MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483 chromosome

Total Repeats: 8167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011149	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011149	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_011149	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_011149	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_011149	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011149	GTG	2	6	5061	5066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011149	CGC	2	6	5930	5935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_011149	TGA	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011149	ATG	2	6	7452	7457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011149	CGG	2	6	7504	7509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_011149	CGT	2	6	7598	7603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011149	ATC	2	6	7607	7612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011149	AAT	2	6	8721	8726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011149	TAG	2	6	9333	9338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011149	TCC	2	6	9345	9350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_011149	GGA	2	6	9358	9363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011149	ATC	2	6	9953	9958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011149	ATA	2	6	10016	10021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011149	TAA	2	6	10050	10055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011149	TGA	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011149	GTG	2	6	11486	11491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011149	TTA	2	6	11540	11545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011149	ATG	2	6	11561	11566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011149	TTC	2	6	14754	14759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_011149	TTG	2	6	14835	14840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011149	TAT	2	6	14971	14976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011149	ATG	2	6	16002	16007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011149	ATT	2	6	16056	16061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011149	GTA	2	6	16443	16448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011149	ATC	2	6	17758	17763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_011149	GAT	2	6	17770	17775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011149	CCA	2	6	20033	20038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_011149	TTA	2	6	23168	23173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011149	TAA	2	6	24097	24102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011149	GTT	2	6	24118	24123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011149	GAT	2	6	24234	24239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011149	TAA	2	6	24261	24266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_011149	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011149	ACG	2	6	24308	24313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_011149	AAG	2	6	24355	24360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011149	GAA	2	6	24401	24406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011149	CAG	2	6	24411	24416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_011149	TAT	2	6	31272	31277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011149	TAT	2	6	31279	31284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011149	CGC	2	6	31353	31358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_011149	CGG	2	6	31391	31396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011149	GGT	2	6	31434	31439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011149	CGC	2	6	31476	31481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
49	NC_011149	CAG	2	6	31504	31509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011149	CAA	2	6	31516	31521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_011149	AGC	2	6	31570	31575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_011149	AGC	2	6	31605	31610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_011149	GGT	2	6	31611	31616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011149	GTG	2	6	31641	31646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011149	GGC	2	6	31755	31760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_011149	GCC	2	6	31912	31917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_011149	AAG	2	6	31922	31927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011149	AGC	2	6	31933	31938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011149	ATG	2	6	31949	31954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011149	CTC	2	6	31957	31962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_011149	GCA	2	6	31980	31985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_011149	GTC	2	6	32014	32019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_011149	GTT	2	6	32259	32264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011149	ATA	2	6	32311	32316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011149	TAT	2	6	32336	32341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011149	ATT	2	6	32395	32400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011149	ATA	2	6	33136	33141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011149	CAT	2	6	33203	33208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_011149	TAA	2	6	33257	33262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011149	GTG	2	6	33302	33307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_011149	ATG	2	6	33329	33334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011149	TAG	2	6	34994	34999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011149	TTG	2	6	35042	35047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011149	AAT	2	6	35054	35059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011149	TAG	2	6	35151	35156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011149	GAT	2	6	35179	35184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011149	ATT	2	6	35233	35238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011149	TTG	2	6	35252	35257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011149	TTG	2	6	35290	35295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011149	TAA	2	6	35322	35327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011149	TCA	2	6	38753	38758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_011149	TGT	2	6	39566	39571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_011149	AAG	2	6	39575	39580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011149	TGT	2	6	39671	39676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011149	TTG	2	6	39677	39682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011149	TGT	2	6	39716	39721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011149	AAT	2	6	39767	39772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011149	AAT	2	6	39979	39984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011149	GAA	2	6	40010	40015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011149	AAT	2	6	41625	41630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011149	GGT	2	6	42912	42917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011149	TGA	2	6	44202	44207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011149	GTT	2	6	44211	44216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011149	ATC	2	6	46031	46036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_011149	TCA	2	6	46101	46106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_011149	TAG	2	6	46147	46152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_011149	GAA	2	6	46157	46162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011149	ATT	2	6	51891	51896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011149	AGT	2	6	51956	51961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011149	ATT	2	6	51982	51987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011149	TTA	2	6	52010	52015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011149	GGT	2	6	52048	52053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011149	CTT	2	6	52604	52609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_011149	GCA	2	6	52648	52653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_011149	TGA	2	6	58768	58773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_011149	GAA	2	6	58826	58831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011149	GTC	2	6	58841	58846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_011149	CTC	2	6	64852	64857	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_011149	ACG	2	6	66908	66913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_011149	GAC	2	6	66922	66927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_011149	CCG	2	6	67027	67032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_011149	TAA	2	6	68427	68432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011149	ATT	2	6	68493	68498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011149	TTA	2	6	68500	68505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011149	TCT	2	6	73833	73838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_011149	GGC	2	6	73941	73946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_011149	TTC	2	6	74971	74976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_011149	TAA	2	6	75035	75040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_011149	TTA	2	6	75205	75210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011149	ATG	2	6	75243	75248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_011149	CTT	2	6	75512	75517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011149	GCC	2	6	75586	75591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_011149	TAA	2	6	76848	76853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011149	CGG	2	6	80097	80102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_011149	TAA	2	6	80222	80227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011149	TTA	2	6	80306	80311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011149	GAT	2	6	80410	80415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011149	GAT	2	6	80539	80544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011149	GAT	2	6	80725	80730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_011149	CTG	2	6	80768	80773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_011149	GGC	2	6	81456	81461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011149	CGG	2	6	82350	82355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_011149	TAA	2	6	86490	86495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011149	TAT	2	6	88080	88085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011149	TTG	2	6	88093	88098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011149	ATG	2	6	88138	88143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011149	CCG	2	6	88454	88459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_011149	GGC	2	6	91927	91932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_011149	AAC	2	6	93394	93399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_011149	AAT	2	6	93676	93681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_011149	CCT	2	6	178492	178497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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287	NC_011149	TGT	2	6	184198	184203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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304	NC_011149	ATA	2	6	197391	197396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_011149	ATT	2	6	304590	304595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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