	20 %	20 %	40 %	20 %	197250845
112	NC_011149	CGCAT	2	10	171249	171258	20 %	20 %	20 %	40 %	197251731
113	NC_011149	CGAAC	2	10	171978	171987	40 %	0 %	20 %	40 %	197247687
114	NC_011149	GTTCA	2	10	172244	172253	20 %	40 %	20 %	20 %	197247687
115	NC_011149	ATGAC	2	10	173210	173219	40 %	20 %	20 %	20 %	197248432
116	NC_011149	CTGGA	2	10	173800	173809	20 %	20 %	40 %	20 %	197248970
117	NC_011149	CAGAA	2	10	175919	175928	60 %	0 %	20 %	20 %	197250232
118	NC_011149	CGAAG	2	10	178790	178799	40 %	0 %	40 %	20 %	197249231
119	NC_011149	AGCAA	2	10	181003	181012	60 %	0 %	20 %	20 %	197250339
120	NC_011149	GGCAT	2	10	186070	186079	20 %	20 %	40 %	20 %	197247645
121	NC_011149	GGCCA	2	10	186492	186501	20 %	0 %	40 %	40 %	197248333
122	NC_011149	CGTTT	2	10	187007	187016	0 %	60 %	20 %	20 %	197248333
123	NC_011149	GGGGA	2	10	187059	187068	20 %	0 %	80 %	0 %	197248333
124	NC_011149	ATCGC	2	10	194404	194413	20 %	20 %	20 %	40 %	197250897
125	NC_011149	AGTAC	2	10	196273	196282	40 %	20 %	20 %	20 %	197251601
126	NC_011149	CGGCG	2	10	198837	198846	0 %	0 %	60 %	40 %	197249954
127	NC_011149	GCCCA	2	10	202096	202105	20 %	0 %	20 %	60 %	197251561
128	NC_011149	GCGCA	2	10	202501	202510	20 %	0 %	40 %	40 %	197251561
129	NC_011149	ATCGG	2	10	203892	203901	20 %	20 %	40 %	20 %	197247727
130	NC_011149	GCCGC	2	10	205102	205111	0 %	0 %	40 %	60 %	197249042
131	NC_011149	ATCCA	2	10	210452	210461	40 %	20 %	0 %	40 %	197251379
132	NC_011149	CGGCG	2	10	212561	212570	0 %	0 %	60 %	40 %	197248848
133	NC_011149	ATTTC	2	10	213091	213100	20 %	60 %	0 %	20 %	197248848
134	NC_011149	AGCGC	2	10	216073	216082	20 %	0 %	40 %	40 %	197249470
135	NC_011149	CGGCG	2	10	217981	217990	0 %	0 %	60 %	40 %	197251223
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261	NC_011149	GCGCC	2	10	430571	430580	0 %	0 %	40 %	60 %	197247629
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264	NC_011149	CGTAT	2	10	435137	435146	20 %	40 %	20 %	20 %	197250186
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277	NC_011149	AGTAG	2	10	456846	456855	40 %	20 %	40 %	0 %	197249621
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